一般的な 代表的な属には以下が含まれます: [ 3 ]
シトロバクターは 周毛性 通性嫌気性桿菌である。 [ 4 ] シトロバクター 属は腸内細菌叢に生息し害を及ぼさないが、機会があれば尿路感染症、菌血症 、脳膿瘍、肺炎 、腹腔内敗血症、髄膜炎、関節感染症を引き起こす可能性がある。 [ 4 ] シトロバクター 属の感染症の死亡率は33～48%で、乳幼児や免疫不全の 人はより感染しやすい。 [ 4 ] エンテロバクターは 菌血症 、呼吸器感染症、尿路感染症 、手術部位の感染症、そして極端な場合には髄膜炎 、副鼻腔炎 、骨髄炎 などの感染症を引き起こすことで知られています。 [ 5 ] エンテロバクター が存在するかどうかを確認するには、まずマッコンキー寒天培地で培養して、乳糖 発酵性であることを確認します。 [ 5 ] エンテロ バクターと大腸菌を区別できます。 エンテロバクターは インドール 陰性で、大腸菌 は陽性です。 [ 5 ] エンテロバクターは 、運動性の違いによりクレブシエラ と区別されます。 [ 5 ] クレブシエラは [ 6 ] 多糖類 からなる莢膜を持ち、数ヶ月間乾燥に耐えることができます。 [ 6 ] クレブシエラ・ニューモニエ 動物の消化管 、下水、土壌で最も一般的なクレブシエラ属菌です。 [ 7 ] クレブシエラ 属菌のコロニーは灰白色で、粘膜状の外面を示します。 [ 6 ] 混合サンプル中のクレブシエラ 属菌を選択するために使用される培地は、オルニチン、ラフィノース、およびクエン酸カリウムを含む寒天で、この属の菌は黄色で湿ったようなコロニーを形成します。 [ 8 ] 大腸菌 [ 7 ] 特に大腸菌は [ 9 ] 大腸菌 株のほとんどは運動性があり、水平遺伝子伝達 によって多くの病原 性を獲得しています。 [ 9 ] 胃腸 症候群を引き起こす大腸菌 には、下痢原性大腸菌 （DEC）、腸管毒素原性大腸菌 （ETEC）、EPEC、EHECを含む志賀毒素産生性大腸菌（STEC）、腸管凝集性 大腸菌（EAEC）、腸管侵入性 大腸菌 （EIEC）など、いくつかの異なる。 [ 9 ] 大腸菌 を識別する方法は、細胞表面のO、H、K多糖類の変異に基づく方法や選択培地を使用する方法など様々である大腸菌 Escherichia coli、 E. coli ）は 、糞便性大腸菌 検査において44℃で乳糖を発酵する能力、および特定の培養培地での増殖と発色反応によって、他のほとんどの大腸菌群と区別できます。エオシンメチレンブルー（EMB）プレートで培養すると、 大腸菌 の陽性結果は、濃い紫色の培地上に金属光沢のある緑色のコロニーとして現れます。また、トリプトン胆汁X-グルクロニド（TBX）で培養すると、24時間の培養期間後に青色または緑色のコロニーとして現れます。大腸菌の培養期間は12～72時間で、最適な増殖温度は37℃です。一般的な大腸菌群とは異なり、大腸菌は ほぼ例外なく糞便由来であり、その存在は糞便汚染の有効な確認となります。大腸菌 のほとんどの株は無害ですが、一部はヒトに重篤な疾患を引き起こす可能性があります。感染の症状や兆候には、血便、腹痛、嘔吐、そして時折発熱などがあります。 この 細菌は 肺炎、 その他の 呼吸器 疾患、 尿路感染症も 引き起こす 可能性があります。 [ 10 ] [ 11 ]
大腸菌群の異なる種類を簡単に区別する方法は、エオシンメチレンブルー 寒天培地を使用することです。[ 12 ] 発酵 能力に基づいて色の変化を起こします。[ 12 ] 大腸菌 （乳糖も発酵する）のコロニーは濃い色になりますが、金属的な緑色の光沢も見られます。その他の大腸菌群は厚くぬるぬるしたコロニーとして現れ、非発酵菌は無色、弱い発酵菌はピンク色になります。
大腸菌
大腸菌 O1572021年11月15日現在、米国の7州で大腸菌 O157:H7株による疾患が10例報告されている。[ 13 ] [ 13 ] 大腸菌株に汚染されていたと結論付けられた。 [ 13 ] これは、ほうれん草から抽出した株の全ゲノムシーケンス を行い、感染者から採取した株と比較することによって判明した。 [ 13 ]
2022年2月7日現在、カナダのアルバータ州とサスカチュワン州では、大腸菌 O157株による感染症の確定症例が合計14件報告されている。[ 14 ] [ 14 ] [ 14 ]
PCR β-ガラクトシダーゼ 遺伝子の増幅は、すべての大腸菌群がこの化合物を産生するため、一般的に大腸菌群を検出するために使用されます。[ 15 ] または ベロ毒素産生大腸菌を検出するために、その ベロ毒素 遺伝子の増幅が使用されます。 [ 15 ] [ 16 ]
化学発光in situハイブリダイゼーション 腸内細菌科の 16S rRNA の特定領域はオリゴヌクレオチド プローブによって結合され、飲料水の水質監視に役立ちます。[ 15 ] 大腸菌は、16S rRNAの特定の配列に結合する大豆ペルオキシダーゼ標識ペプチド核酸（PNA）プローブで標識されます。 化学発光 基質と併用すると、大腸菌 の各コロニーが存在する場所で光が生成され、サンプル中に大腸菌が存在することが示されます。[ 17 ]
紫赤色胆汁寒天培地 固体培地は乳糖発酵性大腸菌群の培養に使用され、中性赤色のpH指示薬 が用いられます。乳糖が発酵するとピンク色のコロニーが現れ、沈殿し た胆汁 に囲まれます。これらのコロニーが大腸菌群であることを確認するために、それらを鮮やかな緑色の乳糖胆汁（BGLB）に移し、培養します。培養後にガスが確認できれば、サンプルに大腸菌群が存在していたことが確認できます。[ 18 ]
膜ろ過法 試験サンプルは標準ろ紙でろ過し、M-endo または LES Endo Agar 培地に移します。コロニーは、22～24 時間培養すると、ピンクがかった赤色で緑色の金属光沢を呈します。これらのコロニーは、ラウリルトリプトース (LST) に接種してガスを発生させ、その後 BGLB に接種すると、大腸菌群であることが確認できます。BGLB チューブでガスが発生した場合、大腸菌群の存在に対して試験は陽性となります。[ 18 ]
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