検索エンジン
Expasyのクエリでは以下のことが可能です。
- 単一の検索でSIBデータベースを並列検索
- ポータルからアクセス可能な160を超えるリソースの完全なセットからの集約された検索結果。[ 1 ]
Expasyは、各リソースの最新リリースから最新の情報を提供します。
Expasyで使用される用語は、EDAMの包括的なオントロジーに基づいています。[ 2 ]
歴史
Expasyは1993年8月に設立されました。当初はExPASy(Expert Protein Analysis System )と呼ばれ、タンパク質配列と構造、および二次元ゲル電気泳動(2-D Page電気泳動)を解析するプロテオミクスサーバーとして機能しました。[ 3 ] ExPASyは、とりわけタンパク質配列知識ベースであるUniProtKB/Swiss-Protと、そのコンピュータ注釈付き補足資料であるUniProtKB/TrEMBLをホストしていました。[ 4 ]
ExPASyは生命科学分野初のウェブサイトであり、世界でも最初の150のウェブサイトの一つでした。2007年4月5日現在 ExPASyは1993年8月1日のインストール以来、10億回参照されている。[ 5 ]
2011年6月、SIBグループによって開発されたバイオインフォマティクスリソースの多様なカタログであるSIB ExPASyバイオインフォマティクスリソースポータルになりました。[ 6 ] Expasyの現在のバージョンは2020年10月にリリースされました。[ 7 ] [ 8 ]
注釈と参考文献
- ↑ 「SIBリソース」 . sib.swiss . 2020年10月27日取得。
- ↑ Ison J 、Kalas M 、Jonassen I、Bolser D、Uludag M、McWilliam H、et al. (2013 年 5 月)。「 EDAM : バイオインフォマティクス操作、データの種類と識別子、トピックとフォーマットのオントロジー」。Bioinformatics。29 ( 10 ): 1325–32。doi : 10.1093 /bioinformatics/ btt113。PMC 3654706。PMID 23479348。
- ↑ Gasteiger E、Gattiker A、Hoogland C、Ivanyi I、Appel RD、Bairoch A (2003年7月)。「ExPASy:詳細なタンパク質知識と分析のためのプロテオミクスサーバー」。Nucleic Acids Research。31 ( 13): 3784–8。doi : 10.1093 / nar / gkg563。PMC 168970。PMID 12824418。
- ↑ "UniProtKB/Swiss-Prot - SIB スイスバイオインフォマティクス研究所 | Expasy" . www.expasy.org . 2024年3月15日取得.
- ↑ ExPASy: SIBバイオインフォマティクスリソースポータル
- ↑ Artimo P、Jonnalageda M、Arnold K、Baratin D、Csardi G、de Castro E、他。 (2012 年 7 月)。「ExPASy: SIB バイオインフォマティクス リソース ポータル」。核酸研究。40 (Web サーバーの問題): W597-603。土井:10.1093/nar/gks400。PMC 3394269。PMID 22661580。
- ↑デュヴォー、セヴリーヌ。ガベラ、キアラ。リサチェク、フレデリック。ストッキンガー、ハインツ。ヨアニディス、ヴァシリオス。クリスティーン・デュリンクス(2021年4月13日)。「Expasy、ユーザーによって設計されたスイスのバイオインフォマティクス リソース ポータル」核酸研究。49 (W1):W216~ W227。土井:10.1093/nar/gkab225。ISSN 0305-1048。PMC 8265094。PMID 33849055。
- ↑ 「新しいExpasy.org、スイスバイオインフォマティクスリソースポータルをご覧ください」。sib.swiss。2020年10月26日取得。