Loading article…
| ハプログループ E-P2 | |
|---|---|
| 起源の可能性のある時期 | 41,400～49,800年前[1] |
| 合体年齢 | 39,200～41,400年前[1] |
| 起源地の可能性 | 東アフリカ[2] [3] |
| 祖先 | E-P177 |
| 子孫 | E-V38、E-M215 |
| 突然変異の定義 | DYS391p、L337、L339、L342、L487、L492、L613、P2/PN2、P179、P180、P181 |
ハプログループ E-P2はE1b1とも呼ばれ、ヒトの Y 染色体 DNA ハプログループです。E-P2 には 2 つの基底分岐、E-V38とE-M215があります。E-P2 は東アフリカとレバント地方に古くから存在していましたが、現在は主にアフリカに分布しており、おそらく起源地と考えられています。中東とヨーロッパでも低頻度で見られます。
起源
セミノら（2004）は、東アフリカ起源であると示唆し、「系統地理学とマイクロサテライト変異の両方から、E-P2とその派生種であるE-M35はおそらく東アフリカ起源であることが示唆される」と述べた。[2]
Trombetta et al. (2011) も東アフリカ起源説を提唱している。
ここで報告された新しいトポロジーは、ハプログループ E-P2 の起源に関して重要な意味を持っています。系統地理学的簡約の原理を用いると、E-M215 の三分岐が E-M2 と E-M329 の共通祖先を支持する方向に解決されたことは、ハプログループ E-P2 が以前に示唆されたように東アフリカに起源を持ち、サハラ以南のアフリカで頻繁に観察される染色体 E-M2 が東アフリカに存在する共通祖先に由来するという仮説を強く支持しています。[3]
古代DNA
ナトゥーフ人の遺骨サンプルからハプログループE1b1（1/5、20%）が含まれていたことが判明した。[4]
エチオピアのモタ洞窟では、4500年前の古代エチオピア人男性の遺骨が発見され、父方のハプログループE1b1と母方のハプログループL3x2aを持っていた。[5] [6]
分布
E-P2は現在、主にその優勢なサブクレードであるE-M215とE-V38の形で、主にアフリカで発見されています。E-M215は北アフリカとアフリカの角でより一般的ですが、中東、ヨーロッパ、南アフリカでも低頻度で発見されています。E-V38は西アフリカ、中央アフリカ、南アフリカ、アフリカ大湖でより一般的ですが、北アフリカと中東でも低頻度で発生します。
E-P2*と呼ばれるパラクレードには、E-V38にもE-M215にも含まれないケースが含まれており、稀であるか存在しないかのどちらかであり、これまでのところ発見されていません。[3]
セミノら。 (2004) は、エチオピアアムハラ48 人中 10.4% 、エチオピアオロモ78 人中 12.8% 、南アフリカ バンツー53 人中 1.9%、セネガル人139 人中 2.9%で E-P2 (xM35,xM2) を発見しました。[8]
Woodら（2005）は、エチオピアのオロモ語のサンプルの11％（1/9）、タンザニアのイラク語のサンプルの11％（1/9）、エチオピアの様々な南セム語族の混合サンプルの10％（2/20） 、エチオピアのアムハラ語のサンプルの6％（1/18）、ガーナのエウェ語のサンプルの3％（1/30）、ガーナのファンテ語のサンプルの3 ％（1/32）、ガンビア/セネガルのウォロフ語のサンプルの3％（1/34）でE-P2（ xP1、xM35）が見つかったと報告しています。[9]
Stefflovaら（2009）は、フィラデルフィア出身のアフリカ系アメリカ人男性199人のうち1人がE-P2（xM35、xM2）であったと報告した。[10]
クルチアーニら。 (2002) E-P2 (xM35, xM2) は、エチオピア系ユダヤ人22 人中 18% 、ブルキナファソのモシ49 人中 2% 、同じくブルキナファソのリマイベ 37 人中 3%、カメルーンのフルベ17 人中 6% で発見されました。[11]
セミノら（2002）は、88人のエチオピア人のうち18.2％にE-P2（xM35、xM2）を発見した。[12] [13]
Moranら（2004）は、エチオピアのアスリートとコントロールグループでE-P2（xM35、xM2）を発見し、次のような結果を報告しました。一般コントロール：4％（4/95）、アルシコントロール：8％（7/85）、5-10K：22％（5/23）、陸上競技：11％（2/11）。[14]
サブクラス
E-M215
ハプログループE-M215はハプログループE-P2のサブグループである。[1]
E-V38
ハプログループE-V38はハプログループE-P2のサブグループである。[1]
E-M329
主要記事:ハプログループ E-M329
ハプログループE-M329はハプログループE-P2のサブグループである。[1]
系統学
系統発生の歴史
2002 年以前、学術文献には Y 染色体系統樹の命名システムが少なくとも 7 つありました。このため、かなりの混乱が生じました。2002 年に、主要な研究グループが集まり、Y 染色体コンソーシアム(YCC) が結成されました。彼らは共同論文を発表し、全員が使用することに同意した単一の新しい系統樹を作成しました。その後、集団遺伝学と遺伝系譜学に関心を持つ市民科学者のグループがワーキング グループを結成し、何よりもタイムリーであることを目指してアマチュア系統樹を作成しました。以下の表は、画期的な 2002 年の YCC 系統樹の時点でこれらの研究をすべてまとめたものです。これにより、以前に発表された文献をレビューする研究者は、命名法間をすばやく移動できます。
研究出版物
YCC ツリーの作成には、以下の研究チームが各自の出版物に基づいて参加しました。
- α Jobling と Tyler-Smith 2000 および Kaladjieva 2001
- βアンダーヒル2000
- γハマー 2001
- δカラフェット 2001
- εセミノ 2000
- ζス 1999
- ηカペリ 2001
系統樹
このハプログループサブクレードの系統樹は、Karafet（2008） [15]のYCC 2008系統樹とその後の発表された研究に基づいています。
参照
WikiquoteにはハプログループE-P2に関連する引用があります。
遺伝学
Y-DNA Eサブクラス
- ハプログループ E-L485
- ハプログループ E-M123
- ハプログループ E-M180
- ハプログループ E-M215
- ハプログループ E-M33
- ハプログループ E-M521
- ハプログループ E-M75
- ハプログループ E-M96
- ハプログループ E-P147
- ハプログループ E-P177
- ハプログループ E-P2
- ハプログループ E-V12
- ハプログループ E-V13
- ハプログループ E-V22
- ハプログループ E-V38
- ハプログループ E-M2
- ハプログループ E-V65
- ハプログループ E-V68
- ハプログループ E-Z820
- ハプログループ E-Z827
Y-DNAバックボーンツリー
参考文献
- ^ abcde 「E-P177 YTree」。
- ^ ab Semino, Ornella; et al. (2004年5月). 「Y染色体ハプログループEとJの起源、拡散、分化：ヨーロッパの新石器化と地中海地域におけるその後の移住イベントに関する推論」. American Journal of Human Genetics . 74 (5): 1023–1034. doi :10.1086/386295. ISSN 0002-9297. OCLC 4922408279. PMC 1181965. PMID 15069642. 17859431 .
- ^ abc トロンベッタら (2011)
- ^ マルティニアノ、ルイ;サンクティス、ビアンカ・デ。ハラスト、ピル。リチャード・ダービン（2020年12月20日）。 「補足資料: 古代の DNA 配列を参照系統系統に配置する」。分子生物学と進化。39 (2): 2020.12.19.423614。bioRxiv 10.1101/2020.12.19.423614。土井：10.1093/molbev/msac017。PMC 8857924。PMID 35084493。S2CID 229549849 。
- ^ Llorente, M. Gallego; et al. (2015年11月13日). 「古代エチオピア人のゲノムは東アフリカにおける広範なユーラシア人の混合を明らかにする」. Science . 350 (6262): 820–822. Bibcode :2015Sci...350..820L. doi :10.1126/science.aad2879. hdl : 2318/1661894 . PMID 26449472. S2CID 25743789.
- ^ Llorente, M. Gallego; et al. (2015年11月13日). 「補足資料：古代エチオピア人のゲノムは東アフリカにおける広範なユーラシア人の混合を明らかにする」(PDF) . Science . 350 (6262): 820–822. Bibcode :2015Sci...350..820L. doi :10.1126/science.aad2879. hdl : 2318/1661894 . PMID 26449472. S2CID 25743789.
- ^ Badro, Danielle A.; Douaihy, Bouchra; Haber, Marc; Youhanna, Sonia C.; Salloum, Angélique; Ghassibe-Sabbagh, Michella; Johnsrud, Brian; Khazen, Georges; Matisoo-Smith, Elizabeth; Soria-Hernanz, David F.; Wells, R. Spencer; Tyler-Smith, Chris; Platt, Daniel E.; Zalloua, Pierre A.; Consortium, The Genographic (2013-01-30). 「Y染色体とmtDNAの遺伝学は、現代の中東集団とヨーロッパおよびアフリカ集団との親和性における重要な対照を明らかにする」。PLOS ONE。8 ( 1 ): e54616。Bibcode : 2013PLoSO...854616B。doi : 10.1371/journal.pone.0054616 . ISSN 1932-6203. PMC 559847 . PMID 23382925.
- ^ セミノら (2004)
- ^ ウッドら (2005)
- ^ ステフロバ他 (2009)
- ^ クルチアーニ他 (2002)
- ^ セミノら (2002)
- ^ アンダーヒル他 (2000)
- ^ モランら（2004）
- ^ カラフェット他 (2008)
文献
- クルチアーニ、フルヴィオ。サントラマッツァ、ピエロ;沈、北東。マコーレー、ヴィンセント。道徳的、ペドロ。オルカーズ、アントネル。デヴィッド・モディアノ。ホームズ、スーザン。デストロ・ビソル、ジョバンニ。コイア、ヴァレンティナ。ウォレス、ダグラス C.オフナー、ピーター J.トッローニ、アントニオ。カヴァッリ＝スフォルツァ、L.ルカ。スコッツァーリ、ロザリア。 Underhill、Peter A. (2002)、「アジアからサハラ以南アフリカへの逆移住は、ヒト Y 染色体ハプロタイプの高解像度分析によってサポートされている」、The American Journal of Human Genetics、70 (5): 1197–214 、土井：10.1086/340257、PMC 447595、PMID 11910562
- クルチアーニ、フルヴィオ。ラ・フラッタ、ロベルタ。サントラマッツァ、ピエロ;セリット、ダニエレ。パスコーネ、ロベルト。道徳的、ペドロ。ワトソン、エリザベス。グイダ、ヴァレンティーナ。コロン、エリアーヌ・ベラウド。ザハロワ、ボリアナ。ラヴィーニャ、ジョアン。ヴォーナ、ジュゼッペ。アマン、ラシード。カリ、フランチェスコ。アカル、ネジャット。リチャーズ、マーティン。トッローニ、アントニオ。アンドレア・ノヴェレット。スコッツァリ、ロザリア（2004）「ハプログループE3b（E-M215）Y染色体の系統地理学的分析により、アフリカ内外での複数の移住イベントが明らかになった」アメリカ人類遺伝学ジャーナル、74（5）：1014–22、doi：10.1086 /386294、PMC 1181964、PMID 15042509
- Karafet, TM; Mendez, FL; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, SL; Hammer, MF (2008)、「新しいバイナリ多型によりヒト Y 染色体ハプログループ ツリーの形状が変わり、解像度が向上」、Genome Research、18 (5): 830–8、doi :10.1101/gr.7172008、PMC 2336805、PMID 18385274
- Moran, Colin N.; Scott, Robert A.; Adams, Susan M.; Warrington, Samantha J.; Jobling, Mark A.; Wilson, Richard H.; Goodwin, William H.; Georgiades, Evelina; Wolde, Bezabhe; Pitsiladis, Yannis P. (2004)、「エリートエチオピア持久力ランナーのY染色体ハプログループ」、Human Genetics、115 (6): 492–7、doi :10.1007/s00439-004-1202-y、PMID 15503146、S2CID 13960753
- セミノ、オルネラ。サンタキアラ＝ベネレセッティ、A. シルヴァーナ。ファラスキ、フランチェスコ。カヴァッリ＝スフォルツァ、L.ルカ。 Underhill、Peter A. (2002)、「Ethiopians and Khoisan Share the Deepest Clades of the Human Y-Chromosome Phylogeny」、The American Journal of Human Genetics、70 (1): 265–268、doi :10.1086/338306、PMC 384897、PMID 11719903
- セミノ、オルネラ。マグリ、キアラ。ベヌッツィ、ジョルジャ州。リン、アリス A.アル・ザヘリー、ナディア。バッタリア、ヴィンチェンツァ;マッチョーニ、リリアナ。トリアンタフィリディス、コスタス州。沈、北東。オフナー、ピーター J.ジボトフスキー、レフA。キング、ロイ。トッローニ、アントニオ。カヴァッリ＝スフォルツァ、L.ルカ。アンダーヒル、ピーター A. Santachiara-Benerecetti, A. Silvana (2004)、「Y染色体ハプログループEとJの起源、拡散、分化：ヨーロッパの新石器化と地中海地域におけるその後の移住イベントに関する推論」、アメリカ人類遺伝学ジャーナル、74 (5): 1023–34、doi :10.1086/386295、PMC 1181965、PMID 15069642
- Stefflova, Klara; Dulik, Matthew C.; Pai, Athma A.; Walker, Amy H.; Zeigler-Johnson, Charnita M.; Gueye, Serigne M.; Schurr, Theodore G.; Rebbeck, Timothy R. (2009)、Relethford, John (ed.)、「アメリカ大陸における性別に偏った混合の文脈におけるフィラデルフィアおよびダカールの集団の遺伝的祖先の評価」、PLOS ONE、4 (11): e7842、Bibcode :2009PLoSO...4.7842S、doi : 10.1371/journal.pone.0007842、PMC 2776971、PMID 19946364
- Trombetta, Beniamino; Cruciani, Fulvio; Sellitto, Daniele; Scozzari, Rosaria (2011)、MacAulay, Vincent (ed.)、「新たに特徴付けられたバイナリ多型の使用を通じて明らかにされたヒト Y 染色体ハプログループ E1b1 (E-P2) の新しいトポロジー」、PLOS ONE、6 (1): e16073、Bibcode :2011PLoSO...616073T、doi : 10.1371/journal.pone.0016073、PMC 3017091、PMID 21253605
- アンダーヒル、ピーター A.沈、北東。リン、アリス A.ジン、リー。パッサリーノ、ジュゼッペ。ヤン、ウェイ・H。カウフマン、エリン。ボネ・タミール、バトシェバ;ベルトランペティ、ジャウメ。フランカラッチ、パオロ。イブラヒム、ムンタセル。ジェンキンス、トレフォー。キッド、ジュディス R.メディ、S. カシム。シールスタッド、マーク・T.ウェルズ、R. スペンサー。アルベルト広場。ロナルド・W・デイビス;フェルドマン、マーカス W.カヴァッリ＝スフォルツァ、L.ルカ。オフナー、ピーター。 J. (2000)、「Y染色体配列変異と人類集団の歴史」、ネイチャージェネティクス、26 (3): 358–61、doi :10.1038/81685、PMID 11062480、S2CID 12893406
- Wood, Elizabeth T; Stover, Daryn A; Ehret, Christopher; Destro-Bisol, Giovanni; Spedini, Gabriella; McLeod, Howard; Louie, Leslie; Bamshad, Mike; Strassmann, Beverly I; Soodyall, Himla; Hammer, Michael F (2005)、「アフリカにおける Y 染色体と mtDNA 変異の対照的なパターン: 性別による偏りのある人口動態プロセスの証拠」、European Journal of Human Genetics、13 (7): 867–76、doi : 10.1038/sj.ejhg.5201408、PMID 15856073
変換表のソース
- Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; 他 (2001 年 2 月)。「島嶼部東南アジアおよびオセアニアのオーストロネシア語族の主に先住民族の父系遺産」。アメリカ 人類遺伝学ジャーナル。68 (2): 432–443。doi : 10.1086/ 318205。PMC 1235276。PMID 11170891。
- Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd , Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; et al. (2001 年 7 月 1 日)。「ヒト Y 染色体のグローバル多様性の階層的パターン」。分子生物学 と進化。18 (7): 1189–1203。doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906。PMID 11420360。
- Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris (2000)、「新しいハプロタイプの新しい用途」、Trends in Genetics、16 (8): 356–62、doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6、PMID 10904265
- カラジェヴァ、ルバ。カラフェル、フランセスク。ジョブリング、マークA;アンジェリチェワ、ドーラ。ら。 (2001 年 2 月)。 「Y染色体とミトコンドリアDNA系統によって明らかにされたVlax Romaの集団間および集団内の遺伝的多様性のパターン」。欧州人類遺伝学ジャーナル。9 (2): 97-104。土井：10.1038/sj.ejhg.5200597。PMID 11313742。
- Karafet, Tatiana; Xu, Liping; Du, Ruofu; Wang, William; et al. (2001 年 9 月). 「東アジアの父系人口史: 起源、パターン、およびミクロ進化プロセス」.アメリカ人類遺伝学ジャーナル. 69 (3): 615–628. doi : 10.1086/323299 . PMC 1235490. PMID 11481588 .
- Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000)、「現存するヨーロッパ人における旧石器時代のホモ・サピエンス・サピエンスの遺伝的遺産：AY染色体の観点」、Science、290 (5494): 1155–9、Bibcode :2000Sci...290.1155S、doi :10.1126/science.290.5494.1155、PMID 11073453
- Su, Bing; Xiao, Junhua; Underhill, Peter; Deka, Ranjan; et al. (1999 年 12 月)。「最終氷期に現代人が東アジアに北上したことの Y 染色体による証拠」。アメリカ人類遺伝 学ジャーナル。65 (6): 1718–1724。doi : 10.1086/ 302680。PMC 1288383。PMID 10577926。
- Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; et al. (2000 年 11 月)。「Y 染色体配列の変異と人類集団の歴史」。Nature Genetics . 26 (3): 358–361. doi :10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.
外部リンク
- ISOGG の Y-DNA ハプログループ E とサブクレード
- ブリテン諸島 DNA プロジェクト
- E1b1.org – ハプログループ E1b1 とそのサブクレードの国際 Y-DNA プロジェクト 2014-12-17 にWayback Machineでアーカイブ