ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| SNW1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SNW1、Bx42、NCOA-62、PRPF45、Prp45、SKIIP、SKIP、SNWドメインを含む1、SKIP1、FUN20 |
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| 外部ID | オミム:603055; MGI : 1913604;ホモロジーン: 56557;ジーンカード:SNW1; OMA :SNW1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 12番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 12|12 D2 | 始める | 87,495,845 bp [2] |
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| 終わり | 87,519,044 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 鼻咽頭上皮
- 耳下腺
- アキレス腱
- 羊水
- 壁側胸膜
- 上腕二頭筋の腱
- 胚上皮
- 海綿骨
- 脛骨
- 大静脈
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| | トップの表現 | - 腎小体
- 脈絡叢上皮
- 網膜色素上皮
- 髄質集合管
- 尿管
- 運動ニューロン
- 上顎突出
- 原始的な線
- 心室帯
- 性器結節
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 転写コリプレッサー活性
- 転写活性化因子活性
- ノッチバインディング
- タンパク質結合
- レチノイン酸受容体結合
- SMADバインディング
- ビタミンD受容体結合
- RNA結合
- 酵素結合
- アンドロゲン受容体結合
| | 細胞成分 |
- 触媒ステップ 2 スプライソソーム
- 核マトリックス
- 核質
- サイクリン/CDK陽性転写伸長因子複合体
- スプライソソーム複合体
- 核
- 核体
- mRNA放出後のスプライソソーム複合体
- 核の粒
- U2型触媒ステップ2スプライソソーム
| | 生物学的プロセス |
- ノッチシグナル伝達経路
- レチノイン酸に対する細胞反応
- トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路の正の調節
- p53クラスメディエーターによるDNA損傷に対する内因性アポトーシスシグナル伝達経路
- 転写の調節、DNAテンプレート
- スプライソソームを介したmRNAスプライシングの正の調節
- レチノイン酸受容体シグナル伝達経路の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- mRNA処理
- ビタミンD受容体シグナル伝達経路の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 神経新生の積極的な制御
- レチノイン酸受容体シグナル伝達経路
- ヒストンH3-K4メチル化の正の制御
- RNAスプライシング
- ビタミンD受容体シグナル伝達経路の正の調節
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始
- ウイルスプロセス
- 転写の負の調節、DNAテンプレート
- ウイルス転写の宿主による正の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- 転写、DNAテンプレート
- スプライソソームを介したmRNAスプライシング
- 第二のエステル交換反応段階のための触媒スプライソソームの生成
- Notch受容体標的の転写の正の制御
- Notchシグナル伝達経路の正の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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SNWドメイン含有タンパク質1は、ヒトではSNW1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
この遺伝子はSNW遺伝子ファミリーのメンバーであり、いくつかのPol IIプロモーターからの転写を促進するコアクチベーターをコードしています。このコアクチベーターはビタミンD受容体のリガンド結合ドメインおよびレチノイド受容体に結合して、ビタミンD、レチノイン酸、エストロゲン、およびグルココルチコイドを介した遺伝子発現を促進します。また、ポリ(A)結合タンパク質2と相互作用してスプライシング因子として機能し、筋肉特異的遺伝子の発現を転写レベルで直接制御します。最後に、このタンパク質は、形質転換活性に必要なSKIオンコタンパク質の領域と相互作用するため、腫瘍形成に関与している可能性があります。[7]
インタラクション
SNW1 は以下と相互作用することが示されています:
参考文献
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- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000021039 – Ensembl、2017 年 5 月
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さらに読む
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