Loading article…
| DNMT3A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | DNMT3A、DNMT3A2、M.HsaIIIA、TBRS、DNA（シトシン-5-）メチルトランスフェラーゼ3アルファ、DNAメチルトランスフェラーゼ3アルファ、HESJAS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：602769; MGI : 1261827;ホモロジーン: 7294;ジーンカード：DNMT3A; OMA :DNMT3A - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA（シトシン-5）メチルトランスフェラーゼ3A（DNMT3A）は、 DNAの特定のCpG構造へのメチル基の転移を触媒する酵素であり、 DNAメチル化と呼ばれるプロセスです。この酵素は、ヒトではDNMT3A 遺伝子によってコードされています。[5] [6]
この酵素は、DNAの新規メチル化を担っています。この機能は、継承されたエピジェネティックパターンの複製の忠実性を保証する維持DNAメチル化とは区別されます。DNMT3Aは、DNMT1、DNMT3A、DNMT3BからなるDNAメチルトランスフェラーゼ酵素ファミリーの一部を形成します。[5] [6]
デノボDNAメチル化は親から子孫に受け継がれる情報を修正する一方で、細胞分化や胚発生、転写調節、ヘテロクロマチン形成、X染色体不活性化、刷り込み、ゲノム安定性などのプロセスに不可欠な重要なエピジェネティックな修正を可能にします。[7]
DNMT3aはクローン造血において最も一般的に変異が見られる遺伝子であり、これは造血幹細胞（HSC）やその他の初期の血液細胞前駆細胞が遺伝的に異なる血液細胞サブポピュレーションの形成に寄与する一般的な老化関連現象である。[8] [9] [10]
遺伝子
DNMT3Aは、ヒトの染色体2p23にある23のエクソンによってコードされる130kDaのタンパク質です。[11]ヒトとマウスの相同遺伝子の間には98%の相同性 があります。 [6] DNMT3Aは哺乳類に広く発現しています。[12]
DNMT3A1とDNMT3A2という2つの主要なタンパク質アイソフォームがあり、分子量はそれぞれ約130 kDaと100 kDaです。DNMT3A1のN末端領域を欠くDNMT3A2タンパク質は、下流プロモーターから開始される転写産物によってコードされます。[13]これらのアイソフォームは、異なる細胞型に存在します。[14]最初に確立されたとき、[13] DNMT3A2は精巣、卵巣、脾臓、胸腺で高度に発現していることがわかりました。最近では、脳の海馬で誘導発現していることが示され、 [15]記憶を確立する際に海馬に必要であることが示されました。[16] DNMT3A2は、コカインに反応して側坐核殻でもアップレギュレーションされます。[17]
タンパク質構造
DNMT3A は、Pro-Trp-Trp-Pro (PWWP) ドメイン、ATRX-DNMT3-DNMT3L (ADD) ドメイン、および触媒メチルトランスフェラーゼ ドメインの 3 つの主要なタンパク質ドメインで構成されています。
DNMT3A1とDNMT3A2の構造は、DNMT3B1の構造と類似しており、また2つの補助タンパク質DNMT3B3とDNMT3Lとも類似している（DNMT3Aアイソフォームの簡略化されたドメインの図を参照）。2つの補助タンパク質は、機能的な触媒ドメインを持つ3つのアイソフォームと相互作用することで、de novoメチル化を刺激する。一般に、すべてのDNMTは、その生物学的機能のために補助タンパク質を必要とする。[18]
PWWPモチーフは、約100アミノ酸のドメイン内にあり、その1つの領域には塩基性残基（リジンとアルギニン）が大量に含まれており、DNAに結合できる正に帯電した表面を形成しています。PWWPドメインの別の領域は、PWWPモチーフ自体を含む疎水性ポケットを介してヒストンメチルリジンに結合することができます。[19] [20]
DNMT3AのADDドメインは、N末端のGATA様ジンクフィンガー、PHDフィンガー、およびC末端のαヘリックスから構成され、これらが一緒になって単一の球状フォールドに配置されている。このドメインは、リジン4がメチル化されていないヒストンH3（H3K4me0）に特異的に結合するリーダーとして機能することができる。[21] ADDドメインは、DNMT3Aがヒストン3の未修飾リジン4（H3K4me0）に結合してその新規メチル化活性を発揮するまで、メチルトランスフェラーゼドメインの阻害剤として機能する。[14]このように、DNMT3Aには、ヒストン3でメチル化されておらず、アミノ末端から4番目の位置のリジンがメチル化されていないヒストンのみを標的とするDNAのメチル化を制御する組み込みの制御メカニズムがあると思われる。
触媒ドメイン（メチルトランスフェラーゼドメイン）は原核生物の間でも高度に保存されている。[22]
3つのDNAメチルトランスフェラーゼ（DNMT3A1、DNMT3A2、DNMT3B）は、通常DNAのCpG部位でシトシンにメチル基を付加する反応を触媒する。 [23] 添付の図は、DNMT3A2を含むメチルトランスフェラーゼ複合体を示す。これらの酵素が効果を発揮するには、補助タンパク質（DNMT3B3、DNMT3Lなど）と連携して作用する必要がある。[24] [25] [26]触媒ドメインを持つ2つのDNMTと複合体を形成した2つの補助タンパク質（触媒活性を持たない）は、ヘテロ四量体として存在する（図を参照）。これらのヘテロ四量体は、補助タンパク質-触媒タンパク質-触媒タンパク質-補助タンパク質の順序で存在する。図に示されている特定の複合体は、触媒タンパク質DNMT3A2と補助タンパク質DNMT3B3によって形成されたヘテロ四量体を示している。複合体の 1 つの補助タンパク質は、ヌクレオソーム コアの酸性パッチに結合します (図の上部 3B3 を参照)。1 つの補助タンパク質がヌクレオソームに接続されると、ヘテロ四量体の方向が決まります。この方向により、最初の触媒 DNMT (ヌクレオソームに接続された補助タンパク質に最も近い) が中間の位置 (リンカー DNA に近くない) に配置されます。2 番目の触媒 DNMT (図の下部 3A2) は、リンカー DNA に配置されます。メチル化は、このリンカー DNA 内では発生しますが (図に示すように)、ヌクレオソーム コアに巻き付いた DNA では発生しません。
Manzoら[27]が示したように、 3つの触媒DNMT（3A1、3A2、3B3）にはそれぞれ固有の結合部位と、これらの酵素の重複する結合部位の両方があります。ヒトゲノムには2,800万のCpG部位があります。 [28]これらのCpGの多くは、CpG部位が比較的高密度のCpGアイランド（DNA領域）内に位置しています。[28]これらの領域のうち、DNMT3A1が独占的に濃縮されている領域は3,970、DNMT3A2が3,838、DNMT3Bが3,432あり、de novo DNMTタンパク質間で共有される部位もあります。[27] さらに、DNAメチルトランスフェラーゼ（DNMT3A1、DNMT3A2、DNMT3B）が利用可能なCpG部位に作用するかどうかは、リンカーDNA内のCpG部位に隣接する配列に依存する。 [26]
関数
DNMT1はDNAメチル化の維持に関与し、DNMT3AとDNMT3Bは維持（DNMT1のエラーを修正）とde novo DNAメチル化の両方を実行します。ヒト癌細胞でDNMT1をノックアウトした後、これらの細胞は継承されたメチル化パターンを保持することがわかり、[29]発現したDNMT3による維持活動が示唆されています。DNMT3はメチル化されていないDNA基質とヘミメチル化されたDNA基質に同等の親和性を示しますが[29]、DNMT1はヘミメチル化されたDNAに対して10～40倍の親和性を示します。[30] [31] DNMT3は両方の形態に結合できるため、維持とde novoの両方の修飾を行う可能性があります。
DNMT3Aの主な活動はデノボメチル化であり、これは導入段落で述べたようなプロセスに不可欠です。遺伝的刷り込みは哺乳類の単為生殖を防ぎ、[32]有性生殖を強制し、遺伝学と系統発生にさまざまな影響を及ぼします。DNMT3Aは遺伝的刷り込みに不可欠です。[33]
ヒトの長期記憶の保存に関する研究では、記憶はDNA のメチル化によって維持されることが示されている。[34]文脈的恐怖条件 付けによって新しい強力な長期記憶が誘発されたラットでは、脳の海馬領域で約 1,000 個の遺伝子の発現が減少し、約 500 個の遺伝子の発現が増加した。これらの変化は、トレーニングの 24 時間後に発生する。この時点で、ラットの海馬ゲノムの 9.17% の発現が変化している。遺伝子の発現の減少は、遺伝子のde novoメチル化に関連している。 [35]
動物実験
マウスでは、この遺伝子の発現が老化動物で減少し、認知的長期記憶の低下を引き起こすことが示されています。[15]
Dnmt3a-/- マウスでは、HSC の自己複製に関連する多くの遺伝子の発現が増加し、一部は分化中に適切に抑制されません。[36]これは、造血幹細胞(HSC)の分化が中止され、代わりに自己複製細胞分裂が増加することを示唆しています。実際、 Dnmt3a-/- HSC でCtnb1 をさらにノックダウンすると、分化が部分的に回復することがわかりました。Ctnb1 は、自己複製細胞分裂に関与する β-カテニンをコードします。[14]
臨床的関連性
この遺伝子は癌で頻繁に変異し、癌ゲノムアトラスプロジェクトで特定された127の頻繁に変異する遺伝子の1つです[37] DNMT3A変異は急性骨髄性白血病（AML）で最も一般的に見られ、配列決定された症例の25％強で発生しました。これらの変異はタンパク質の位置R882で最も頻繁に発生し、この変異は機能喪失を引き起こす可能性があります。[38] DNMT3A変異は全生存率の低下と関連しており、AML細胞が致死的な疾患を引き起こす可能性に重要な共通の影響を及ぼすことを示唆しています。[ 39] DNMT3A変異細胞株は、同質遺伝子の野生型の対応細胞株と比較して、はるかに多くの誤ったRNAスプライシングを持つという点で、トランスクリプトーム不安定性を示すこともわかっています。 [40]この遺伝子の変異は、過成長障害である タットン・ブラウン・ラーマン症候群とも関連しています。
インタラクション
DNMT3A は以下と相互作用することが示されています:
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000119772 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020661 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab Okano M, Xie S, Li E (1998年7月). 「新規哺乳類DNA（シトシン-5）メチルトランスフェラーゼファミリーのクローニングと特性評価」Nature Genetics . 19 (3): 219– 220. doi :10.1038/890. PMID 9662389. S2CID 256263.
- ^ abc Xie S, Wang Z, Okano M, Nogami M, Li Y, He WW, et al. (1999年8月). 「ヒトDNMT3遺伝子ファミリーのクローニング、発現および染色体位置」. Gene . 236 (1): 87– 95. doi :10.1016/S0378-1119(99)00252-8. PMID 10433969.
- ^ Jia Y, Li P, Fang L, Zhu H, Xu L, Cheng H, et al. (2016-04-12). 「がんにおける広範な DNA 低メチル化のメカニズムとしての、頻繁に過剰発現する UHRF ファミリータンパク質による DNMT3A de novo DNA メチル化の負の制御」Cell Discovery . 2 : 16007. doi :10.1038/celldisc.2016.7. PMC 4849474. PMID 27462454 .
- ^ Jan M, Ebert BL, Jaiswal S (2017年1月). 「クローン造血」.血液学セミナー. 54 (1): 43– 50. doi : 10.1053/j.seminhematol.2016.10.002 . PMC 8045769. PMID 28088988 .
- ^ Sperling AS、 Gibson CJ、Ebert BL（2017年1月）。「骨髄異形成症候群の遺伝学：クローン造血から二次性白血病まで」。Nature Reviews 。がん。17（1）：5–19。doi ： 10.1038/nrc.2016.112。PMC 5470392。PMID 27834397。
- ^ Steensma DP、Bejar R、 Jaiswal S 、 Lindsley RC、Sekeres MA、Hasserjian RP、Ebert BL (2015 年 7 月)。「不確定な潜在性のクローン造血と骨髄異形成症候群との区別」。Blood。126 ( 1 ) : 9– 16。doi : 10.1182/blood-2015-03-631747。PMC 4624443。PMID 25931582。
- ^ Robertson KD、Uzvolgyi E、Liang G、Talmadge C、Sumegi J、Gonzales FA、Jones PA (1999 年 6 月)。「ヒト DNA メチルトランスフェラーゼ (DNMT) 1、3a、3b: 正常組織での mRNA 発現と腫瘍での過剰発現を調整する」。核酸研究。27 ( 11 ) : 2291– 2298。doi :10.1093/nar/27.11.2291。PMC 148793。PMID 10325416。
- ^ Del Castillo Falconi VM、Torres-Arciga K、Matus-Ortega G、Díaz-Chávez J、Herrera LA（2022年8月）。「DNAメチルトランスフェラーゼ：進化から臨床応用まで」。International Journal of Molecular Sciences。23 （ 16 ）：8994。doi ：10.3390/ ijms23168994。PMC 9409253。PMID 36012258。
- ^ ab Chen T, Ueda Y, Xie S, Li E (2002年10月). 「代替プロモーターから生成された新しいDnmt3aアイソフォームはユークロマチンに局在し、その発現は活性なde novoメチル化と相関する」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (41): 38746– 38754. doi : 10.1074/jbc.M205312200 . PMID 12138111.
- ^ abc Yang L、Rau R 、 Goodell MA（2015年3月）。 「血液悪性腫瘍におけるDNMT3A」。Nature Reviews。がん。15 （ 3）：152-165。doi：10.1038/nrc3895。PMC 5814392。PMID 25693834。
- ^ ab Oliveira AM、 Hemstedt TJ、Bading H (2012年7月)。「加齢に伴うDnmt3a2発現低下の回復により認知能力が回復」。Nature Neuroscience。15 ( 8): 1111– 1113。doi :10.1038/nn.3151。PMID 22751036。S2CID 10590208。
- ^ Oliveira AM、 Hemstedt TJ、Freitag HE 、 Bading H (2016年8月)。「Dnmt3a2：認知機能を高めるハブ」。分子精神医学。21 ( 8): 1130– 1136。doi ：10.1038/mp.2015.175。PMID 26598069。S2CID 25308306 。
- ^ Cannella N、Oliveira AM、Hemstedt T、Lissek T、Buechler E、Bading H、Spanagel R (2018年8月)。「コカイン欲求の回復には側坐核シェルのDnmt3a2が必要である」。The Journal of Neuroscience。38 ( 34 ) : 7516– 7528。doi :10.1523/JNEUROSCI.0600-18.2018。PMC 6596133。PMID 30030395。
- ^ Gujar H、Weisenberger DJ、Liang G (2019年2月) 。「エピゲノムの形成におけるヒトDNAメチル トランスフェラーゼとそのアイソフォームの役割」。遺伝子。10 (2): 172。doi : 10.3390 / genes10020172。PMC 6409524。PMID 30813436。
- ^ van Nuland R、van Schaik FM、Simonis M、van Heesch S、Cuppen E、Boelens R、他 (2013 年 5 月)。「ヌクレオソーム DNA 結合は PSIP1-PWWP ドメインによる H3K36 メチル化ヌクレオソームの認識を促進する」。エピ ジェネティクス& クロマチン。6 ( 1): 12。doi : 10.1186 /1756-8935-6-12。PMC 3663649。PMID 23656834。
- ^ Rona GB、Eleutherio EC 、 Pinheiro AS (2016 年 3 月) 。 「PWWP ドメインと DNA およびヒストン のメチル化リジンを感知するモード」。Biophysical Reviews。8 ( 1): 63– 74。doi : 10.1007 /s12551-015-0190-6。PMC 5425739。PMID 28510146。
- ^ Ren W、Gao L、 Song J（2018年12月） 。 「DNMT1およびDNMT3Aを介したDNAメチル化の構造的基礎」。遺伝子。9 （12）：620。doi ：10.3390/ genes9120620。PMC 6316889。PMID 30544982。
- ^ Xu F, Mao C, Ding Y, Rui C, Wu L, Shi A, et al. (2010-01-01). 「哺乳類 DNA メチルトランスフェラーゼの分子および酵素プロファイル: 構造と薬剤のターゲット」Current Medicinal Chemistry . 17 (33): 4052– 4071. doi :10.2174/092986710793205372. PMC 3003592. PMID 20939822 .
- ^ Zeng Y、Ren R、Kaur G、Hardikar S、Ying Z、Babcock L、Gupta E、Zhang X、Chen T、Cheng X（2020年11月）。「不活性Dnmt3b3アイソフォームはDnmt3bを介したDNAメチル化を優先的に促進する」。Genes Dev。34 （ 21〜22 ）：1546〜1558。doi：10.1101 / gad.341925.120。PMC 7608744。PMID 33004415。
- ^ Jia D、Jurkowska RZ、Zhang X、 Jeltsch A、Cheng X (2007 年 9 月)。「Dnmt3L に結合した Dnmt3a の構造は、de novo DNA メチル化のモデルを示唆している」。Nature . 449 ( 7159 ) : 248– 51。Bibcode : 2007Natur.449..248J。doi :10.1038/nature06146。PMC 2712830。PMID 17713477。
- ^ Xu TH、Liu M、Zhou XE、Liang G、Zhao G、Xu HE、Melcher K、Jones PA (2020年10月)。「ヌクレオソーム結合DNAメチルトランスフェラーゼDNMT3AおよびDNMT3Bの構造」。Nature . 586 ( 7827): 151– 155. Bibcode :2020Natur.586..151X. doi :10.1038/s41586-020-2747-1. PMC 7540737 . PMID 32968275.
- ^ ab Gao L、Emperle M、Guo Y、Grimm SA、Ren W、Adam S、U Ryu H、Zhang ZM、Chen D、ying J、Dukatz M、Anteneh H、Jurkowska RZ、Lu J、Wang Y、Bashtrykov P、 Wade PA、Wang GG、Jeltsch A、Song J (2020 年 7 月)。 「DNMT3BおよびDNMT3Aの包括的な構造機能特性評価により、独特のde novo DNAメチル化機構が明らかになりました。」ナットコミューン。11 (1): 3355. Bibcode :2020NatCo..11.3355G。土井：10.1038/s41467-020-17109-4。PMC 7335073。PMID 32620778。
- ^ ab Manzo M, Wirz J, Ambrosi C, Villaseñor R, Roschitzki B, Baubec T (2017年12月). 「DNMT3Aのアイソフォーム特異的局在は二価CpGアイランドにおけるDNAメチル化忠実度を制御する」. EMBO J. 36 ( 23): 3421– 3434. doi :10.15252/embj.201797038. PMC 5709737. PMID 29074627 .
- ^ ab Lövkvist C, Dodd IB, Sneppen K, Haerter JO (2016年6月). 「ヒトエピゲノムのDNAメチル化はCpG部位の局所トポロジーに依存する」. Nucleic Acids Res . 44 (11): 5123–32 . doi :10.1093/nar / gkw124. PMC 4914085. PMID 26932361.
- ^ ab Rhee I, Jair KW, Yen RW, Lengauer C, Herman JG, Kinzler KW, et al. (2000 年 4 月). 「DNMT1 を欠くヒト癌細胞でも CpG メチル化は維持される」. Nature . 404 (6781): 1003– 1007. Bibcode :2000Natur.404.1003R. doi :10.1038/35010000. PMID 10801130. S2CID 4425037.
- ^ Pradhan S、Bacolla A、Wells RD、Roberts RJ (1999 年 11 月)。「組み換えヒト DNA (シトシン-5) メチルトランスフェラーゼ。I. 発現、精製、および de novo メチル化と維持メチル化の比較」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 46): 33002– 33010。doi : 10.1074/ jbc.274.46.33002。PMID 10551868。
- ^ Pradhan S, Talbot D, Sha M, Benner J, Hornstra L, Li E, et al. (1997 年 11 月). 「バキュロウイルスによる全長マウス DNA メチルトランスフェラーゼの発現と特性評価」. Nucleic Acids Research . 25 (22): 4666– 4673. doi :10.1093/nar/25.22.4666. PMC 147102. PMID 9358180 .
- ^ Reik W, Walter J (2001年1月). 「ゲノムインプリンティング：ゲノムに対する親の影響」. Nature Reviews. 遺伝学. 2 (1): 21– 32. doi :10.1038/35047554. PMID 11253064. S2CID 12050251.
- ^ 金田正人、岡野正人、秦和人、佐渡哲也、辻本直人、李英、佐々木裕 (2004年6月)。 「父方および母方のインプリンティングにおけるde novo DNAメチルトランスフェラーゼDnmt3aの必須の役割」。自然。429 (6994): 900– 903。Bibcode :2004Natur.429..900K。土井：10.1038/nature02633. PMID 15215868。S2CID 4344982 。
- ^ Miller CA, Sweatt JD (2007年3月). 「DNAの共有結合修飾が記憶形成を制御する」. Neuron . 53 (6): 857– 869. doi : 10.1016/j.neuron.2007.02.022 . PMID 17359920.
- ^ Duke CG、Kennedy AJ、Gavin CF、Day JJ、Sweatt JD（2017年7月）。「海馬における経験依存的なエピゲノム再編成」。Learn Mem . 24 （ 7 ）：278–288。doi ： 10.1101/lm.045112.117。PMC 5473107。PMID 28620075。
- ^ Challen GA, Sun D, Jeong M, Luo M, Jelinek J, Berg JS, et al. (2011年12月). 「Dnmt3aは造血幹細胞の分化に必須である」. Nature Genetics . 44 (1): 23– 31. doi :10.1038/ng.1009. PMC 3637952. PMID 22138693 .
- ^ Kandoth C, McLellan MD, Vandin F, Ye K, Niu B, Lu C, et al. (2013年10月). 「12の主要ながん種における変異の状況と意義」. Nature . 502 (7471): 333– 339. Bibcode :2013Natur.502..333K. doi :10.1038/nature12634. PMC 3927368. PMID 24132290 .
- ^ Shih AH、Abdel-Wahab O、Patel JP、 Levine RL（2012年9月）。「骨髄悪性腫瘍におけるエピジェネティック制御因子の変異の役割」。Nature Reviews。がん。12 （ 9）：599– 612。doi ：10.1038/nrc3343。PMID 22898539。S2CID 20214444 。
- ^ Ley TJ、Ding L、Walter MJ、 McLellan MD、Lamprecht T、Larson DE、他 (2010 年 12 月)。「急性骨髄性白血病における DNMT3A 変異」。The New England Journal of Medicine。363 ( 25): 2424– 2433。doi :10.1056/NEJMoa1005143。PMC 3201818。PMID 21067377。
- ^ Banaszak LG、Giudice V、Zhao X、Wu Z、Gao S、Hosokawa K、他 (2018年3月)。「CRISPR/Cas9遺伝子編集によるDNMT3A変異の誘導後の異常なRNAスプライシングとゲノム不安定性」。Blood Cells 、Molecules & Diseases。69 : 10–22。doi : 10.1016/ j.bcmd.2017.12.002。PMC 6728079。PMID 29324392。
- ^ ab Kim GD, Ni J, Kelesoglu N, Roberts RJ, Pradhan S (2002年8月). 「ヒト維持DNAメチルトランスフェラーゼとde novo DNA (シトシン-5) メチルトランスフェラーゼ間の協力とコミュニケーション」. The EMBO Journal . 21 (15): 4183– 4195. doi :10.1093/emboj/cdf401. PMC 126147. PMID 12145218 .
- ^ abcd Ling Y, Sankpal UT, Robertson AK, McNally JG, Karpova T, Robertson KD (2004). 「SUMO-1 による de novo DNA メチルトランスフェラーゼ 3a (Dnmt3a) の修飾は、ヒストン脱アセチル化酵素 (HDAC) との相互作用および転写を抑制する能力を調節する」。核酸研究。32 (2): 598– 610。doi : 10.1093 / nar /gkh195。PMC 373322。PMID 14752048。
- ^ Lehnertz B, Ueda Y, Derijck AA, Braunschweig U, Perez-Burgos L, Kubicek S, et al. (2003年7月). 「Suv39hを介したヒストンH3リジン9のメチル化は、ペリセントリックヘテロクロマチンの主要なサテライトリピートへのDNAメチル化を誘導する」Current Biology . 13 (14): 1192– 1200. Bibcode :2003CBio...13.1192L. doi : 10.1016/s0960-9822(03)00432-9 . PMID 12867029. S2CID 2320997.
- ^ ab Fuks F, Burgers WA, Godin N, Kasai M, Kouzarides T (2001 年 5 月). 「Dnmt3a は脱アセチル化酵素に結合し、配列特異的リプレッサーによってリクルートされて転写を抑制します」. The EMBO Journal . 20 (10): 2536– 2544. doi :10.1093/emboj/20.10.2536. PMC 125250. PMID 11350943 .
- ^ Brenner C, Deplus R, Didelot C, Loriot A, Viré E, De Smet C, et al. (2005年1月). 「MycはDNAメチルトランスフェラーゼコリプレッサーのリクルートメントを介して転写を抑制する」. The EMBO Journal . 24 (2): 336– 346. doi :10.1038/sj.emboj.7600509. PMC 545804. PMID 15616584.
- ^ Fuks F, Hurd PJ, Deplus R, Kouzarides T (2003 年 5 月). 「DNA メチルトランスフェラーゼは HP1 および SUV39H1 ヒストンメチルトランスフェラーゼと関連している」. Nucleic Acids Research . 31 (9): 2305– 2312. doi :10.1093/nar/gkg332. PMC 154218. PMID 12711675.
さらに読む
- Adams MD、Kerlavage AR、Fleischmann RD、Fuldner RA、Bult CJ、Lee NH、他 (1995 年 9 月)。「8,300 万ヌクレオチドの cDNA 配列に基づくヒト遺伝子の多様性と発現パターンの初期評価」。Nature . 377 ( 6547 Suppl): 3– 174。PMID 7566098。
- Bonaldo MF、 Lennon G、Soares MB (1996 年 9 月)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする2つのアプローチ」。ゲノム研究。6 (9): 791– 806。doi : 10.1101/ gr.6.9.791。PMID 8889548 。
- Robertson KD、Uzvolgyi E、Liang G、Talmadge C、Sumegi J、Gonzales FA、Jones PA (1999 年 6 月)。「ヒト DNA メチルトランスフェラーゼ (DNMT) 1、3a、3b: 正常組織での mRNA 発現と腫瘍での過剰発現を調整する」。核酸研究。27 ( 11 ) : 2291– 2298。doi :10.1093/nar/27.11.2291。PMC 148793。PMID 10325416。
- Fuks F、Burgers WA、Godin N、Kasai M 、 Kouzarides T (2001 年 5 月)。「Dnmt3a は脱アセチル化酵素に結合し、配列特異的リプレッサーによってリクルートされて転写を抑制します」。EMBOジャーナル。20 ( 10): 2536– 2544。doi :10.1093 / emboj/ 20.10.2536。PMC 125250。PMID 11350943。
- Vaute O、Nicolas E、Vandel L 、 Trouche D (2002 年 1 月)。「ヒストンメチルトランスフェラーゼ Suv39H1 とヒストン脱アセチル化酵素間の機能的および物理的相互作用」。 核酸研究。30 (2): 475– 481。doi :10.1093 / nar /30.2.475。PMC 99834。PMID 11788710。
- Di Croce L、Raker VA、 Corsaro M、Fazi F、Fanelli M、Faretta M、他 (2002 年 2 月)。「メチルトランスフェラーゼのリクルートメントと、発癌性転写因子による標的プロモーターの DNA 過剰メチル化」。Science。295 ( 5557 ) : 1079– 1082。Bibcode : 2002Sci ...295.1079D。doi : 10.1126 /science.1065173。hdl :11576/ 2506625。PMID 11834837。S2CID 29532358 。
- Hata K、Okano M、Lei H 、 Li E (2002 年 4 月) 。 「Dnmt3L は、マウスに母性インプリントを確立するために、 de novo DNA メチルトランスフェラーゼの Dnmt3 ファミリーと連携します」。Development。129 ( 8): 1983– 1993。doi :10.1242/dev.129.8.1983。PMID 11934864 。
- Chen T、Ueda Y、Xie S、Li E (2002 年 10 月)。「代替プロモーターから生成された新しい Dnmt3a アイソフォームはユークロマチンに局在し、その発現は活性 de novo メチル化と相関する」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 41): 38746– 38754。doi : 10.1074/jbc.M205312200。PMID 12138111。
- Kim GD、Ni J、Kelesoglu N、Roberts RJ、Pradhan S (2002 年 8 月)。「ヒト維持 DNA メチルトランスフェラーゼと de novo DNA (シトシン-5) メチルトランスフェラーゼ間の協力とコミュニケーション」。EMBOジャーナル。21 ( 15 ) : 4183– 4195。doi :10.1093 / emboj/cdf401。PMC 126147。PMID 12145218。
- 柳沢 勇、伊藤 栄、湯浅勇、丸山 健 (2002 年 9 月)。「ヒト DNA メチルトランスフェラーゼ DNMT3A および DNMT3B は、CpG 含有量の異なる 2 種類のプロモーターを持つ」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子構造と発現。1577 (3): 457– 465。doi :10.1016/S0167-4781(02)00482-7。PMID 12359337 。
- Fatemi M、Hermann A 、Gowher H、Jeltsch A (2002 年 10 月)。「Dnmt3a と Dnmt1 は DNA の de novo メチル化中に機能的に協力する」。European Journal of Biochemistry。269 ( 20): 4981– 4984。doi : 10.1046 / j.1432-1033.2002.03198.x。PMID 12383256。
- Weisenberger DJ、Velicescu M、Preciado-Lopez MA、Gonzales FA、Tsai YC、Liang G、Jones PA (2002 年 9 月)。「哺乳類細胞における DNA メチルトランスフェラーゼ 3a の選択的スプライシング変異体の同定と特性評価」。Gene . 298 ( 1 ): 91– 99. doi :10.1016/S0378-1119(02)00976-9. PMID 12406579。
- Chedin F、 Lieber MR、Hsieh CL (2002 年 12 月)。「DNA メチルトランスフェラーゼ様タンパク質 DNMT3L は Dnmt3a による de novo メチル化を刺激する」。米国 科学アカデミー紀要。99 ( 26): 16916– 16921。Bibcode : 2002PNAS ...9916916C。doi : 10.1073/ pnas.262443999。PMC 139244。PMID 12481029。
- Robert MF、Morin S、Beaulieu N、Gauthier F、Chute IC、Barsalou A、MacLeod AR (2003 年 1 月)。「DNMT1 はヒト癌細胞における CpG メチル化と異常遺伝子サイレンシングの維持に必要」。Nature Genetics。33 ( 1 ) : 61– 65。doi : 10.1038 /ng1068。PMID 12496760。S2CID 561490。
- Fuks F、Hurd PJ、 Deplus R、Kouzarides T (2003 年 5 月)。「DNA メチルトランスフェラーゼは HP1 および SUV39H1 ヒストン メチルトランスフェラーゼと関連している」。核酸研究。31 ( 9): 2305– 2312。doi :10.1093/ nar /gkg332。PMC 154218。PMID 12711675。
- Yakushiji T, Uzawa K, Shibahara T, Noma H, Tanzawa H (2003 年 6 月)。「口腔扁平上皮癌における DNA メチルトランスフェラーゼの過剰発現と CDKN2A 遺伝子のメチル化状態」。International Journal of Oncology。22 ( 6): 1201– 1207。doi :10.3892/ijo.22.6.1201。PMID 12738984 。
- Ling Y、Sankpal UT、Robertson AK、McNally JG、Karpova T、Robertson KD (2004)。「SUMO-1 による de novo DNA メチルトランスフェラーゼ 3a (Dnmt3a) の修飾は、ヒストン脱アセチル化酵素 (HDAC) との相互作用と転写を抑制する能力を調節する」。核酸研究 。32 ( 2 ): 598– 610。doi :10.1093/nar/ gkh195。PMC 373322。PMID 14752048。