レトロデュオ

• 720°（NTSC）
• バトルロード（NTSC版）（レベル2以降でゲームがフリーズするが、チートコードを使えばレベル3にジャンプできる）
• ディガー・T・ロック：失われた都市の伝説（PAL版）（タイトル画面は表示されるが、ゲーム内でグラフィックの不具合が発生しクラッシュし、プレイ不能になる）
• ダックハント（ NESザッパーは電源に接続できません。アクセサリー対応のNES-SNES変換ケーブルで動作しますが、NESザッパーはCRTテレビでのみ動作します）
• マニアックマンション
• Paperboy (NTSC) (コントローラーは認識されませんが、動作する改造版があります。通常は海賊版マルチカートリッジ (400 in 1 または 500 in 1) に掲載されています)
• ローリングサンダー（Retro Duo 2.0以降に対応）

下記にリストされているPAL版ゲームのほとんど、あるいはすべては、実際のNTSC版スーパーファミコン（セキュリティチップを無効にした場合でも）ではプレイできません。ここにこれらのゲームが掲載されているのは、(NTSC版) Retro Duoと実際のNTSC版スーパーファミコンとの互換性の問題を反映したものではありません。

• ActRaiser 2 (NTSC)
• バットマン リターンズ(PAL版)
• ドナルド・イン・マウイ・マラード（PAL）
• ドンキーコングカントリー（PAL版）
• ドンキーコングカントリー2 ディディーコングの冒険（PAL版）
• ドンキーコングカントリー3 ディクシーコングのダブルトラブル！（PAL版）
• EarthBound (NTSC) (軽微な互換性の問題あり。著作権侵害対策チェックが作動し、敵の出現率が上昇します。プレイは十分に可能です)
• GP-1：パートII（PAL方式）
• 時間の幻想（PAL版）
• カービィのファンパック（PAL版）
• リーサル・エンフォーサーズ（PAL版）
• アウト・オブ・ディス・ワールド（NTSC版）（画面の枠線が点滅し、スプライトが歪んで表示されるか、全く表示されない）
• Plok (PAL)
• パイロットウイングス（PAL版）（軽微な互換性の問題あり。移動ターゲットのプラットフォームが点滅したり、時折ミラー効果が発生したりします。画面に軽微なちらつきや霞みが発生します。プレイには問題ありません。）
• 聖剣伝説（PAL版）
• スターウィング（PAL版）
• スタントレースFX（PAL版）
• スーパーゴーストアンドゴブリンズ（PAL版およびNTSC版）（ステージ3-2のボスは見えず、ステージ4は敵、プレイヤー、および一部のプラットフォームを除いて完全に真っ黒で、プレイ不可能）
• スーパーマリオオールスターズ（PAL版）
• スーパーマリオオールスターズ＋スーパーマリオワールド（PAL版）
• スーパーマリオカート（PAL版）（プレイはできるが、グラフィックに非常に不具合がある）
• スーパーマリオRPG：七星伝説（ソフトウェアバージョン1.2および1.3）
• スーパーメトロイド（PAL版）
• Terranigma (PAL) (これまでのクローン作品と同様に、著作権侵害対策チェックに引っかかる)
• ゾンビ（PAL版）

コントローラー／アクセサリー（NES-SNESケーブルに対応していますが、アクセサリー対応のもののみ）

• ロブ
• NESザッパー
• パワーパッド
• NESの利点
• NES Max
• パワーグローブ