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| エイリアス | CHKB、CHETK、CHKL、CK、CKB、CKEKB、EK、EKB、MDCMC、コリンキナーゼ ベータ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：612395; MGI : 1328313;ホモロジーン: 88718;ジーンカード：CHKB; OMA :CHKB - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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コリンキナーゼベータ (CK)は、エタノールアミンキナーゼ (EK)、コリンキナーゼ様タンパク質、コリン/エタノールアミンキナーゼベータ (CKEKB)、またはコリン/エタノールアミンキナーゼとしても知られ、 CHKB遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] [6]この遺伝子は、ヒトの 22 番染色体にあります。コードされているタンパク質は、リン脂質の生合成において重要な役割を果たします。コリンキナーゼ (CK) とエタノールアミンキナーゼ (EK) は、ホスファチジルエタノールアミンの生合成の最初のステップを触媒します。この遺伝子座からは、下流のCPT1B遺伝子座からのエクソンを含むリードスルー転写産物が発現されます。[7] [8] [9]
構造
CHKB遺伝子は、 22番染色体のq腕の13.3番の位置にあり、4,041塩基対にまたがっています。[7] CHKB遺伝子は、 60個のアミノ酸からなる7kDaのタンパク質を生成します。[10] [11]タンパク質の構造はホモ二量体であることが判明しており、CHKAタンパク質とヘテロ二量体を形成します。[9] [8]また、触媒機能に不可欠なブレンナーホスホトランスフェラーゼコンセンサス配列など、複数の高度に保存されたドメインを含むこともわかっています。[12]
関数
CHKB遺伝子は、リン脂質生合成における重要なタンパク質をコードしています。CHKB遺伝子によってコードされるコリンキナーゼ (CK) およびエタノールアミンキナーゼ (EK) タンパク質は、in vitro でコリン/エタノールアミンをホスホコリン/ホスホエタノールアミンにリン酸化することを触媒します。触媒はマグネシウムおよびADPの存在下でATPによって制御され、コリンをホスファチジルコリンの生合成の酵素経路に送ります。これは、すべての動物細胞におけるホスホコリン/ホスホエタノールアミンの生合成の最初のステップであり、ケネディ経路によって行われます。哺乳類由来の高度に精製されたコリンキナーゼおよびその組み換え遺伝子産物は、エタノールアミンキナーゼ活性も示すことが示されており、両方の活性が同じタンパク質に存在することを示しています。ただし、このタンパク質はエタノールアミンでより高い活性を示すことが示されており、in vivo でのホスファチジルコリン生合成には大きく寄与しない可能性があります。 CHKBによってコードされるコリンキナーゼ様タンパク質はコリン/エタノールアミンキナーゼファミリーに属しますが、その正確な機能は不明です。この遺伝子には2つの異なるアイソフォームをコードする少なくとも2つの転写バリアントが見つかっており、そのうちの1つはバイシストロニックです。[7] [8] [9] [13] [14]
臨床的意義
CHKBの変異は、ミトコンドリアの欠陥や関連疾患を引き起こすことがわかっています。遺伝子のノックダウンは、コリンキナーゼとホスファチジルコリンの活性を低下させることが知られています。この活性障害は、ミトコンドリア膜のリン脂質組成の変化につながり、ミトコンドリアの機能と構造に大きな障害をもたらします。主な障害には、巨大先天性筋ジストロフィー（MDCMC）やナルコレプシーなどがあります。[7] [15]
巨大円錐型先天性筋ジストロフィー (MDCMC)
CHKB変異は、主に巨大コニア型先天性筋ジストロフィー（MDCMC）と関連している。巨大コニア型先天性筋ジストロフィー（MDCMC）は常染色体 劣性先天性筋ジストロフィーであり、筋生検の結果、ミトコンドリア肥大が見られ、筋線維の周辺では一般的であるが中心部ではまれである。[16]
MDCMCの一般的な臨床症状としては、以下のものがある：[15] [17]
c.810T>Aのホモ接合変異を持つスペイン人の患者では、神経性 萎縮、線維末梢のミトコンドリア肥大、複合体I欠乏などの症状が見られた。 [15] CHKB遺伝子のホモ接合変異（p.E292X）を持つ別の患者は、筋肉のけいれんとして特徴付けられる腕のリズミカルなけいれんを示した。[14]最後に、c.810T>Aのホモ接合を持つ患者は、ガワー徴候、筋緊張低下、近位筋の衰弱の兆候を示した。[18]
ナルコレプシー
ナルコレプシーは、日中の過度の眠気、睡眠の断片化、異常な急速眼球運動（レム）睡眠の症状、脱力発作、入眠時幻覚、睡眠麻痺を特徴とする神経学的に障害のある睡眠障害です。脱力発作は感情によって引き起こされる突然の筋緊張の喪失であり、ナルコレプシーの診断に使用される最も重要な臨床的特徴です。ヒトのナルコレプシーは主に散発的に発生する障害ですが、家族内での集積が観察されています。[19]
インタラクション
CHKBは以下のタンパク質とタンパク質相互作用を示すことが示されている。 [20] [8]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000100288 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022617 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Yamazaki N, Yamanaka Y, Hashimoto Y, Shinohara Y, Shima A, Terada H (1997年6月). 「ヒト筋肉型カルニチンパルミトイルトランスフェラーゼIをコードする遺伝子の構造的特徴」. FEBS Letters . 409 (3): 401–406. doi : 10.1016/S0014-5793(97)00561-9 . PMID 9224698.
- ^ Aoyama C, Liao H, Ishidate K (2004年5月). 「哺乳類細胞におけるコリンキナーゼアイソフォームの構造と機能」.脂質研究の進歩. 43 (3): 266–281. doi :10.1016/j.plipres.2003.12.001. PMID 15003397.
- ^ abcd 「Entrez Gene: CHKBコリンキナーゼベータ」。
この記事には、パブリック ドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています。
- ^ abcd 「CHKB - コリン/エタノールアミンキナーゼ - Homo sapiens (ヒト) - CHKB遺伝子とタンパク質」 。 2018年8月23日閲覧。 この記事には、CC BY 4.0 ライセンスに基づいて利用可能なテキストが組み込まれています。
- ^ abc 「UniProt: ユニバーサルタンパク質知識ベース」。核酸研究。45 (D1): D158–D169。2017年1月。doi : 10.1093 / nar/gkw1099。PMC 5210571。PMID 27899622 。
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- ^ 「タンパク質CHKB-CPT1B」。心臓オルガネラタンパク質アトラス知識ベース（COPaKB）。2018年8月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2018年8月23日閲覧。
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- ^ 三橋 聡、大熊 明、タリム B、唐橋 正之、幸村 剛、青山 千恵、他 (2011 年 6 月)。「ホスファチジルコリンの新規生合成不全によりミトコンドリア構造異常を伴う先天性筋ジストロフィー」。アメリカ 人類遺伝学誌。88 (6): 845–851。doi :10.1016/j.ajhg.2011.05.010。PMC 3113344。PMID 21665002。
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- ^ Mick DU、Dennerlein S、Wiese H、Reinhold R、Pacheu-Grau D、Lorenzi I、他 (2012 年 12 月)。「MITRAC はミトコンドリアタンパク質の転座を呼吸鎖の組み立てと翻訳調節に結び付ける」。Cell . 151 ( 7): 1528–1541. doi : 10.1016/j.cell.2012.11.053 . hdl : 11858/00-001M-0000-000E-DDDF-4 . PMID 23260140。
さらに読む
- Aoyama C, Liao H, Ishidate K (2004 年 5 月). 「哺乳類細胞におけるコリンキナーゼアイソフォームの構造と機能」.脂質研究の進歩. 43 (3): 266–281. doi :10.1016/j.plipres.2003.12.001. PMID 15003397.
- Collins JE、Wright CL、Edwards CA、Davis MP、Grinham JA 、 Cole CG、他 (2005)。「ゲノム注釈主導型アプローチによるヒトORFeomeのクローニング」。ゲノム生物学。5 (10): R84。doi : 10.1186 / gb - 2004-5-10 - r84。PMC 545604。PMID 15461802。
- 広沢正人、長瀬哲也、村橋裕也、菊野理、大原雄 (2001年2月)。 「発現配列タグマッピングによるヒト22番染色体上の新規転写配列の同定」。DNA 研究。8 (1): 1 ～ 9。土井：10.1093/dnares/8.1.1。PMID 11258795。
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- 青山 千恵、中島 健、松井 正、石立 憲 (1998 年 2 月)。「42 kDa ラット腎臓コリン/エタノールアミンキナーゼの相補 DNA 配列」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 脂質と脂質代謝。1390 (1): 1–7。doi : 10.1016 /s0005-2760(97)00177-x。PMID 9487136 。
- 山崎 暢、山中 勇、橋本 勇、篠原 勇、嶋 明、寺田 秀 (1997 年 6 月)。「ヒト筋肉型カルニチンパルミトイルトランスフェラーゼ I をコードする遺伝子の構造的特徴」。FEBS Letters。409 ( 3 ): 401–406。doi : 10.1016 / S0014-5793 (97)00561-9。PMID 9224698。
外部リンク
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト CHKB ゲノムの位置と CHKB 遺伝子の詳細ページ。
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト CKB ゲノムの位置と CKB 遺伝子の詳細ページ。