| スカーブ2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | SCARB2、AMRF、CD36L2、EPM4、HLGP85、LGP85、LIMP-2、LIMPII、SR-BII、スカベンジャー受容体クラスBメンバー2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム:602257; MGI : 1196458;ホモロジーン: 48353;ジーンカード:SCARB2; OMA :SCARB2 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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リソソーム膜タンパク質2(LIMP-2)は、ヒトではSCARB2遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] LIMP-2は、脳、心臓、肝臓、肺、腎臓で主にリソソーム細胞小器官の膜に発現していますが、心筋ではLIMP-2は介在板でも発現しています。リソソーム内の膜タンパク質であるLIMP-2は、リソソーム/エンドソーム輸送を制御する働きをします。LIMP-2の変異は、ゴーシェ病、ミオクローヌスてんかん、および動作性ミオクローヌス腎不全症候群を引き起こすことが示されています。また、肥大型心筋症の患者ではLIMP-2の異常なレベルも見つかっています。
構造
ヒトLIMP-2の理論上の分子量は54.3kDaで、長さは478アミノ酸である。[6]
LIMP-2は1985年にルイスらによってラットの肝臓リソソームから最初に発見されましたが、[7] LIMP-2は1992年に2つのグループによってクローン化され、1つはヒトの転移性 膵島 腫瘍細胞から、もう1つはラットの肝臓 リソソーム膜からLIMP-2を単離しました。[8] [9] LIMP-2は、およそ77 kDaの前駆体から合成された、およそ85 kDaの分子量のタンパク質として単離されました。理論値(54.3 kDa)と実測値(85 kDa)の重量の不一致は、このタンパク質のヒト型には10個の高マンノース型N結合オリゴ糖鎖が存在するためです。マウスとラットでは11個です。[10] LIMP-2にはN末端付近とC末端付近に1つずつ疎水性領域があり、またリソソーム標的配列として機能する20アミノ酸からなるイソロイシン/ロイシンに富む短い細胞質尾部もあります。[11] [12] LIMP-2は脳、心臓、肝臓、肺、腎臓で発現することが示されている。[10]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、主にリソソームとエンドソームの境界膜に位置するIII型糖タンパク質である。マウスとラットにおける類似タンパク質の研究は、このタンパク質が膜輸送およびエンドソーム/リソソーム区画の再編成に関与している可能性を示唆した。[13]ラット肝細胞において、LIMP-2は、内部移行およびリソソーム輸送の半減期がそれぞれ32分および2.0時間であり、よく知られているリソソームタンパク質であるlamp-1およびlamp-2の半減期と類似しているが、細胞質末端のアミノ酸配列は異なる。[14]
LIMP2は最近、心筋の介在板の新規成分として特定されました。介在板はギャップ結合、接着結合、デスモソームで構成され、隣接する心筋細胞の機械的および電気的結合に重要です。この複合体の成分としてのLIMP-2の発見は、レニン過剰発現のホモ接合高血圧トランスジェニックラットモデルの遺伝子スクリーニングから生まれました。このモデルでは、これらのラットの一部が急速に心不全を発症し、他のラットは代償状態のままです。[15] 143の差次的調節遺伝子のうち、LIMP-2は心不全を起こしやすいラットの心筋生検で有意にアップレギュレーションされていることが特定され、これはヒトの心不全でも当てはまることが証明されました。 LIMP-2ノックアウトマウスを用いたさらなる解析により、LIMP-2を欠損した動物はアンジオテンシンII投与後の正常な肥大反応を示さず、間質線維症および拡張型心筋症を発症し、介在板構造が破壊されることが実証された。生化学および免疫組織化学分析により、LIMP-2はリソソーム膜の外側にある介在板でN-カドヘリンと相互作用することが判明した。RNA干渉によるLIMP-2のノックダウンにより、N-カドヘリンとリン酸化β-カテニンの結合が減少し、LIMP-2の過剰発現は逆の効果をもたらした。[16]
LIMP-2は他の臓器でも役割を果たしている。LIMP-2ノックアウトマウスで観察される特徴的な尿細管性タンパク尿は、リソソーム/エンドソーム融合の失敗によるものであることが示されており、そのため腎臓の近位尿細管で再吸収されたタンパク質が適切に分解されず、タンパク尿を引き起こす。[17]マウスにおけるLIMP-2の欠損は、細胞膜輸送プロセスを損ない、骨盤接合部閉塞、難聴、末梢神経障害を引き起こすことも報告されている。[18]
臨床的意義
大動脈弁狭窄症による肥大型心筋症の患者では、SCARB2 mRNAが有意に上昇しており、LIMP-2が肥大型マーカーとして機能する可能性があることを示唆している。[16]
SCARB2遺伝子の変異は、進行性の神経疾患を特徴とし、タンパク尿、腎不全、巣状糸球体硬化症を伴う稀な症候群であるミオクローヌス腎不全症候群を引き起こすことが示されています。[19] [20] [21]
SCARB2の変異はゴーシェ病やミオクロニーてんかんを引き起こすことも示されています[22]。LIMP -2はグルコセレブロシダーゼ酵素(ゴーシェ病で欠損している酵素)を適切に選別してリソソームに送るために重要であるためです。
SCARB2は、小児の手足口病を引き起こす2つのウイルス、エンテロウイルス71とコクサッキーウイルスA16の受容体である。[23]
インタラクション
LIMP-2 は以下と相互作用することが示されています:
- N-カドヘリン[16 ]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000138760 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029426 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: SCARB2 スカベンジャー受容体クラス B、メンバー 2」。
- ^ 「ヒトSCARB2のタンパク質配列(Uniprot ID:Q14108)」。心臓オルガネラタンパク質アトラスナレッジベース(COPaKB)。2015年7月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2015年7月14日閲覧。
- ^ Lewis V, Green SA, Marsh M, Vihko P, Helenius A, Mellman I (1985年6月). 「リソソーム膜の糖タンパク質」. The Journal of Cell Biology . 100 (6): 1839–47. doi :10.1083/jcb.100.6.1839. PMC 2113609. PMID 3922993 .
- ^ 藤田 英、高田 裕、河野 亜、田中 裕、高橋 哲、姫野 正、加藤 和 (1992 年 4 月). 「ヒト転移性膵島腫瘍細胞における 85 kDa ヒトリソソームシアロ糖タンパク質 (hLGP85) をコードする cDNA クローンの単離と配列決定」。生化学および生物物理学研究コミュニケーション。184 (2): 604-11。土井:10.1016/0006-291X(92)90632-U。PMID 1374238。
- ^ Akasaki K, Kinoshita H, Fukuzawa M, Maeda M, Yamaguchi Y, Furuno K, Tsuji H (1992年1月). 「ラット肝臓リソソームからの分子量85,000の新規膜糖タンパク質の単離と特性評価」. Chemical & Pharmaceutical Bulletin . 40 (1): 170–3. doi : 10.1248/cpb.40.170 . PMID 1576668.
- ^ ab Tabuchi N, Akasaki K, Sasaki T, Kanda N, Tsuji H (1997年10月). 「マウス肝臓における主要なリソソーム膜糖タンパク質LGP85/LIMP IIの同定と特性評価」Journal of Biochemistry . 122 (4): 756–63. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021820. PMID 9399579.
- ^ Ogata S, Fukuda M (1994年2月). 「Limp II膜糖タンパク質のリソソーム標的化には、細胞質末端の特定の位置に新しいLeu-Ileモチーフが必要」. The Journal of Biological Chemistry . 269 (7): 5210–7. doi : 10.1016/S0021-9258(17)37676-7 . PMID 8106503.
- ^ Sandoval IV、Arredondo JJ、Alcalde J、Gonzalez Noriega A、Vandekerckhove J、Jimenez MA、Rico M (1994 年 3 月)。「拡張カルボキシル細胞質末端に含まれる残基 Leu(Ile)475-Ile(Leu、Val、Ala)476 は、常在リソソーム膜タンパク質 LIMP II をリソソームに標的化するために重要です」。The Journal of Biological Chemistry。269 ( 9): 6622–31。doi : 10.1016/S0021-9258(17)37418-5。PMID 7509809 。
- ^ Gonzalez A, Valeiras M, Sidransky E, Tayebi N (2014年2月). 「リソソーム膜タンパク質2:リソソーム関連病理学における新たな役割」.分子遺伝学と代謝. 111 (2): 84–91. doi :10.1016/j.ymgme.2013.12.005. PMC 3924958. PMID 24389070 .
- ^ Akasaki K, Michihara A, Fukuzawa M, Kinoshita H, Tsuji H (1994年9月). 「培養ラット肝細胞における細胞表面とリソソーム間の85kDaリソソーム膜糖タンパク質のサイクリング」. Journal of Biochemistry . 116 (3): 670–6. PMID 7852289.
- ^ シュローン B、ヘイマンズ S、シャルマ U、ブランケシュタイン WM、ポハレル S、クロイエンス JP、ポーター JG、エベロ CT、デュスタース R、ファン レーウェン RE、ヤンセン BJ、デベッツ JJ、スミッツ JF、デーメン MJ、クラインズ HJ、ボーンスタイン P、ピント YM (2004 年 9 月)。 「トロンボスポンジン 2 は心筋マトリックスの完全性にとって不可欠です。発現の増加は不全を起こしやすい心肥大を識別します。」循環研究。95 (5): 515-22。土井: 10.1161/01.RES.0000141019.20332.3e。PMID 15284191。
- ^ abc シュローン B、レンダース JJ、ファン エルク A、ベルトランド AT、ファン ルーン M、ファン レーウェン RE、クッベン N、デュスタース RF、シェリングス MW、ヤンセン BJ、デベッツ JJ、シュウェイク M、ホイダル MA、ヘイマンズ S、サフティグ P、ピント YM (2007 年 5 月)。 「リソソーム内在性膜タンパク質 2 は、心臓挿入椎間板の新規成分であり、負荷誘発性心筋細胞肥大に不可欠です。」実験医学ジャーナル。204 (5): 1227–35。土井:10.1084/jem.20070145。PMC 2118572。PMID 17485520。
- ^ Desmond MJ、Lee D、Fraser SA、Katerelos M、Gleich K、Martinello P、Li YQ、Thomas MC、Michelucci R、Cole AJ、Saftig P、Schwake M、Stapleton D、Berkovic SF、Power DA (2011 年 6 月)。「内因性リソソームタンパク質 SCARB2/Limp-2 を欠くマウスおよびヒトの尿細管タンパク尿」。American Journal of Physiology 。腎生理学。300 ( 6): F1437–47。doi : 10.1152 /ajprenal.00015.2011。PMID 21429972。S2CID 25993341 。
- ^ Gamp AC, Tanaka Y, Lüllmann-Rauch R, Wittke D, D'Hooge R, De Deyn PP, Moser T, Maier H, Hartmann D, Reiss K, Illert AL, von Figura K, Saftig P (2003 年 3 月). 「LIMP-2/LGP85 欠損はマウスの尿管腎盂接合部閉塞、難聴、末梢神経障害を引き起こす」. Human Molecular Genetics . 12 (6): 631–46. doi : 10.1093/hmg/ddg062 . PMID 12620969.
- ^ Balreira A、Gaspar P、Caiola D、Chaves J、Beirão I、Lima JL、Azevedo JE、Miranda MC (2008 年 7 月)。「進行性ミオクロニーてんかんおよびネフローゼ症候群に関連する LIMP-2 遺伝子のナンセンス変異」。Human Molecular Genetics。17 ( 14 ) : 2238–43。doi : 10.1093/hmg/ddn124。hdl : 10400.16 / 885。PMID 18424452 。
- ^ Berkovic SF、Dibbens LM、Oshlack A、Silver JD、Katerelos M、Vears DF、Lüllmann-Rauch R、Blanz J、Zhang KW、Stankovich J、Kalnins RM、Dowling JP、Andermann E、Andermann F、Faldini E、D'Hooge R、Vadlamudi L、Macdonell RA、Hodgson BL、Bayly MA、Savige J、Mulley JC、Smyth GK、Power DA、Saftig P、Bahlo M (2008 年 3 月)。「3 人の無関係な被験者によるアレイベースの遺伝子発見により、SCARB2/LIMP-2 欠損がミオクローヌスてんかんおよび糸球体硬化症を引き起こすことが示される」。American Journal of Human Genetics。82 (3): 673–84。doi :10.1016/j.ajhg.2007.12.019. PMC 2427287. PMID 18308289 .
- ^ Hopfner F、Schormair B、Knauf F、Berthele A、Tölle TR、Baron R、Maier C、Treede RD、Binder A、Sommer C、Maihöfner C、Kunz W、Zimprich F、Heemann U、Pfeufer A、Näbauer M、Kääb S、Nowak B、Gieger C、Lichtner P、Trenkwalder C、Oexle K、Winkelmann J (2011 年 10 月 27 日)。「活動性ミオクローヌス腎不全症候群における新規 SCARB2 変異および孤立性 AMRF 特徴における SCARB2 変異の評価」。BMC Neurology。11 : 134。doi : 10.1186 / 1471-2377-11-134。PMC 3222607。PMID 22032306。
- ^ Velayati A、DePaolo J、Gupta N、Choi JH、Moaven N、Westbroek W、Goker-Alpan O、Goldin E、Stubblefield BK、Kolodny E、Tayebi N、Sidransky E (2011 年 11 月)。 「SCARB2の変異はゴーシェ病の修飾因子である」。人間の突然変異。32 (11): 1232–8。土井:10.1002/humu.21566。PMC 3196787。PMID 21796727。
- ^ 山吉 S、山下 Y、李 J、花形 N、箕輪 T、竹村 T、小池 S (2009 年 7 月)。 「スカベンジャー受容体 B2 はエンテロウイルス 71 の細胞受容体です。」自然医学。15 (7): 798–801。土井:10.1038/nm.1992。PMID 19543282。S2CID 9192537 。
さらに読む
- Eskelinen EL、Tanaka Y 、 Saftig P (2003 年 3 月)。「酸性の境界で: リソソーム膜タンパク質の新たな機能」。Trends in Cell Biology。13 ( 3): 137–45。doi : 10.1016 /S0962-8924(03)00005-9。PMID 12628346。
- Sandoval IV、Arredondo JJ、Alcalde J、Gonzalez Noriega A、Vandekerckhove J、Jimenez MA、Rico M (1994 年 3 月)。「拡張カルボキシル細胞質テールに含まれる残基 Leu(Ile)475-Ile(Leu、Val、Ala)476 は、常在リソソーム膜タンパク質 LIMP II をリソソームに標的化するために重要です」。The Journal of Biological Chemistry。269 (9): 6622–31。doi : 10.1016/ S0021-9258 (17)37418-5。PMID 7509809。
- Calvo D、Dopazo J、Vega MA (1995 年 1 月)。「CD36、CLA-1 (CD36L1)、および LIMPII (CD36L2) 遺伝子ファミリー: 細胞分布、染色体位置、および遺伝的進化」。Genomics . 25 ( 1): 100–6. doi :10.1016/0888-7543(95)80114-2. PMID 7539776。
- Crombie R、Silverstein R (1998 年 2 月)。「リソソーム膜タンパク質 II はトロンボスポンジン 1 に結合する。細胞接着分子 CD36 との構造機能相同性により、保存された認識モチーフが定義される」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 9): 4855–63。doi : 10.1074/jbc.273.9.4855。PMID 9478926。
- Harris RA、Yang A、Stein RC、Lucy K、Brusten L、Herath A、Parekh R、Waterfield MD、O'Hare MJ、Neville MA、Page MJ、Zvelebil MJ (2002 年 2 月)。「広範なヒト乳がん細胞株タンパク質発現マップ データベースのクラスター分析」。プロテオミクス。2 ( 2 ): 212–23。doi : 10.1002/1615-9861(200202) 2 :2<212::AID-PROT212>3.0.CO;2-H。PMID 11840567。S2CID 44946014 。
- Wistow G、Bernstein SL、Wyatt MK、Fariss RN、Behal A、Touchman JW、Bouffard G、Smith D、Peterson K (2002 年 6 月)。「NEIBank プロジェクトのためのヒト RPE/脈絡膜の発現配列タグ分析: 6000 を超える非冗長転写産物、新規遺伝子、スプライスバリアント」。Molecular Vision。8 : 205–20。PMID 12107410 。
- Kuronita T、Eskelinen EL、Fujita H、Saftig P、Himeno M、Tanaka Y (2002 年 11 月)。「エンドソームとリソソームの形態の生合成と維持におけるリソソーム膜タンパク質 LGP85 の役割」。Journal of Cell Science。115 ( Pt 21): 4117–31。doi :10.1242/jcs.00075。PMID 12356916。S2CID 23366278 。
- Rodionov DG、Höning S、Silye A、Kongsvik TL、von Figura K、Bakke O (2002 年 12 月)。「ロイシン選別シグナルとクラスリン関連アダプタータンパク質複合体 AP3 間の相互作用の構造要件」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 49): 47436–43。doi : 10.1074/jbc.M207149200。PMID 12370188。
- Gamp AC、Tanaka Y、Lüllmann-Rauch R、Wittke D、D'Hooge R、De Deyn PP、Moser T、Maier H、Hartmann D、Reiss K、Illert AL、von Figura K、Saftig P (2003 年 3 月)。「LIMP-2/LGP85 欠損はマウスの尿管腎盂接合部閉塞、難聴、末梢神経障害を引き起こす」。ヒト分子遺伝学。12 (6 ) : 631–46。doi : 10.1093/hmg/ ddg062。PMID 12620969 。
- Zhang H、Li XJ、Martin DB、Aebersold R (2003 年 6 月)。「ヒドラジド化学、安定同位体標識、質量分析法を用いた N 結合型糖タンパク質の同定と定量」。Nature Biotechnology 21 ( 6): 660–6. doi :10.1038/nbt827. PMID 12754519. S2CID 581283.
- Mulcahy JV、 Riddell DR、Owen JS (2004 年 2 月)。「ヒトスカベンジャー受容体クラス B タイプ II (SR-BII) と細胞コレステロール排出」。The Biochemical Journal。377 ( Pt 3): 741–7。doi :10.1042/ BJ20030307。PMC 1223905。PMID 14570588。
- Eckhardt ER、Cai L、Shetty S、Zhao Z、Szanto A、Webb NR、Van der Westhuyzen DR (2006 年 2 月)。「スカベンジャー受容体 SR-BII による高密度リポタンパク質エンドサイトーシスはクラスリン依存性であり、カルボキシル末端ジロイシンモチーフを必要とする」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 7 ): 4348–53。doi : 10.1074/jbc.M513154200。hdl : 2437 /112281。PMID 16368683 。
- Gupta SN、Kloster MM、Rodionov DG、Bakke O (2006 年 6 月)。「LIMP II からの AP3 結合モチーフの導入による不変鎖の直接選別経路への再ルーティング」。European Journal of Cell Biology。85 ( 6): 457–67。doi :10.1016/ j.ejcb.2006.02.001。PMID 16542748 。
- Tserentsoodol N、Gordiyenko NV、Pascual I、Lee JW、Fliesler SJ 、 Rodriguez IR (2006)。「網膜内脂質輸送は高密度リポタンパク質様粒子とクラス B スカベンジャー受容体に依存する」。Molecular Vision。12 : 1319–33。PMID 17110915 。
- グローブ J、ヒュービー T、スタマタキ Z、ヴァンウォレゲム T、ミュールマン P、ファーカー M、シュワルツ A、モロー M、オーウェン JS、ルルー ロエルズ G、バルフ P、マッキーティング JA (2007 年 4 月)。 「スカベンジャー受容体BIおよびBIIの発現レベルはC型肝炎ウイルスの感染力を調節する」。ウイルス学ジャーナル。81 (7): 3162–9。土井:10.1128/JVI.02356-06。PMC 1866051。PMID 17215280。
