自閉症の遺伝性

自閉症の遺伝率は、遺伝的変異によって説明できる自閉症の発現の違いの割合です。遺伝率が高い場合、その症状は主に遺伝的であると考えられます。自閉症には強力な遺伝的根拠があります。自閉症の遺伝学は複雑ですが、自閉症スペクトラム障害（ASD）は、大きな影響を及ぼすまれな突然変異よりも、多重遺伝子の影響によって説明されることが多いです。^{[1] [2]}

自閉症は遺伝的要素が強いことが知られており、研究では一貫して兄弟や自閉症の病歴がある家族で発症率が高いことが示されています。このことから、研究者は遺伝が自閉症の発症にどの程度寄与しているかを調査することになりました。双子研究や家族研究を含む多数の研究で、自閉症の遺伝率は約 80 ～ 90% と推定されており、^[3]遺伝的要因が病因に大きく関与していることを示しています。遺伝率の推定値は、自閉症が遺伝のみによって決定されることを意味するものではなく、環境要因もこの障害の発症に寄与しています。^[4]

1977年から1995年にかけて行われた双子の研究では、自閉症の遺伝率は90％以上と推定された。言い換えれば、自閉症者と非自閉症者の違いの90％は遺伝的影響によるものである。^[5]一卵性双生児の片方だけが自閉症の場合、もう一方は学習障害や社会性障害を抱えていることが多い。^{[6]成人した兄弟の場合、}広義の自閉症表現型の1つ以上の特徴を持つ可能性は30％にも達し、^[7]対照群の可能性よりもはるかに高い。^[8]

遺伝子連鎖解析は決定的ではないが、 ^[11]多くの関連解析により、自閉症に関連する遺伝子変異が発見されている。 ^[12]自閉症の個人ごとに、多くの遺伝子の変異が関係しているのが典型的である。異なる遺伝子セットの変異は、異なる自閉症の個人に関係している可能性がある。複数の遺伝子の変異間、または環境と変異遺伝子の間には、有意な相互作用がある可能性がある。家族研究で自閉症とともに受け継がれる遺伝子マーカーを特定することにより、多数の候補遺伝子が特定されており、そのほとんどは神経の発達と機能に関与するタンパク質をコードしている。^{[13] [14]}しかし、候補遺伝子のほとんどについて、自閉症の可能性を高める実際の変異は特定されていない。通常、自閉症は、メンデル遺伝（単一遺伝子）変異、または脆弱X症候群や22q13欠失症候群などの単一染色体異常にまで遡ることはできない。^{[15] [16]}

自閉症の10～15％は、単一遺伝子疾患またはコピー数多型（CNV）（減数分裂中に遺伝物質が自然に変化して遺伝物質が削除または複製される）に起因する可能性がある。 ^{[17] [18] [19]}これらは、より一般的な特発性自閉症とは対照的に、症候群性自閉症を引き起こすことがある。^{[20] [21]散発性（非遺伝性）症例は、自閉症に関与する候補}遺伝子座を特定するために調査されてきた。自閉症のかなりの割合は、遺伝性は高いが遺伝しない可能性がある。つまり、自閉症を引き起こす突然変異は、親のゲノムには存在しない。^[22]

アレイ比較ゲノムハイブリダイゼーション（CGH）の解像度が向上するにつれて、遺伝的原因に起因する自閉症の割合が30～40％に増加する可能性があるが、 ^[22]この分野のいくつかの結果は不注意に説明されており、自閉症の大部分はCNVによって引き起こされ、アレイCGHで検出可能である、またはCNVを検出することは遺伝子診断に等しいと一般の人々を誤解させている可能性がある。^[23]自閉症ゲノムプロジェクトのデータベースには、自閉症と遺伝子座を結び付ける遺伝連鎖とCNVデータが含まれており、すべてのヒト染色体が関与している可能性があることを示唆している。^[24]自閉症自体の診断ではなく、自閉症関連のサブ表現型を使用する方が、感受性遺伝子座の特定に有用である可能性がある。^[25]

双子研究は、自閉症スペクトラム障害（ASD）に対する遺伝的および環境的影響を調査するユニークな機会を提供します。同一の DNA を共有する一卵性双生児と、DNA の約半分を共有する二卵性双生児を研究することにより、研究者は、一卵性双生児と二卵性双生児で、片方の双生児が自閉症と診断され、もう片方がそうでない場合の割合を比較して、自閉症の遺伝率を推定できます。双子研究は、疾患や一般的な人間の特性の遺伝率を判断するのに役立つツールです。双子研究には、一卵性双生児（一卵性または MZ）と二卵性双生児（二卵性または DZ）の特徴の一致を判断することが含まれます。双子研究で起こり得る問題は、（1）一卵性の診断における誤り、および（2）DZ 双生児が共有する社会的環境が MZ 双生児のそれと同等であるという仮定です。

遺伝的関与なしに環境によって引き起こされる症状の場合、MZ 双生児の一致率は DZ 双生児の一致率と等しくなります。対照的に、完全に遺伝的起源の症状の場合、理論的には MZ ペアの一致率は 100% になりますが、DZ ペアの場合は、関与する遺伝子の数や同類交配などの要因に応じて、通常はそれよりずっと低くなります。

遺伝的影響がほとんどないと思われる疾患の例としては、過敏性腸症候群（IBS）が挙げられ、MZペアとDZペアの一致率はそれぞれ28％と27％です。^[26]遺伝性が極めて高い人間の特徴の例としては、目の色があり、MZペアの一致率は98％、DZペアの一致率は年齢に応じて7～49％です。^[27]

一卵性双生児の研究によると、自閉症の遺伝率は36%から95.7%の範囲にあり、より広い表現型の一致は通常、範囲の上限に見られます。^[28]兄弟および二卵性双生児における自閉症の一致率は0%から23.5%の間です。これは、古典的自閉症の場合は2～4%、より広いスペクトルの場合は10～20%である可能性が高いです。一般人口の有病率を0.1%と仮定すると、兄弟における古典的自閉症のリスクは一般人口の20～40倍になります。

注目すべき双子研究は、自閉症の遺伝性を明らかにしようと試みてきました。

1977 年に行われた小規模な研究は、自閉症の遺伝性を調べた最初の研究でした。この研究には、10 組の DZ 双子と 11 組の MZ 双子が参加し、各組の少なくとも 1 組は幼児期自閉症を示していました。MZ 双子の一致率は 36% でしたが、DZ 双子では 0% でした。「認知異常」の一致率は、MZ ペアで 82%、DZ ペアで 10% でした。自閉症の一致がなかった 17 組のうち 12 組では、生物学的危険が自閉症に関連していると考えられました。^[29]

1979 年の症例報告では、自閉症の症状が一致する一卵性双生児のペアについて論じられている。双子は 4 歳になるまで同じような発達を遂げ、そのうちの 1 人は 4 歳で自然に改善した。もう 1 人はまれに発作を起こしたが、自閉症のままであった。この報告では、遺伝的要因は双子の発達において「すべてにおいて重要」ではないと指摘されている。^[30]

1985年にUCLA遺伝子研究登録簿に登録された双子の研究では、23組のMZ双子で自閉症の一致率が95.7%、17組のDZ双子で23.5%であることが判明しました。^[31]

1989年の研究では、北欧諸国で自閉症の症例がスクリーニングされた。MZ双生児11組とDZ双生児10組が検査された。自閉症の一致率はMZ双生児では91%、DZ双生児では0%だった。「認知障害」の一致率はそれぞれ91%と30%だった。自閉症の一致率が低かった双生児のほとんどで、自閉症の双生児は周産期のストレスがより高かった。^[32]

1995年に英国の双子のサンプルが再検査され、MZ双子の自閉症の一致率は60%であるのに対し、DZでは0%であった。また、より広い範囲の一致率はMZでは92%であるのに対し、DZでは10%であった。この研究は、「産科的危険は通常、独立した病因ではなく、遺伝的影響を受けた異常な発達の結果であると思われる」と結論付けている。^[33]

1999年の研究では、一般の子供と青少年の社会的認知能力が調査された。その結果、「男性の社会的認知能力は低い」こと、そして遺伝率は0.68で、若い双子のほうが遺伝的影響が大きいことが判明した。^[34]

2000年に、一般集団の一卵性双生児の相互社会的行動を調べた研究があり、MZ（つまり「高度に遺伝性」）の一致率は73％、DZペアの一致率は37％であることがわかった。^[35]

2004年の研究では、16人のMZ双生児を調査し、「厳密に定義された自閉症」の一致率は43.75%であることがわかりました。一致しない双生児の間には神経解剖学的な違い（小脳の白質と灰白質の体積の不一致）が見つかりました。要約では、以前の研究では、自閉症ではない双生児の75%がより広い表現型を示していたと指摘されています。^[36]

2004 年の別の研究では、16 家族のサンプルで、自閉症の特徴的な症状 (社会的交流の障害、コミュニケーション障害、反復行動) が、兄弟姉妹と比較して一卵性双生児の間で症状のばらつきが少ないかどうかが調べられました。この研究では、双生児の症状が顕著に集約されていることが示されました。また、「自閉症に見られる臨床的特徴のレベルは、主に独立した遺伝的特徴の結果である可能性がある」という結論が出されました。^[37]

2006年にイギリスで行われた双子研究では、3,400組の双子の大規模なグループで自閉症の特徴の遺伝率が高いことが判明しました。^[38]

2006年以前の双子研究を批判したある人物は、研究対象が小規模すぎるため、その結果は非遺伝的根拠でもっともらしく説明できると述べた。^[39]

2015年に行われた双子研究のメタ分析では、遺伝が自閉症の発症に大きな役割を果たしており、自閉症を発症する可能性の64%から91%に寄与していることが著者らによって発見されました。^[40]

2024年にマルティーニらが双子を対象に行った研究では、遺伝的要因が環境要因と比較して自閉症特性の安定性に大きな影響を与えることを示唆する結果が得られた。^[41]

99人の自閉症患者を対象とした研究では、兄弟における自閉症の一致率は2.9%、自閉症の「軽度変異」の一致率は12.4%から20.4%であることがわかった。^[8]

自閉症児の兄弟31人、発達遅延児の兄弟32人、および対照群32人を対象とした研究。自閉症児の兄弟はグループとして「空間および言語能力において優れた能力を示したが、セットシフト、計画、言語流暢性課題の成績が予想以上に悪かった」ことが判明した。^[42]

2005 年のデンマークの研究では、「デンマーク精神医学中央登録簿とデンマーク市民登録システムのデータを調べ、出生地、両親の出生地、両親の年齢、精神疾患の家族歴、父親のアイデンティティなど、自閉症のリスク要因を調査しました。」全体の有病率は約 0.08% であることがわかりました。自閉症児の兄弟における自閉症の有病率は 1.76% であることがわかりました。アスペルガー症候群またはPDDの子供の兄弟における自閉症の有病率は 1.04% であることがわかりました。母親が精神疾患と診断されていた場合、リスクは 2 倍高くなります。この研究では、「自閉症のリスクは、子供の出生地の都市化の程度の増加と、母親ではなく父親の年齢の増加に関連している」こともわかりました。^[43]

2007 年の研究では、自閉症児を 2 人以上持つ 86 家族の系図を含むデータベースを調べたところ、3 番目に生まれた男児のうち 42 人が自閉症の症状を示しており、親が子供に突然変異を受け継ぐ可能性は 50% であることが示唆された。数学モデルは、自閉症の症例の約 50% が自然発生的な突然変異によって引き起こされることを示唆している。最も単純なモデルは、親が自閉症を引き起こす既存の突然変異を持っているかどうかによって、親を 2 つのリスク クラスに分けるというもので、自閉症児の約 4 分の 1 が親からコピー数変異を受け継いでいることを示唆した。 ^[44]

1994年の研究では、ダウン症児の親を対照として、自閉症児の親の性格を調査した。標準化されたテストを使用した結果、自閉症児の親は、自閉症でない子供の親に比べて「よそよそしく、無神経で、反応が鈍い」ことが判明した。^[45]

1997年の研究では、多重発症自閉症の家族では社会的・コミュニケーション的欠陥や定型的行動の割合が高いことがわかった。^[46]

自閉症は物理学者、エンジニア、科学者の家族に多く見られることがわかった。自閉症児の父親の12.5%と祖父（父方と母方の両方）の21.2%がエンジニアであったのに対し、他の症候群の子どもの父親の5%と祖父の2.5%はエンジニアであった。^[47] 他の研究でも同様の結果が出ている。^{[48] [49]}このような発見から「オタク症候群」という造語が生まれた。^[50]

2001年に行われた自閉症の男の子の兄弟と両親を対象とした研究では、自閉症の現在の認知理論の観点から表現型が調べられました。この研究では、より広い意味での自閉症の表現型には、情報処理の利点をもたらす「認知スタイル」（弱い中心的一貫性）が含まれる可能性があるという可能性が浮上しました。^[51]

2005年の研究では、自閉症者の反復行動と親の強迫性行動の間に正の相関関係があることが示されました。 ^[52] 2005年の別の研究では、一般集団における閾値下自閉症の特性に焦点を当てました。親と子の間、および配偶者間の社会的障害または能力の相関は約0.4であることがわかりました。^[53]

2005年の報告書では、DSM-IV基準に従ってアスペルガー症候群（AS）と診断された58人の被験者の家族の精神病歴を調査した。3人（5％）にはASの第一親等親戚がいた。9人（19％）には統合失調症の家族歴があった。35人（60％）にはうつ病の家族歴があった。64人の兄弟姉妹のうち、4人（6.25％）がASと診断された。^[54] 2022年に18か月間にわたって86人の母子ペアを対象に行われた研究によると、「母親の以前のうつ病は、後に子供の行動上の問題を予測するものではなかった」。^[55]

双子化のプロセス自体が、おそらく周産期要因により、自閉症発症の危険因子であると考えられてきた。^[56] しかし、3つの大規模な疫学研究がこの考えを否定した。^{[5] [57]}これらの研究は、カリフォルニア、スウェーデン、オーストラリアで行われた。^[57]西オーストラリアで行われたある研究では、自閉症スペクトラム障害と診断された乳児および後に子供を含む、生まれたすべての乳児の出生記録を保管する母子保健研究データベースを使用した。この研究では、自閉症スペクトラム障害の発生率について分析された集団は、出生年が1980年から1995年までの子供に限定された。焦点は、双子集団と非双子集団との比較における自閉症スペクトラム障害の発生率にあった。次の2つの研究^{[33] [57]}は、双子集団における自閉症スペクトラム障害のリスクを調査した。双子化のプロセスだけでは危険因子ではないという結論が導き出された。^[57]これらの研究のデータでは、MZ双生児は両方とも自閉症スペクトラム障害を患うが、DZ双生児では片方のみが自閉症スペクトラム障害を患うことが示され、その発症率はMZ双生児では90%であるのに対し、DZ双生児では0%である。^[33] MZ双生児の高い対称性は、DZ双生児や双子以外の兄弟姉妹と比較して、MZ双生児の結果における自閉症スペクトラム障害の高い対称性を説明できる。^[57]

双子や家族の研究では、自閉症は遺伝性の高い病気であることが示されていますが、研究者には多くの疑問が残されています。最も顕著なものは次のとおりです。

• 一卵性双生児の一致率は高いのに、二卵性双生児の一致率はなぜ低いのでしょうか?
• なぜ自閉症児の親は一般的に自閉症ではないのでしょうか?
• 一卵性双生児において 100% の一致が見られない原因として、どのような要因が考えられますか?
• 重度の知的障害は遺伝子型の特徴なのでしょうか、それとも全く独立したものなのでしょうか?

最初の2つの疑問に対する手がかりは、自閉症患者の少なくとも30％が父親の精子または母親の卵子で発生した自然発生的な新生突然変異によって脳の発達に重要な遺伝子が破壊されていることを示す研究から得られます。これらの自然発生的な突然変異は、家族歴のない家族でも自閉症を引き起こす可能性があります。^[58]

一卵性双生児の一致率は、2つの理由から100%とは言い難い。これらの突然変異は「表現性」が異なり、その影響は偶然の影響、エピジェネティック、環境要因によって異なって現れるからである。また、自然発生的な突然変異は、受精後に片方の胚にのみ発生し、もう片方には発生しない可能性がある。^[59]知的障害を発症する可能性は、遺伝子が脳の発達に及ぼす重要性と、突然変異がこの機能をどのように変化させるかによって決まるが、突然変異が発生する遺伝的および環境的背景も役割を果たしている。^[60] 自閉症に罹患した複数の個人に同じ突然変異が繰り返し見られることから、BrandlerとSebatは、自閉症のスペクトラムが多くの異なる遺伝性疾患の量子へと分裂しつつあると示唆している。^[60]

自閉症の患者が一人だけで、家族歴や兄弟に罹患歴がない場合の最も簡潔な説明は、1つまたは複数の遺伝子に影響を与える単一の自然発生的な突然変異が重要な要因であるというものです。^{[60] [61]}数十の個々の遺伝子または突然変異が明確に特定されており、サイモンズ財団自閉症研究イニシアチブによってカタログ化されています。^{[62] [63]}

単一遺伝子または遺伝子座における稀な突然変異または新生突然変異から生じる自閉症の例としては、脆弱X症候群などの神経発達障害、代謝疾患（例えばプロピオン酸血症）^{[64] 、} 22q13欠失症候群や16p11.2欠失症候群などの染色体異常^[65]などがあげられる。

これらの変異自体は、臨床結果にかなりのばらつきがあることが特徴であり、通常、変異キャリアの一部のみが自閉症の基準を満たします。たとえば、16p11.2欠失のキャリアは、欠失を持たない第一度近親者よりも平均IQが32ポイント低くなりますが、知的障害の閾値IQ70を下回っているのは20%のみで、自閉症であるのも20%のみです。^{[66] [67]約85%が自閉症、} ADHD、不安障害、気分障害、粗大運動遅延、てんかんなどの神経行動学的診断を受けており、15%は診断されていません。^[67]これらの神経行動学的表現型に加えて、16p11.2の欠失/重複は大頭症/小頭症、体重調節と関連しており、特に重複は統合失調症と関連しています。^{[66] [68] [69]}自閉症や統合失調症に関連する突然変異を持つ対照群は、神経発達症例や集団対照群と比較して、中程度の認知表現型や生殖能力を示すのが典型的である。^[70]そのため、単一の突然変異が他の遺伝的要因や環境的要因に応じて複数の異なる影響を及ぼす可能性がある。

このモデルでは、自閉症は遺伝子の一般的な機能的変異の組み合わせから生じることが多い。各遺伝子が自閉症のリスクを高めるのに寄与する影響は比較的小さい。このモデルでは、社会行動などの自閉症の中核症状を直接制御する遺伝子は1つもない。代わりに、各遺伝子は細胞プロセスを破壊するタンパク質をコードしており、これらの破壊の組み合わせは、おそらく環境の影響と相まって、シナプス形成などの重要な発達プロセスに影響を及ぼします^[71]。たとえば、1つのモデルでは、多くの変異がMETやその他の受容体チロシンキナーゼに影響し、それがERKおよびPI3Kシグナル伝達の破壊に収束します。^[65]

このモデルでは、ほとんどの家族が2つのタイプに分類されます。大多数の家族では、息子の自閉症リスクは低いですが、少数の家族ではリスクが50％近くになります。低リスクの家族では、散発性自閉症は主に自然突然変異によって引き起こされ、娘の浸透率は低く、息子の浸透率は高くなります。高リスクの家族は、新しい原因となる突然変異を抱えているが影響を受けず、優性突然変異を孫に伝える（主に女の子）子供から成ります。^[44]

自閉症のエピジェネティックモデルはいくつか提案されている。^[72]これらは、エピジェネティック変異から生じる脆弱X症候群や、エピジェネティック調節因子が関与するレット症候群の患者に自閉症が発生することから示唆されている。エピジェネティックモデルは、標準的な遺伝子スクリーニング戦略が自閉症の治療に非常に困難を伴う理由を説明するのに役立つだろう。^[73]

ゲノム刷り込みモデルが提案されており、その強みの一つは、自閉症スペクトラム障害における男女比の高さを説明できることである。^{[74]一つの仮説は、自閉症はある意味で統合}失調症やその他の精神病スペクトラム障害と正反対であり、ゲノム刷り込みの変化がこれら2つの疾患の発症を媒介し、自閉症スペクトラム障害は脳の過成長を制御する父親由来の遺伝子の増大した影響を伴うのに対し、統合失調症は母親由来の遺伝子の発現と低成長を伴うというものである。^[75]

自閉症の遺伝的要因は自閉症リスクの大部分を説明できるが、すべてを説明するわけではない。自閉症は遺伝的素因と早期の環境的障害の相互作用によって引き起こされるというのが一般的な仮説である。^[76]残りのリスクに対処するために、環境要因に基づくいくつかの理論が提案されている。これらの理論の中には、出生前環境要因、たとえば出生異常を引き起こす因子に焦点を当てているものもあれば、出生後の環境、たとえば子供の食事に焦点を当てているものもある。自閉症のリスクに関連する既知のすべての催奇形性物質（出生異常を引き起こす因子）は、受胎後最初の8週間に作用するようで、これは自閉症が発達の非常に早い段階で発生するという強力な証拠である。^[77]他の環境的原因の証拠は逸話的であり、信頼できる研究によって確認されていないが、^[78]広範な調査が進行中である。^[79] 2015年の研究では、共有されていない環境要因がASDの社会的障害に影響を与えるという証拠が見つかった^[80]

自閉症スペクトラム障害は、すべての人種、民族、社会経済グループに影響を及ぼします。それでも、すべての文化において女性よりも男性の方が多く影響を受けており、^[81]男性と女性の比率は適切に3対1です。^[82]ある研究では、自閉症スペクトラム障害の診断に関するリソース、研究、記録を保持する自閉症遺伝学リソース交換（AGREデータベース）を分析しました。この研究では、自然突然変異が自閉症スペクトラム障害（ASD）を引き起こす場合、男性の浸透率が高く、女性の浸透率が低いという結論に達しました。^{[82] [83]} 2020年に発表された研究では、この考えの背後にある理由をさらに調査しました。^[84]男性と女性の主な違いは、男性にはX染色体とY染色体が1つずつあるのに対し、女性はX染色体が2つあるという事実であることはよく知られています。このことから、ASDの性別による偏りに関与する遺伝子は、Y染色体には存在せずX染色体に存在するという考えが導かれる。^{[84] [81]}

別の研究では、NLGN4と呼ばれる遺伝子が変異するとASDを引き起こす可能性があることがわかりました。^{[85]この遺伝子と他のNLGN遺伝子は、}ニューロンのコミュニケーションに重要です。 ^[81]このNLGN4遺伝子は、X染色体（NLGN4X）とY染色体（NLGN4Y）の両方に見られます。性染色体は97％同一です。^{[81] [84]}発生する突然変異のほとんどはNLGN4X遺伝子にあることが判明しています。^{[81] [85]} NLGN4XとNLGN4Yの違いを研究した結果、NLGN4Yタンパク質は表面期待値とシナプス制御が悪く、ニューロンのコミュニケーションが不十分であることがわかりました。^{[81] [84]}研究者らは、メカニズムがNLGN4Xに関連する場合、男性の方が自閉症の発生率が高いと結論付けました。^[81]この関連性は、女性は2つのX染色体を持っていることから結論付けられました。 X染色体上の遺伝子に突然変異がある場合、もう一方のX染色体を使ってその突然変異を補うことができる。一方、男性はX染色体を1本しか持っていないため、X染色体上の遺伝子に突然変異がある場合、その遺伝子のコピーが1つだけ使用され、それが使用される。男性と女性のゲノムの違いは、男性にASDの発生率が高くなるメカニズムの1つである。^{[81] [84] [85]}

既知の遺伝性症候群、突然変異、代謝性疾患は、自閉症症例の最大20％を占めています。^[86]多くの対立遺伝子が自閉症表現型と強く連鎖していることが示されています。多くの場合、調査結果は決定的ではなく、連鎖を示さない研究もあります。これまで連鎖している対立遺伝子は、自閉症表現型として現れる遺伝子型が多数あるという主張を強く支持しています。自閉症に関連する対立遺伝子の少なくともいくつかは、一般集団にかなり多く見られ、まれな病原性突然変異ではないことを示しています。これはまた、自閉症の病因に関与する すべてのまれな対立遺伝子の組み合わせを特定する上でいくつかの課題を提示しています。

2008年の研究では、自閉症に関連する遺伝子と他の神経疾患に関連する遺伝子を比較し、既知の自閉症遺伝子の半分以上が他の疾患に関与していることが判明し、他の疾患が自閉症と分子メカニズムを共有している可能性があることを示唆しました。^[87]

他にも、注目すべき、あるいは有望であることが示されている候補遺伝子座が多数存在します。ゲノムワイドスキャンが複数回実施され、多くの染色体にわたるマーカーが特定されています。^{[147] [148] [149]}

研究されている遺伝子座の例としては、17q21領域^{[150] [151]} 3p24-26遺伝子座^[147] PTEN ^[152] 15q11.2–q13 ^{[128]および}22q11.2領域の欠失^[153]などがある。

祖先と自閉症発症率を共有する家系におけるホモ接合マッピングにより、最近、以下の候補遺伝子が示唆された：PCDH10、DIA1（旧称C3ORF58）、NHE9、CNTN3、SCN7A、およびRNF8 。これらの遺伝子のいくつかは、神経活動によって制御されることが知られている転写因子の1つであるMEF2の標的であるように見えた^{[ 154] [155]。MEF2}自体も最近、自閉症関連疾患の候補遺伝子として示唆されている[156]。^[157]