| 脂肪1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | FAT1、CDHF7、CDHR8、FAT、ME5、hFat1、FAT非典型カドヘリン1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム:600976; MGI : 109168;ホモロジーン: 66302;ジーンカード:FAT1; OMA :FAT1 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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プロトカドヘリンFAT1は、ヒトではFAT1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子はショウジョウバエの脂肪遺伝子の相同遺伝子であり、ショウジョウバエの発達中に細胞増殖を制御するために不可欠な腫瘍抑制因子をコードする。この遺伝子産物はカドヘリンスーパーファミリーのメンバーであり、カドヘリン型反復の存在を特徴とする膜貫通タンパク質のグループである。この遺伝子は、多くの胎児上皮で高レベルで発現している。選択的スプライシングおよび/または選択的プロモーター使用に由来する転写バリアントが存在するが、それらは完全には説明されていない。[6]
マウスのFat1ノックアウトマウスは胎児期には致死的ではないが、腎臓内の足細胞の足突起の異常な融合により、仔マウスは48時間以内に死亡する。これらのFat1ノックアウトマウスはまた、部分的に浸透性ではあるが、多くの場合重度の正中線欠陥を示し、全前脳症、小眼球症-無眼球症、稀に単眼症も含まれる。[7]
マウスFat1の細胞質尾部にあるEVHモチーフはEna/VASPと相互作用し、 RNAiによるFat1の除去はラット上皮細胞の細胞移動を減少させることが示されている[8]
Fat1の細胞質末端はラットの血管平滑筋細胞において転写抑制因子アトロフィンに結合することも示されている[9]
FAT1のカルボキシル末端にはPDZドメイン(PSD95/Dlg1/ZO-1)リガンドモチーフ(-HTEV)が存在する。ゼブラフィッシュFat1はタンパク質スクリブルに結合し、Hippoシグナル伝達を制御することがわかった[10]
ヒトSHSY5Y細胞株を神経分化のモデルとして用いたところ、ヒトFAT1がHippoキナーゼ成分を制御し、FAT1の喪失によりTAZの核質再配置とHippo標的遺伝子CTGFの転写の増強がもたらされることが示された。同じ研究では、FAT1がTGF-βシグナル伝達を制御できることも示された[11]
FAT1はβ-カテニンに結合し、大腸癌におけるWntシグナル伝達を制御することがわかっている。 [12]
ヒトFAT1はグリピカン3(GPC3)に結合し、肝臓癌細胞の細胞移動を制御することがわかった。[13]
構造
ヒトFAT1カドヘリン遺伝子は、1995年にヒトT白血病(T-ALL)細胞株からクローン化され、染色体4q34-35に位置する27のエクソンで構成されています。[5]構造的には、FAT1タンパク質は1回膜貫通タンパク質であり、細胞外部分は34のカドヘリンリピート、5つのEGF様ドメイン、およびラミニンG様ドメインで構成されています。[14]
FAT1タンパク質は翻訳されると、細胞表面発現に達する前に、フーリン媒介S1切断を受け、非共有結合ヘテロ二量体を形成しますが、この処理は細胞表面で切断されていないFAT1を発現する癌細胞ではしばしば乱れます。[15]
FAT1カドヘリンはその細胞外ドメインで多重リン酸化されるが、リン酸化はFJX1によって触媒されない。[16] FAT1の細胞外ドメインは、ADAM10の分解酵素によって細胞表面から剥がれ落ちることもあり、この細胞外ドメインの放出は膵臓癌の新たなバイオマーカーとなる可能性がある。[17]
FAT1は、上皮間葉系(EMT)転換中の乳がん細胞において、細胞質尾部に12個のアミノ酸が追加される選択的スプライシングを受けることもわかっています。 [18]同様のスプライスバリアントは、細胞質尾部の選択的スプライシングによって細胞の移動が制御されるマウスFat1でも報告されています。[19]
臨床的意義
癌
FAT1カドヘリンは、さまざまな状況で腫瘍抑制因子またはがん遺伝子として推定されている。FAT1のヘテロ接合性の喪失は、原発性口腔癌[20]および星状細胞腫瘍[21]で報告されている。また、DCIS乳癌[22] 、黒色腫[15] 、白血病[23]など、さまざまな癌でFAT1の過剰発現が報告されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000083857 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000070047 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab Dunne J、Hanby AM、Poulsom R、Jones TA、Sheer D、Chin WG、他 (1995 年 11 月)。「染色体 4q34-q35 に位置し、推定接着分子をコードするショウジョウバエ fat 遺伝子のヒト相同遺伝子である FAT の分子クローニングと組織発現」。Genomics。30 ( 2 ) : 207–23。doi : 10.1006 /geno.1995.9884。PMID 8586420 。
- ^ ab 「Entrez Gene: FAT FAT 腫瘍抑制因子ホモログ 1 (Drosophila)」。
- ^ Ciani L、Patel A、Allen ND、ffrench-Constant C (2003 年 5 月)。「巨大プロトカドヘリン mFAT1 を欠くマウスは、腎スリット接合部の異常と、部分的に浸透する単眼症および無眼症の表現型を示す」。分子 細胞生物学。23 (10): 3575–82。doi :10.1128/ mcb.23.10.3575-3582.2003。PMC 164754。PMID 12724416。
- ^ Moeller MJ、Soofi A、Braun GS、Li X 、 Watzl C、Kriz W、Holzman LB (2004 年 10 月)。「プロトカドヘリン FAT1 は Ena/VASP タンパク質に結合し、アクチンのダイナミクスと細胞分極に必要である」。EMBOジャーナル 。23 ( 19 ): 3769–79。doi :10.1038/ sj.emboj.7600380。PMC 522787。PMID 15343270。
- ^ Hou R, Sibinga NE (2009 年 3 月). 「アトロフィンタンパク質は Fat1 カドヘリンと相互作用し、血管平滑筋細胞の移動と配向を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 284 (11): 6955–65. doi : 10.1074/jbc.M809333200 . PMC 2652288. PMID 19131340 .
- ^ Skouloudaki K, Puetz M, Simons M, Courbard JR, Boehlke C, Hartleben B, et al. (2009年5月). 「ScribbleはHippoシグナル伝達に関与し、ゼブラフィッシュの正常な前腎の発達に必要である」。米国科学アカデミー 紀要。106 ( 21): 8579–84。Bibcode :2009PNAS..106.8579S。doi : 10.1073 / pnas.0811691106。PMC 2688978。PMID 19439659。
- ^ Ahmed AF、de Bock CE、Lincz LF、Pundavela J、Zouikr I、Sontag E、et al. (2015 年 12 月)。「FAT1 カドヘリンは Hippo シグナル伝達の上流で TAZ を介して作用し、神経分化を制御する」。細胞および 分子生命科学。72 (23): 4653–69。doi :10.1007/ s00018-015-1955-6。PMC 11113810。PMID 26104008。S2CID 15861327 。
- ^ Morris LG、Kaufman AM、Gong Y、Ramaswami D、Walsh LA、Turcan Ş、et al. (2013 年 3 月)。「複数のヒト癌における FAT1 の反復性体細胞変異が異常な Wnt 活性化を引き起こす」。Nature Genetics。45 ( 3 ) : 253–61。doi : 10.1038/ng.2538。PMC 3729040。PMID 23354438。
- ^ Meng P, Zhang YF, Zhang W, Chen X, Xu T, Hu S, et al. (2021年1月). 「肝臓がん細胞における新規グリピカン3相互作用タンパク質としての非定型カドヘリンFAT1の同定」. Scientific Reports . 11 (1): 40. doi :10.1038/s41598-020-79524-3. PMC 7794441. PMID 33420124.
- ^ Sadeqzadeh E 、de Bock CE 、Thorne RF(2014年1月)。「眠れる巨人:脂肪カドヘリンの健康と疾患における新たな役割」。Medicinal Research Reviews。34(1):190–221。doi : 10.1002/med.21286。PMID 23720094。S2CID 27462828。
- ^ ab Sadeqzadeh E, de Bock CE, Zhang XD, Shipman KL, Scott NM, Song C, et al. (2011年8月). 「ヒト黒色腫細胞によるFAT1カドヘリンタンパク質の二重処理により、異なるタンパク質産物が生成される」. The Journal of Biological Chemistry . 286 (32): 28181–91. doi : 10.1074/jbc.M111.234419 . PMC 3151063. PMID 21680732 .
- ^ Sadeqzadeh E、de Bock CE、O'Donnell MR、Timofeeva A、Burns GF、Thorne RF (2014 年 9 月)。「FAT1 カドヘリンは細胞外ドメインで多重リン酸化されるが、リン酸化は 4 関節ホモログによって触媒されない」。FEBS Letters。588 ( 18 ) : 3511–7。doi :10.1016/ j.febslet.2014.08.014。PMID 25150169。S2CID 23869464 。
- ^ Wojtalewicz N, Sadeqzadeh E, Weiß JV, Tehrani MM, Klein-Scory S, Hahn S, et al. (2014). 「巨大カドヘリン Fat1 の可溶性形態は、ADAM10 を介したエクトドメイン切断によって膵臓がん細胞から放出される」. PLOS ONE . 9 (3): e90461. Bibcode :2014PLoSO...990461W. doi : 10.1371 /journal.pone.0090461 . PMC 3953070. PMID 24625754.
- ^ Shapiro IM、Cheng AW、Flytzanis NC、Balsamo M、Condeelis JS、Oktay MH、他。 (2011 年 8 月)。 「EMT主導の選択的スプライシングプログラムがヒト乳がんで発生し、細胞の表現型を調節する」。PLOS ジェネティクス。7 (8): e1002218。土井:10.1371/journal.pgen.1002218。PMC 3158048。PMID 21876675。
- ^ Braun GS、Kretzler M、Heider T、Floege J、Holzman LB、Kriz W、Moeller MJ (2007 年 8 月)。「FAT1 の異なるスプライシングアイソフォームは、遊走細胞内で非対称に分布している」。The Journal of Biological Chemistry。282 ( 31): 22823–33。doi : 10.1074/ jbc.M701758200。PMID 17500054。
- ^ Nakaya K, Yamagata HD, Arita N, Nakashiro KI, Nose M, Miki T, Hamakawa H (2007年8月). 「CGHアレイを用いた口腔癌における腫瘍抑制遺伝子FATのホモ接合性欠失の同定」。Oncogene . 26 (36): 5300–8. doi :10.1038/sj.onc.1210330. PMID 17325662. S2CID 22365273 .
- ^ Chosdol K、Misra A、Puri S、Srivastava T、Chattopadhyay P、Sarkar C、他 (2009 年 1 月)。「ヒト星状細胞腫瘍におけるヘテロ接合性の頻繁な消失と候補腫瘍抑制遺伝子「FAT」の発現変化 」。BMC Cancer。9 : 5。doi : 10.1186 / 1471-2407-9-5。PMC 2631005。PMID 19126244。
- ^ Kwaepila N、Burns G、Leong AS (2006 年 4 月)。「326 の乳がんにおけるヒト FAT1 (hFAT) タンパク質の免疫組織学的局在。この接着分子は病因に役割を果たしているか?」。病理学。38 (2 ) : 125–31。doi : 10.1080/00313020600559975。PMID 16581652。S2CID 36772164 。
- ^ de Bock CE、Ardjmand A、Molloy TJ、Bone SM、Johnstone D、Campbell DM、他 (2012 年 5 月)。「Fat1 カドヘリンは過剰発現しており、前駆 B 細胞急性リンパ芽球性白血病の診断と再発のペアサンプルで生存の独立した予後因子である」。 白血病。26 ( 5 ) : 918–26。doi :10.1038/leu.2011.319。PMID 22116550。S2CID 205194465 。
さらに読む
- Bonaldo MF、 Lennon G、Soares MB (1996 年 9 月)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。ゲノム研究。6 (9): 791–806。doi : 10.1101/ gr.6.9.791。PMID 8889548 。
- Matsuyoshi N, Tanaka T, Toda K, Imamura S (1997 年 6 月). 「ヒト黒色腫細胞で発現する新規カドヘリンの同定」. The Journal of Investigative Dermatology . 108 (6): 908–13. doi : 10.1111/1523-1747.ep12292703 . PMID 9182820.
- 松吉 暢、今村 聡 (1997年6 月)。「ヒト線維芽細胞では複数のカドヘリンが発現している」。生化学および生物物理学的研究通信。235 (2): 355–8。doi :10.1006/bbrc.1997.6707。PMID 9199196 。
- Dias Neto E、Correa RG、Verjovski-Almeida S、Briones MR、Nagai MA、da Silva W、他 (2000 年 3 月)。「ORF 発現配列タグによるヒトトランスクリプトームのショットガン シーケンシング」。 米国科学アカデミー紀要。97 ( 7): 3491–6。Bibcode : 2000PNAS ...97.3491D。doi : 10.1073 / pnas.97.7.3491。PMC 16267。PMID 10737800。
- Brandenberger R、Wei H、Zhang S、Lei S 、 Murage J、Fisk GJ、他 (2004 年 6 月)。「トランスクリプトーム特性評価により、ヒト ES 細胞の成長と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」。Nature Biotechnology。22 ( 6 ) : 707–16。doi :10.1038/nbt971。PMID 15146197。S2CID 27764390。
- Tanoue T, Takeichi M (2004 年 5 月). 「哺乳類 Fat1 カドヘリンはアクチンのダイナミクスと細胞間接触を制御する」. The Journal of Cell Biology . 165 (4): 517–28. doi :10.1083/jcb.200403006. PMC 2172355. PMID 15148305 .
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, et al. (2004 年 9 月). 「ヒトとマウスの遺伝子の配列比較によりプロモーター領域に相同ブロック構造が明らかになった」. Genome Research . 14 (9): 1711–8. doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316. PMID 15342556 .
- Wu Q (2005年 4 月)。「クラスター化した脊椎動物プロトカドヘリン遺伝子の比較ゲノミクスと多様化選択」。遺伝学。169 ( 4 ) : 2179–88。doi : 10.1534 /genetics.104.037606。PMC 1449604。PMID 15744052。
- Magg T、Schreiner D、Solis GP、Bade EG、 Hofer HW (2005 年 7 月)。「ヒトプロトカドヘリン Fat1 のプロセシングと細胞質ドメインの核への移行」。実験細胞研究。307 (1): 100–8。doi :10.1016/ j.yexcr.2005.03.006。PMID 15922730 。
- Blair IP、Chetcuti AF、Badenhop RF、Scimone A、Moses MJ、Adams LJ、他 (2006 年 4 月)。「ポジショナルクローニング、関連分析、発現研究により、カドヘリン遺伝子 FAT に双極性障害感受性対立遺伝子が含まれているという収束的証拠が得られた」。分子精神医学。11 (4): 372–83。doi : 10.1038/ sj.mp.4001784。PMID 16402135 。
- Schreiner D 、Müller K、Hofer HW (2006 年 10 月) 。「ヒトプロトカドヘリン hFat1 の細胞内ドメインは Homer シグナル伝達スキャフォールディングタンパク質と相互作用する」。FEBS Letters。580 ( 22 ): 5295–300。doi : 10.1016 /j.febslet.2006.08.079。PMID 16979624。S2CID 10267922。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006 年 11 月)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 ( 3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
- Nakaya K, Yamagata HD, Arita N, Nakashiro KI, Nose M, Miki T, Hamakawa H (2007 年 8 月)。「CGH アレイを用いた口腔癌における腫瘍抑制遺伝子 FAT のホモ接合性欠失の同定」。Oncogene。26 ( 36 ) : 5300–8。doi : 10.1038 /sj.onc.1210330。PMID 17325662。S2CID 22365273。
- Braun GS、Kretzler M、Heider T、Floege J、Holzman LB、Kriz W、Moeller MJ (2007 年 8 月)。「FAT1 の異なるスプライシングを受けたアイソフォームは、遊走細胞内で非対称に分布している」。The Journal of Biological Chemistry。282 ( 31): 22823–33。doi : 10.1074/jbc.M701758200。PMID 17500054。
