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1999年水資源開発法 （WRDA 1999）、公法106-53（本文）（PDF）は、1999年8月17日に米国議会によって制定されました。 [ 1 ] WRDA 1999の規定のほとんどは、米国陸軍工兵隊によって管理されています。
アラスカ、アリゾナ、カリフォルニア、デラウェア、ニュージャージー、ニューヨーク、フロリダ、グアム、ジョージア、イリノイ、インディアナ、カンザス、ケンタッキー、ルイジアナ、メイン、メリーランド、マサチューセッツ、ミシガン、ミシシッピ、モンタナ、オレゴン、バージニア、ミネソタ、オハイオ、ペンシルベニア、ミズーリ、プエルトリコ、ロードアイランド、テネシー、テキサス、ウェストバージニア、ワシントンにおける航行、洪水制御、環境修復、レクリエーション、ハリケーンおよび暴風雨被害軽減、河岸安定化、生態系修復、海岸保護、帯水層貯留および回収、航行緩和のための小規模プロジェクトのプロジェクトおよび調査を承認する。
第2編は、1936年洪水対策法（FCA 1936）を改正し、州およびその他の地方自治体から拠出された資金を環境修復（現在は洪水対策のみ）事業に使用することを認めるものである。
1948年連邦建設法を改正し、小規模な構造物および非構造物の建設を可能にするとともに、単一プロジェクトに支出できる最大額を500万ドルから700万ドルに引き上げる。
1960年金融行動監視法を改正する：
1958年河川港湾法（RHA 1958）を改正する。
1968年沿岸水路法（RHA 1968）を改正し、大西洋沿岸内水路およびメキシコ湾沿岸内水路における追加の海岸被害軽減活動を認可する。
1976年水資源開発法を改正し、浚渫砂を州の海岸に敷設する際に州が負担する総費用の割合を50％から35％に引き下げる。長官に対し、オハイオ州およびその他の五大湖沿岸州と協力して、五大湖沿岸における浚渫土砂の有益な再利用を完全に実施し、最大限に活用するよう指示する。長官に対し、テキサス州の特定の海岸線において、特定の海岸保護プロジェクトを設計・建設し、海岸侵食を安定させる権限を与える。
1986年水資源開発法を改正する：
1990年水資源開発法を改正する：
1992年水資源開発法を改正する：
1996年水資源開発法を改正する：
米国全土の河川における洪水災害の軽減と自然機能および価値の回復を目的としたプロジェクトを認可する。環境修復または非構造的な洪水対策プロジェクトの実施費用の35%を連邦政府以外の団体が負担することを義務付ける。プロジェクトの選定基準、方針、および手続きを規定する。特定の議会委員会への報告を義務付ける。単一プロジェクトの費用上限を3,000万ドルとする。歳出予算を認可する。
米国の海岸線の現状に関する報告書を議会に提出すること、およびそのような海岸線の地球物理学的および気候学的特性に関するデータを収めた国家沿岸データバンクを設立することを指示する。
1999年度から2002年度にかけて、レクリエーション施設の利用に関連する修繕・維持管理事業、解説、標識設置、生息地または施設の改善、資源保全、年間運営・維持管理、および法執行のために、レクリエーション利用料から一定額を差し引くことを承認する。
1998年連邦活動目録改革法に従い、本質的に政府的な性質を持たないすべての陸軍工兵隊の活動の目録作成と見直しを指示する。
アラバマ州とミシシッピ州、アラスカ州、アーカンソー州、ルイジアナ州、オクラホマ州とテキサス州、カリフォルニア州、デラウェア州、ニュージャージー州、ペンシルベニア州、コロンビア特別区、フロリダ州、アイダホ州、イリノイ州、インディアナ州、アイオワ州、ルイジアナ州、メリーランド州、ミシガン州、ミシシッピ州、ミズーリ州、カンザス州、アイオワ州とネブラスカ州、ニュージャージー州、ニューヨーク州、ノースダコタ州、オクラホマ州、オレゴン州、ペンシルベニア州、ロードアイランド州、サウスカロライナ州、テネシー州、テキサス州、ユタ州、バージニア州、ウェストバージニア州、ウェストバージニア州とペンシルベニア州における、洪水制御、航行、生息地復元、給水、海岸線保護、海岸保護と港湾緩和、海岸侵食制御、暴風雨被害軽減と海岸侵食保護、レクリエーション、歩行者アクセス機能、ハリケーン保護、堤防、環境インフラ、魚類と野生生物の損失緩和、流域、運河システム復元、環境復元、および水路変更に関するプロジェクトを修正または再承認する。
コネチカット州、メイン州、マサチューセッツ州における航行プロジェクトの認可を取り消す。
メイン州、カリフォルニア州、ケンタッキー州、アラバマ州、ネバダ州、ルイジアナ州、ミシガン州、アーカンソー州、ミズーリ州、オクラホマ州において、特定のプロジェクトを名前で変更します。
深水港湾プロジェクトの建設、運営、維持管理における連邦政府以外の費用分担要件に関する調査および勧告を、特定の議会委員会に指示する。
アーカンソー州、カリフォルニア州、フロリダ州、ジョージア州、アイダホ州、イリノイ州、ウィスコンシン州、ルイジアナ州、マサチューセッツ州、ミシガン州、ミシガン州、オハイオ州、ミシシッピ州、モンタナ州、ネバダ州、ニューメキシコ州、ニューヨーク州、ニューヨーク州、バーモント州、ノースカロライナ州、オハイオ州、インディアナ州、ミシガン州、ペンシルベニア州、サウスカロライナ州、サウスダコタ州、テキサス州、ユタ州、ワシントン州、ウェストバージニア州、五大湖、チェサピーク湾、ミシシッピ川上流およびイリノイ川上流、サスケハナ川流域およびチェサピーク湾上流における特定のプロジェクトに関する調査を指揮する。
カリフォルニア州ラガス・クリークおよびイリノイ州ソーントン貯水池における天然資源保全局の治水事業の残りの部分を完了させることを長官に承認する。
1928年洪水対策法を改正し、ミシシッピ川委員会の委員の年俸を引き上げる。
1992年水資源開発法を改正し、カリフォルニア州、コネチカット州、ジョージア州、インディアナ州、ルイジアナ州、ニューハンプシャー州、ニュージャージー州、ニューヨーク州、マサチューセッツ州、ミシガン州、ミシシッピ州、ミズーリ州、ノースカロライナ州、オクラホマ州、オレゴン州、ペンシルベニア州、テネシー州、ユタ州、およびバージニア州における特定のプロジェクトに対する建設支援のための歳出を認可する。
堆積物浚渫技術の見直しを指示し、汚染された堆積物の除去効果を高め、水柱の汚染を大幅に低減する技術を選択する。
カリフォルニア州、インディアナ州、ペンシルベニア州の指定されたダムにおける安全支援を承認する。
1986年水資源開発法を改正する。
1996年水資源開発法を改正し、フロリダ州、ルイジアナ州、ワシントン州の特定区域を航路維持管理プログラムの対象に追加する。
ニューヨーク州大西洋沿岸の監視プログラムに対する年間予算認可額を増額するため、1992年水資源開発法を改正する。
WRDA 1996を改正する：
1976年海洋保護・研究・保護区法を改正し、環境保護庁長官が非毒性または非有害廃棄物の投棄場所を指定する権限を2003年1月1日まで延長する。
1994年エネルギー・水資源開発歳出法を改正し、テキサス州ガルベストンのサンジャシント処分場に関する譲渡条件および必要な補償額を改定する。
再生水および地下水調査・施設法を改正し、フェニックス都市圏の水再生・再利用プロジェクトの計画、設計、建設を指示することで、地域の下水処理場からの下水をフェニックス都市圏の特定の用途に完全に利用できるようにする。
水管理の評価において、地域別の水管理計画を検討することを認めるが、特定の議会委員会に報告書が提出されるまでは、そのような計画の実施を禁止する。
浚渫土砂の有効利用を目的とした特定のプロジェクトを認可する。
ミズーリ川およびミシシッピ川中流域の魚類および野生生物の生息地を保護・改善するためのプロジェクト計画を指揮する。
連邦政府以外の関係者に対する技術的な計画および設計支援を承認し、魚類スクリーン、魚道装置、および稚魚や成魚が灌漑システムに誤って侵入する頻度を減らすためのその他の対策を策定および評価するための、現場固有の調査を実施する。
コネチカット州、フロリダ州、インディアナ州、ルイジアナ州、およびミシシッピ川上流域におけるプロジェクトに関連する必要報告書の作成を指示する。
陸軍、連邦緊急事態管理庁（FEMA）、環境保護庁（EPA）、およびその他の適切な連邦機関の長に対し、オレゴン州がウィラメット川流域における包括的な流域全体戦略を策定・実施するのを支援するよう指示する。
特定の行動や研究を指示する。
米国の潮汐湿地および非潮汐湿地・水域における有毒微生物に関連する問題、およびそれに起因する生態系の劣化に対処するための管理戦略の策定を承認する。
放棄された非石炭鉱山および休止中の鉱山からの排水および関連活動によって引き起こされる水質問題に対処するためのプロジェクトを実施するにあたり、連邦政府および非連邦政府の利害関係者に対し、技術、計画、および設計に関する支援を認可する。放棄された鉱山の復旧に関する技術データベースの維持を認可する。
カンザス州、メリーランド州、ミズーリ州、オクラホマ州、オレゴン州、サウスカロライナ州、ワシントン州、ウェストバージニア州における不動産取引を統括する。マクナリー国立野生生物保護区の管理権限を陸軍から内務省に移管する。
アーカンソー州とロードアイランド州の特定の水路や施設に、政治的に不適切な名称を指定する。
バージニア州ラッパハノック川にあるエンブリーダムの撤去を、連邦政府の全額負担で行うよう指示する。
バージニア州フロントロイヤルにあるアブテックス・ファイバーズ社の施設における環境修復および浄化を、連邦政府の全額負担で実施するよう指示する。また、国防総省に対し、当該目的のために指定された資金を拠出するよう指示する。
本条項に基づき連邦資金を受け取る条件として、サウスダコタ州、シャイアン川スー族、およびロウアー・ブルール・スー族に対し、ピック・スローン・ミズーリ川流域計画の一環として実施されたビッグベンド・プロジェクトおよびオアヘ・プロジェクトに関連する洪水によって生じた陸生野生生物生息地の喪失を回復するための計画をそれぞれ策定するよう指示する。また、各計画は長官に提出され、審査を受けた後、適切な議会委員会に提出されることを義務付ける。さらに、長官に対し、これらの計画を実施するための資金を利用可能にするよう指示する。経過措置および承認された資金の使途についても概説する。
サウスダコタ州陸生野生生物生息地復元信託基金、シャイアン川スー族陸生野生生物復元信託基金、ロウアーブルールスー族陸生野生生物生息地復元信託基金を設立する。
魚類・野生生物保護または公共レクリエーション目的のために、指定された連邦所有地をサウスダコタ州狩猟・漁業・公園局に移管するよう指示する。また、シャイアン川スー族およびロウアー・ブルール・スー族の利用のために、指定された陸軍工兵隊所有地およびレクリエーション区域を移管するよう長官に指示する。
長官に対し、米国地質調査所が1999年10月31日までに、本条項に基づく土地の移転がミズーリ川の水量に及ぼす潜在的な影響に関する包括的な調査を完了するよう指示する。長官が、当該移転によってミズーリ川下流諸州への水量が著しく減少しないと判断するまで、当該移転を禁止する。