ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| NDUFS8 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NDUFS8、CI-23k、CI23KD、TYKY、NADH:ユビキノン酸化還元酵素コアサブユニットS8、MC1DN2 |
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| 外部ID | オミム:602141; MGI : 2385079;ホモロジーン: 1867;ジーンカード:NDUFS8; OMA :NDUFS8 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 19番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 19|19A | 始める | 3,958,863 bp [2] |
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| 終わり | 3,962,774 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 心の頂点
- 右副腎
- 右副腎皮質
- 左副腎
- 左副腎皮質
- 太ももの筋肉
- 右耳介
- 左心室
- 腓腹筋
- 横行結腸粘膜
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| | トップの表現 | - 心室中隔
- 心室の心筋
- 心筋
- 外眼筋
- ヒラメ筋
- 肋間筋
- 内側前庭核
- 嗅上皮
- 深部小脳核
- 胃の上皮
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 酸化還元酵素活性、NAD(P)Hに作用する
- NADH脱水素酵素(ユビキノン)活性
- 4鉄、4硫黄クラスター結合
- 酸化還元酵素活性
- 鉄硫黄クラスター結合
- 金属イオン結合
- NADH脱水素酵素活性
| | 細胞成分 |
- ミトコンドリア呼吸鎖複合体I
- ミトコンドリアマトリックス
- レスピラソーム
- ミトコンドリア
- 膜
| | 生物学的プロセス |
- 酸化ストレスへの反応
- ミトコンドリア呼吸鎖複合体Iの組み立て
- ミトコンドリア電子伝達、NADHからユビキノン
- 好気呼吸
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001271443 NM_001271444 NM_144870 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_001258372 NP_001258373 NP_659119 |
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| 場所 (UCSC) | 11 章: 68.03 – 68.04 Mb | 19 章: 3.96 – 3.96 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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NADH 脱水素酵素 [ユビキノン] 鉄硫黄タンパク質 8、ミトコンドリアNADH-ユビキノン酸化還元酵素 23 kDa サブユニット、複合体 I-23kD (CI-23kD)、またはTYKY サブユニットとしても知られる酵素は、ヒトではNDUFS8 遺伝子によってコードされています。[5] [6] [7] [8] NDUFS8 タンパク質は、複合体 Iとしても知られるNADH 脱水素酵素 (ユビキノン)のサブユニットで、ミトコンドリア内膜に位置し、電子伝達系の 5 つの複合体の中で最大です。[9]この遺伝子の変異は、リー症候群と関連しています。[7]
構造
NDUFS8は、染色体11のq腕の13.2の位置にあります。 [7] NDUFS8遺伝子は、210個のアミノ酸からなる23.7 kDaのタンパク質を生成します。[10] [11]コードされているタンパク質TYKYには、鉄硫黄クラスターN-2結合部位であると考えられている2つの4Fe4Sフェレドキシンコンセンサスパターンが含まれています。[12]複合体Iの他のサブユニットの研究では、サブユニットTYKY、PSST、49 kDa、ND1 、およびND5が鉄硫黄クラスターと相互作用して、 NADH脱水素酵素(ユビキノン)の触媒コアを形成することが示唆されています。[13]
関数
この遺伝子は、ミトコンドリアNADH:ユビキノン酸化還元酵素、または複合体Iのサブユニットをコードします。複合体Iは、 NADHの酸化、ユビキノンの還元、およびミトコンドリアからの陽子の排出を担う呼吸鎖の多量体酵素です。コードされているタンパク質は、複合体Iの6〜8個の鉄硫黄クラスターのうち2つの結合に関与しており、電子伝達プロセスに必要です。[7]
臨床的意義
NDUFS8の変異はミトコンドリア疾患と関連付けられており、ミトコンドリア呼吸鎖の機能不全から生じる臨床的に多様な疾患群のいずれかを引き起こす可能性があります。表現型の範囲は、単一臓器に影響を及ぼす孤立性疾患から重度の多臓器疾患まで多岐にわたります。一般的な臨床的特徴には、眼瞼下垂、外眼筋麻痺、近位ミオパシーおよび運動不耐性、心筋症、感音難聴、視神経萎縮、色素性網膜症、脳症、発作、脳卒中様発作、運動失調、痙縮および乳酸アシドーシスなどがあります。ミトコンドリア疾患は、酸化リン酸化タンパク質に直接影響を及ぼすか、またはこのプロセスを実行するために必要な複雑な機構の生成に影響を与えることで呼吸鎖機能に影響を及ぼすミトコンドリアDNAまたは核DNAの変異によって引き起こされる可能性があります。[8]
NDUFS8変異はリー症候群とも関連している。リー症候群は、脳幹、視床、基底核、小脳、脊髄を含む中枢神経系の1つ以上の領域における局所的両側性病変の存在を特徴とする、早期発症の進行性神経変性疾患である。臨床的特徴は中枢神経系のどの領域が関与しているかによって異なり、亜急性発症の精神運動遅滞、筋緊張低下、運動失調、脱力、視力喪失、眼球運動異常、発作、嚥下障害、乳酸アシドーシスなどがある。[8] NDUFS8の病原性変異の症例報告の1つでは、複合体Iミトコンドリア欠乏症とリー症候群の診断が生じたことが判明した。患者の症状には、無呼吸、チアノーゼ、高炭酸ガス血症、筋緊張低下、活発な腱反射、足首クローヌス、不規則発作などがあった。さらに分析を進めると、乳酸値の上昇、脳病変、閉塞性肥大型心筋症が明らかになった。[12]
インタラクション
複合体Iの共サブユニットに加えて、NDUFS8はMLH1およびGEMとタンパク質間相互作用を有する。[14] [15]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000110717 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000059734 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ de Sury R、Martinez P、Procaccio V、Lunardi J、Issartel JP (1998 年 7 月)。「ミトコンドリア NADH:ユビキノン酸化還元酵素の鉄硫黄 TYKY サブユニットをコードするヒト NDUFS8 遺伝子のゲノム構造」。Gene . 215 (1): 1–10. doi : 10.1016/S0378-1119(98)00275-3. PMID 9666055。
- ^ Procaccio V、Depetris D、Soularue P、Mattei MG、Lunardi J、Issartel JP (1997 年 3 月)。「ミトコンドリア複合体 I の 23 kDa サブユニットをコードする NDUFS8 ヒト遺伝子の cDNA 配列と染色体位置」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子構造と発現。1351 (1–2): 37–41。doi :10.1016/s0167-4781(97)00020-1。PMID 9116042 。
- ^ abcd 「Entrez Gene: NDUFS8 NADH 脱水素酵素 (ユビキノン) Fe-S タンパク質 8、23kDa (NADH-コエンザイム Q 還元酵素)」。
- ^ abc 「NDUFS8 - NADH脱水素酵素[ユビキノン]鉄硫黄タンパク質8、ミトコンドリア前駆体 - Homo sapiens(ヒト) - NDUFS8遺伝子とタンパク質」。www.uniprot.org 。 2018年7月19日閲覧。
- ^ ドナルド・ヴォート;ジュディス・G・ヴォート;シャーロット・W・プラット (2013)。 「18」。生化学の基礎: 分子レベルでの生命(第 4 版)。ニュージャージー州ホーボーケン:ワイリー。 581–620ページ。ISBN 9780470547847。
- ^ Zong NC、Li H、Li H、Lam MP、Jimenez RC、Kim CS、Deng N、Kim AK、Choi JH、Zelaya I、Liem D、Meyer D、Odeberg J、Fang C、Lu HJ、Xu T、Weiss J、Duan H、Uhlen M、Yates JR、Apweiler R、Ge J、Hermjakob H、Ping P (2013 年 10 月)。「専門的な知識ベースによる心臓プロテオーム生物学と医学の統合」。Circulation Research。113 ( 9 ) : 1043–53。doi : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151。PMC 4076475。PMID 23965338。
- ^ Yao, Daniel. 「心臓オルガネラタンパク質アトラス知識ベース (COPaKB) —— タンパク質情報」.amino.heartproteome.org . 2018年7月20日閲覧。
- ^ ab Loeffen J、Smeitink J、Triepels R、Smeets R、Schuelke M、Sengers R、Trijbels F、Hamel B、Mullaart R、van den Heuvel L (1998 年 12 月)。 「リー症候群患者における最初の核にコードされた複合体I変異」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。63 (6): 1598–608。土井:10.1086/302154。PMC 1377631。PMID 9837812。
- ^ フランツ・シューラー;カシーダ、ジョン E. (2001-07-02)。 「光親和性標識によって確立されたNADH:ユビキノン酸化還元酵素におけるPSSTとND1サブユニットの機能的結合」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 生体エネルギー学。1506 (1): 79–87。土井: 10.1016/S0005-2728(01)00183-9。ISSN 0005-2728。PMID 11418099。
- ^ 「細胞骨格の足場タンパク質はリンチ症候群関連ミスマッチ修復タンパク質MLH1と相互作用する」IntAct。
- ^ 「ヒトRas-MAPK/PI3Kシグナル伝達経路を強調したタンパク質相互作用データセット」IntAct。
さらに読む
- Procaccio V、Wallace DC (2004 年 5 月)。 「ミトコンドリア複合体 I NDUFS8 変異 を持つ患者における遅発性リー症候群」。神経学。62 (10): 1899–901。doi :10.1212/ 01.wnl.0000125251.56131.65。PMC 2821060。PMID 15159508。
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング: 真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Dunbar DR、Shibasaki Y、Dobbie L、Andersson B、Brookes AJ (1997)。「5つのヒト呼吸鎖複合体I遺伝子のゲノムクローンのin situハイブリダイゼーションマッピング」。細胞遺伝学と細胞遺伝学。78 (1): 21–4。doi : 10.1159 /000134618。PMID 9345899 。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Triepels RH、Hanson BJ、van den Heuvel LP、Sundell L、Marusich MF、Smeitink JA、Capaldi RA (2001 年 3 月)。「ヒトの複合体 I の欠陥は、モノクローナル抗体分析によって、異なるサブユニットアセンブリパターンに解決できます」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 12): 8892–7。doi : 10.1074 /jbc.M009903200。hdl : 2066 / 185667。PMID 11112787。
- Lescuyer P、Martinez P、Lunardi J (2002 年 3月)。「YY1 と Sp1 は、ミトコンドリア複合体 I TYKY サブユニットをコードするヒト NDUFS8 遺伝子の転写を活性化します」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子構造と発現。1574 (2): 164–74。doi :10.1016/s0167-4781(01)00377-3。PMID 11955626 。
- Murray J、Taylor SW、Zhang B、Ghosh SS、Capaldi RA (2003 年 9 月)。「ペルオキシナイトライトによるミトコンドリア複合体 I への酸化損傷: 質量分析による反応性チロシンの同定」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 39): 37223–30。doi : 10.1074/ jbc.M305694200。PMID 12857734。
- Ugalde C、Janssen RJ、van den Heuvel LP、Smeitink JA、Nijtmans LG (2004 年 3 月)。「遺伝性複合体 I 欠損症における複合体 I とその他のミトコンドリア OXPHOS 複合体の組み立てまたは安定性の相違」。ヒト分子遺伝学 。13 ( 6): 659–67。doi : 10.1093/hmg/ddh071。hdl : 10261 / 369371。PMID 14749350。
- Bourges I、Ramus C、Mousson de Camaret B、Beugnot R、Remacle C、Cardol P、Hofhaus G、Issartel JP (2004 年 11 月)。「ミトコンドリアヒト複合体 I の構造的構成: ミトコンドリアエンコードサブユニット ND4 および ND5 の役割とプロヒビチンとの相互作用」。The Biochemical Journal。383 ( Pt . 3 ): 491–9。doi :10.1042/BJ20040256。PMC 1133742。PMID 15250827 。
外部リンク
- PDBe-KBのUniProt : O00217 (ヒト NADH 脱水素酵素 [ユビキノン] 鉄硫黄タンパク質 8、ミトコンドリア)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。
- PDBe-KBのUniProt : Q8K3J1 (マウス NADH 脱水素酵素 [ユビキノン] 鉄硫黄タンパク質 8、ミトコンドリア)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。