ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| トララップ |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TRRAP、PAF350/400、PAF400、STAF40、TR-AP、Tra1、形質転換/転写ドメイン関連タンパク質、DEDDFA、DFNA75 |
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| 外部ID | オミム:603015; MGI : 2153272;ホモロジーン: 39246;ジーンカード:TRRAP; OMA :TRRAP - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5|5 G2 | 始める | 144,704,542 bp [2] |
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| 終わり | 144,796,588 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 心室帯
- 腓骨神経
- 神経節隆起
- 下垂体前葉
- 頬粘膜細胞
- 太ももの皮
- 睾丸
- 子宮内膜間質細胞
- 小脳の右半球
- 顆粒球
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| | トップの表現 | - 卵黄嚢
- 吻側回遊流
- 心室帯
- 内頸動脈
- 網膜の神経層
- 前扁桃体領域
- 骨髄間質
- 上顎突出
- 下顎突出
- 側坐核
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 転写共調節活性
- タンパク質結合
- チオール依存性脱ユビキチン化酵素
- キナーゼ活性
| | 細胞成分 |
- ゴルジ体
- 転写因子 TFTC 複合体
- NuA4ヒストンアセチルトランスフェラーゼ複合体
- 核質
- 核
- Swr1複合体
- ヒストンアセチルトランスフェラーゼ複合体
- SAGAコンプレックス
| | 生物学的プロセス |
- 転写の調節、DNAテンプレート
- ヒストンH2Aのアセチル化
- 転写、DNAテンプレート
- ヒストン脱ユビキチン化
- ヒストンH4のアセチル化
- リン酸化
- ベータカテニン-TCF複合体の組み立て
- ヒストンのアセチル化
- タンパク質の脱ユビキチン化
- DNA修復
- クロマチン組織
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_003496 NM_001244580 NM_001375524 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001231509 NP_003487 NP_001362453 |
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| 場所 (UCSC) | 7 章: 98.88 – 99.05 Mb | 5 番: 144.7 – 144.8 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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形質転換/転写ドメイン関連タンパク質(TRRAP)は、ヒトではTRRAP遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] TRRAPはホスファチジルイノシトール3キナーゼ関連キナーゼタンパク質ファミリー
に属する。
関数
TRRAPはアダプタータンパク質であり、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性(HAT)を持つさまざまな多タンパク質クロマチン複合体に存在し、エピジェネティックな転写活性化を担っています。TRRAPはMYC (c-Myc)転写活性化において中心的な役割を果たし、MYCによる細胞形質転換にも関与しています。p53/ TP53、E2F1、E2F4を介した転写活性化に必要です。また、主要遺伝子の転写を調節解除するウイルス性腫瘍タンパク質であるアデノウイルスE1Aを介した転写活性化にも関与しています。[7]
TRRAPは有糸分裂チェックポイントと正常な細胞周期の進行にも必要です。MRN複合体(MRE11、RAD50、NBS1で構成)はDNA二本鎖切断(DSB)の検出と修復に関与しています。TRRAPはMRN複合体と関連しており、TRRAPが除去されると複合体はcDNA末端結合活性が低下します。したがって、TRRAPはDSB修復とクロマチンリモデリングの間のリンクとして機能する可能性があります。[8] [9]
インタラクション
変換/転写ドメイン関連タンパク質は、以下と相互作用することが示されています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000196367 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000045482 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ abc McMahon SB、Van Buskirk HA、 Dugan KA、Copeland TD、Cole MD(1998年8月)。「新規ATM関連タンパク質TRRAPはc-MycおよびE2Fオンコタンパク質の必須補因子である」。Cell。94 (3 ): 363–74。doi :10.1016/S0092-8674(00) 81479-8。PMID 9708738。S2CID 17693834 。
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- ^ Murr R、Vaissière T、Sawan C、Shukla V、Herceg Z (2007 年 8 月)。「クロマチンベースのプロセスのオーケストレーション: TRRAP に注意」。Oncogene . 26 ( 37): 5358–72. doi :10.1038/sj.onc.1210605. PMID 17694078. S2CID 22598445.
- ^ Robert F、Hardy S、Nagy Z、Baldeyron C、Murr R、Déry U、Masson JY、Papadopoulo D、Herceg Z、Tora L (2006 年 1 月)。「転写ヒストンアセチルトランスフェラーゼ補因子 TRRAP は MRN 修復複合体と関連し、DNA 二本鎖切断修復に役割を果たす」。Mol . Cell. Biol . 26 (2): 402–12. doi :10.1128/MCB.26.2.402-412.2006. PMC 1346889. PMID 16382133 。
- ^ Herceg Z, Wang ZQ (2005 年 3 月). 「有糸分裂時のランデブー: クロマチン中の TRRAPed」.細胞周期. 4 (3): 383–7. doi : 10.4161/cc.4.3.1546 . PMID 15711126.
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- ^ ab Fuchs M, Gerber J, Drapkin R, Sif S, Ikura T, Ogryzko V, Lane WS, Nakatani Y, Livingston DM (2001年8月). 「p400複合体はE1A変換の必須ターゲットである」. Cell . 106 (3): 297–307. doi : 10.1016/s0092-8674(01)00450-0 . PMID 11509179. S2CID 15634637.
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- ^ ab Liu X、Tesfai J、Evrard YA、Dent SY、Martinez E (2003 年 5 月)。「c-Myc 形質転換ドメインはヒト STAGA 複合体をリクルートし、転写活性化には TRRAP および GCN5 アセチラーゼ活性を必要とする」。J . Biol. Chem . 278 (22): 20405–12。doi : 10.1074 / jbc.M211795200。PMC 4031917。PMID 12660246。
- ^ ab Martinez E、Palhan VB、Tjernberg A、Lymar ES、Gamper AM、Kundu TK、Chait BT、Roeder RG (2001 年 10 月)。「ヒト STAGA 複合体は、生体内で pre-mRNA スプライシングおよび DNA 損傷結合因子と相互作用するクロマチンアセチル化転写コアクチベーターです」。Mol . Cell. Biol . 21 (20): 6782–95. doi :10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001. PMC 99856. PMID 11564863 。
さらに読む
- Herceg Z、Wang ZQ (2006)。「有糸分裂時のランデブー:クロマチン中のTRRAPed」。 細胞周期。4 ( 3): 383–7。doi : 10.4161/cc.4.3.1546。PMID 15711126。
- Murr R、Vaissière T、Sawan C、Shukla V、Herceg Z (2007)。「クロマチンベースのプロセスのオーケストレーション:TRRAPに注意」。Oncogene . 26 ( 37): 5358–72. doi :10.1038/sj.onc.1210605. PMID 17694078. S2CID 22598445.
- McMahon SB、Van Buskirk HA、Dugan KA、Copeland TD、Cole MD (1998)。「新規 ATM 関連タンパク質 TRRAP は c-Myc および E2F オンコタンパク質の必須補因子である」。Cell . 94 (3): 363–74. doi : 10.1016/S0092-8674 ( 00)81479-8 . PMID 9708738. S2CID 17693834。
- Vassilev A、山内 J、小谷 T、Prives C、Avantaggiati ML、Qin J、中谷 Y (1999)。 「PCAF ヒストン アセチラーゼ複合体の 400 kDa サブユニットは、ATM スーパーファミリーに属します。」モル。セル。2 (6): 869–75。土井: 10.1016/S1097-2765(00)80301-9。PMID 9885574。
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- Nikiforov MA、Chandriani S、Park J、Kotenko I、Matheos D、Johnsson A、McMahon SB、Cole MD (2002)。「Myc ファミリー腫瘍タンパク質による TRRAP 依存性および TRRAP 非依存性転写活性化」。Mol . Cell. Biol . 22 (14): 5054–63. doi :10.1128/MCB.22.14.5054-5063.2002. PMC 139788. PMID 12077335 。
- Ard PG、Chatterjee C、Kunjibettu S、Adside LR、Graninski LE、McMahon SB (2002)。「p53 による mdm2 癌遺伝子の転写制御には TRRAP アセチルトランスフェラーゼ複合体が必要」。Mol . Cell. Biol . 22 (16): 5650–61. doi :10.1128/MCB.22.16.5650-5661.2002. PMC 133988. PMID 12138177 。
- Cavusoglu N、Brand M、Tora L、Van Dorsselaer A (2003)。「1次元ゲル電気泳動後のマトリックス支援レーザー脱離/イオン化飛行時間質量分析法によって同定された、TATA結合タンパク質を含まないTAFII含有転写複合体の新しいサブユニット」。プロテオミクス。3 ( 2 ) : 217–23。doi :10.1002/pmic.200390030。PMID 12601814。S2CID 6035986。
- Liu X、Tesfai J、Evrard YA、Dent SY、Martinez E (2003)。「c-Myc 形質転換ドメインはヒト STAGA 複合体をリクルートし、転写活性化には TRRAP および GCN5 アセチラーゼ活性を必要とする」。J . Biol . Chem . 278 ( 22): 20405–12。doi : 10.1074/ jbc.M211795200。PMC 4031917。PMID 12660246。