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| ベータコロナウイルス香港 | |
|---|---|
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| HcoV-HKU1の形成。 | |
ウイルスの分類 
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| (ランク外): | ウイルス |
| 領域: | リボビリア |
| 王国： | オルタナウイルス科 |
| 門: | ピスビリコタ |
| クラス： | ピソニビリセテス |
| 注文： | ニドウイルス目 |
| 家族： | コロナウイルス科 |
| 属: | ベータコロナウイルス |
| 亜属： | エンベコウイルス |
| 種： | ベータコロナウイルス香港
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| 同義語 | |
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ベータコロナウイルス・ホンコネンセ [1]（一般にヒトコロナウイルスHKU1、略してHCoV-HKU1と呼ばれる）は、ヒトと動物に生息するコロナウイルスの一種である。風邪の症状を伴う上気道疾患を引き起こすが、肺炎や細気管支炎に進行することもある。 [2] 2004年1月に香港の男性から初めて発見された。 [3] その後の研究では、世界中に分布し、発生時期も古いことが明らかになった。
このウイルスはエンベロープを持つプラス鎖一本鎖 RNAウイルスで、N-アセチル-9-O-アセチルノイラミン酸受容体に結合して宿主細胞に侵入する。[4]ヘマグルチニンエステラーゼ（HE）遺伝子を持ち、ベータコロナウイルス属エンベコウイルス亜属に属する。[5]
歴史
HCoV-HKU1は、2004年1月に、急性呼吸窮迫症候群とレントゲン検査で両側肺炎が確認されたため入院した71歳の男性で初めて検出された。男性は最近、中国の深センから香港に戻ってきたところだった。[3] [6]
2021年の新しい二名法命名提案によると、2023年にHCoV-HKU1はBetacoronavirus hongkonenseに改名されました。
ウイルス学
Woo氏らはHCoV-HKU1分離株の培養には失敗したが、完全なゲノム配列を得ることに成功した。系統解析により、HKU1はマウス肝炎ウイルス（MHV）に最も近縁であり、その点でHCoV-OC43などの他の既知のヒトベータコロナウイルスとは異なることが示された。[3]このウイルスは、Pyrc氏らによってヒト呼吸器上皮のex vivoモデルで培養に成功した。[7]さらなる研究により、ウイルスは細胞表面のO-アセチル化シアリン酸に付着することが明らかになった。[8]これによりSタンパク質の構造変化が誘発され、エントリー受容体との相互作用が促進される。[9]興味深いことに、カリクレイン13酵素は、Pyrc氏のチームによってスパイクタンパク質の処理を担う活性化因子として特定されている。これは潜在的にウイルスの組織や細胞の好みを特定し、種間の伝播の調節にも影響する可能性がある。[10]
RNA依存性RNAポリメラーゼ（RdRp）、スパイク（S）、ヌクレオカプシド（N）遺伝子を解析したところ、相容れない系統関係が発見された。HCoV-HKU1の22株のゲノム配列を完全に解析した結果、これが自然組換えによるものであることが確認された。[3] HCoV-HKU1はげっ歯類に由来する可能性が高い。[11]
HCoV-HKU1は、ヒトに感染することが知られている7つのコロナウイルスのうちの1つです。他の6つは以下のとおりです。[12]
- ヒトコロナウイルス229E（HCoV-229E）
- ヒトコロナウイルスNL63（HCoV-NL63）
- ヒトコロナウイルスOC43（HCoV-OC43）
- 中東呼吸器症候群関連コロナウイルス（MERS-CoV）
- 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス（SARS-CoV-1）
- 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）
HCoV-HKU1スパイク（S）タンパク質とヘマグルチニンエステラーゼ（HE）タンパク質の構造は、それぞれ2016年と2020年にクライオ電子顕微鏡法によって解明されました。Sタンパク質（ PDB：5I08）はその大きなサイズで知られています。[13] HEタンパク質（PDB：6Y3Y）は、従来のタンパク質（OC43のものなど）とは異なり、はるかに小さな残留レクチンドメインを持っています。このドメインは、サイズの変化とグリコシル化によって免疫システムによる認識から保護されています。[14]
疫学
2003年のSARS流行期に呼吸器疾患患者から採取したSARS陰性の鼻咽頭吸引液のトレースバック分析により、肺炎を患っていた35歳の女性の検体中にCoV-HKU1 RNAが存在することが確認された。[6]
HCoV-HKU1発見の最初の報告に続いて、同年オーストラリア北部の患者10名からウイルスが確認されました。呼吸器サンプルは5月から8月（オーストラリアの冬）の間に採取されました。研究者らは、HCoV-HKU1陽性サンプルのほとんどが冬の終わりの数か月間に子供から採取されたものであることを発見しました。[15]
西半球での最初の症例は、 HCoV-HKU1が地域に存在するかどうかを知ることに興味を持っていたコネチカット州ニューヘイブンのイェール・ニューヘイブン病院の臨床ウイルス学者が古い検体を分析した結果、2005年に発見されました。彼らは、7週間（2001年12月から2002年2月）に851人の乳幼児から収集された検体の研究を実施しました。9人の子供の検体からヒトコロナウイルスHKU1が検出されました。検体が採取された時点でこれらの子供たちは呼吸器感染症を患っていました（1人の少女は重症で人工呼吸器が必要でした）が、直接免疫蛍光法ではヒトRSウイルス（RSV）、パラインフルエンザウイルス（1～3型）、インフルエンザA型およびB型、アデノウイルス、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（RT-PCR）ではヒトメタニューモウイルスおよびHCoV-NHなどの他の原因に対する検査は陰性でした。研究者らは、ニューヘイブンで特定された株は香港で発見された株と類似しており、世界中に分布していることを示唆していると報告した。[16]ニューヘイブンで発見されたこれらの株は、ヒトコロナウイルスNL63の株であるHCoV-NH （ニューヘイブンコロナウイルス）と混同しないようにする必要がある。
2005年7月、フランスで6件の症例が報告された。これらの症例では、フランスの調査官らは鼻咽頭吸引物と便サンプルからウイルスを回収するための改良技術を利用した。[17]
参照
参考文献
- ^ 「Taxon Details | ICTV」。国際ウイルス分類委員会（ICTV） 。 2024年7月25日閲覧。
- ^ Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P.; Liu, Ding Xiang (2016-07-25). 「ヒトコロナウイルス：ウイルスと宿主の相互作用のレビュー」.疾患. 4 (3): 26. doi : 10.3390/diseases4030026 . ISSN 2079-9721. PMC 5456285 . PMID 28933406.
表1を参照。
- ^ abcd Woo, PCY; Lau, SKP; Chu, C.-m.; Chan, K.-h.; Tsoi, H.-w.; Huang, Y.; Wong, BHL; Poon, RWS; Cai, JJ; Luk, W.-k.; Poon, LLM; Wong, SSY; Guan, Y.; Peiris, JSM; Yuen, K.-y. (2004). 「肺炎患者由来の新規コロナウイルス、コロナウイルス HKU1 の特性評価と完全ゲノム配列」。Journal of Virology . 79 (2): 884–95. doi :10.1128/JVI.79.2.884-895.2005. PMC 538593 . PMID 15613317.
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- ^ Woo, Patrick CY; Huang, Yi; Lau, Susanna KP; Yuen, Kwok-Yung (2010-08-24). 「コロナウイルスのゲノミクスとバイオインフォマティクス分析」.ウイルス. 2 (8): 1804–1820. doi : 10.3390/v2081803 . ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708.
ベータコロナウイルスサブグループAのすべてのメンバーにおいて、ノイラミン酸O-アセチルエステラーゼ活性と活性部位FGDSを持つ糖タンパク質をコードするヘマグルチニンエステラーゼ（HE）遺伝子が、ORF1abの下流およびS遺伝子の上流に存在します（図1）。
- ^ ab ラウ、SKP;うーん、PCY。そうだ、CCY。ツェー、H.ツォイ、H.-w.チェン、VCC。リー、P.タン、BSF。チャン、CHY。リー、RA;それで、L.-y.;ラウ、Y.-l.チャン、K.-H.ユエン、K.-y. (2006)。 「香港におけるコロナウイルスHKU1とその他のコロナウイルス感染症」。臨床微生物学ジャーナル。44 (6): 2063–71。土井：10.1128/JCM.02614-05。PMC 1489438。PMID 16757599。
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外部リンク
ウィキスペシーズにおけるヒトコロナウイルスHKU1に関連するデータ