ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
SCO2 利用可能な構造 PDB オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス SCO2 、CEMCOX1、MYP6、SCO1L、SCO2 シトクロム c オキシダーゼ アセンブリ タンパク質、シトクロム c オキシダーゼ アセンブリ タンパク質、PD-ECGF、TP、グリオスタチン、TYMP、ECGF1、TdRPase、SCO シトクロム c オキシダーゼ アセンブリ タンパク質 2、シトクロム c オキシダーゼ 2 の合成、MC4DN2 外部ID オミム : 604272; MGI : 3818630; ホモロジーン : 68444; ジーンカード :SCO2; OMA :SCO2 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 15番染色体(マウス) [2] バンド 15|15 E3 始める 89,255,840 bp [2] 終わり 89,258,049 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 右子宮管 顆粒球 横行結腸粘膜 単球 歯肉上皮 生殖腺 眼瞼結膜 歯周繊維 肝臓の右葉 気管支上皮
トップの表現 卵黄嚢 胚盤胞 胚 十二指腸 結腸 近位尿細管 右腎臓 太ももの筋肉 小腸 桑実胚
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合
銅イオン結合
金属イオン結合
タンパク質ジスルフィド還元酵素活性
細胞成分
筋原線維
ミトコンドリアマトリックス
ミトコンドリア内膜
ミトコンドリア
ミトコンドリア内膜の不可欠な構成要素
膜
膜の不可欠な構成要素
生物学的プロセス
細胞銅イオン恒常性
銅イオン輸送
目の発達
呼吸鎖複合体IVアセンブリ
細胞の酸化還元恒常性
ミトコンドリアシトクロムc酸化酵素の組み立て
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_005138 NM_001169109 NM_001169110 NM_001169111
RefSeq (タンパク質) NP_001162580 NP_001162581 NP_001162582 NP_005129
場所 (UCSC) 22章: 50.52 – 50.53 Mb 15 章: 89.26 – 89.26 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
SCO2 シトクロム c 酸化酵素アセンブリ( SCO2 ホモログ、ミトコンドリア および SCO シトクロム酸化酵素欠損ホモログ 2 とも呼ばれる ) は 、ヒトでは SCO2 遺伝子によってコードされる タンパク質 です。 [5] [6] [7]コードされるタンパク質は 、シトクロム c 酸化酵素 (COX) (複合体 IV) アセンブリ因子 の 1 つです。ヒト COX は、複数のアセンブリ因子を必要とする 多量体 タンパク質複合体です。 シトクロム c 酸化酵素 (COX) は、 シトクロム cから 分子状酸素 への 電子の移動 を触媒し 、好気性 ATP 生成に必要な ミトコンドリア内膜 を横切る プロトン勾配を 維持するのに役立ちます。コードされるタンパク質は、 シトクロム c 酸化酵素サブユニット II の生合成に関与する メタロシャペロンです。この遺伝子の変異は、致死的な乳児脳心筋症および 近視 と関連しています 6。 [7]
構造
SCO2遺伝子は、 22番染色体 の q腕 の 13.33番の位置にあり、2,871塩基対にまたがっています。 [7] SCO2遺伝子 は 、 136個の アミノ酸 からなる15.1 kDaのタンパク質を生成します 。 [8] [9] このタンパク質は、 41個の アミノ酸からなる N末端 ミトコンドリア標的プレシーケンスを含み 、 ヒトSCO2の グリシン -102から グリシン -242の間の領域で 酵母タンパク質と同一性を共有しています。 [10] SCO2は 、哺乳類シトクロムc酸化酵素(COX) (複合体IV) のサブユニットです。 [7]
関数
SCO2 遺伝子 は、 ミトコンドリア呼吸鎖の哺乳類 シトクロム c 酸化酵素 (COX) (複合体IV) の組み立てと機能に必須の タンパク質をコードしています。SCO2は、 複合体IV の必須サブユニットである シトクロム c 酸化酵素サブユニットII の 生合成 に関与する メタロシャペロン として機能します。複合体IVは、 シトクロム c から 二核銅A中心を介して 触媒サブユニット1 の二金属中心に電子を転送します。 [11]この生合成では、 シトクロム c 酸化酵素サブユニットII のCu(A)部位に銅が輸送され 、サブユニットが適切に合成され成熟します。さらに、SCO2は チオール ジスルフィド 酸化 還元酵素として機能し、 シトクロム c 酸化酵素サブユニットII の成熟中に SCO1 の システイン の酸化還元状態を制御します 。 シトクロムc酸化酵素サブユニットII の成熟と合成は、 哺乳類のシトクロムc酸化酵素(COX) (複合体IV) の機能に必要である。 [12] [13] 複合体IVは 、いくつかの組み立て因子を必要とする 多量体 タンパク質複合体であり、 シトクロムcから分子状 酸素 への 還元当量の転移を 触媒し 、 ミトコンドリア内膜 を越えて プロトン をポンプする。 [7]
臨床的意義
銅 と 酸素 の調節を変える SCO2 の変異は 、シトクロムc酸化酵素欠損1(CEMCOX1)、 近視6 (MYP6)、および リー症候群 (LS)による致死的な乳児心脳筋症に関連することがわかっています。 [14] [12] CEMCOX1は、 筋緊張低下 、 発達遅延 、 肥大型心筋症 、 乳酸 アシドーシス、神経膠症、 基底 核 、 脳幹 および 脊髄 におけるニューロン喪失 、および シトクロムc酸化酵素 欠損を特徴とする疾患によって特徴付けられます 。 近視6は、遠くの物体からの平行光線が 網膜 の前で焦点を合わせる目の 屈折 異常によって特徴付けられ、近くの物体の方が遠くの物体よりもよく見えます。最後に、 リー症候群は、 脳幹 、 視床 、 基底核 、 小脳 、 脊髄 を含む 中枢神経系 の1つ以上の領域における局所的かつ両側性の 病変 の存在を特徴とする、 早期発症の進行性 神経変性疾患です。臨床症状には、 精神運動遅滞 、 筋緊張低下 、 運動失調 、脱力、 視力喪失 、 眼球運動 異常、 発作 、 嚥下障害 などがあります 。 [12] 患者のG1541Aの病原性変異は、SMA 1表現型を伴う新生児 筋緊張低下の強力な証拠を示しており、 COX 欠損が少ないことが判明しています 。 [15] 1602T>Gの変異は、急速に進行する疾患 表現型 を引き起こすことが判明しています。 [16] その他の病原性変異としては、 E140Kの ミスセンス変異、Q53Xの ナンセンス変異 、および重度のタンパク質不安定性をもたらす1541G>A変異が挙げられる。 [17] [18] [19]
インタラクション
共複合体相互作用に加えて、SCO2はCOX20 依存的に COA6 、THEM177 、 COX20 、COX16 、 SCO1 など と相互作用することが分かっています。 [12] [20]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000284194 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000091780 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ Paret C, Ostermann K, Krause-Buchholz U, Rentzsch A, Rödel G (1999年3月). 「SCO1遺伝子ファミリーのヒトメンバー:酵母における相補性解析と細胞内局在」. FEBS Letters . 447 (1): 65– 70. doi : 10.1016/S0014-5793(99)00266-5 . PMID 10218584.
^ Horng YC、Leary SC、Cobine PA、Young FB、George GN、Shoubridge EA、Winge DR (2005 年 10 月)。「ヒト Sco1 および Sco2 は銅結合タンパク質として機能する」。The Journal of Biological Chemistry。280 ( 40): 34113– 22。doi : 10.1074/ jbc.M506801200。PMID 16091356 。
^ abcde 「Entrez Gene: SCO2 SCO2 シトクロム c オキシダーゼアセンブリタンパク質 [ Homo sapiens (ヒト) ]」。
^ Zong NC、Li H、Li H、Lam MP、Jimenez RC、Kim CS、Deng N、Kim AK、Choi JH、Zelaya I、Liem D、Meyer D、Odeberg J、Fang C、Lu HJ、Xu T、Weiss J、Duan H、Uhlen M、Yates JR、Apweiler R、Ge J、Hermjakob H、Ping P (2013 年 10 月)。「専門的な知識ベースによる心臓プロテオーム生物学と医学の統合」。Circulation Research。113 ( 9 ) : 1043– 53。doi : 10.1161 /CIRCRESAHA.113.301151。PMC 4076475。PMID 23965338 。
^ 「タンパク質 SCO2 ホモログ、ミトコンドリア」。 心臓オルガネラタンパク質アトラス知識ベース (COPaKB) 。
^ パパドプロウLC、スーCM、デビッドソンMM、タンジK、西野I、サドロックJE、クリシュナS、ウォーカーW、セルビーJ、グレラムDM、コスターRV、リヨンG、スカライスE、レベルR、カプランP、シャンスケS、デVivo DC、Bonilla E、Hirano M、DiMauro S、Schon EA (1999 年 11 月)。 「COX欠損およびCOXアセンブリ遺伝子であるSCO2の変異を伴う致死性乳児心脳筋症」。 自然遺伝学 。 23 (3): 333– 7. 土井 :10.1038/15513。 PMID 10545952。S2CID 23387553 。
^ 「MT-CO2 - シトクロムc酸化酵素サブユニット2 - Homo sapiens (ヒト) - MT-CO2遺伝子とタンパク質」 。www.uniprot.org 。 2018年7月31日 閲覧 。 この記事には、CC BY 4.0 ライセンスの下で利用可能な UniProt の [www.uniprot.org テキスト] が組み込まれています。
^ abcd 「SCO2 - タンパク質SCO2ホモログ、ミトコンドリア前駆体 - Homo sapiens(ヒト) - SCO2遺伝子とタンパク質」 。www.uniprot.org 。 2018年7月31日 閲覧 。 この記事には、CC BY 4.0 ライセンスの下で利用可能な UniProt の [www.uniprot.org テキスト] が組み込まれています。
^ 「UniProt : ユニバーサルタンパク質知識ベース」。 核酸 研究 。45 (D1): D158 – D169 。2017年1月。doi : 10.1093 /nar/gkw1099。PMC 5210571。PMID 27899622 。
^ Jaksch M、Paret C、Stucka R、Horn N、Müller-Höcker J、Horvath R、Trepesch N、Stecker G、Freisinger P、Thirion C、Müller J、Lunkwitz R、Rödel G、Shoubridge EA、Lochmüller H (2001 年 12 月)。「ミトコンドリア銅結合タンパク質をコードする SCO2 の変異によるシトクロム c 酸化酵素欠損は、ヒト筋芽細胞において銅によって回復する」。Human Molecular Genetics。10 ( 26 ): 3025– 35。doi : 10.1093/ hmg /10.26.3025。PMID 11751685 。
^ Tarnopolsky MA、Bourgeois JM、Fu MH、Kataeva G、Shah J、Simon DK、Mahoney D、Johns D、MacKay N、Robinson BH (2004 年 3 月)。「脊髄性筋萎縮症 I 型表現型として現れる新規 SCO2 変異 (G1521A)」。 American Journal of Medical Genetics。パート A。125A ( 3 ): 310– 4。doi :10.1002 / ajmg.a.20466。PMID 14994243。S2CID 24732177。
^ Knuf M、Faber J、Huth RG、Freisinger P、Zepp F、Kampmann C (2007 年 1 月 )。「シトクロム c 酸化酵素欠損による致死性乳児心脳筋症における新規複合ヘテロ接合性 SCO2 変異の同定」。Acta Paediatrica。96 ( 1 ): 130– 2。doi :10.1111/ j.1651-2227.2007.00008.x。PMID 17187620。S2CID 20422657 。
^ Salviati L、Sacconi S、Rasalan MM、Kronn DF、Braun A、Canoll P、Davidson M、Shanske S、Bonilla E、Hays AP、Schon EA、DiMauro S (2002 年 5 月)。「新しい SCO2 変異によるシトクロム c 酸化酵素欠損が Werdnig-Hoffmann 病を模倣」。Archives of Neurology。59 ( 5 ) : 862–5。doi : 10.1001 /archneur.59.5.862。PMID 12020273 。
^ Tay SK、Shanske S、 Kaplan P 、 DiMauro S (2004 年 6 月)。「シトクロム c 酸化酵素アセンブリ遺伝子 SCO2 の変異と早期胎児死亡との関連」。Archives of Neurology。61 ( 6): 950–2。doi : 10.1001/archneur.61.6.950。PMID 15210538 。
^ Joost K、Rodenburg R、Piirsoo A、van den Heuvel B、Zordania R、Ounap K (2010 年 3 月)。「早期発症型心脳筋症の新生児における SCO2 遺伝子の新たな変異」。 小児 神経学 。42 (3): 227– 30。doi :10.1016/ j.pediatrneurol.2009.10.004。PMID 20159436 。
^ ケリアン S、アラム=ファルク Y、アランダ B、バンカルズ I、ブリッジ A、デロウ C、ディマー E、フォイアーマン M、フリードリヒセン A、ハントリー R、コーラー C、カダケ J、リロイ C、リバン A、リーフティンク C、モンテッキ-パラッツィ L、オーチャード S、リッセ J、ロブ K、ローチャート B、ソーニークロフト D、チャン Y、アプワイラー R、ヘルムヤコブ H (2007 年 1 月)。 「IntAct -- 分子相互作用データのオープンソース リソース」。 核酸研究 。 35 (データベースの問題): D561–5。 土井 :10.1093/nar/gkl958。 PMC 1751531 。 PMID 17145710。
さらに読む
Jaksch M、Ogilvie I、Yao J、Kortenhaus G 、Bresser HG、Gerbitz KD、Shoubridge EA (2000 年 3 月)。「SCO2 の変異は、肥大型心筋症およびシトクロム c 酸化酵素欠損症の異なる形態と関連している」。 ヒト 分子 遺伝学 。9 (5): 795– 801。doi : 10.1093/hmg/9.5.795。PMID 10749987 。
Jaksch M、Horvath R、Horn N、Auer DP、Macmillan C、Peters J、Gerbitz KD、Kraegeloh-Mann I、Muntau A、Karcagi V、Kalmanchey R、Lochmuller H、Shoubridge EA、Freisinger P (2001 年 10 月)。「SCO2 のホモ接合性 (E140K) は、心筋症および神経障害の乳児期発症を遅らせる」。 神経 学 。57 ( 8 ) : 1440–6。doi :10.1212/wnl.57.8.1440。PMID 11673586。S2CID 24920023 。
Jaksch M、Paret C、Stucka R、Horn N、Müller-Höcker J、Horvath R、Trepesch N、Stecker G、Freisinger P、Thirion C、Müller J、Lunkwitz R、Rödel G、Shoubridge EA、Lochmüller H (2001 年 12 月)。「ミトコンドリア銅結合タンパク質をコードする SCO2 の変異によるシトクロム c 酸化酵素欠損は、ヒト筋芽細胞において銅によって回復する」。Human Molecular Genetics。10 ( 26 ) : 3025– 35。doi : 10.1093/hmg/10.26.3025。PMID 11751685 。
Salviati L、Hernandez-Rosa E、Walker WF、Sacconi S、DiMauro S、Schon EA、Davidson MM (2002 年 4 月)。「SCO2 変異を持つ患者の培養細胞におけるシトクロム c オキシダーゼ活性は銅補給によって回復する」。The Biochemical Journal。363 ( Pt 2 ): 321– 7。doi :10.1042/ 0264-6021 :3630321。PMC 1222481。PMID 11931660 。
Collins JE、Goward ME、Cole CG、Smink LJ、Huckle EJ、Knowles S、Bye JM、Beare DM、Dunham I (2003 年 1 月)。「ヒト遺伝子注釈の再評価: 22 番染色体の第 2 世代分析」。 ゲノム 研究 。13 ( 1 ) : 27– 36。doi :10.1101/gr.695703。PMC 430954。PMID 12529303 。
Sacconi S, Salviati L, Sue CM, Shanske S, Davidson MM, Bonilla E, Naini AB, De Vivo DC, DiMauro S (2003 年 2 月)。「シトクロム c 酸化酵素単独欠損症患者の変異スクリーニング」。 小児 研究 。53 ( 2 ): 224– 30。doi :10.1203/01.PDR.0000048100.91730.6A。hdl : 11577 / 1368344。PMID 12538779。S2CID 12496207 。
Brandenberger R、Wei H、Zhang S、Lei S、Murage J、Fisk GJ、Li Y、Xu C、Fang R、Guegler K、Rao MS、Mandalam R、Lebkowski J、Stanton LW (2004 年 6 月)。「トランスクリプトーム特性評価により、ヒト ES 細胞の成長と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」。Nature Biotechnology。22 ( 6 ) : 707– 16。doi : 10.1038 /nbt971。PMID 15146197。S2CID 27764390。
Leary SC、Kaufman BA、Pellecchia G、Guercin GH、Mattman A、Jaksch M、Shoubridge EA (2004 年 9 月)。「ヒト SCO1 と SCO2 は、シトクロム c 酸化酵素への銅の送達において独立した協力的な機能を果たす」。 ヒト 分子 遺伝 学 。13 ( 17): 1839–48。doi : 10.1093/hmg/ddh197。PMID 15229189 。
Collins JE、Wright CL、Edwards CA、Davis MP、Grinham JA、Cole CG、Goward ME、Aguado B、Mallya M、Mokrab Y、Huckle EJ、Beare DM、Dunham I (2005)。「ゲノム注釈主導型アプローチによるヒトORFeomeのクローニング」。 ゲノム生物学。5 ( 10 ) : R84。doi : 10.1186 / gb -2004-5-10- r84。PMC 545604。PMID 15461802 。
Stiburek L、Vesela K、Hansikova H、Pecina P、Tesarova M、Cerna L、Houstek J、Zeman J (2005 年 12 月)。「SCO2 および SURF1 の変異による組織特異的シトクロム c 酸化酵素アセンブリの欠陥」。The Biochemical Journal。392 ( Pt 3): 625– 32。doi : 10.1042/ BJ20050807。PMC 1316303。PMID 16083427 。
Matoba S、Kang JG、Patino WD、Wragg A、Boehm M、Gavrilova O、Hurley PJ、Bunz F、Hwang PM (2006 年 6 月)。「p53 はミトコンドリア呼吸を制御する」。Science。312 ( 5780 ) : 1650– 3。Bibcode : 2006Sci ... 312.1650M。doi :10.1126/science.1126863。PMID 16728594。S2CID 36668814 。
Leary SC、Cobine PA、Kaufman BA、Guercin GH、Mattman A、Palaty J、Lockitch G、Winge DR、Rustin P、Horvath R、Shoubridge EA (2007 年 1 月)。「ヒトシトクロム c 酸化酵素アセンブリ因子 SCO1 および SCO2 は、細胞銅恒常性の維持において調節的役割を果たす」。 細胞 代謝 。5 ( 1 ): 9– 20。doi : 10.1016/j.cmet.2006.12.001。PMID 17189203 。
Banci L、Bertini I、Ciofi-Baffoni S、Gerothanassis IP、Leontari I、 Martinelli M、Wang S (2007 年 9 月)。「ヒト SCO2 の構造特性」。 構造 。15 ( 9 ): 1132–40。doi : 10.1016/ j.str.2007.07.011。PMID 17850752 。
外部リンク