マンハッタンの陰謀

マンハッタンプロットは、通常、多数のデータポイント、多くの非ゼロ振幅、および高振幅値の分布を持つデータを表示するために使用されるプロットの一種です。このプロットは、ゲノムワイド関連研究（GWAS）で重要なSNPを表示するためによく使用されます。^[1]

この名前は、このような区画がマンハッタンの スカイライン、つまり、それよりも低い高さの「ビル」の上にそびえ立つ超高層 ビルの輪郭に似ていることから付けられました。

GWAS マンハッタン プロットでは、ゲノム座標がx軸に沿って表示され、各一塩基多型(SNP)の関連p値の負の対数がy軸に表示されます。つまり、マンハッタン プロット上の各ドットは SNP を表します。最も強い関連はp値が最小 (例: 10 ⁻¹⁵ ) であるため、負の対数は最大 (例: 15) になります。各ブロックの異なる色は通常、各染色体の範囲を示します。

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