α因子に反応してシュムーを放出する細胞と 交配するサッカロミセス・セレビシエ 酵母の交配 、別名酵母の有性生殖 は、酵母種の 遺伝的多様性 と適応を促進する生物学的プロセスです。 サッカロミセス・セレビシエ (パン酵母)などの酵母種は、単細胞真核生物であり、1セットの 染色体 を含む一倍体 細胞、または2セットの染色体を含む二倍体細胞のいずれかとして存在できます。一倍体酵母細胞には、a とαの2つの交配型 があり、それぞれが反対のタイプを識別して相互作用するための特定のフェロモンを生成し、単純な 性的分化 を示します。[ a ] 酵母細胞の交配型は、その交配行動を制御するMAT と呼ばれる特定の遺伝子座 によって決定されます。一倍体酵母は、遺伝子組換え の一種によって交配型を切り替えることができ、細胞周期 ごとに交配型を変更できます。異なる接合型の2つの半数体細胞が出会うと、複雑なシグナル伝達 プロセスを経て細胞融合 が起こり、二倍体細胞が形成される。二倍体細胞は無性 生殖も可能であるが、栄養不足の条件下では減数分裂 を起こして新たな半数体胞子を生成する。
MAT遺伝子座によって制御される特定の 遺伝子発現 パターンによって生じるa細胞 とα細胞の違いは、交配過程において極めて重要である。さらに、交配の決定には、フェロモンの検出と応答機構を含む、非常に感度が高く複雑なシグナル伝達経路が関与している。自然界では、酵母の交配は近縁の細胞間で起こることが多いが、交配型の切り替えとフェロモンシグナル伝達によって、遺伝的多様 性を高めるために時折異系交配が 行われることもある。酵母種によっては独自の交配行動を示すものもあり、酵母の生殖戦略の多様性と適応性を示している。
交配タイプ 酵母細胞は、二倍体または一倍体のいずれかの形態で安定して存在することができます。一倍体および二倍体の酵母細胞はどちらも有糸分裂 によって増殖し、その過程で娘細胞が母細胞から出芽します。一倍体細胞は、反対の接合型の他の一倍体細胞(a細胞 はα細胞とのみ接合でき、その逆も同様)と接合して、安定した二倍体細胞を生成することができます。二倍体細胞は、通常、栄養不足などのストレス条件に直面すると、減数分裂を起こして4つの一倍 体胞子 (2つのa 胞子と2つのα胞子)を生成することができます。 [ 1 ] [ 2 ]
a細胞とα細胞の違い異なる交配型の2つの半数体酵母がフェロモンを分泌し、突起を伸ばし、交配する。 a 細胞は、隣接するα細胞にa 細胞の存在を知らせる交配フェロモンである α因子を産生する。 [ 3 ] a 細胞は、α細胞の交配フェロモンであるα因子に反応して、α因子の供給源に向かって突起(アル・キャップの 漫画キャラクターであるシュムーに似た独特の形状のため、シュムーとして知られる)を伸ばす。 [ 4 ] 同様に、α細胞はα因子を産生し、フェロモンの供給源に向かって突起を伸ばすことでα因子に反応する。 [ 5 ] 反対の交配型の交配フェロモンに対する半数体細胞の選択的反応により、 a 細胞とα細胞の間では交配が可能になるが、同じ交配型の細胞間では交配は不可能になる。[ 6 ]
a細胞 とα細胞の間のこれらの表現型の 違いは、2つの接合型の細胞で活発に転写され抑制される 遺伝子 のセットが異なることに起因します。 a 細胞はα 因子を生成する遺伝子を活性化し、α因子に結合して細胞内のシグナル伝達を誘発する 細胞表面受容体 (Ste2)を生成します。 [ 7 ] [ 8 ] a細胞はまた、α細胞であることに関連する遺伝子を抑制します。逆に、α細胞はα因子を生成する遺伝子を活性化し、 α 因子に結合して応答する細胞表面受容体(Ste3)を生成し、α細胞はa 細胞であることに関連する遺伝子を抑制します。[ 9 ]
MAT 遺伝子座a 細胞とα細胞を特徴づける転写抑制と活性化の異なるセットは、染色体III上に位置するMAT と呼ばれる交配型遺伝子座 の2つの対立遺伝子 (MAT a またはMATα )のいずれかの存在によって引き起こされます。 [ 10 ] MAT遺伝子 座は通常、2つの交配型間で共有される配列に基づいて5つの領域(W、X、Y、Z1、Z2)に分けられます。[ 11 ] 違いは、ほとんどの遺伝子とプロモーターを含むY領域(Y aとYα)にあります。 [ 7 ]
MAT のMAT aアレルは、a 1 と呼ばれる遺伝子をコードしており、a 特異的な転写プログラム(STE2の発現やSTE3の抑制など)を制御し、 a半数 体 細胞 を定義します。MAT のMATαアレルは、 α1 およびα2遺伝子をコードしており、α特異的な転写プログラム(STE3 の発現、STE2の抑制、 プレプロα因子の 産生など)を制御し、α 半数体細胞を定義します。[ 7 ] S. cerevisiaeには、α2と配列の大部分を共有する明らかな機能のない a 2 遺伝子がありますが、Candida albicans などの他の酵母種には、機能的で明確なMAT a 2 遺伝子があります。[ 6 ] [ 10 ]
半数体細胞と二倍体細胞の違い MAT 遺伝子座を用いた一倍体および二倍体酵母細胞における接合の制御半数体 細胞は2つの交配型(a またはα)のいずれかであり、反対の交配型の半数体細胞によって生成される交配フェロモンに反応します。[ 4 ] 半数体細胞は減数分裂を 行うことができません。[ 12 ] 二倍体 細胞はどちらの交配フェロモンも生成または反応せず、交配もしませんが、減数分裂を 行って4つの半数体細胞を生成することができます。[ 13 ]
半数体a 細胞と α 細胞の違いと同様に、遺伝子抑制と活性化の異なるパターンが、半数体細胞と二倍体細胞の表現型の違いの原因となっている。 [ 14 ] a 細胞と α 細胞の転写パターンに加えて、両方の接合型の半数体細胞は、半数体特異的遺伝子 ( HO など) を活性化し、二倍体特異的遺伝子 ( IME1 など) を抑制する半数体転写パターンを共有している。[ 15 ] 逆に、二倍体細胞は二倍体特異的遺伝子を活性化し、半数体特異的遺伝子を抑制する。[ 16 ]
半数体細胞と二倍体細胞の遺伝子発現パターンの違いは、MAT 遺伝子座に起因する。半数体細胞は16本の染色体 それぞれを1コピーしか持たないため、MAT アレル(MAT a またはMATα のいずれか)を1つしか持たず、これが接合型を決定する。[ 17 ] 二倍体細胞はa 細胞とα細胞の接合によって生じ、MAT a アレルを持つ染色体とMATα アレルを持つ染色体を含む32本の染色体(16対)を持つ。[ 18 ] MAT a アレル(a 1遺伝子)とMATα アレル(α1およびα2遺伝子)によってコード化された情報の組み合わせが、二倍体転写プログラムを活性化する。 [ 19 ] 逆に、 MAT a またはMATαのいずれか1つの MAT アレルのみが存在すると、半数体転写プログラムが活性化される。[ 20 ] [ 7 ]
遺伝子工学 によって、MATα半数体細胞に MAT a アレルを追加することで、二倍体細胞のように振る舞わせることができます。[ 21 ] この細胞は交配フェロモンを生成したり反応したりせず、飢餓状態になると減数分裂を試みますが失敗し、致命的な結果となります。[ 21 ] 同様に、二倍体細胞内のMAT 遺伝子座の 1 つのコピーを削除してMAT a またはMATα アレルを残すと、二倍体細胞は関連する交配型の半数体細胞のように振る舞います。[ 22 ] [ 23 ]
偽造細胞に似た細胞 MAT遺伝子座の α1 およびα2 遺伝子が不活性化されたα細胞は、a 細胞の交配行動を示す。a様 フェイカー(alf)細胞がα細胞と交配すると、活性なa1遺伝子のコピーを欠く二倍体細胞が形成される。 その結果、これらの二倍体細胞は、一倍体特異的遺伝子を抑制するために必要なa1-α2タンパク質複合体を形成できない。 この 二倍 体細胞は一倍体α細胞のように振る舞い、αフェロモンを産生してa一倍体細胞と交配し、 異数性 を引き起こす。[ 24 ]
α細胞は通常互いに交配しないため、α細胞集団におけるa様偽細胞の存在は、 a 様偽細胞アッセイで検出できる。この試験では、 HIS3 遺伝子の活性コピーを欠くMATα集団を、 HIS1 遺伝子を欠くYPH316酵母のような試験株にYEPD 寒天培地 上で曝露する。酵母株のペアをサボロー寒天培地に移した後、 a 様偽細胞が試験株と交配して二倍体細胞を形成したものだけが、生存に必要なアミノ酸 ヒスチジン を合成できる。a様 偽細胞は酵母細胞の第III染色体の損傷から自然に生じるため、生存したペアの割合から染色体不安定性 の程度を推測できる。[ 25 ]
交尾の決断 酵母の交配は、α細胞のa因子またはα細胞のα因子フェロモンがそれぞれα細胞のSte3受容体またはa細胞のSte2受容体に結合し、ヘテロ三量体Gタンパク質を活性化することによって刺激される。 [ 26 ] [ 27 ] [ 28 ]この G タンパク質の 二 量体 部分は、Ste5とそのMAPK カスケードを 膜 にリクルートし、 Fus3 のリン酸化 を引き起こす。[ 29 ]
スイッチング機構は、Fus3タンパク質(MAPKタンパク質)とホスファターゼ Ptc1 の間の競合の結果として生じる。[ 30 ] これらのタンパク質は両方とも、足場タンパク質である Ste5 の4つのリン酸化部位を制御しようとし、Fus3はリン酸化部位をリン酸化しようとし、Ptc1はそれらを脱リン酸化しようとする。[ 31 ]
α因子の存在は、Ste5リン酸化部位内に存在する4アミノ酸モチーフを介してPtc1をSte5にリクルートする。[ 32 ] Ptc1はSte5を脱リン酸化し、Fus3-Ste5複合体の解離を引き起こす。[ 33 ] Fus3は、4つのリン酸化部位のリン酸化状態に応じてスイッチのように解離する。[ 34 ] Fus3が解離するためには、4つのリン酸化部位すべてが脱リン酸化されている必要がある。[ 35 ] [ 36 ] Ptc1がリクルートされるにつれてFus3のPtc1との競合能力は低下し、したがってフェロモンの存在下では脱リン酸化速度が増加する。[ 37 ]
Fus3の相同体であるKss1は、シュムーイングに影響を与えず、スイッチのような交配決定にも寄与しない。[ 38 ] [ 39 ]
酵母では、交配とシュムーの生成は、全か無かのスイッチのようなメカニズムによって行われます。[ 40 ] このスイッチのようなメカニズムにより、酵母細胞は、非常に負担の大きい手順に無謀な決断をすることを避けることができます。[ 41 ] 交配の決定は、エネルギーを節約しつつ、潜在的な交配相手を失わないように十分な速さで行われる必要があります。[ 42 ]
酵母は、以下の方法で交配に対する極めて高い感受性を維持している。
多部位リン酸化 – Fus3は、4つのリン酸化部位すべてが脱リン酸化されたときにのみSte5から解離し、完全に活性化します。1つのリン酸化部位だけでもα因子に対する免疫をもたらします。[ 43 ] 2段階結合 – Fus3とPtc1はSte5上の別々のドッキング部位に結合する。ドッキング後にのみ、リン酸化部位に作用することができる。[ 44 ] 立体障害 – Ste3上の4つのリン酸化部位を制御するためのFus3とPtc1の競合 a 型 酵母と α 型酵母は同じ接合応答経路を共有しており、唯一の違いは各接合型が持つ受容体の種類である。[ 45 ] したがって、α 因子で刺激されたa 型酵母の上記の説明は、a 因子で刺激された α 型酵母のメカニズムに似ている。[ 46 ] [ 47 ]
交配型転換 半数体の酵母が分裂し、接合型転換を起こして接合し、二倍体を形成する。 野生型の一倍体酵母は、 a 型 と α 型の間で接合型を切り替えることができる。[ 48 ] その結果、特定の接合型の単一の一倍体細胞が酵母のコロニーを形成したとしても、接合型切り替えによって、集団内には a 型 と α 型の両方の接合型の細胞が存在することになる。[ 49 ] [ 50 ] 一倍体細胞が反対の接合型の細胞と接合して二倍体を形成しようとする強い衝動と相まって、接合型切り替えとそれに続く接合によって、コロニーを形成したのが一倍体細胞か二倍体細胞かに関わらず、コロニー内の細胞の大部分が二倍体になる。[ 51 ] 研究室 で研究されている酵母株 の大部分は、接合型切り替えができないように改変されている(HO 遺伝子の欠失による。下記参照)。これにより、半数体酵母の安定的な増殖が可能となる。なぜなら、a 接合型の半数体細胞はa 細胞のままであり(α細胞はα細胞のままである)、人工的に他の接合型に曝露されない限り二倍体細胞を形成できないからである。[ 52 ]
酵母染色体III上のサイレントHML およびHMR 遺伝子座と活性MAT遺伝子座の位置
HML とHMR :サイレントマッティングカセット半数体酵母は、 MAT 遺伝子座に存在する情報を置き換えることで接合型を切り替えます。[ 53 ] 例えば、a細胞は MAT a アレルをMATα アレルに置き換えることでα細胞に切り替わります。[ 54 ] MAT の一方のアレルを他方のアレルに置き換えることができるのは、酵母細胞がMAT aアレルとMATαアレルの両方のサイレンシングされたコピーを余分に持っているためです。HML(ホモタリック接合左 ) 遺伝子座 は通常MATα アレルのサイレンシングされたコピーを持ち、HMR(ホモタリック接合右 ) 遺伝子座 は 通常 MAT aアレル のサイレン シング さ れ た コピーを持っています。[ 7 ] サイレンシングされたHML およびHMR遺伝子座は、そこに存在する情報が活性 MAT 遺伝子座に「読み込まれる」ため、しばしばサイレント接合カセットと呼ばれます。[ 55 ]
これらの追加の交配型情報のコピーは発現しないため、MAT 遺伝子座に存在する対立遺伝子の機能に干渉しません。したがって、活性MAT遺伝子座に MAT a 対立遺伝子が存在する半数体細胞は、 HML に存在するMATα 対立遺伝子のサイレンシングされたコピーも持っているにもかかわらず、依然としてa 細胞です。[ 56 ] 活性MAT遺伝子座に存在する対立遺伝子のみが転写されるため、 MAT に存在する対立遺伝子のみが細胞の挙動に影響を与えます。[ 6 ] 隠れた交配型遺伝子座は、サイレンシングされた交配カセットからの転写を阻害するヘテロクロマチン 足場を形成するSIR タンパク質 によってエピジェネティックにサイレンシングされます。[ 57 ]
嵌合型スイッチのメカニズム 酵母接合型プロモーター構造 接合型転換のプロセスは、HO遺伝子によって開始される遺伝子変換イベントです。 [ 58 ] HO遺伝子 は 厳密 に 制御された半数体特異的遺伝子であり、細胞周期 のG1 期 に半数体細胞でのみ活性化されます。[ 59 ] HO 遺伝子によってコードされるタンパク質はDNA エンドヌクレアーゼ であり、物理的にDNAを切断しますが、MAT 遺伝子座でのみ切断します(HOエンドヌクレアーゼのDNA配列特異性による)。[ 60 ]
HOがMAT でDNAを切断すると、エキソヌクレアーゼが 切断されたDNA末端に引き寄せられ、切断部位の両側のDNAの分解を開始します。[ 61 ] このエキソヌクレアーゼによるDNA分解により、 MAT アレルをコードしていたDNAが除去されます。しかし、結果として生じたDNAのギャップは、HML またはHMR に存在する遺伝情報をコピーすることによって修復され、 MAT a またはMATα 遺伝子の新しいアレルが埋められます。したがって、 HML およびHMR に存在するサイレンシングされたMAT a およびMATα アレルは、活性MAT 遺伝子座におけるHO誘導DNA損傷を修復するための遺伝情報の源として機能します。[ 7 ]
嵌合型スイッチの方向性 HOエンドヌクレアーゼによる切断後のMAT 遺伝子座の修復は、ほぼ必ず接合型スイッチをもたらします。 [ 7 ] [ 60 ] a細胞が MAT 遺伝子座に存在するMAT a アレルを切断すると、 MAT での切断はほぼ必ずHML に存在する情報をコピーすることによって修復されます。[ 6 ] これによりMATは MATα アレルに修復され、細胞の接合型はa からαに切り替わります。[ 62 ] 同様に、HOエンドヌクレアーゼによってMATα アレルが切断されたα細胞は、ほぼ必ずHMR に存在する情報を使用して損傷を修復し、MAT a 遺伝子をMAT 遺伝子座にコピーして、α細胞の接合型をa に切り替えます。[ 63 ]
これは、第III染色体の左腕に位置する組換えエンハンサー (RE)の結果です。 [ 64 ] 通常、a 細胞ではMcm1が REに結合してHML領域を使用した組換えを促進します。[ 65 ] REの欠失により、a 細胞は代わりにHMRを使用して修復し、接合型を切り替えるのではなく、a 細胞の状態を維持します。 [ 66 ] α細胞では、α2因子がREに結合してHML領域を使用した組換えを抑制します。[ 67 ] したがって、酵母はHMR領域を使用してMAT 遺伝子座のDNA修復を行うというあらかじめ決められた傾向を持っています。 [ 68 ]
交配と近親交配 2006年、進化遺伝学者のレオニード・クルグリャクは、 S. cerevisiaeの 交配は、約5万回の細胞分裂ごとに異なる株間の交配のみを伴うことを発見した。酵母の交配の大部分は、同じ株のメンバー間で行われる。これは、交配型スイッチングにより、単一の子嚢から単一の半数体 細胞から両方の交配型を生成できるためである。[ 69 ] このことから、酵母は、遺伝的多様性 の高い集団における適応度 に対する自然選択 ではなく、減数分裂中の組換えDNA修復によって交配能力を主に維持していることが示唆される。[ 70 ]
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外部リンク アンドリュー・マレーのセミナー:酵母の性 糸状子嚢菌Neurospora tetrasperma の交配型染色体は、性染色体の初期進化のモデルとなる。