ウィリアム・サミュエル・ジョンソン

植民地代理人として、彼は植民地に対するイギリスの政策を厳しく批判した。イギリスでの経験から、イギリスの政策は多くの愛国者が主張するように邪悪な政府の陰謀によるものではなく、アメリカの状況に対する無知によって形成されたものであると確信した。愛国者たちの要求が過激化するにつれ、ジョンソンは心からその大義に身を捧げることが難しくなった。イギリスの政策は賢明ではないと考えていたが、母国との繋がりを断つことも難しかった。国際的に名高い学者であった彼は、イギリス国内やイギリスとアメリカのロイヤリストの間に多くの友人がいた。イギリスの作家サミュエル・ジョンソンは彼について、「人生の様々な出来事によって私の目に留まった人々の中で、あなたのように親交を深めたいと強く願った人はほとんどいない」と述べている。^{[ 12 ]}彼はまた、宗教的および職業的な繋がりによってイギリスと結びついていた。彼はイギリスの英国国教会やオックスフォードの学術コミュニティと親密な関係を築き、1766年にはオックスフォードから名誉学位を授与された。

ジョンソンは、植民地と本国双方にとって独立がもたらす結果を恐れ、極端な行動を避け、両者の政治的な相違点について妥協点を見出そうとした。しかし、数ヶ月で終わるはずだったイギリス政府に対する訴訟は5年間も長引き、その間、彼は家族と離れ離れになり、法律事務所の顧客を失い、感謝も報酬もほとんど得られず、イギリスとの関係を理由に批判にさらされた。1771年後半に帰国し、父が亡くなる直前の3ヶ月間を共に過ごした。彼は植民地の最高裁判所の判事に任命された（ 1772年～1774年）。

彼は1774年に大陸会議の代表に選出されたが、弟子のロジャー・シャーマンを優先してその栄誉を辞退した。レキシントン・コンコードの戦いの後、コネチカット議会は、彼の強い個人的な反対にもかかわらず、ボストンの愛国派マサチューセッツ民兵とイギリス軍の戦線の両方を通り抜けて、イギリス軍司令官トーマス・ゲージ将軍のもとへ彼を危険な訪問に送り込み、イギリスと単独和平を結ぶことで戦闘を終結させる交渉をさせた。彼は成功したが、再び戦線を越えてコネチカットに戻ると、議会が考えを変え、戦争に賛成票を投じ、ジョンソンに何の指示も残さずに休会していた。^{[ 13 ]}独立宣言後も、彼はアメリカ独立革命は必要なく、独立は関係者全員にとって悪いことだと信じていた。^{[ 14 ]}彼は議会と弁護士業から引退した。 1779年7月、トライオン将軍のコネチカット海岸への襲撃によりフェアフィールドとノーウォークの町が焼​​き払われた後、パニックに陥ったストラトフォードの住民は彼にタイロン将軍に取り成して町を救ってくれるよう懇願した。^{[ 15 ]}彼は反対していた危険な任務をまた引き受けることを拒否したが、町民集会が開かれ、彼がタイロンを訪問すべきだという決議が可決された。彼に同行する委員会が任命され、ジョンソンが和平努力を支持していることを示唆する購読者向け新聞がジョンソンの承認なしに印刷された。この新聞は彼の政敵に利用され、敵と連絡を取ったとして逮捕されたが、すぐに容疑は取り下げられた。

独立が達成されると、ジョンソンは新しい国の政府に自由に参加するようになった。彼は弁護士業を再開し、平和宣言後しばらくして、総会上院議員として以前の職に復帰した^{[ 16 ]。}同上院では、西部の土地をめぐるペンシルベニア州との紛争（1779～80年）において、コネチカット州の法律顧問も務めた。彼は連合会議（1785～1787年）の代表に任命された。同時代の人々は、彼の影響力を認めていた。ジェレマイア・ワズワースは友人に彼についてこう書いている。「ジョンソン博士は、あなたや私よりもはるかに大きな影響力を持っていると思います。南部の代表たちは彼をとても気に入っています。」^{[ 17 ]} 1785年、バーモント共和国は、連合会議でバーモントの利益を代表してくれたことへの感謝として、ジョンソンに旧キングス・カレッジ地区の町を与えた。 ^{[ 18 ]}バーモント州ジョンソンの町、旧ジョンソン州立大学、ウィスコンシン州マディソンのジョンソン通り^{[ 19 ]}は彼の名にちなんでいる。

1787年、ジョンソンはフィラデルフィア憲法制定会議の代表の一人として重要な役割を果たした。代表制に関する彼の雄弁な演説は、議論の中で大きな影響力を持った。彼は、コネチカット州をはじめとする小規模州の権利が、より強力な近隣州によって侵害されるのを防ぐために、強力な連邦政府が必要だと考えていた。彼は、連邦議会における各州の平等な代表権を求めるニュージャージー案を支持した。

概して、彼は連邦政府の権限拡大を支持した。司法権は「法だけでなく衡平法にも及ぶべきである」（「法と衡平法において」という文言は彼の提案で採用された）と主張した。主権は「連邦にある」ため、独立州に対する反逆罪はあり得ないと主張した。遡及的に犯罪とする事後法の禁止には反対した。なぜなら、そのような禁止は「連邦議会に対する不当な疑念」を意味すると考えたからである。

ジョンソンは憲法制定の最終段階においても影響力を持っていた。彼は、全州に平等な代表権を与える上院と人口に基づいた下院からなる連邦議会を規定した、最終的な大妥協の先駆けとなったコネチカット妥協案を全面的に支持した。また、彼は憲法の最終形態を策定した5人からなる文体委員会にも参加し、委員長も務めた。

キャサリン・ドリンカー・ボーエンは、1966年の著書『フィラデルフィアの奇跡』の中で、ジョンソンを「議論と政治戦略の達人である4人（つまり、委員会の同僚であるアレクサンダー・ハミルトン、ガバヌール・モリス、ジェームズ・マディソン、ルーファス・キング）を統括するのに最適な人物」と評している。「委員会における彼の存在は、きっと安心感を与えたに違いない。医師の物静かな態度は、彼らの警戒心を解いたのだ。」^{[ 20 ]}