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| EC番号 | 3.4.22.69 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | BRENDAエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZyme ビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイク | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
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| ペプチダーゼ C30、コロナウイルスエンドペプチダーゼ | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | ペプチダーゼ_C30 | ||||||||
| パム | PF05409 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| プロサイト | PS51442 | ||||||||
| メロプス | C30 | ||||||||
| SCOP2 | d1q2wb1 / スコープ / SUPFAM | ||||||||
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3C様プロテアーゼ（3CL pro）または主要プロテアーゼ（M pro）は、正式にはC30エンドペプチダーゼまたは3-キモトリプシン様プロテアーゼとして知られており、[2]コロナウイルスで見られる主要なプロテアーゼです。コロナウイルスのポリタンパク質を11の保存された部位で切断します。システインプロテアーゼであり、 PAプロテアーゼ群の一員です。活性部位にシステイン-ヒスチジン触媒二分子を持ち、Gln- ( Ser / Ala / Gly )ペプチド結合を切断します。
酵素委員会は、このファミリーをSARS コロナウイルス主要プロテアーゼ( M pro ; EC 3.4.22.69)と呼んでいます。3CL プロテアーゼは、コロナウイルス非構造タンパク質5 (nsp5) に対応します。一般名の「3C」は、ピコルナウイルスに見られる相同プロテアーゼである3C プロテアーゼ(3C pro ) を指します。
関数
3C様プロテアーゼは、P1位のグルタミンとP1'位の小さなアミノ酸（セリン、アラニン、またはグリシン）との間のペプチド結合を触媒的に切断することができる。例えば、 SARSコロナウイルス3CLproは以下のペプチドを自己切断することができる：[3] [4] [5]
TSAVL Q - S GFRK-NH2とSGVTF Q - G KFKKは、SARS 3C様プロテアーゼの2つの自己切断部位に対応する2つのペプチドである。
このプロテアーゼはコロナウイルスレプリカーゼポリタンパク質（P0C6U8 ）の処理に重要である。これはコロナウイルスの主なプロテアーゼであり、非構造タンパク質5（nsp5）に対応する。[6]これはコロナウイルスポリタンパク質を11の保存された部位で切断する。3CLプロテアーゼは活性部位にシステイン-ヒスチジン触媒二量体を有する。 [4]システインの硫黄は求核剤として作用し、ヒスチジンのイミダゾール環は一般的な塩基として作用する。[7]
命名法
EC によって提供された別名には、3CLpro、3C 様プロテアーゼ、コロナウイルス 3C 様プロテアーゼ、Mpro、SARS 3C 様プロテアーゼ、SARS コロナウイルス 3CL プロテアーゼ、SARS コロナウイルス メインペプチダーゼ、SARS コロナウイルス メインプロテアーゼ、SARS-CoV 3CLpro 酵素、SARS-CoV メインプロテアーゼ、SARS-CoV Mpro、および重症急性呼吸器症候群コロナウイルス メインプロテアーゼがあります。
治療対象として
3CLproおよび相同3Cproを標的としたプロテアーゼ阻害剤が数多く開発されており、その中にはCLpro-1、GC376、ルピントリビル、ルフォトレルビル、PF-07321332、AG7404などがある。[11] [12] [13] [14] [1]静脈内投与のプロドラッグPF -07304814 （ルフォトレルビル）は2020年9月に臨床試験に入った。 [15]
臨床試験の後、2021年12月に、経口薬ニルマトレルビル（旧PF-07321332）が、ニルマトレルビル/リトナビル併用療法（ブランド名パクスロビド）の一部として、緊急使用許可（EUA）の下で市販されました。 [16] [17] 2023年5月、この薬は高リスクの成人に対してFDAの完全な承認を取得しましたが、12〜18歳の子供は引き続きEUAの対象でした。[18]
3C様プロテアーゼ阻害剤エンシトレルビルは、 2022年に日本でCOVID-19の治療薬として承認されました。[19] [20]
2022年には、2億3500万個の分子を対象とした超大規模な仮想スクリーニングキャンペーンにより、いくつかのコロナウイルスの主なプロテアーゼを標的とした新しい広域スペクトル阻害剤が特定されました。これは異例なことにペプチド模倣物ではありません。[21]
その他の3C(類似)プロテアーゼ
3C様プロテアーゼ（3C(L)pro）は、（+）ssRNAウイルスに広く見られます。それらはすべて、触媒ダイアドまたはトライアドを使用するキモトリプシン様フォールド（PAクラン）を持つシステインプロテアーゼです。それらは、基質特異性と阻害剤の有効性に関していくつかの一般的な類似点を共有しています。それらは、それらが見つかるウイルスのファミリーに対応して、配列の類似性によってサブファミリーに分類されます：[22]
- このエントリーはコロナウイルス3CLプロです。
- ピコルナウイルス科には、ピコルナウイルス3C pro ( EC 3.4.22.28; InterPro : IPR000199 ; MEROPS C03) があります。これは最も古くから研究されている科です。例としては、ポリオウイルスやライノウイルス(どちらもエンテロウイルス属のメンバー見られるものがあります。
- カリシウイルス科には 3CL pro ( InterPro : IPR001665 ; MEROPS C37) があります。例としては、ノーウォークウイルスに見られるものがあります。
追加のメンバーはポティウイルス科と非コロナウイルス科の ニドウイルス目から知られている。[23]
参照
- 3CLプロ1
- カルモフール
- COVID ムーンショット
- エブセレン
- EDP-235
- エガネリシブ
- GC376
- GRL-0617
- イスカルトレルビル
- MK-7845
- ニルマトレビル
- オルゴトレルビル
- レイ1216
- ルピントリビル
- SIM0417
- テアフラビンジガレート
- トロビル
- 180円
- テトラヒドロカンナブトール
参考文献
- ^ abc Dai W, Zhang B, Jiang XM, Su H, Li J, Zhao Y, et al. (2020年6月). 「SARS-CoV-2主要プロテアーゼを標的とした抗ウイルス薬候補の構造ベース設計」. Science . 368 (6497): 1331– 1335. Bibcode :2020Sci...368.1331D. doi : 10.1126/science.abb4489 . PMC 7179937. PMID 32321856 .
- ^ Ahmad B、Batool M、Ain QU、Kim MS、Choi S（2021年8月）。「分子動力学と結合自由エネルギーシミュレーションによるPF-07321332 SARS-CoV-2プロテアーゼ阻害剤の結合メカニズムの探究」。International Journal of Molecular Sciences。22（17）：9124。doi ： 10.3390 / ijms22179124。PMC 8430524。PMID 34502033。
- ^ Goetz DH、Choe Y、Hansell E、Chen YT、McDowell M、Jonsson CB、Roush WR、McKerrow J、Craik CS（2007年7月）。「SARSコロナウイルスの主要プロテアーゼに対する基質特異性プロファイリングと新しいクラスの阻害剤の同定」。生化学。46 （30 ）：8744–52。doi：10.1021/bi0621415。PMID 17605471 。
- ^ ab Fan K, Wei P, Feng Q, Chen S, Huang C, Ma L, Lai B, Pei J, Liu Y, Chen J, Lai L (2004 年 1 月). 「重症急性呼吸器症候群コロナウイルス 3C 様プロテアーゼの生合成、精製、基質特異性」. The Journal of Biological Chemistry . 279 (3): 1637– 42. doi : 10.1074/jbc.m310875200 . PMC 7980035. PMID 14561748 .
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ビリオン構造のセクションを参照してください。
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この記事には、パブリック ドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています。
- ^ 「Xocova（エンシトレルビルフマル酸）錠125mg、緊急薬事承認制度に基づき、日本でSARS-CoV-2感染症の治療薬として承認取得」塩野義製薬（プレスリリース）2022年11月22日。 2022年11月28日閲覧。
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- ^ Luttens A、Gullberg H、Abdurakhmanov E、Vo DD、Akaberi D、Talibov VO、et al. (2022年2月)。「超大規模仮想スクリーニングにより、コロナウイルスに対して広範囲の活性を持つSARS-CoV-2主要プロテアーゼ阻害剤が特定されました」。J Am Chem Soc . 144 (7): 2905– 2920. doi :10.1021/jacs.1c08402. ISSN 0002-7863. PMC 8848513 . PMID 35142215.
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- ^ Ziebuhr J、Bayer S、Cowley JA、Gorbalenya AE (2003 年 1 月)。 「無脊椎動物ニドウイルスの3C様プロテイナーゼは、コロナウイルスとポティウイルスの相同体を結びつける。」ウイルス学ジャーナル。77 (2): 1415–26 .土井: 10.1128/jvi.77.2.1415-1426.2003。PMC 140795。PMID 12502857。
さらに読む
- Chuck CP、Chow HF、Wan DC 、 Wong KB (2011 年 11 月 2 日)。「グループ 1、2a、2b、および 3 コロナウイルス由来の 3C 様プロテアーゼの基質特異性のプロファイリング」。PLOS ONE。6 ( 11 ): e27228。Bibcode : 2011PLoSO...627228C。doi : 10.1371 / journal.pone.0027228。PMC 3206940。PMID 22073294。
