ハプログループ E-P177

ハプログループ E-P177
ハプログループ E-P177
起源の可能性のある時期	49,800年前
合体年齢	41,400年前
起源地の可能性	アフリカ
祖先	E-P147
子孫	E-P2、E-P75
突然変異の定義	P177、PF1939

ハプログループE-P177は、ヒトY染色体DNAハプログループである。E-P177には、ハプログループE-P2とハプログループE-P75の2つのサブクレードが知られている。 ^[2]

サブクラス

E-P2

ハプログループE-P2はハプログループE-P177のサブグループである。^[2]

E-P75

ハプログループE-P75はハプログループE-P177のサブグループである。^[2]

系統学

系統発生の歴史

2002 年以前、学術文献には Y 染色体系統樹の命名システムが少なくとも 7 つありました。このため、かなりの混乱が生じました。2002 年に、主要な研究グループが集まり、Y 染色体コンソーシアム (YCC) が結成されました。彼らは共同論文を発表し、全員が使用することに同意した単一の新しい系統樹を作成しました。その後、集団遺伝学と遺伝系譜学に関心を持つ市民科学者のグループがワーキンググループを結成し、何よりもタイムリーであることを目指してアマチュア系統樹を作成しました。以下の表は、画期的な 2002 年の YCC 系統樹の時点でこれらの研究をすべてまとめたものです。これにより、以前に発表された文献をレビューする研究者は、命名法間をすばやく移動できます。

研究出版物

YCC ツリーの作成には、以下の研究チームが各自の出版物に基づいて参加しました。

α Jobling と Tyler-Smith 2000 および Kaladjieva 2001
βアンダーヒル2000
γハマー 2001
δカラフェット 2001
εセミノ 2000
ζス 1999
ηカペリ 2001

系統樹

ハプログループE-P177には、確認済みおよび提案済みの系統樹がいくつかあります。科学的に認められているのは、Y染色体コンソーシアム（YCC）のもので、Karafet et al.（2008）^{[2]で発表され、その後更新されました。新たな科学を示す草稿の系統樹は}、テキサス州ヒューストンのゲノム研究センターのThomas Krahnによって提供されています。国際遺伝系譜学会（ISOGG）もアマチュア向けの系統樹を提供しています。

ゲノム研究センタードラフトツリー

これは、ゲノム研究センターの Thomas Krahn によるハプログループ E-P177 のドラフトツリー提案ツリーです。サブクレードの最初の 3 つのレベルが表示されています。

E-P177 P177
- E1b1 P2、P179、P180、P181、DYS391p
  - E-V38 L222.1、V38、V100
  - E-M215 M215/ページ40
  - E-M329 M329
- E-P75 P75

2012 ISOGGツリー

2012 ISOGG ツリーに基づくハプログループ E-P177 のサブクレードと定義される変異を以下に示します。サブクレードの最初の 3 つのレベルを示します。

E-P177 P177
- E1b1 P2、P179、P180、P181、DYS391p
  - E-V38 L222.1、V38、V100
  - E-M215 M215/ページ40
- E-P75 P75

参照

遺伝学

Y-DNA Eサブクラス

Y-DNAバックボーンツリー

参考文献

^ ab "E-P177 YTree"より。
^ abcd Karafet, Tatiana M.; et al. (2008年4月2日). 「新たなバイナリ多型がヒトY染色体ハプログループツリーの解像度を再形成し向上させる」(PDF) .ゲノム研究. 18 (5): 830–838. doi :10.1101/gr.7172008. OCLC 678393385. PMC 2336805. PMID 18385274. S2CID 12995903 .

変換表のソース

Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; 他 (2001 年 2 月)。「島嶼部東南アジアおよびオセアニアのオーストロネシア語族の主に先住民族の父系遺産」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。68 (2): 432–443。doi :10.1086/318205。PMC 1235276。PMID 11170891。
Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd , Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; et al. (2001 年 7 月 1 日)。「ヒト Y 染色体のグローバル多様性の階層的パターン」。分子生物学と進化。18 (7): 1189–1203。doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906。PMID 11420360。
Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris (2000)、「新しいハプロタイプの新しい用途」、Trends in Genetics、16 (8): 356–62、doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6、PMID 10904265
カラジェヴァ、ルバ。カラフェル、フランセスク。ジョブリング、マークA;アンジェリチェワ、ドーラ。他。 (2001 年 2 月)。「Y染色体とミトコンドリアDNA系統によって明らかにされたVlax Romaの集団間および集団内の遺伝的多様性のパターン」。欧州人類遺伝学ジャーナル。9 (2): 97-104。土井：10.1038/sj.ejhg.5200597。PMID 11313742。S2CID 21432405 。
Karafet, Tatiana; Xu, Liping; Du, Ruofu; Wang, William; et al. (2001 年 9 月). 「東アジアの父系人口史: 起源、パターン、およびミクロ進化プロセス」.アメリカ人類遺伝学ジャーナル. 69 (3): 615–628. doi :10.1086/323299. PMC 1235490. PMID 11481588 .
Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000)、「現存するヨーロッパ人における旧石器時代のホモ・サピエンス・サピエンスの遺伝的遺産：AY染色体の観点」、Science、290 (5494): 1155–9、Bibcode :2000Sci...290.1155S、doi :10.1126/science.290.5494.1155、PMID 11073453
Su, Bing; Xiao, Junhua; Underhill, Peter; Deka, Ranjan; et al. (1999 年 12 月)。「最終氷期に現代人が東アジアに北方移住したことを示す Y 染色体の証拠」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。65 (6): 1718–1724。doi :10.1086/302680。PMC 1288383。PMID 10577926。
Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; et al. (2000 年 11 月)。「Y 染色体配列の変異と人類集団の歴史」。Nature Genetics . 26 (3): 358–361. doi :10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.

外部リンク

ISOGG 2008 の Y-DNA ハプログループ E とそのサブクレード
ブリテン諸島 DNA プロジェクト

[YFull-1] "E-P177 YTree"より。

[Karafet-2] Karafet, Tatiana M.; et al. (2008年4月2日). 「新たなバイナリ多型がヒトY染色体ハプログループツリーの解像度を再形成し向上させる」(PDF) .ゲノム研究. 18 (5): 830–838. doi :10.1101/gr.7172008. OCLC 678393385. PMC 2336805. PMID 18385274. S2CID 12995903 .