トーマス・キャバリエ・スミス

トーマス・キャバリエ・スミス
生まれる	( 1942-10-21 )1942年10月21日 ロンドン、イギリス
死亡	2021年3月19日(2021-03-19)（享年78歳）
国籍	イギリス
母校	ケンブリッジ大学ゴンヴィル・アンド・キース・カレッジ、 ロンドン大学キングス・カレッジ
知られている	キャバリエ・スミスの生物分類システム
受賞歴	王立協会会員（1998年） 国際生物学賞（2004年） リンネ賞（2007年） フリンク賞（2007年）
科学者としてのキャリア
フィールド	動物学
機関	キングス・カレッジ・ロンドン、ブリティッシュ・コロンビア大学、オックスフォード大学
論文	クラミドモナス における細胞小器官の発達(1967)
Webサイト	www.zoo.ox.ac.uk/people/view/cavaliersmith_t.htm

トーマス（トム）・キャバリエ＝スミス、FRS、FRSC、NERC教授フェロー（1942年10月21日 - 2021年3月19日^{[1] ）は、}オックスフォード大学動物学部の進化生物学の教授であった。^[2]

彼の研究は、数多くの単細胞生物（原生生物）の発見につながり、クロミスタ、クロマルベオラータ、オピストコンタ、リザリア、エクスカヴァータなど、さまざまな主要な分類群を提唱しました。彼は、すべての生物の分類体系を確立したことで知られています。

キャバリエ・スミスは1942年10月21日にロンドンで生まれた。両親はメアリー・モード（旧姓ブラット）とアラン・ヘイルズ・スペンサー・キャバリエ・スミスであった。^[3]

彼はノーウィッチ校、ケンブリッジ大学ゴンヴィル・アンド・キーズ・カレッジ（生物学修士）、ロンドン大学キングス・カレッジ（動物学博士）で教育を受けた。1964年から1967年にかけて、博士論文はジョン・ランドール卿の指導を受け、その論文の題名は「クラミドモナス・ラインハルディの細胞小器官発達」であった。^[4]

1967年から1969年まで、キャバリエ＝スミスはロックフェラー大学の客員研究員を務めた。 1969年にロンドン大学キングス・カレッジの生物物理学の講師となり、1982年に講師に昇進した。1980年代初頭から、スミスは生物間の分類上の関係についての見解を推進した。彼は多作で、ほぼ比類のない豊富な情報から新しい関係を提案した。1989年にブリティッシュコロンビア大学の植物学教授に任命された。1999年にオックスフォード大学に加わり、2000年に進化生物学の教授となった。^[5]

トーマス・キャバリエ・スミスは癌の発症により2021年3月に亡くなった。

キャバリエ＝スミスは多作な分類学者で、比類のないほど豊富な情報から新しい関係を提案した。彼の提案は分類学の概念や分類に翻訳され、新しい名前を関連付けたり、場合によっては古い名前を再利用したりした。キャバリエ＝スミスは明確な分類哲学に従ったり支持したりはしなかったが、彼のアプローチは進化分類学に最も近いものだった。彼と他の数人の同僚は、分岐論的アプローチによる分類に反対し、分岐と分類の目標は異なると主張した。^[6]彼のアプローチは、他の多くの人々の原生生物に対する幅広い扱いと似ていた。^{[7] [8]}

キャバリエ＝スミスの分類学的命題の範囲は広大であったが、構成要素（分類群）の数と構成、そしてしばしばそれらの関係は安定していなかった。命題はしばしば曖昧で短命であった。彼は頻繁に分類群を修正したが、名前は変えなかった。彼のアプローチは普遍的に受け入れられたわけではなかった。他の人たちは、変形分岐論の哲学に従って、原子化された反証可能な命題の入れ子構造で原生生物の分類学を支えようとした。^[9]しかし、このアプローチはもはや擁護できるとは考えられていない。^[10]

分類構造を導いたキャバリエ・スミスのアイデアは、通常、最初は表や複雑な注釈付きの図表の形で発表されました。科学会議で発表されたときには、アイデアが簡単に理解できないほど内容が豊富すぎることがあり、また、多くの場合、内容が小さすぎました。そのような図表の一部は出版物に掲載され、そこでは慎重な精査が可能になり、一部の主張の推測的な性質が明らかになりました。キャバリエ・スミスのアイデアの豊かさ、その継続的な進化、そして分類学への移行が、進化の道筋 (系統発生) とその結果の分類に関するキャバリエ・スミスの調査に独特の特徴を与えました。

キャバリエ＝スミスは、チャールズ・ダーウィンに特徴づけられた物語に頼る初期の伝統主義的スタイルを勇敢に守り通した。その一例は、このグループがクレードに相当するという明確な証拠があるにもかかわらず、クロロフィル a と c を持つプラスチドを持つ系統 (主にクリソファイトとその他のストラメノパイル、クリプトファイト、ハプトファイト) を統合したクロミスタの擁護である。

キャバリエ＝スミスは、3 つのグループの共通の祖先がクロロフィル ac を含むプラスチドを獲得した単一の共生イベントがあり、グループ間の相違 (細胞学的構成要素とその配置など) はその後の進化の変化の結果であると主張しました。クロミストが単系統であるというこの解釈には、3 つのグループすべての従属栄養 (原生動物) メンバーがプラスチドを持つ祖先から発生したことも必要でした。

代替仮説は、3つの色素植物の系統は（他の系統を除いて）密接に関連しておらず（つまり多系統であり）、おそらくすべて祖先にはプラスチドがなく、別々の共生イベントによってクロロフィルa/cプラスチドのストラメノパイル、クリプトモナド、ハプト植物が確立されたというものでした。色素植物の多系統性は、その後の研究で再主張されました。^[11]

キャバリエ・スミスは、進化の洞察を分類群や階層構造に翻訳する客観的で再現可能な方法論を欠いていたため、彼の出版物を注意深く追っていない人たちはしばしば混乱した。以下に示すように、彼の分類群の多くは頻繁な調整を必要とした。その結果、分類名が適用される分類群の範囲に関して混乱が生じた。

キャバリエ・スミスはまた、革新的な分類概念によく知られた名前（原生動物など）を再利用しました。原生動物は、新しい意味での使用と並行して、古い意味でも現在でも使用されているため、混乱が生じました^。キャバリエ・スミスは出版を急いでおり、物語や分類の概要を頻繁に変更する傾向があったため、彼のアプローチや主張は頻繁に議論されました。

Palaeos.comは彼の執筆スタイルを次のように説明しています。

オックスフォード大学のキャバリエ・スミス教授は、高く評価されている膨大な研究成果を著している。しかし、彼は、説明するのが少々難しい意味で物議を醸している。その問題は、文体の問題なのかもしれない。キャバリエ・スミス教授は、他の人が平叙文を使うところで断言し、他の人が意見を述べるところで平叙文を使い、天使でさえ踏み込むことを恐れるようなところで意見を述べる傾向がある。さらに、彼は傲慢で、反動的で、ひねくれているようにさえ聞こえる。その一方で、彼は、他の皆が間違っているときに正しいことを言い続けてきた長い経歴がある。我々の考え方では、これらすべては、彼が細部に取り組むという、比類のない美徳によって影を潜めている。このため、論文は非常に長く、非常に複雑になり、彼の幼少期の見解を説明しようとする人たちの間で、あらゆる種類の暗いつぶやき、髪の毛をむしり、歯ぎしりを引き起こす。例えば、Zrzavý（2001）^[13] [および] Patterson（1999）^{[14] [ 15] [16]}を参照。 それにもかかわらず、彼は関連する事実をすべて扱っています。^[17]

キャバリエ＝スミスは、あらゆる生命体、特に原生生物の分類学と分類法について広範囲に渡って著作を残した。生物学に対する彼の主要な貢献の 1 つは、新しい生命界であるクロミスタを提唱したことであるが、この界が単系統であるとは広く認められていない (上記参照)。

彼はまた、 Chromalveolata (1981)、Opisthokonta (1987)、Rhizaria (2002)、Excavata (2002)など、真核生物の新しい分類群を導入しました。彼の主張はよく知られていますが、多くの議論を呼んでおり、科学界で広く受け入れられていません。彼の分類の改訂は、すべての生命体の全体的な分類に影響を与えることが多かったです。

キャバリエ＝スミスの最初の主要な分類システムは、すべての生物を8つの界に分けるというものだった。1981年、彼はロバート・ウィテカーの五界システムを完全に改訂し、細菌界、真菌界、繊毛菌界、動物界、胆植物界、緑色植物界、隠蔽植物界、およびミドリムシ界の8つの界が存在すると提案した。^[18]

1983年、彼は特に古細菌が細菌とは別のグループであるという証拠が増えてきたことを踏まえて、体系を改訂し^[19]、1981年の扱いから除外した一連の系統を含め、多系統の問題に対処し、関係性に関する新しいアイデアを推進した。さらに、ミトコンドリアを欠く原生生物がいくつか発見された。^{[20]ミトコンドリアは}プロテオバクテリアの共生の結果であることが知られていたため、これらのミトコンドリアを持たない真核生物は原始的なものであり、真核生物発生における重要なステップを示していると考えられた。その結果、これらのミトコンドリアを持たない原生生物は、原始人亜界アーキゾアとして特別な地位を与えられ、彼は後にこれを界に昇格させた。^{[20]これは後に}アーキゾア仮説と呼ばれるようになった。^[21] 1993年には、8つの界は真正細菌界、古細菌界、古生動物界、原生動物界、色素動物界、植物界、菌類、動物界となりました。^[22]

アーキゾア界は、多系統性と側系統性の証拠により、放棄される前に多くの構成変化を経た。^{[23] [24]彼は}アーキゾア界の以前のメンバーの一部をアメーボゾア門に分類した。^[25]

1998年までに、キャバリエ＝スミスは、界を8つから6つに減らしました。動物界、原生動物界、菌類、植物界（灰色藻、紅藻、緑藻を含む）、褐色動物界、細菌界です。^{[26]しかし、彼はすでに1981年の論文[18]}でこの簡略化された体系を初めて提示し、1983年にそれを承認していました。^[27]

キャバリエ＝スミスの界のうち 5 つは、次の図に示すように 真核生物として分類されます。

• 真正細菌
• ネオムラ
  • 古細菌
  • 真核生物
    • 原生動物界
    • ユニコント（従属栄養生物）
      • 動物界
      • 菌類界
    • ビコント類（主に光合成を行う）
      • 植物界（紅藻類および緑藻類を含む）
      • クロミスタ王国

動物界は、放射状動物門（海綿動物門、刺胞動物門、板動物門、有櫛動物門）、粘液動物門、中生動物門、左右相称動物門（その他の動物門）の 4 つの亜界に分かれています。

彼は3つの新しい動物門を創設した：鰓顎動物門（ワムシ、棘頭動物、腹足類、顎口動物）、腕足動物門（腕足動物と鱗脚類）、葉足動物門（鰓爪動物とクマムシ類）で、合計23の動物門を認定した。^[26]

キャバリエ・スミスの2003年の分類体系: ^[28]

• ユニコンツ
  • 原生動物門アメーボゾア（祖先的に単毛動物）
  • オピストコント
    • 単糸状原生動物門チョアノゾア
    • 菌類界
    • 動物界
• ビコンツ
  • 原生動物のインフラ界リザリア
    • ケルコゾア門
    • レタリア門(放射性動物および有孔虫)
  • 原生動物界Excavata
    • ルコゾア門
    • メタモナダ門
    • ユーグレノゾア門
    • ペルコロゾア門
  • 原生動物門無動物門(テコモナデアおよびディフィレイダ)
  • クロムアルベオレートクレード
    • クロミスタ界（隠遁動物門、異角動物門、ハプト植物門）
    • 原虫インフラ界Alveolata
      • 繊毛虫門
      • ミオゾア門(プロタルベオラタ門、恐竜門、およびアピコンプレックス門)
  • 植物界(ウイルス科、紅色植物門、緑色植物門)

キャバリエ・スミスと彼の共同研究者は2015年に分類を改訂し、PLOS ONEに発表した。この体系では、原核生物を細菌界（以前は「真正細菌」）と古細菌界（以前は「古細菌」）の2つの界に分けるという区分を再導入した。これは、細菌と古細菌の分類学的概要（TOBA）と生命カタログにおけるコンセンサスに基づいている。^[29]

2006年、キャバリエ・スミスは、すべての生命の最後の普遍的な共通祖先は、2つの膜を持つ非鞭毛性の グラム陰性細菌（「ネギバクテリウム」）（別名ディデルム細菌）であると提唱した。^[30]

キャバリエ＝スミスは、 1980年にロンドン・リンネ協会（FLS）、 1983年に生物学研究所（FIBiol）、 1987年に王立芸術協会（FRSA）、 1988年にカナダ高等研究機構（CIFAR）、 1997年にカナダ王立協会（FRSC）、1998年にロンドン王立協会（FRS）の会員に選出された^。[31]

2004年に天皇から国際生物学賞、2007年にリンネ動物学賞を受​​賞。1998年から2007年までカナダ高等研究研究所（CIFAR）フェロー、CIFARの統合微生物多様性顧問に任命された。^[32] 2007年にはロンドン動物学会のフリンク賞を受賞した。^[5]

Wikispeciesには、Thomas Cavalier-Smithに関する情報があります。

• 「T. Cavalier-Smith」。動物学（学部ウェブページ）。オックスフォード大学。2008年5月1日時点のオリジナルよりアーカイブ。

• 「T. Cavalier-Smith」に関する学術的参考文献 – Google Scholar 経由。

• 「トーマス・キャバリエ＝スミス」（伝記）。英国ロンドン：王立協会。