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| エイリアス | CTBP2、C末端結合タンパク質2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：602619; MGI : 1201686;ホモロジーン: 75187;ジーンカード：CTBP2; OMA :CTBP2 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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C末端結合タンパク質2はCtBP2としても知られ、ヒトではCTBP2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
CtBP（哺乳類のCtBP1とCtBP2）は、最もよく特徴付けられた転写コリプレッサーの1つです。[8]これらは通常、標的遺伝子をオフにします。これは、プロリン-イソロイシン-アスパラギン酸-ロイシン-セリン（PIDLSモチーフ）の一般的な形の短いモチーフを持つ配列特異的DNA結合タンパク質に結合することによって行われます。次に、ヒストン修飾酵素、ヒストン脱アセチル化酵素、ヒストンメチラーゼ、ヒストン脱メチラーゼをリクルートします。これらの酵素は協力して、活性化ヒストンマークを除去し、抑制ヒストンマークを追加すると考えられています。例えば、ヒストン脱アセチル化酵素1（HDAC1）とHDAC2は活性化マークであるヒストン3アセチルリジン9（H3K9Ac）を除去し、ヒストンメチラーゼG9aはメチル基を付加し、ヒストン脱メチル化酵素リジン特異的脱メチル化酵素1（LSD1）は活性化マークH3K4meを除去することができる。[9]
CtBPは多くの異なるDNA結合タンパク質に結合し、また、Friend of GATA（ Fog）などのDNA結合タンパク質に結合しているコリプレッサーにも結合します。 [10] CtBPは二量体化および多量体化して、より大きな転写複合体を橋渡しすることもできます。これらは主に、遺伝子抑制複合体の組み立てを可能にする足場タンパク質であると思われます。
CtBPの興味深い側面の1つは、 NADHと、それほどではないがNAD +に結合する能力です。これにより、細胞の代謝状態を感知し、NADH / NAD +比の変化に応じて遺伝子を制御できるのではないかと提案されています。したがって、CtBPは脂肪生物学において重要であり、 PRDM16、NRIP、FOG2などの重要なタンパク質に結合することがわかっています。[11]
CtBPタンパク質の哺乳類における完全な機能的役割は、CtBP1とCtBP2の部分的な重複のために評価が困難であった。[12]同様に、CtBP2ノックアウトマウスとダブルノックアウトマウスの早期致死性は、これらのタンパク質の削除による細胞への影響の詳細な分析を妨げている。重要な結果は、CtBP遺伝子が1つしかないモデル生物から出ている。ショウジョウバエでは、CtBPは発達と概日リズムに関与している。[13]線虫であるC. elegansでは、 CtBPは寿命に関与している。[14]概日リズムと寿命はどちらも代謝に関連しているようで、代謝感知におけるCtBPの役割を裏付けている。
哺乳類の CtBP2 遺伝子は、2 つの異なるタンパク質をコードする代替転写産物を生成します。上で説明した転写抑制因子 (コリプレッサー) に加えて、シナプス リボンとして知られる特殊シナプスの主要構成要素であるより長いアイソフォームがあります。両方のタンパク質には、 NAD +依存性 2-ヒドロキシ酸脱水素酵素に類似したNAD +結合ドメインが含まれています。3 ' 非翻訳領域の一部を使用して、この遺伝子を染色体 21q21.3 にマッピングしましたが、ゲノムの他の場所にも同様の遺伝子座がある可能性が高いことが指摘されました。ブラスト分析により、この遺伝子は染色体 10 に存在することが示されています。[7]
代替プロモーターの使用
脊椎動物の網膜では、網膜の発達中にCtBP2遺伝子が代替プロモーターから転写され、CTBP2転写共調節因子と、より大きなリボンシナプス足場タンパク質RIBEYEが生成されます。[15] CtBP2遺伝子座の多目的機能は、鳥類と霊長類の網膜間で保存されているようで、RIBEYE mRNAの生成はエピジェネティックサイレンシングメカニズムによって発達的に遅延されます。[16] 発達中のヒト網膜では、RIBEYE mRNAアイソフォームの転写はDNAメチル化によってエピジェネティックに制御されています。近位RIBEYEプロモーターを含むDNA配列はDNAメチル化に富み、おそらく錐体桿体ホメオボックス（CRX）転写因子の結合を阻害することによって、このアイソフォームの転写を遅らせます。[16]ヒト多能性幹細胞（hPSC）由来の3D網膜オルガノイドの包括的転写産物解析により、CTPB2アイソフォームの早期かつ持続的な発現と、それに続く発達中のヒトの眼におけるRIBEYEの遅延発現が実証された。[17]
インタラクション
CTBP2 は以下と相互作用することが示されています:
参考文献
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さらに読む
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外部リンク
- ファクターブックCtBP2
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト CTBP2 ゲノムの位置と CTBP2 遺伝子の詳細ページ。