COX5B

COX5B
識別子
エイリアス	COX5B、シトクロム c 酸化酵素サブユニット Vb、COXVB、シトクロム c 酸化酵素サブユニット 5B
外部ID	オミム: 123866; MGI : 88475;ホモロジーン: 37538;ジーンカード：COX5B; OMA :COX5B - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体2（ヒト）
終わり	97,648,383 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体1（マウス）
終わり	36,732,762 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	右心室; ; 心の頂点; ; 外側広筋; ; 左心室; ; 上腕二頭筋の骨格筋組織; ; 舌の体; ; 視床の外側核群; ; 腹直筋の骨格筋組織; ; 上腕三頭筋; ; 腎髄質;
	トップの表現
	右腎臓; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 網膜の神経層; ; 太ももの筋肉; ; 上前頭回; ; 一次視覚野; ; リップ; ; 卵黄嚢; ; 胚; ; 胚;
	参照表現データの詳細
	; ; ; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; 金属イオン結合; シトクロムc酸化酵素活性;
細胞成分	ミトコンドリア内膜; ミトコンドリアエンベロープ; ミトコンドリア; 膜; ミトコンドリア呼吸鎖複合体IV;
生物学的プロセス	呼吸器系による呼吸ガス交換; ミトコンドリア電子伝達、シトクロム c から酸素; ミトコンドリアATP合成とプロトン輸送の結合;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	1329
	12859
	ENSG00000135940
	ENSMUSG00000061518
	P10606
	P19536
	NM_001862
	NM_009942
	NP_001853
	該当なし
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
ＰＤＢ	1v55 S:30-98 1occ S:30-98 1v54 F:30-98 1oco F:30-98 1ocz S:30-98 1ocr F:30-98 2occ S:30-98

シトクロム c 酸化酵素サブユニット Vb
シトクロム c 酸化酵素サブユニット Vb
	13サブユニット酸化シトクロムc酸化酵素の構造。
識別子
シンボル	COX5B
パム	PF01215
インタープロ	著作権
プロサイト	PDOC00663
SCOP2	1occ / スコープ / SUPFAM
OPMスーパーファミリー	4
OPMタンパク質	1v55
医療機器	cd00924
パム
利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
ＰＤＢ	1v55 S:30-98 1occ S:30-98 1v54 F:30-98 1oco F:30-98 1ocz S:30-98 1ocr F:30-98 2occ S:30-98

ミトコンドリアのシトクロムc酸化酵素サブユニット 5B は、ミトコンドリア電子伝達系の最後の酵素である複合体 IVとしても知られるシトクロム c 酸化酵素複合体のサブユニットであるヒトの酵素です。^{[2]ヒトでは、シトクロム c 酸化酵素サブユニット 5B は}COX5B遺伝子によってコードされています。

構造

この酵素は14kDaで、129個のアミノ酸から構成されています。^[3]^{[4]このタンパク質は}複合体IVのサブユニットであり、複合体IVは13個のミトコンドリアおよび核にコードされたサブユニットで構成されています。^[2]サブユニットVbの配列はよく保存されており、亜鉛イオンを配位する3つの保存されたシステインが含まれています。^[5]^[6]これらのシステインのうち2つはサブユニットのC末端部分に集まっています。

遺伝子

COX5B遺伝子は、染色体2のq腕の11.2番に位置し、4つのエクソンで構成され、長さは2,137塩基対です。^[2]

関数

シトクロムc酸化酵素 (COX) は、ミトコンドリア呼吸鎖の末端酵素です。これは、シトクロムcから酸素への電子の移動を結合し、ミトコンドリア内膜を横切るプロトン電気化学的勾配に寄与し、プロトン駆動力を介してATP合成を促進する、複数のサブユニットからなる酵素複合体です。ミトコンドリアにコード化されたサブユニットは、プロトンポンプ活動の電子移動を実行します。核コード化サブユニットの機能は不明ですが、複合体の調節と組み立てに役割を果たしている可能性があります。^[2]

要約反応:

4 Fe ²⁺ -シトクロムc + 8 H ⁺_in + O ₂ → 4 Fe ³⁺ -シトクロムc + 2 H ₂ O + 4 H ⁺_out^[11]

臨床的意義

COX5AとCOX5BはBcl-2による癌細胞の代謝の調節に関与している。^[12]

ヒト免疫不全ウイルス（HIV）の転写活性化タンパク質（Tat）は、マウスとヒトの肝臓、心臓、脳のサンプルから分離された透過性ミトコンドリア中のシトクロムcオキシダーゼ（COX）の活性を阻害します。^[13]

インタラクション

COX5Bはアンドロゲン受容体と相互作用することが示されている。^[14]

参考文献

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さらに読む

Lomax MI, Hsieh CL, Darras BT, Francke U (1991). 「ヒトシトクロムc酸化酵素サブユニットVb遺伝子の構造とコーディング遺伝子および7つの擬似遺伝子の染色体マッピング」. Genomics . 10 (1): 1– 9. doi :10.1016/0888-7543(91)90476-U. hdl : 2027.42/29338 . PMID 1646156.
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外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒト COX5B ゲノムの位置と COX5B 遺伝子の詳細ページ。
COPaKBにおけるCOX5Bの質量分析特性評価
PROSITEのシトクロム c 酸化酵素サブユニット Vb
PDBe-KBの UniProt : P10606 (シトクロム c 酸化酵素サブユニット 5B、ミトコンドリア)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

[pmid15299438-1] Miki K, Sogabe S, Uno A, et al. (1994年5月). 「Rhodopseudomonas viridis由来シトクロムc2の結晶構造解析への自動分子置換法の適用」(PDF) . Acta Crystallogr. D . 50 (Pt 3): 271– 5. Bibcode :1994AcCrD..50..271M. doi :10.1107/S0907444993013952. PMID 15299438.

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[refGRCh38Ensembl-7] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000135940 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-8] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000061518 – Ensembl、2017 年 5 月

[9] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[10] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[Biochem-11] プラット・ドナルド・ヴォート、ジュディス・G・ヴォート、シャーロット・W. (2013). 「18」。生化学の基礎: 分子レベルでの生命(第 4 版)。ニュージャージー州ホーボーケン：ワイリー。ページ 581–620。ISBN 978-0-470-54784-7。{{cite book}}: CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク)

[12] ^ Chen ZX、Pervaiz S (2010 年 3 月)。 「 Bcl-2 による癌細胞代謝の調節におけるシトクロム c 酸化酵素サブユニット Va および Vb の関与」。細胞死と分化。17 (3): 408– 20。doi : 10.1038/ cdd.2009.132。PMID 19834492 。

[13] ルクール H、ボルニュ＝サンチェス A、シャロアン O、エル＝クーリー R、ブラバン M、ランゴンネ A、ポルセドゥ M、ブリエール JJ、ブロン N、ルブイヤ D、ペシュー C、デニオー A、ブレナー C、ブリアン JP、ミュラー S、ラスティン P、ジャコット E (2012)。「HIV-1 Tatタンパク質はミトコンドリア膜の透過性を直接誘導し、シトクロムcオキシダーゼを不活性化します。」細胞死と病気。3 (3): e282。土井：10.1038/cddis.2012.21。PMC 3317353。PMID 22419111。

[pmid11719263-14] Beauchemin AM, Gottlieb B, Beitel LK, Elhaji YA, Pinsky L, Trifiro MA (2001). 「シトクロム c 酸化酵素サブユニット Vb はヒトアンドロゲン受容体と相互作用する: 脊髄球性筋萎縮症における神経毒性の潜在的メカニズム」Brain Res. Bull . 56 ( 3– 4): 285– 97. doi :10.1016/S0361-9230(01)00583-4. PMID 11719263. S2CID 24740136.