DNMT3B

DNA（シトシン-5）-メチルトランスフェラーゼ3βは、ヒトではDNMT3B遺伝子によってコードされる酵素である。^[⁵^] この遺伝子の変異は、免疫不全、セントロメア不安定性、顔面異常症候群と関連している。^[⁶^]

関数

CpGメチル化は、胚発生、インプリンティング、およびX染色体不活性化に重要なエピジェネティック修飾です。マウスを用いた研究では、DNAメチル化が哺乳類の発生に必要であることが示されています。この遺伝子は、維持メチル化ではなく新規メチル化に関与すると考えられているDNAメチルトランスフェラーゼをコードしています。このタンパク質は主に核に局在し、その発現は発生段階に応じて調節されています。8つの選択的スプライシング転写バリアントが報告されています。バリアント4と5の全長配列はまだ決定されていません。^[⁵^]

臨床的意義

免疫不全-セントロメア不安定性-顔面異常（ICF）症候群は、 DNMT3B遺伝子の変異によって引き起こされる異常なDNAメチル化に起因するリンパ球成熟の欠陥の結果である。 ^{[ 6 ]}

この遺伝子の変異もニコチン依存症の一因となる可能性がある。^{[ 7 ]}

相互作用

DNMT3Bは以下と相互作用することが示されている：

CBX5、^{[ 8 ]}
DNMT1、^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}
DNMT3A、^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}
KIF4A、^{[ 11 ]}
NCAPG、^{[ 11 ]}
SMC2、^{[ 11 ]}
SUMO1 ^{[ 12 ]} および
UBE2I . ^{[ 12 ]}

参考文献

1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000088305 – Ensembl、2017年5月
1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027478 – Ensembl、2017年5月
↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
1 2 "Entrez Gene: DNMT3B DNA (シトシン-5-)-メチルトランスフェラーゼ 3 beta"。
1 2 Ehrlich M (2003 年 10 月). 「ICF 症候群、DNA メチルトランスフェラーゼ 3B 欠損症および免疫不全症」. Clinical Immunology . 109 (1): 17–28 . doi : 10.1016/S1521-6616(03)00201-8 . PMID 14585272 .
↑ Hancock DB、Guo Y、Reginsson GW、Gaddis NC、Lutz SM、Sherva R、et al. (2017 年 10 月)。「ヨーロッパ系およびアフリカ系アメリカ人の祖先を対象としたゲノムワイド関連研究により、ニコチン依存に寄与する DNMT3BのSNP が特定された」。Molecular Psychiatry。23 ( 9): 1911–1919。doi : 10.1038/ mp.2017.193。PMC 5882602。PMID 28972577。
1 2 3 Lehnertz B、Ueda Y、Derijck AA、Braunschweig U、Perez-Burgos L、Kubicek S、Chen T、Li E、Jenuwein T、Peters AH (2003 年 7 月)。「Suv39h を介したヒストン H3 リジン 9 メチル化は、セントロメア周辺ヘテロクロマチンの主要サテライト反復配列への DNA メチル化を誘導する」。Current Biology。13 ( 14 ) : 1192–200。Bibcode : 2003CBio ...13.1192L。doi : 10.1016 /s0960-9822 ( 03 ) 00432-9。PMID 12867029。S2CID 2320997。
1 2 Kim GD、Ni J、Kelesoglu N、Roberts RJ、Pradhan S (2002 年 8 月)。「ヒトの維持型および新規 DNA (シトシン-5) メチルトランスフェラーゼ間の協力とコミュニケーション」。The EMBO Journal。21 ( 15): 4183–95。doi : 10.1093/ emboj / cdf401。PMC 126147。PMID 12145218。
↑ Ling Y, Sankpal UT, Robertson AK, McNally JG, Karpova T, Robertson KD (2004). "新規DNAメチルトランスフェラーゼ3a（Dnmt3a）のSUMO-1による修飾は、ヒストン脱アセチル化酵素（HDAC）との相互作用および転写抑制能力を調節する" . Nucleic Acids Research . 32 (2): 598– 610. doi : 10.1093/nar/gkh195 . PMC 373322 . PMID 14752048 .
1 2 3 Geiman TM、Sankpal UT、Robertson AK、Chen Y、Mazumdar M、Heale JT、Schmiesing JA、Kim W、Yokomori K、Zhao Y、Robertson KD (2004)。「DNMT3Bと有糸分裂染色体凝縮機構の構成要素を連結する新規DNAメチルトランスフェラーゼ複合体の単離と特性評価」。Nucleic Acids Research。32 ( 9 ) : 2716–29。doi : 10.1093 / nar / gkh589。PMC 419596。PMID 15148359。
1 2 Kang ES、Park CW、Chung JH (2001 年 12 月)。「新規 DNA メチルトランスフェラーゼ Dnmt3b は、その N 末端領域を介して SUMO-1 および Ubc9 と相互作用し、SUMO-1 による修飾を受ける」。Biochemical and Biophysical Research Communications。289 ( 4): 862–8。doi : 10.1006 / bbrc.2001.6057。PMID 11735126。

さらに読む

ワイメンガ C、ハンセン RS、ギメリ G、ビョルク EJ、デイビス EG、バレンタイン D、ベロフラドスキー BH、ファンドンゲン JJ、スミーツ DF、ファンデンフーベル LP、ルイテン JA、ストレングマン E、ウィーマス C、ピアソン PL (2000 年 12 月)。「ICF症候群における遺伝的変異：遺伝的不均一性の証拠」。人間の突然変異。16 (6): 509–17 .土井: 10.1002/1098-1004(200012)16:6 < 509::AID-HUMU8 > 3.0.CO ; 2-V。PMID 11102980。S2CID 6746943。
Okano M, Xie S, Li E (1998年7月). 「新規哺乳類DNA（シトシン-5）メチルトランスフェラーゼファミリーのクローニングと特性解析」. Nature Genetics . 19 (3): 219–20 . doi : 10.1038/890 . PMID 9662389. S2CID 256263 .
Robertson KD、Uzvolgyi E、Liang G、Talmadge C、Sumegi J、Gonzales FA、Jones PA (1999年6月) 「ヒトDNAメチルトランスフェラーゼ（DNMT）1、3a、3b：正常組織におけるmRNA発現の協調と腫瘍における過剰発現」 Nucleic Acids Research . 27 (11): 2291–8 . doi : 10.1093 / nar/27.11.2291 . PMC 148793. PMID 10325416 .
Xie S, Wang Z, Okano M, Nogami M, Li Y, He WW, Okumura K, Li E (1999年8月). "ヒトDNMT3遺伝子ファミリーのクローニング、発現および染色体上の位置". Gene . 236 (1): 87–95 . doi : 10.1016/S0378-1119(99)00252-8 . PMID 10433969 .
Okano M, Bell DW, Haber DA, Li E (1999年10月). "DNAメチルトランスフェラーゼDnmt3aおよびDnmt3bは新規メチル化および哺乳類の発生に必須である" . Cell . 99 ( 3): 247–57 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)81656-6 . PMID 10555141. S2CID 15122892 .
Hansen RS、Wijmenga C、Luo P、Stanek AM、Canfield TK、Weemaes CM、Gartler SM（1999年12月）。「 DNMT3B DNAメチルトランスフェラーゼ遺伝子はICF免疫不全症候群で変異している」。米国科学アカデミー紀要。96 （25 ）：14412–7。Bibcode：1999PNAS ...9614412H。doi：10.1073/ pnas.96.25.14412。PMC 24450。PMID 10588719。
Xu GL、Bestor TH、Bourc'his D、Hsieh CL、Tommerup N、Bugge M、Hulten M、Qu X、Russo JJ、Viegas-Péquignot E (1999 年 11 月)。「DNAメチルトランスフェラーゼ遺伝子の変異によって引き起こされる染色体不安定性と免疫不全症候群」。自然。402 (6758): 187–91。Bibcode : 1999Natur.402..187X。土井：10.1038/46052。PMID 10647011。S2CID 4338524。
Hartley JL、Temple GF、Brasch MA（2000年11月）。「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」。Genome Research。10（11 ）：1788–95。doi：10.1101/ gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863。
Fuks F、Burgers WA、Godin N、Kasai M、Kouzarides T (2001 年 5 月)。「Dnmt3a は脱アセチル化酵素に結合し、配列特異的なリプレッサーによってリクルートされて転写をサイレンシングする」。The EMBO Journal。20 ( 10 ) : 2536–44。doi : 10.1093 / emboj / 20.10.2536。PMC 125250。PMID 11350943。
Kang ES、Park CW、Chung JH（2001年12月）。「新規DNAメチルトランスフェラーゼDnmt3bは、そのN末端領域を介してSUMO-1およびUbc9と相互作用し、SUMO-1による修飾を受ける」。Biochemical and Biophysical Research Communications。289 （ 4）：862–8。doi ： 10.1006 / bbrc.2001.6057。PMID 11735126。
Rhee I、Bachman KE、Park BH、Jair KW、Yen RW、Schuebel KE、Cui H、Feinberg AP、Lengauer C、Kinzler KW、Baylin SB、Vogelstein B (2002年4月)「DNMT1とDNMT3bは協力してヒト癌細胞の遺伝子をサイレンシングする」 Nature.416 ( 6880 ) : 552–6.Bibcode : 2002Natur.416..552R.doi : 10.1038 / 416552a.PMID 11932749.S2CID 4397868 .
Hata K, Okano M, Lei H, Li E (2002年4月). "Dnmt3Lは、マウスにおける母性インプリントを確立するために、新規DNAメチルトランスフェラーゼであるDnmt3ファミリーと協力する". Development . 129 (8): 1983–93 . doi : 10.1242/dev.129.8.1983 . PMID 11934864 .
Beaulieu N、Morin S、Chute IC、Robert MF、Nguyen H、MacLeod AR（2002年8月）。「DNAメチルトランスフェラーゼDNMT3Bの癌細胞生存における必須の役割」。The Journal of Biological Chemistry。277（31）：28176–81。doi：10.1074/jbc.M204734200。PMID 12015329。
Saito Y, Kanai Y, Sakamoto M, Saito H, Ishii H, Hirohashi S (2002年7月). "ヒト肝癌発生におけるセントロメア近傍サテライト領域のDNA低メチル化に関連するDNAメチルトランスフェラーゼ3bスプライスバリアントDNMT3b4の過剰発現" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (15): 10060– 5. Bibcode : 2002PNAS...9910060S . doi : 10.1073/pnas.152121799 . PMC 126624 . PMID 12110732 .
Kim GD、Ni J、Kelesoglu N、Roberts RJ、Pradhan S（2002年8月）。「ヒトの維持型および新規DNA（シトシン-5）メチルトランスフェラーゼ間の協力とコミュニケーション」。The EMBO Journal。21（15）：4183–95。doi：10.1093 / emboj / cdf401。PMC 126147。PMID 12145218。
Deplus R、Brenner C 、 Burgers WA、Putmans P、Kouzarides T、de Launoit Y、Fuks F (2002年9月)。「Dnmt3Lはヒストン脱アセチル化酵素をリクルートする転写抑制因子である」。Nucleic Acids Research。30 ( 17): 3831–8。doi : 10.1093/nar / gkf509。PMC 137431。PMID 12202768。
Shen H、Wang L、Spitz MR、Hong WK、Mao L、Wei Q（2002年9月）。「ヒトシトシンDNAメチルトランスフェラーゼ3Bプロモーターの新規多型は肺癌リスクの増加と関連している」。Cancer Research。62 （17 ）：4992–5。PMID 12208751 。
白津英、久保田哲、熊沢明、佐渡哲、千々和達、稲垣和、末武勇、田島俊、涌井和久、三木裕、林正、福島裕、佐々木裕 (2002 年 9 月)。「日本人のICF症候群患者における3つの新規DNMT3B変異」。アメリカ医学遺伝学ジャーナル。112 (1): 31–7 .土井: 10.1002/ajmg.10658。PMID 12239717。

外部リンク

米国国立医学図書館の医学主題見出し（MeSH）におけるDNMT3b
EC 2.1.1.37

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000088305 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027478 – Ensembl、2017年5月

[3] 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[entrez-5] 1 2 "Entrez Gene: DNMT3B DNA (シトシン-5-)-メチルトランスフェラーゼ 3 beta"。

[Ehrlich_2003-6] 1 2 Ehrlich M (2003 年 10 月). 「ICF 症候群、DNA メチルトランスフェラーゼ 3B 欠損症および免疫不全症」. Clinical Immunology . 109 (1): 17–28 . doi : 10.1016/S1521-6616(03)00201-8 . PMID 14585272 .

[HancockGuo2017-7] Hancock DB、Guo Y、Reginsson GW、Gaddis NC、Lutz SM、Sherva R、et al. (2017 年 10 月)。「ヨーロッパ系およびアフリカ系アメリカ人の祖先を対象としたゲノムワイド関連研究により、ニコチン依存に寄与する DNMT3BのSNP が特定された」。Molecular Psychiatry。23 ( 9): 1911–1919。doi : 10.1038/ mp.2017.193。PMC 5882602。PMID 28972577。

[pmid12867029-8] 1 2 3 Lehnertz B、Ueda Y、Derijck AA、Braunschweig U、Perez-Burgos L、Kubicek S、Chen T、Li E、Jenuwein T、Peters AH (2003 年 7 月)。「Suv39h を介したヒストン H3 リジン 9 メチル化は、セントロメア周辺ヘテロクロマチンの主要サテライト反復配列への DNA メチル化を誘導する」。Current Biology。13 ( 14 ) : 1192–200。Bibcode : 2003CBio ...13.1192L。doi : 10.1016 /s0960-9822 ( 03 ) 00432-9。PMID 12867029。S2CID 2320997。

[pmid12145218-9] 1 2 Kim GD、Ni J、Kelesoglu N、Roberts RJ、Pradhan S (2002 年 8 月)。「ヒトの維持型および新規 DNA (シトシン-5) メチルトランスフェラーゼ間の協力とコミュニケーション」。The EMBO Journal。21 ( 15): 4183–95。doi : 10.1093/ emboj / cdf401。PMC 126147。PMID 12145218。

[pmid14752048-10] Ling Y, Sankpal UT, Robertson AK, McNally JG, Karpova T, Robertson KD (2004). "新規DNAメチルトランスフェラーゼ3a（Dnmt3a）のSUMO-1による修飾は、ヒストン脱アセチル化酵素（HDAC）との相互作用および転写抑制能力を調節する" . Nucleic Acids Research . 32 (2): 598– 610. doi : 10.1093/nar/gkh195 . PMC 373322 . PMID 14752048 .

[pmid15148359-11] 1 2 3 Geiman TM、Sankpal UT、Robertson AK、Chen Y、Mazumdar M、Heale JT、Schmiesing JA、Kim W、Yokomori K、Zhao Y、Robertson KD (2004)。「DNMT3Bと有糸分裂染色体凝縮機構の構成要素を連結する新規DNAメチルトランスフェラーゼ複合体の単離と特性評価」。Nucleic Acids Research。32 ( 9 ) : 2716–29。doi : 10.1093 / nar / gkh589。PMC 419596。PMID 15148359。

[pmid11735126-12] 1 2 Kang ES、Park CW、Chung JH (2001 年 12 月)。「新規 DNA メチルトランスフェラーゼ Dnmt3b は、その N 末端領域を介して SUMO-1 および Ubc9 と相互作用し、SUMO-1 による修飾を受ける」。Biochemical and Biophysical Research Communications。289 ( 4): 862–8。doi : 10.1006 / bbrc.2001.6057。PMID 11735126。

[

[

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

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[ 12 ]

関数

臨床的意義

相互作用

参考文献

さらに読む

外部リンク

関連するトピック

遺伝子

酵素

免疫不全、セントロメア不安定性、顔面異常症候群

胚発生