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| 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス1 | |
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| SARSウイルス粒子の電子顕微鏡画像 | |
ウイルスの分類 
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| (ランク外): | ウイルス |
| 領域: | リボウイルス |
| 王国： | オルタナウイルス科 |
| 門: | ピスビリコタ |
| クラス： | ピソニビリセテス |
| 注文： | ニドウイルス目 |
| 家族： | コロナウイルス科 |
| 属: | ベータコロナウイルス |
| 亜属： | サルベコウイルス |
| 種： | |
| 歪み： | 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス1
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| 同義語 | |
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重症急性呼吸器症候群コロナウイルス1（SARS-CoV-1）は、以前は重症急性呼吸器症候群コロナウイルス（SARS-CoV ）として知られており、[2] 2002～2004年のSARS流行の原因となった呼吸器疾患である重症急性呼吸器症候群（SARS）を引き起こすコロナウイルスの一種です。[3]これは、肺内の上皮細胞に感染する、エンベロープを持つプラス鎖の一本鎖RNAウイルスです。 [4]このウイルスは、アンジオテンシン変換酵素2に結合して宿主細胞に侵入します 。[5]これは、人間、コウモリ、ハクビシンに感染します。[6] [7] SARS-CoV-1の流行は、単純な公衆衛生対策によってほぼ制御されました。 SARS-CoV-1は患者が病気のときに最も伝染性が高いため、症状のある患者を隔離することでその拡散を効果的に抑制できる可能性がある。[8]
2003年4月16日、アジアでのSARSの発生と世界各地での二次感染を受けて、世界保健機関（WHO）はプレスリリースを発表し、複数の研究所で特定されたコロナウイルスがSARSの正式な原因であると発表しました。米国疾病予防管理センター（CDC）とカナダ国立微生物学研究所（NML）は2003年4月にSARS-CoV-1ゲノムを特定しました。 [9] [10]オランダのロッテルダムにあるエラスムス大学の科学者は、SARSコロナウイルスがコッホの原則を満たしていることを実証し、それが原因物質であることを確認しました。実験では、ウイルスに感染したマカクザルは人間のSARS患者と同じ症状を発症しました。[11]
2019年後半、SARSに非常によく似たウイルスが発見されました。重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）と名付けられたこのウイルスは、 COVID-19の原因病原体であり、その増殖がCOVID-19パンデミックのきっかけとなりました。[12]
SARS
重症急性呼吸器症候群（SARS）は、SARS-CoV-1によって引き起こされる疾患です。重篤な病気を引き起こすことが多く、最初は筋肉痛、頭痛、発熱などの全身症状が見られ、その後2～14日以内に呼吸器症状（主に咳、呼吸困難、肺炎）が発症します[13]。SARS患者によく見られるもう1つの所見は、血液中のリンパ球数の減少です[14] 。
2003年のSARSの流行では、SARS-CoV-1感染が確認された患者の約9％が死亡しました。[15] 60歳以上の死亡率はさらに高く、このサブセットの患者では死亡率が50％に近づきました。[15]
起源と進化の歴史
2003年3月、WHOはSARSの原因物質の特定に協力する主要な研究所の世界的ネットワークを設立した。ネットワーク内の研究所は早い段階で、パラミクソウイルスとコロナウイルス科のメンバーに検索範囲を絞り込んだ。研究所が共有した初期の調査結果は、コロナウイルスを示唆するものとなり、その一貫性は高まった。3月21日、香港大学の科学者らは、SARSの原因物質であると強く疑われる新しいウイルスを分離したと発表した。[16]
疫学的証拠は、このウイルスが人獣共通感染症起源であることを示唆しており、広東省で最初に検出されたSARS症例の33%以上が動物または食品取扱者であった。 [17]血清学的有病率調査は、この人獣共通感染症の関連性を裏付けている（広東省の市場で無症状の動物取扱者の多くがSARS-CoVに対する抗体を持っていた）。[17]
2003年4月12日、バンクーバーのマイケル・スミス・ゲノム科学センターの科学者らは、 SARSに関連していると考えられるコロナウイルスの遺伝子配列のマッピングを完了した。マルコ・マーラとキャロライン・アステルが率いるチームは、トロントの感染患者のサンプルを使用して、ブリティッシュコロンビア州疾病予防管理センターおよびマニトバ州ウィニペグの国立微生物学研究所と共同で作業を行った。[18] [19]この地図は、WHOによってSARSとの戦いにおける重要な前進として歓迎され、[要出典]、 GSCのウェブサイト（下記参照）を通じて世界中の科学者と共有されている。トロントのマウント・サイナイ病院のドナルド・ローは、この発見が「前例のないスピード」で行われたと述べた。[20] SARSコロナウイルスの配列はその後、他の独立したグループによって確認されている。
分子疫学的研究により、2002～2003年に中国南部で分離されたウイルスと、2003年後半から2004年初頭に同じ地域で分離されたウイルスは異なっており、別々の種交配イベントを示していることが実証されました。[21]アウトブレイク株の 系統発生によると、雲南省、貴州省、広西チワン族自治区を含む南西部の省は、他の省よりもヒトのSARS-CoV-1によく似ていますが、ウイルスの進化は宿主との相互作用と特殊性の産物です。[22]
2003年5月下旬、中国広東省の地元市場で食用として売られていた野生動物のサンプルを調べたところ、SARSコロナウイルスの株がハクビシン（Paguma sp.）から分離できたが、動物が必ずしも臨床症状を示すとは限らないことが判明した。暫定的な結論としては、SARSウイルスはハクビシンから人間へ種の壁を越えたというもので、広東省では1万匹以上のハクビシンが殺された。このウイルスは後にタヌキ（Nyctereuteus sp.）[23] 、 イタチアナグマ（Melogale spp.）、飼い猫でも発見された。2004年、香港大学中国疾病予防管理センターと広州疾病予防管理センターの科学者らは、ハクビシンに現れたSARSコロナウイルスと人間の間に遺伝的関連を確立し、ウイルスが動物種から人間に感染した可能性があるという主張を裏付けた。[24]市場で感染したハクビシンは、感染した動物が見つからなかった農場まで追跡されました。ウイルスがもともと市場に持ち込まれたのがハクビシンなのか、人間なのか、それとも他の動物なのかは不明です。[23]
2005年に、2つの研究で中国のコウモリからいくつかのSARSに似たコロナウイルスが特定されました。[25] [26]コウモリSARSウイルスは細胞培養では複製されませんでしたが、2008年にアメリカの研究者[27]がコウモリSARSウイルスの遺伝子構造を改変し、コウモリウイルスとマウスの両方でヒト受容体結合ドメインを導入することで、進化の過程で人獣共通感染症が発生する可能性があることを示しました。[ 28] これらのウイルスの系統発生解析により、SARSコロナウイルスはコウモリに由来し、直接または中国の市場で飼われていた動物を介して人間に広がった可能性が高いことが示されました。コウモリは目に見える病気の兆候を示しませんでしたが、SARSに似たコロナウイルスの自然宿主である可能性があります。
系統発生
コウモリは、病原体を保有しながらも悪影響を示さず、感染源となる宿主、つまり自然のリザーバーである可能性が高い。コウモリの個体群からはSARS-CoVの直接の祖先は発見されていないが、WIV16は2013年から2016年の間に中国雲南省西陽イ族郷の洞窟で発見され、遺伝的に96％類似したウイルス株を持っている。 [29] WIV16の雲南省洞窟内、またはまだ特定されていない他のコウモリの洞窟内でコウモリSARSr-CoVの組み換えによってSARS-CoV-1が出現したという仮説は、非常に可能性が高いと考えられている。[30]
SARS-CoV-1および関連コロナウイルスの全ゲノム配列に基づく系統樹は次のとおりです。
ウイルス学
SARS-CoV-1はコロナウイルス亜科に典型的な複製戦略に従っている。このウイルスの主なヒト受容体はアンジオテンシン変換酵素2（ACE2）とヘマグルチニン（HE）であり、[40] 2003年に初めて特定された。[41] [42]
ヒトSARS-CoV-1は、いくつかの異なる動物群に宿主されていた祖先コロナウイルス間の複雑な組み換えの歴史を持っているようです。 [43] [44] 組み換えが起こるためには、少なくとも2つのSARS-CoV-1ゲノムが同じ宿主細胞内に存在する必要があります。組み換えは、 RNAポリメラーゼが1つのテンプレートから別のテンプレートに切り替えるゲノム複製中に発生する可能性があります（コピー選択組み換え）。[44]
SARS-CoV-1は、ヒトに感染することが知られている7つのコロナウイルスのうちの1つです。他の6つは以下のとおりです。[45]
- ヒトコロナウイルス229E（HCoV-229E）
- ヒトコロナウイルスNL63（HCoV-NL63）
- ヒトコロナウイルスOC43（HCoV-OC43）
- ヒトコロナウイルス HKU1 (HCoV-HKU1)
- 中東呼吸器症候群関連コロナウイルス（MERS-CoV）
- 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）
参照
参考文献
引用
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出典
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外部リンク
ウィキメディア・コモンズには、 SARS-CoVに関連するメディアがあります。
Wikispeciesには、重症急性呼吸器症候群コロナウイルスに関する情報があります。
- WHOのプレスリリース、SARSウイルスを特定し命名
- SARS ウイルスの遺伝子地図 2006-08-18 にWayback Machineでアーカイブ
- SARS ウイルスに関する科学特集 (無料コンテンツ: 登録不要)
- マギル大学の SARS リソース(Wayback Machineより) (2005 年 3 月 1 日アーカイブ)
- 米国疾病予防管理センター（CDC）SARSホーム
- 世界保健機関が警戒