分子遺伝学は、 DNA分子の構造や発現の違いが生物間でどのように変異として現れるかを研究する生物学の一分野です。分子遺伝学では、遺伝子スクリーニングを用いて生物のゲノム内の遺伝子の構造や機能を決定するために、「調査的アプローチ」がよく用いられます。[ 1 ] [ 2 ]
この研究分野は、古典的なメンデル遺伝学、細胞生物学、分子生物学、生化学、バイオテクノロジーといった生物学のいくつかの下位分野の融合に基づいています。遺伝的継承、遺伝子制御と発現、さまざまな生命過程の背後にある分子メカニズムなどを探求するために、これらの分野を統合しています。[ 1 ]
分子遺伝学の重要な目標は、遺伝子変異を特定して研究することです。研究者は、遺伝子の変異を探したり、遺伝子に変異を誘発したりして、遺伝子配列と特定の表現型を結びつけます。[ 3 ]したがって、分子遺伝学は、さまざまな遺伝性疾患の治療法の探索に役立つ可能性のある、変異と遺伝的状態を結びつける強力な方法論です。
生命の設計図としてのDNAの発見と分子遺伝学研究のブレークスルーは、多くの科学者の共同研究から生まれた。1869年、白血球の構成を研究していた化学者ヨハン・フリードリヒ・ミーシャーは、細胞核からヌクレインと名付けた新しい分子を発見し、単離した。これは最終的に、後に生命の分子基盤であると判明する分子DNAの最初の発見となった。彼は、ヌクレインが水素、酸素、窒素、リンから構成されていることを突き止めた。[ 4 ]生化学者アルブレヒト・コッセルは、ヌクレインを核酸として特定し、デオキシリボ核酸(DNA)と名付けた。彼は、DNAとRNAの基本構成要素であるヌクレオチド(アデニン、グアニン、チミン、シトシン、ウラシル)を単離することで、この研究をさらに発展させた。ヌクレオチドに関する彼の研究は、ノーベル生理学賞をもたらした。[ 5 ]
1800年代初頭、遺伝学の父の一人として知られるグレゴール・メンデルは、エンドウ豆を使った様々な実験を通して遺伝学の分野に多大な貢献をしました。彼は、遺伝子が何で構成されているかを知らずに、劣性形質や優性形質などの遺伝の原理を発見することができました。[ 6 ] 19世紀半ば、解剖学者のヴァルター・フレミングは、現在私たちが染色体と呼んでいるものと、有糸分裂による染色体の分離過程を発見しました。彼とテオドール・ボヴェリの研究は、メンデルがずっと以前に観察したいくつかのパターンを説明するのに役立つ染色体遺伝説を初めて提唱しました。[ 7 ]
分子遺伝学が学問分野として発展するためには、いくつかの科学的発見が必要でした。DNAが生命の遺伝暗号を細胞間、そして世代間で伝達する手段として発見されたことは、遺伝を司る分子を特定する上で不可欠でした。分子遺伝学は、当初、細菌の遺伝子形質転換に関する研究から始まりました。1944年、Avery、McLeod、McCarthy [ 8 ]は、肺炎球菌 の毒性株からDNAを分離し、このDNAのみを使用して無害な株を毒性株に変換することができました。彼らは、細菌によるDNAの取り込み、組み込み、発現を「形質転換」と呼びました。この発見は、DNAが細菌の遺伝物質であることを示唆しました。[ 9 ] 細菌の形質転換は、ストレス条件によって誘発されることが多く、形質転換の機能はゲノム損傷の修復であると考えられています。[ 9 ]
1950年、エルヴィン・シャルガフは、 DNAが生命の遺伝物質であることを示す証拠となる規則を導き出した。それは、「1) DNAの塩基組成は種によって異なり、2) 天然のDNA分子では、アデニン(A)の量はチミン(T)の量と等しく、グアニン(G)の量はシトシン(C)の量と等しい」というものであった。[ 10 ]シャルガフの規則として知られるこれらの規則は、分子遺伝学の理解に役立った。[ 10 ] 1953年、フランシス・クリックとジェームズ・ワトソンは、ロザリンド・フランクリンとモーリス・ウィルキンスが行ったX線結晶学の研究に基づいて、DNAの3次元二重らせん構造を導き出すことができた。[ 11 ]
ファージグループは、マックス・デルブリュックを中心とした生物学者の非公式なネットワークであり、1945年から1970年頃にかけて分子遺伝学と分子生物学の起源に大きく貢献した。[ 12 ]ファージグループは、実験モデル生物として使用した細菌感染ウイルスであるバクテリオファージからその名が付けられた。このグループに所属する分子遺伝学者による研究は、遺伝子によってコードされたタンパク質がDNA複製、DNA修復、DNA組換えでどのように機能するか、またウイルスがタンパク質と核酸成分からどのように組み立てられるか(分子形態形成)の理解に貢献した。さらに、鎖終結コドンの役割が解明された。注目すべき研究の1つは、バクテリオファージT4の主要ヘッドタンパク質をコードする遺伝子に欠陥のある「アンバー」変異体を使用して、シドニー・ブレナーとその共同研究者によって行われた。[ 13 ] この研究は、遺伝子とそれがコードするポリペプチドの共線性を実証し、タンパク質のアミノ酸配列は、タンパク質を決定する遺伝子のヌクレオチド配列によって指定されるという「配列仮説」の強力な証拠を提供した。
The isolation of a restriction endonuclease in E. coli by Arber and Linn in 1969 opened the field of genetic engineering.[14] Restriction enzymes were used to linearize DNA for separation by electrophoresis and Southern blotting allowed for the identification of specific DNA segments via hybridization probes.[15][16] In 1971, Berg utilized restriction enzymes to create the first recombinant DNA molecule and first recombinant DNA plasmid.[17] In 1972, Cohen and Boyer created the first recombinant DNA organism by inserting recombinant DNA plasmids into E. coli, now known as bacterial transformation, and paved the way for molecular cloning.[18] The development of DNA sequencing techniques in the late 1970s, first by Maxam and Gilbert, and then by Frederick Sanger, was pivotal to molecular genetic research and enabled scientists to begin conducting genetic screens to relate genotypic sequences to phenotypes.[19]Polymerase chain reaction (PCR) using Taq polymerase, invented by Mullis in 1985, enabled scientists to create millions of copies of a specific DNA sequence that could be used for transformation or manipulated using agarose gel separation.[20] A decade later, the first whole genome was sequenced (Haemophilus influenzae), followed by the eventual sequencing of the human genome via the Human Genome Project in 2001.[21] The culmination of all of those discoveries was a new field called genomics that links the molecular structure of a gene to the protein or RNA encoded by that segment of DNA and the functional expression of that protein within an organism.[22] Today, through the application of molecular genetic techniques, genomics is being studied in many model organisms and data is being collected in computer databases like NCBI and Ensembl. The computer analysis and comparison of genes within and between different species is called bioinformatics, and links genetic mutations on an evolutionary scale.[23]

セントラルドグマは分子遺伝学の研究において重要な役割を果たしています。セントラルドグマは、DNAが自己複製し、DNAがRNAに転写され、RNAがタンパク質に翻訳されると述べています。[ 24 ]セントラルドグマとともに、遺伝暗号はRNAがどのようにタンパク質に翻訳されるかを理解するために用いられます。DNAの複製とDNAからmRNAへの転写は核内で起こり、RNAからタンパク質への翻訳はリボソーム内で起こります。[ 25 ]遺伝暗号は、DNA分子の4つの交換可能な部分、すなわち「塩基」と呼ばれるアデニン、シトシン、チミン(RNAではウラシル)、グアニンから構成されており、冗長性があります。つまり、これらの塩基対の複数の組み合わせ(3回読み取られる)が同じアミノ酸を生成します。[ 26 ]プロテオミクスとゲノミクスは、分子遺伝学とセントラルドグマの研究から生まれた生物学の分野です。[ 27 ]
生物のゲノムは、その生物のDNAセット全体で構成され、その生物の遺伝的特性、機能、発達を担っています。DNA自体の構成は分子遺伝学の分野において不可欠な要素であり、DNAが遺伝情報を保存し、伝達し、読み取りや翻訳が可能な形式になる方法の基礎となっています。[ 28 ]
DNAは二本鎖分子であり、各鎖は逆平行に配向している。ヌクレオチドはDNAの構成要素であり、それぞれ糖分子、リン酸基、および4つの窒素塩基(アデニン、グアニン、シトシン、チミン)のいずれかから構成されている。DNAの一本鎖は共有結合によって結合しているが、2本の逆平行鎖はヌクレオチド塩基間の水素結合によって結合している。アデニンはチミンと結合し、シトシンはグアニンと結合する。これら4つの塩基配列がすべての生物の遺伝暗号を形成し、生物が合成できるすべてのタンパク質の情報を含んでいる。[ 29 ]
DNAの独特な構造により、細胞分裂中に生物学的情報を世代を超えて保存および伝達することが可能になります。細胞分裂の際、細胞はゲノムをコピーして娘細胞に伝達できなければなりません。これは、DNAの二本鎖構造により可能になります。なぜなら、一方の鎖がもう一方の鎖と相補的であるため、これらの鎖のそれぞれが新しい相補鎖の形成のための鋳型鎖として機能することができるからです。これが、DNA複製プロセスが半保存的プロセスとして知られている理由です。[ 30 ]
順遺伝学は、特定の表現型を生み出す遺伝子または遺伝子変異を同定するために使用される分子遺伝学技術です。遺伝子スクリーニングでは、変異原(化学物質または放射線)またはトランスポゾンを使用してランダムな変異を生成し、特定の表現型について個体をスクリーニングします。多くの場合、細菌や細胞培養など、目的の表現型を観察するのが難しい場合は、変異誘発の後に選択の形で二次アッセイが行われることがあります。細胞は、抗生物質耐性遺伝子または蛍光レポーターを使用して形質転換され、目的の表現型を持つ変異体が非変異体から選択されます。[ 31 ]
目的の表現型を示す変異体を分離し、相補性試験を実施して、その表現型が複数の遺伝子に起因するかどうかを判定します。変異遺伝子は、優性(機能獲得)、劣性(機能喪失)、または上位性(変異遺伝子が別の遺伝子の表現型を覆い隠す)として特徴付けられます。最後に、配列決定により変異の位置と具体的な性質がマッピングされます。[ 32 ] 順遺伝学は偏りのないアプローチであり、しばしば多くの予期せぬ発見につながりますが、費用と時間がかかる場合があります。線虫Caenorhabditis elegans、ショウジョウバエDrosophila melanogaster、ゼブラフィッシュDanio rerioなどのモデル生物は、遺伝子変異に起因する表現型を研究するために成功裏に使用されてきました。[ 33 ]


逆遺伝学とは、目的遺伝子に意図的に変異を起こさせた結果生じる表現型を決定するために用いられる分子遺伝学的手法のことである。表現型は、変異していない遺伝子の機能を推測するために用いられる。変異は、目的遺伝子に対するランダムな変化、または意図的な変化である。変異は、ヌクレオチド置換によって引き起こされるミスセンス変異、フレームシフト変異を誘発するためのヌクレオチドの追加または削除、あるいは遺伝子または遺伝子セグメントの完全な追加/削除である。特定の遺伝子の削除は、遺伝子が発現せず機能喪失が生じる遺伝子ノックアウトを引き起こす(例:ノックアウトマウス)。ミスセンス変異は、機能の完全な喪失を引き起こす場合もあれば、ノックダウンとして知られる部分的な機能喪失をもたらす場合もある。ノックダウンは、 RNA干渉(RNAi)によっても達成できる。[ 35 ]あるいは、遺伝子を生物のゲノムに置換(トランスジーンとも呼ばれる)して遺伝子ノックインを作成し、宿主による機能獲得をもたらすこともできる。[ 36 ]これらの技術は表現型を特定の機能に結びつけるという決定に関して固有の偏りがあるものの、目的の遺伝子がすでに分かっているため、順遺伝学よりも生産速度がはるかに速い。
分子遺伝学は、遺伝学の基礎原理をツールとして活用し、疾患や生物における生物学的プロセスの分子基盤をより深く理解するための科学的手法です。以下に、この分野の研究者がよく用いるツールをいくつか紹介します。
マイクロサテライトまたは単一配列反復配列(SSRS)は、ゲノム上の特定の位置にある6ヌクレオチドからなる短い反復DNAセグメントで、遺伝マーカーとして使用されます。これらの反復配列は個人/家族に非常に固有であるため、研究者はDNAフィンガープリンティングや親子鑑定などの技術でこれらのマイクロサテライトを分析できます。また、遺伝子マップの作成や遺伝的連鎖の研究にも使用でき、特定の形質や疾患の原因となる遺伝子や突然変異を特定できます。マイクロサテライトは、集団遺伝学にも応用でき、グループ間の比較を研究できます。[ 37 ]
ゲノムワイド関連解析(GWAS)は、特定の疾患に関連する可能性のある集団の遺伝的変異を研究するために、一塩基多型( SNP )を利用する手法です。ヒトゲノムプロジェクトはヒトゲノム全体をマッピングし、このアプローチを研究者がより容易に、かつ費用対効果の高い方法で実施できるようにしました。GWASを実施するために、研究者は2つのグループを使用します。1つは研究対象の疾患を持つグループ、もう1つはその特定の疾患を持たない対照群です。参加者からDNAサンプルを採取し、実験機器を使用してゲノムを抽出し、参加者を比較して疾患に関連する可能性のあるSNPを探すために迅速に調査します。この手法により、研究者はヒトゲノム内の関心のある遺伝子と場所を特定し、それをさらに研究して疾患の原因を特定することができます。[ 38 ]
核型分析では、染色体が凝縮状態にある有糸分裂中期に染色体を分析することができます。染色体は染色され、顕微鏡を通して観察され、染色体異常がないか調べられます。この技術は、ダウン症候群などの先天性遺伝疾患の検出、胚の性別の特定、転座などの染色体変異によって引き起こされる一部の癌の診断に使用できます。[ 39 ]
遺伝子工学は新興の科学分野であり、研究者は分子遺伝学技術を利用して生物のDNAを改変し、産業、農業、医療目的のために遺伝子改変生物や遺伝子強化生物を作り出すことができる。これは、DNA配列の塩基対の変更や、DNAの特定領域の追加や削除を含むゲノム編集技術によって行うことができる。[ 40 ]
遺伝子編集により、科学者は生物のDNAを改変/編集することができます。これを行う方法の1つは、細菌に自然に存在するゲノム免疫防御から応用されたCRISPR/Cas9技術です。この技術は、科学者が特定の場所でDNA鎖を切断することを可能にするCas9タンパク質に依存しており、切断がゲノム内の適切な場所で行われるようにするために特殊なRNAガイド配列を使用します。次に、科学者はDNA修復経路を使用してゲノムに変化を誘導します。この技術は、病気の治療に幅広い影響を及ぼします。[ 41 ]
分子遺伝学は医学の進歩に幅広い影響を与えており、疾患の分子基盤を理解することで、より効果的な診断と治療の機会が生まれます。この分野の目標の1つは個別化医療であり、個人の遺伝子が、罹患している疾患の原因を特定し、治療法を個別に調整するのに役立ち、より効果的な個別化治療アプローチを可能にする可能性があります。たとえば、個人の特定の遺伝子変異によって、特定の薬剤に対する感受性が高まる場合もあれば、治療に対する副作用のリスクが高くなる場合もあります。したがって、この情報により、研究者や臨床医は、標準的な試行錯誤アプローチではなく、患者に対する治療効果について最も情報に基づいた決定を下すことができます。[ 42 ]
法医学遺伝学は、さまざまな分子遺伝学的手法を用いることで、犯罪捜査において重要な役割を果たしています。一般的な手法の一つに、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)やゲル電気泳動などの分子遺伝学的手法を組み合わせたDNAフィンガープリンティングがあります。PCRは、標的DNA配列を増幅する技術であり、犯罪現場からごく微量のDNAでも抽出して何度も複製することで、分析に十分な量の材料を得ることができます。ゲル電気泳動は、DNA配列をサイズに基づいて分離する技術であり、得られたパターンはDNAフィンガープリンティングとして知られ、個人ごとに固有のものです。これらの分子遺伝学的手法を組み合わせることで、単純なDNA配列を抽出、増幅、分析し、他の配列と比較することが可能になり、法医学で用いられる標準的な手法となっています。[ 43 ]
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