ビタミンD受容体

仮想化
利用可能な構造
電子データ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1DB1、1IE8、1IE9、1KB2、1KB4、1KB6、1S0Z、1S19、1TXI、1YNW、2HAM、2HAR、2HAS、2HB7、2HB8、3A2I、3A2J、3A3Z、3A40、3A78、3AUQ、 3AUR、3AX8、3AZ1、3AZ2、3AZ3、3B0T、3CS4、3CS6、3KPZ、3M7R、3OGT、3P8X、3TKC、3VHW、4G2I、3W0A、3W0C、3W0Y、3WGP、3WWR、4ITE、4ITF、 4PA2、3X31、 3X36、4FHH、4FHI、2HBH
識別子
エイリアス	VDR、NR1I1、PPP1R163、ビタミンD（1,25-ジヒドロキシビタミンD3）受容体、ビタミンD受容体
外部ID	オミム：601769; MGI : 103076;ホモロジーン: 37297;ジーンカード：VDR; OMA :VDR - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体12（ヒト）
終わり	47,943,048 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	15番染色体（マウス）
終わり	97,808,511 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	脛骨; ; 毛包; ; 小腸粘膜; ; 結腸粘膜; ; S状結腸粘膜; ; 十二指腸; ; 回腸粘膜; ; 腕の皮膚; ; 横行結腸粘膜; ; 歯周繊維;
	トップの表現
	十二指腸; ; リップ; ; 大腸; ; 右腎臓; ; 結腸; ; 小腸のリーベルキューン陰窩; ; 左結腸; ; パネートセル; ; 小腸; ; ランゲルハンス島;
	参照表現データの詳細
	; ; ; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	リトコール酸結合; 配列特異的DNA結合; DNA結合; リトコール酸受容体活性; 核受容体活性; ステロイドホルモン受容体活性; タンパク質結合; DNA結合転写因子活性; 亜鉛イオン結合; 金属イオン結合; ビタミンD応答要素結合; レチノイドX受容体結合; カルシトリオール結合; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的; 転写シス調節領域結合; RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合; ビタミンD結合; 転写因子結合; 核受容体コアクチベーター活性; シグナル伝達受容体の活性;
細胞成分	核; 核質; 受容体複合体; RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体; 細胞質;
生物学的プロセス	細胞集団増殖の負の調節; 乳腺退縮に関わるアポトーシス過程の正の調節; ケラチノサイト分化の正の調節; カルシジオール1-モノオキシゲナーゼ活性の調節; 腸管吸収; カルシウムイオン輸送; ステロイドホルモンを介したシグナル伝達経路; 転写の調節、DNAテンプレート; 授乳; 胆汁酸シグナル伝達経路; 動物の器官の形態形成; 細胞形態形成; 骨格系の発達; 遺伝子発現の正の調節; RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御; 多細胞生物の発達; ケラチノサイト増殖の抑制; 脱落膜化; RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御; 転写の負の調節、DNAテンプレート; RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始; ビタミンD 24-ヒドロキシラーゼ活性の正の調節; 妊娠に関与する乳腺の分岐; シグナル伝達; 細胞カルシウムイオン恒常性; 転写、DNAテンプレート; ビタミンD受容体シグナル伝達経路; ビタミンDの代謝プロセス; 細胞分化; 細胞内受容体シグナル伝達経路;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	7421
	22337
	ENSG00000111424
	ENSMUSG00000022479
	P11473
	P48281
NM_000376 ; NM_001017535 ; NM_001017536 ; NM_001364085 ; NM_001374661;
	NM_001374662
	NM_009504
NP_000367 ; NP_001017535 ; NP_001017536 ; NP_001351014 ; NP_001361590;
	NP_001361591
	NP_033530
	ウィキデータ
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ビタミンD 受容体( VDR 、カルシトリオール受容体としても知られる) は、転写因子の核受容体ファミリーのメンバーです。^[5]カルシトリオール(ビタミン Dの活性型、1,25-(OH) ₂ビタミン D ₃ ) は VDR に結合し、レチノイド X 受容体とヘテロ二量体を形成します。その後、VDR ヘテロ二量体は核に入り、ゲノムDNA内のビタミン D 応答要素( VDRE )に結合します。VDR 結合により、多くの特定の遺伝子産物が発現または転写抑制されます。VDR は、マイクロ RNAを介した転写後メカニズムにも関与しています。 ^[6]ヒトでは、ビタミン D 受容体は染色体 12q 13.11に位置するVDR遺伝子によってコードされています。^[7]

VDRは体のほとんどの組織で発現しており、腸管や腎臓でのカルシウムやその他のミネラルの輸送に関与する遺伝子の転写を制御します。 ^[8] グルココルチコイドはVDRの発現を低下させます。^[8] 多くの種類の免疫細胞もVDRを発現しています。^[9]

関数

VDR遺伝子はビタミンDの核ホルモン受容体をコードしている。最も強力な天然アゴニストはカルシトリオール（1,25-ジヒドロキシコレカルシフェロール）であり、ビタミンD ₂の相同体であるエルカルシトリオール（1-α,25-ジヒドロエルゴカルシフェロール）も強力な活性化剤である。他の形態のビタミンDは、二次胆汁酸リトコール酸と同様に、より低い親和性で結合する。この受容体はトランスアクティング転写調節因子のファミリーに属し、ステロイドおよび甲状腺ホルモン受容体と配列の類似性を示す。^[10]

この核ホルモン受容体の下流ターゲットには、ミネラル代謝に関与する多くの遺伝子が含まれます。^[8]この受容体は、免疫応答や癌に関与する経路など、さまざまな他の代謝経路を制御します。^[9] ビタミンDの作用を強化し、エイズ進行率と直接相関するVDR変異体と、エイズ進行とのVDRの関連は、相加モデルに従います。^[11] FokI多型は、メタ分析で明らかにされたように、エンベロープウイルス感染の危険因子です。^[12] この遺伝子の重要性は、自然な老化プロセスでも注目されており、遺伝子の3'UTRハプロタイプは長寿との関連を示しています。^[13]

臨床的関連性

この遺伝子の変異は、II型ビタミンD抵抗性くる病と関連している。開始コドンの一塩基多型により、3コドン下流に代替翻訳開始部位が生じる。選択的スプライシングにより、同じタンパク質をコードする複数の転写変異体が生じる。^[14] VDR遺伝子変異は、骨粗鬆症に関連するものを含む多くの生物学的エンドポイントに影響を与えると思われる^[15]

ビタミンD受容体は毛周期の調節に重要な役割を果たしている。実験動物では、VDRの喪失が脱毛と関連している。^[16]実験的研究では、非結合型VDRがcWnt（wntシグナル伝達経路）およびソニックヘッジホッグ標的遺伝子の調節領域と相互作用し、出生後の毛周期中にこれらの経路の誘導に必要であることが示された。^[17]これらの研究により、非結合型VDRが形態形成後の毛周期を調節する新たな作用が明らかになった。

研究者たちは、HIV-1感染感受性や進行、自然な老化プロセスなど、さまざまな疾患や正常な表現型におけるVDR多型の役割を解明することに力を注いできました。最も注目すべき発見としては、ビタミンDの作用を強化し、エイズ進行率と直接相関するVDR変異体の報告、エイズ進行とのVDRの関連は加法モデルに従うこと^[11]、およびメタ分析で明らかにされたエンベロープウイルス感染の危険因子としてのFokI多型の役割などがあります。^[12]

インタラクション

ビタミン D 受容体は、転写活性化に影響を与える他の多くの因子と相互作用することが示されています。

バッグ1 , ^[18]
CAV3、^[19]
MED12、^[20]
MED24 , ^[20]
NCOR1 , ^[21]
NCOR2、^[21]^[22]
NCOA2 ^[23]^[24]^[25]
RXRA、^[24]^[26]
RUNX1 , ^[22]
RUNX1T1、^[22]
SNW1、^[24]^[26]
STAT1、^[27]および
ZBTB16 . ^[22]^[28]

インタラクティブな経路マップ

下記の遺伝子、タンパク質、代謝物をクリックすると、それぞれの記事にリンクします。 ^{[§ 1]}

^ インタラクティブなパスウェイマップは、WikiPathways: "VitaminDSynthesis_WP1531" で編集できます。

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さらに読む

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外部リンク

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ビタミン D 受容体: 今月の分子 2015-10-16 にWayback Machineでアーカイブ
IUPHAR: ビタミンD受容体
PDBe-KBの UniProt : P11473 (ビタミン D3 受容体)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。

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