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| ハプログループ E-M329 (旧 E3* / E1b1c) | |
|---|---|
| 起源の可能性のある時期 | 39,200年前[1] |
| 合体年齢 | 25,700年前[1] |
| 起源地の可能性 | 東アフリカ[2] |
| 祖先 | E-V38 |
| 子孫 | E-V2403、E-M329* |
| 突然変異の定義 | M329 |
ハプログループE-M329は、 E1b1a2としても知られ、ヒトのY染色体DNAハプログループです。[a] E-M329は主に東アフリカで見られます。[2]
起源
Trombetta et al. (2011) は東アフリカ起源説を提唱した。
ここで報告された新しいトポロジーは、ハプログループ E-P2 の起源に関して重要な意味を持っています。系統地理学的簡約の原理を用いると、E-M215 の三分岐が E-M2 と E-M329 の共通祖先を支持する方向に解決されたことは、ハプログループ E-P2 が以前に示唆されたように東アフリカに起源を持ち、サハラ以南のアフリカで頻繁に観察される染色体 E-M2 が東アフリカに存在する共通祖先に由来するという仮説を強く支持しています。[2]
分布
E-M329 は主に東アフリカで見られます。[2] E-M329 はエチオピア南西部、特にオモティック語を話す人々の間で頻繁に発生します。[3] [4] Semino et al. (2004) エチオピアのオロモ人で78 人のオロモ人を含む 2,400 人のうち2 人の E-M329 症例を発見しました。[5]カデナスら。 (2007)カタールでは 72 人中 1 人の E-M329 症例が発見されました。[6]
サブクラス
E-V2403
E-V2403はハプログループE-M329のサブクラスである。[1]
E-M329*
E-M329*はハプログループE-M329のサブグループである。[1]
系統学
系統発生の歴史
2002 年以前、学術文献には Y 染色体系統樹の命名システムが少なくとも 7 つありました。このため、かなりの混乱が生じました。2002 年に、主要な研究グループが集まり、Y 染色体コンソーシアム (YCC) が結成されました。彼らは共同論文を発表し、全員が使用することに同意した単一の新しい系統樹を作成しました。その後、集団遺伝学と遺伝系譜学に関心を持つ市民科学者のグループがワーキング グループを結成し、何よりもタイムリーであることを目指してアマチュア系統樹を作成しました。以下の表は、画期的な 2002 年の YCC 系統樹の時点でこれらの研究をすべてまとめたものです。これにより、以前に発表された文献をレビューする研究者は、命名法間をすばやく移動できます。
研究出版物
YCC ツリーの作成には、以下の研究チームが各自の出版物に基づいて参加しました。
- α Jobling と Tyler-Smith 2000 および Kaladjieva 2001
- βアンダーヒル2000
- γハマー 2001
- δカラフェット 2001
- εセミノ 2000
- ζス 1999
- ηカペリ 2001
系統樹
このハプログループサブクレードの系統樹は、Y染色体コンソーシアム（YCC）2008年系統樹[7] 、 ISOGG Y-DNAハプログループE系統樹[8]、およびその後に発表された研究に基づいています。
- E1b1a (L222.1、V38、V100)
- E1b1a1 (DYS271/M2/SY81、M291、P1/PN1、P189、P293、V43、V95、Z1101、Z1107、Z1116、Z1120、Z1122、Z1123、Z1124、Z1125、Z1127、Z1130、Z1133)
- E1b1a2 (M329)
参照
WikiquoteにはハプログループE-M329に関連する引用があります。
遺伝学
Y-DNA Eサブクラス
- ハプログループ E-L485
- ハプログループ E-M123
- ハプログループ E-M180
- ハプログループ E-M215
- ハプログループ E-M33
- ハプログループ E-M521
- ハプログループ E-M75
- ハプログループ E-M96
- ハプログループ E-P147
- ハプログループ E-P177
- ハプログループ E-P2
- ハプログループ E-V12
- ハプログループ E-V13
- ハプログループ E-V22
- ハプログループ E-V38
- ハプログループ E-M2
- ハプログループ E-V65
- ハプログループ E-V68
- ハプログループ E-Z820
- ハプログループ E-Z827
Y-DNAバックボーンツリー
注記
- ^ E-M329 は以前は E1b1c として知られていました。
参考文献
- ^ abcd "E-M329 YTree"。
- ^ abcd Trombetta, Beniamino; Fulvio Cruciani; Daniele Sellitto; Rosaria Scozzari (2011年1月6日). MacAulay, Vincent (編). 「新たに特徴付けられたバイナリ多型の使用により明らかになったヒトY染色体ハプログループE1b1 (E-P2) の新しいトポロジー」. PLOS ONE . 6 (1): e16073. Bibcode :2011PLoSO...616073T. doi : 10.1371/journal.pone.0016073 . PMC 3017091. PMID 21253605 .
- ^ ab 「Plaster et al. Passa によって予測された Y-DNA E サブクレード」。
- ^ ab CA, Plaster (2011-09-28). エチオピアにおけるY染色体、ミトコンドリアDNA、アイデンティティラベルの変異。discovery.ucl.ac.uk (博士論文) 。 2018年6月27日閲覧。
- ^ Semino, Ornella; Magri, C; Benuzzi, G; Lin, AA; Al-Zahery, N; Battaglia, V; MacCioni, L; Triantaphyllidis, C; et al. (2004). 「Y染色体ハプログループEとJの起源、拡散、分化：ヨーロッパの新石器化と地中海地域におけるその後の移住イベントに関する推論」。American Journal of Human Genetics。74 ( 5 ): 1023–1034。doi :10.1086/386295。PMC 1181965。PMID 15069642。
- ^ Cadenas, Alicia M.; Lev A Zhivotovsky, Luca L Cavalli-Sforza, Peter A Underhill and Rene J Herrera (2007年10月10日). 「オマーン湾の特徴はY染色体の多様性」. European Journal of Human Genetics . 16 (3): 374–386. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . PMID 17928816.
{{cite journal}}: CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク) - ^ Karafet, Tatiana M.; Fernando L. Mendez; Monica B. Meilerman; Peter A. Underhill; Stephen L. Zegura; Michael F. Hammer (2008 年 5 月)。「新しいバイナリ多型により、ヒト Y 染色体ハプログループ ツリーの形状が変わり、解像度が向上」。ゲノム研究。18 ( 5 ): 830–838。doi :10.1101/ gr.7172008。PMC 2336805。PMID 18385274 。
- ^ 国際遺伝系譜学会（2010年2月3日）「Y-DNAハプログループEとそのサブクレード – 2010年」 。 2010年12月17日閲覧。
変換表のソース
- Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; 他 (2001 年 2 月)。「島嶼部東南アジアおよびオセアニアのオーストロネシア語族の主に先住民族の父系遺産」。アメリカ 人類遺伝学ジャーナル。68 (2): 432–443。doi : 10.1086/ 318205。PMC 1235276。PMID 11170891。
- Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd , Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; et al. (2001 年 7 月 1 日)。「ヒト Y 染色体のグローバル多様性の階層的パターン」。分子生物学 と進化。18 (7): 1189–1203。doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906。PMID 11420360。
- Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris (2000)、「新しいハプロタイプの新しい用途」、Trends in Genetics、16 (8): 356–62、doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6、PMID 10904265
- カラジェヴァ、ルバ。カラフェル、フランセスク。ジョブリング、マークA;アンジェリチェワ、ドーラ。他。 (2001 年 2 月)。 「Y染色体とミトコンドリアDNA系統によって明らかにされたVlax Romaにおける集団間および集団内の遺伝的多様性のパターン」。欧州人類遺伝学ジャーナル。9 (2): 97-104。土井：10.1038/sj.ejhg.5200597。PMID 11313742。
- Karafet, Tatiana; Xu, Liping; Du, Ruofu; Wang, William; et al. (2001 年 9 月). 「東アジアの父系人口史: 起源、パターン、およびミクロ進化プロセス」.アメリカ人類遺伝学ジャーナル. 69 (3): 615–628. doi : 10.1086/323299 . PMC 1235490. PMID 11481588 .
- Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000)、「現存するヨーロッパ人における旧石器時代のホモ・サピエンス・サピエンスの遺伝的遺産：AY染色体の観点」、Science、290 (5494): 1155–9、Bibcode :2000Sci...290.1155S、doi :10.1126/science.290.5494.1155、PMID 11073453
- Su, Bing; Xiao, Junhua; Underhill, Peter; Deka, Ranjan; et al. (1999 年 12 月)。「最終氷期に現代人が東アジアに北上したことの Y 染色体による証拠」。アメリカ人類遺伝 学ジャーナル。65 (6): 1718–1724。doi : 10.1086/ 302680。PMC 1288383。PMID 10577926。
- Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; et al. (2000 年 11 月)。「Y 染色体配列の変異と人類集団の歴史」。Nature Genetics . 26 (3): 358–361. doi :10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.