ヒトのタンパク質コード遺伝子
| SDHAF2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SDHAF2、C11orf79、PGL2、SDH5、コハク酸脱水素酵素複合体アセンブリ因子2 |
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| 外部ID | オミム：613019; MGI : 1913322;ホモロジーン: 32370;ジーンカード：SDHAF2; OMA :SDHAF2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置（マウス） |
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 | | クロ。 | 19番染色体（マウス）[2] |
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| | バンド | 19|19A | 始める | 10,477,898 bp [2] |
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| 終わり | 10,503,506 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| トップの表現 | - ランゲルハンス島
- 下垂体前葉
- 顆粒球
- 単球
- 回腸粘膜
- 心の頂点
- 横行結腸粘膜
- 右副腎
- 左副腎
- 右副腎皮質
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| | トップの表現 | - 耳板
- 球形嚢
- 心室中隔
- 耳小胞
- 胸鎖乳突筋
- 心室の心筋
- 心筋
- 側頭筋
- 二腹筋
- 胎児肝臓造血前駆細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- ミトコンドリアマトリックス
- ミトコンドリア
- 核小体
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- ミトコンドリア電子伝達、コハク酸からユビキノン
- タンパク質-FAD結合
- トリカルボン酸回路
- ミトコンドリア呼吸鎖複合体 II の組み立て
- タンパク質の脱リン酸化
- 上皮間葉転換の負の調節
- 標準的なWntシグナル伝達経路の負の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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コハク酸脱水素酵素複合体アセンブリ因子2は、以前はSDH5として知られ、 SDHアセンブリ因子2またはSDHAF2としても知られ、ヒトではSDHAF2遺伝子によってコードされるタンパク質です。この遺伝子は、複合体の活性に必要なコハク酸脱水素酵素複合体サブユニットのフラビン化に必要なミトコンドリアタンパク質をコードします。この遺伝子の変異は、褐色細胞腫および傍神経節腫に関連しています 。[5]
構造
SDHAF2 は、染色体 11のq 腕の 12.2 番の位置にあり、16,642 塩基対にまたがっています。[5] SDHAF2遺伝子は、65 個のアミノ酸からなる 6.7 kDa のタンパク質を生成します。[6] [7]この高度に保存されたタンパク質は、フラビンアデニンジヌクレオチド(FAD)の補因子です。[8]この構造は、明確に定義された保存された表面残基の領域を持つ 5 本のらせん束を表しています。この保存された領域には、負に帯電した周辺部と正に帯電した表面、および疎水性のパッチが含まれます。この領域は、 α ヘリックスI、II、および接続バンドにあります。 [9]
関数
SDHAF2遺伝子は、電子伝達系とクレブス (トリカルボン酸) 回路の両方で重要な役割を果たすミトコンドリア呼吸鎖のコハク酸脱水素酵素 (SDH) 複合体 (ミトコンドリア複合体 II)に関連するミトコンドリアタンパク質をコードします。SDHAF2 は、主に SDH 依存性呼吸において SDH 複合体の適切な機能に不可欠であり、複合体の触媒サブユニットと相互作用します。SDHAF2 は、 SDH 複合体の別のサブユニットであるSDH1 (SDHA) のフラビ化に関与します。これは、フラビンアデニンジヌクレオチド(FAD) 補因子をSDHAに組み込むことによって行われます。このようなフラビ化は、完全に機能する SDH 複合体に必要です。SDHAF2 のノックダウンは、SDH 複合体の機能喪失、酵素複合体の安定性の低下、およびすべてのサブユニットの大幅な減少につながります。SDHAF2 は腫瘍抑制因子としても機能することがわかっています。[10] [11] [12] [13]
臨床的意義
SDHAF2は腫瘍抑制遺伝子である。この遺伝子の構成的変異は遺伝性 傍神経節腫を引き起こす。これは神経内分泌腫瘍であり、以前はSDHサブユニット変異に関連していることが知られていた。傍神経節腫は神経堤腫瘍であり、通常は傍神経節の化学受容器組織に由来し、頭部、頸部、胸部、腹部など、さまざまな部位に発生する可能性がある。最も一般的には頭頸部領域、具体的には頸動脈分岐部、頸静脈孔、迷走神経、中耳に発生する。[14]表現型には、過剰なカテコールアミン誘発性高血圧、主要血管および脳神経の機能不全、重大な病的状態、発汗、動悸などがある。副腎外に局在する場合、腫瘍は転移性かつ攻撃的になる可能性がある。SDH複合体の機能喪失は、傍神経節腫の原因であることが知られています。[12] [11] [10]この遺伝子の変異は、この疾患の患者のごく一部のDNAにのみ見られます。 [11]
インタラクション
SDHAF2はSDH触媒二量体内のSDHAと相互作用する。SDHAに加えて、SDHAF2には17のタンパク質間相互作用があり、その中にはIMMT、SUCLG2、UBINEDDSUMO1、SSX2IPなどのタンパク質との相互作用が含まれる。 [ 15]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000167985 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024668 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab 「Entrez Gene: コハク酸脱水素酵素複合体アセンブリ因子 2」。
- ^ Zong NC、Li H、Li H、Lam MP、Jimenez RC、Kim CS、Deng N、Kim AK、Choi JH、Zelaya I、Liem D、Meyer D、Odeberg J、Fang C、Lu HJ、Xu T、Weiss J、Duan H、Uhlen M、Yates JR、Apweiler R、Ge J、Hermjakob H、Ping P (2013 年 10 月)。「専門的な知識ベースによる心臓プロテオーム生物学と医学の統合」。Circulation Research。113 ( 9 ) : 1043–53。doi : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151。PMC 4076475。PMID 23965338。
- ^ Yao, Daniel. 「心臓オルガネラタンパク質アトラス知識ベース (COPaKB) —— タンパク質情報」.amino.heartproteome.org . 2018年7月23日閲覧。
- ^ Starker LF、Delgado-Verdugo A、Udelsman R、Björklund P、Carling T（2010年12月）。「原発性副甲状腺機能亢進症の副甲状腺腫瘍における新規内分泌腫瘍抑制遺伝子SDHAF2（SDH5）の発現と体細胞変異」。内分泌。38 （ 3 ）：397–401。doi ：10.1007/s12020-010-9399-0。PMID 20972721。S2CID 25914943 。
- ^ Eletsky A, Jeong MY, Kim H, Lee HW, Xiao R, Pagliarini DJ, Prestegard JH, Winge DR, Montelione GT, Szyperski T (2012 年 10 月). 「酵母コハク酸脱水素酵素フラビニル化因子 Sdh5 の溶液 NMR 構造により推定 Sdh1 結合部位が明らかに」.生化学. 51 (43): 8475–7. doi :10.1021/bi301171u. PMC 3667956. PMID 23062074 .
- ^ ab Hao HX、Khalimonchuk O、Schraders M、Dephoure N、Bayley JP、Kunst H、Devilee P、Cremers CW、Schiffman JD、Bentz BG、Gygi SP、Winge DR、Kremer H、Rutter J (2009 年 8 月)。「コハク酸脱水素酵素のフラビン化に必要な遺伝子 SDH5 が傍神経節腫で変異している」。Science。325 ( 5944 ) : 1139–42。Bibcode : 2009Sci ...325.1139H。doi : 10.1126 /science.11 75689。PMC 3881419。PMID 19628817。
- ^ abc ベイリー JP、クンスト HP、カスコン A、サンピエトロ ML、ガアル J、コルペルシューク E、ヒノハル＝グティエレス A、ティマーズ HJ、ホーフスルート LH、ヘルムセン MA、スアレス C、フセイン AK、フレンズ AH、ヘス FJ、ヤンセン JC、トップスCM、Corssmit EP、de Knijff P、Lenders JW、クレマース CW、デヴィリー P、ディンジェンス WN、デ クライガー RR、ロブレド M (2010 年 4 月)。 「家族性および散発性傍神経節腫および褐色細胞腫における SDHAF2 変異」。ランセット。腫瘍学。11 (4): 366–72。doi :10.1016/S1470-2045(10)70007-3. PMID 20071235.
- ^ ab Kugelberg J, Welander J, Schiavi F, Fassina A, Bäckdahl M, Larsson C, Opocher G, Söderkvist P, Dahia PL, Neumann HP, Gimm O (2014 年 3 月). 「フォン ヒッペル リンドウ関連褐色細胞腫における SDHAF2 と SDHD の役割」. World Journal of Surgery . 38 (3): 724–32. doi :10.1007/s00268-013-2373-2. PMID 24322175. S2CID 11895429.
- ^ Pagon RA、Adam MP、Ardinger HH、他 (1993)。「遺伝性傍神経節腫-褐色細胞腫症候群」。PMID 20301715 。
- ^ 「SDHAF2 - ミトコンドリアのコハク酸脱水素酵素アセンブリ因子2」。www.uniprot.org 。 2018年7月18日閲覧。
- ^ ケリアン S、アラム=ファルク Y、アランダ B、バンカルズ I、ブリッジ A、デロウ C、ディマー E、フォイアーマン M、フリードリヒセン A、ハントリー R、コーラー C、カダケ J、リロイ C、リバン A、リーフティンク C、モンテッキ-パラッツィ L、オーチャード S、リッセ J、ロブ K、ローチャート B、ソーニークロフト D、チャン Y、アプワイラー R、ヘルムヤコブ H (2007 年 1 月)。 「IntAct -- 分子相互作用データのオープンソース リソース」。核酸研究。35 (データベースの問題): D561-5。CiteSeerX 10.1.1.279.8196。土井：10.1093/nar/gkl958。PMC 1751531。PMID 17145710。
さらに読む
- ベイサル BE、ファー JE、ルービンスタイン WS、ガルス RA、ジョンソン KA、アストン CE、マイヤーズ EN、ジョンソン JT、カラウ R、カークパトリック SJ、ミシオレク D、シン D、サハ S、ゴリン SM、エヴァンス GA、ジェームズ MR、リチャード CW （1997年1月）。 「染色体 11q23 上の家族性非クロム親和性傍神経節腫のインプリント遺伝子の詳細なマッピング」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。60 (1): 121-32。PMC 1712548。PMID 8981955。
- Gaal J、Burnichon N、Korpershoek E、Roncelin I、Bertherat J、Plouin PF、de Krijger RR、Gimenez-Roqueplo AP、Dinjens WN (2010 年 3 月)。「イソクエン酸脱水素酵素の変異は褐色細胞腫および傍神経節腫ではまれである」。臨床内分泌学および代謝学ジャーナル。95 (3): 1274–8。doi : 10.1210 / jc.2009-2170。PMID 19915015 。
- Kunst HP、Rutten MH、de Mönnink JP、Hoefsloot LH、Timmers HJ、Marres HA、Jansen JC、Kremer H、Bayley JP、Cremers CW (2011 年 1 月)。 「SDHAF2 (PGL2-SDH5) および遺伝性頭頸部傍神経節腫」。臨床がん研究。17 (2): 247–54。土井: 10.1158/1078-0432.CCR-10-0420。PMID 21224366。
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。
