Loading article…
| EGR1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | EGR1、AT225、G0S30、KROX-24、NGFI-A、TIS8、ZIF-268、ZNF225、初期成長反応1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：128990; MGI : 95295;ホモロジーン: 56394;ジーンカード：EGR1; OMA :EGR1 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EGR-1 (早期成長反応タンパク質 1) は、 ZNF268 (ジンクフィンガータンパク質 268) またはNGFI-A (神経成長因子誘導タンパク質 A)としても知られ、ヒトではEGR1遺伝子によってコードされるタンパク質です。
EGR-1 は哺乳類の転写因子です。Krox-24、TIS8、ZENKとも呼ばれています。もともとはマウスで発見されました。
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、Cys 2 His 2型ジンクフィンガータンパク質のEGRファミリーに属します。これは核タンパク質であり、転写調節因子として機能します。これが活性化する標的遺伝子の産物は、分化と有糸分裂に必要です。研究によると、これは腫瘍抑制遺伝子であることが示唆されています。[5]
脳内での発現パターンは特徴的で、その誘導は神経活動と関連していることが示されています。いくつかの研究では、神経可塑性に役割を果たしていることが示唆されています。[6]
EGR-1は記憶形成における重要な転写因子であり、脳ニューロンのエピジェネティックな再プログラミングに不可欠な役割を果たしています。EGR-1はDNA脱メチル化経路を開始するTET1タンパク質をリクルートします。[7] DNAメチル化マークを除去すると、下流の遺伝子が活性化されます。EGR-1はTET1とともに、脳の発達、学習、長期的な神経可塑性における 脳DNAのメチル化部位の分布のプログラミングに使用されます。EGR-1はVAMP2 （シナプスエキソサイトーシスに重要なタンパク質）の発現を制御することもわかっています。[8]
神経系での機能に加えて、線維性疾患において誘導されるEGR-1とその相同遺伝子EGR-2は線維形成において重要な機能を持ち、マウスで実験的に誘導された線維症に必要であるという重要な証拠があります。[9]
卵巣機能にも関与している可能性がある[10]
構造
EGR-1 の DNA 結合ドメインは、Cys 2 His 2タイプの 3 つのジンク フィンガードメインで構成されています。EGR-1 ジンク フィンガー ドメインのアミノ酸構造は、1 文字のアミノ酸コードを使用して、この表に示されています。フィンガー 1 から 3 は、f1 - f3 で示されます。数字は、アルファ ヘリックスの残基 (アミノ酸) を参照しています(ゼロはありません)。「x」でマークされた残基は、ジンク フィンガーの一部ではなく、ジンク フィンガー全体を連結する役割を果たします。
アミノ酸キー:アラニン(Ala、A)、アルギニン(Arg、R)、アスパラギン(Asn、N)、アスパラギン酸(Asp、D)、システイン(Cys、C)、グルタミン酸(Glu、E)、グルタミン(Gln、Q)、グリシン(Gly、G)、ヒスチジン(His、H)、イソロイシン(Ile、I)、ロイシン(Leu、L)、リジン(Lys、K)、メチオニン(Met、M)、フェニルアラニン(Phe、F)、プロリン(Pro、P)、セリン(Ser、S)、トレオニン(Thr、T)、トリプトファン(Trp、W)、チロシン(Tyr、Y)、バリン(Val、V)
EGR-1のジンクフィンガードメインに結合したDNAの結晶構造は1991年に解明され、ジンクフィンガーDNA結合ドメインの初期研究に大きく貢献した。[11]
ヒト EGR-1 タンパク質は（未処理の状態で）分子量 57.5 kDaの 543 個のアミノ酸を含み、遺伝子は5 番染色体上に位置しています。
DNA結合特異性
EGR-1はDNA配列5'-GCG TGG GCG-3'（および5'-GCG GGG GCG-3'のような類似配列）に結合します。[12] [13] f1の位置6は5' G（左から数えて最初の塩基）に結合します。f1の位置3は2番目の塩基（C）に結合します。f1の位置-1は3番目の位置（G）に結合します。f2の位置6は4番目の塩基（T）に結合します。
インタラクション
EGR-1 は以下と相互作用することが示されています:
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000120738 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000038418 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: EGR1 初期成長応答 1」。
- ^ Knapska E, Kaczmarek L (2004 年 11 月). 「哺乳類の脳における神経可塑性の遺伝子: Zif268/Egr-1/NGFI-A/Krox-24/TIS8/ZENK?」. Progress in Neurobiology . 74 (4): 183–211. doi :10.1016/j.pneurobio.2004.05.007. PMID 15556287. S2CID 39251786.
- ^ Sun Z, Xu X, He J, Murray A, Sun MA, Wei X, Wang X, McCoig E, Xie E, Jiang X, Li L, Zhu J, Chen J, Morozov A, Pickrell AM, Theus MH, Xie H. EGR1 は TET1 をリクルートして、発達中および神経活動時に脳のメチロームを形成します。Nat Commun. 2019 年 8 月 29 日;10(1):3892. doi: 10.1038/s41467-019-11905-3. PMID 31467272
- ^ Petersohn D, Thiel G (1996 年 8 月). 「ヒトシナプトブレビン II 遺伝子の転写調節におけるジンクフィンガータンパク質 Sp1 および zif268/egr-1 の役割」. European Journal of Biochemistry . 239 (3): 827–34. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0827u.x . PMID 8774732.
- ^ Bhattacharyya S、Wu M、Fang F 、 Tourtellotte W、Feghali-Bostwick C、Varga J (2011 年 5 月)。「早期成長応答転写因子: 線維症の重要なメディエーターと抗線維症治療の新たなターゲット」。Matrix Biology。30 ( 4 ) : 235–42。doi : 10.1016 /j.matbio.2011.03.005。PMC 3135176。PMID 21511034。
- ^ Han P, Guerrero-Netro H, Estienne A, Cao B, Price CA (2017年10月). 「ウシ顆粒膜細胞における早期成長反応1の調節と作用」.生殖. 154 (4): 547–557. doi : 10.1530/REP-17-0243 . PMID 28733346.
- ^ Pavletich NP、Pabo CO (1991 年 5 月)。「亜鉛フィンガー DNA 認識: 2.1 A における Zif268-DNA 複合体の結晶構造」。Science . 252 ( 5007 ): 809–17。doi : 10.1126/science.2028256。PMID 2028256。S2CID 38000717 。
- ^ Christy B, Nathans D (1989年11月). 「成長因子誘導性タンパク質Zif268のDNA結合部位」.米国科学アカデミー紀要. 86 (22): 8737–41. Bibcode :1989PNAS...86.8737C. doi : 10.1073/pnas.86.22.8737 . PMC 298363. PMID 2510170 .
- ^ Swirnoff AH、 Milbrandt J (1995年4月)。「NGFI-Aおよび関連するジンクフィンガー転写因子のDNA結合特異性」。分子細胞生物学。15 (4):2275–87。doi : 10.1128/ mcb.15.4.2275。PMC 230455。PMID 7891721 。
- ^ Zhang F, Lin M, Abidi P, Thiel G, Liu J (2003 年 11 月). 「Egr1 と c/EBPbeta の特異的相互作用がヒト低密度リポタンパク質受容体遺伝子の転写活性化につながる」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (45): 44246–54. doi : 10.1074/jbc.M305564200 . PMID 12947119.
- ^ ab Silverman ES、Du J、Williams AJ、Wadgaonkar R、Drazen JM、Collins T (1998 年 11 月)。「cAMP 応答エレメント結合タンパク質結合タンパク質 (CBP) と p300 は、早期成長応答因子 1 (Egr-1) の転写共活性化因子である」。The Biochemical Journal。336 ( Pt 1) ( 1): 183–9。doi :10.1042/bj3360183。PMC 1219856。PMID 9806899。
- ^ Russo MW、Sevetson BR、Milbrandt J (1995 年 7 月)。「NGFI-A および Krox20 を介した転写のリプレッサーである NAB1 の同定」。米国科学アカデミー紀要。92 (15): 6873–7。Bibcode :1995PNAS... 92.6873R。doi : 10.1073 / pnas.92.15.6873。PMC 41432。PMID 7624335 。
- ^ Liu J、Grogan L、Nau MM、Allegra CJ、Chu E、Wright JJ (2001 年 4 月)。「p53 と一次応答遺伝子 Egr-1 の物理的相互作用」。International Journal of Oncology。18 ( 4): 863–70。doi : 10.3892 /ijo.18.4.863。PMID 11251186 。
- ^ Bae MH、Jeong CH、Kim SH、Bae MK、Jeong JW、Ahn MY、他 (2002 年 10 月)。「プロテアソーム成分 C8 との関連による Egr-1 の調節」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research。1592 ( 2): 163–7。doi : 10.1016 /s0167-4889(02)00310-5。PMID 12379479。
さらに読む
- Heath RG (1975 年 3 月)。「脳の機能と行動。I. 精神病患者と実験動物における感情と感覚現象」。神経精神疾患ジャーナル。160 ( 3 ) : 159–75。doi : 10.1097 /00005053-197503000-00002。PMID 1090709。S2CID 23024944。
- Silverman ES、Collins T (1999 年 3 月)。「血管生物学における Egr-1 を介した遺伝子転写の経路」。アメリカ病理学ジャーナル。154 ( 3 ) : 665–70。doi : 10.1016 / S0002-9440 (10)65312-6。PMC 1866415。PMID 10079243。
- Adamson ED 、 Mercola D (2002)。「Egr1 転写因子: 前立腺腫瘍細胞の増殖と生存における複数の役割」。腫瘍生物学。23 (2): 93–102。doi : 10.1159 /000059711。PMID 12065847。S2CID 46795197。
- Blaschke F、Bruemmer D、Law RE (2004 年 8 月)。「Egr-1 は、動脈硬化症および再狭窄における主要な血管病原性転写因子です」。Reviews in Endocrine & Metabolic Disorders 5 ( 3): 249–54。doi : 10.1023 / B:REMD.0000032413.88756.ee。PMID 15211096。S2CID 11968305 。
- Abdulkadir SA (2005年11 月)。「前立腺腫瘍形成のメカニズム: 転写因子 Nkx3.1 およびEgr1の役割」。Annals of the New York Academy of Sciences。1059 ( 1 ) : 33–40。Bibcode :2005NYASA1059...33A。doi :10.1196 / annals.1339.018。PMID 16382041。S2CID 6774788。
- Khachigian LM (2006 年 2 月)。「心血管病理生物学における早期成長反応 1」。Circulation Research。98 ( 2 ) : 186–91。doi : 10.1161/01.RES.0000200177.53882.c3。PMID 16456111。