外部ドメイン

エクトドメインは、細胞外空間（細胞の外側の空間）に広がる膜タンパク質のドメインです。エクトドメインは通常、表面との接触を開始し、シグナル伝達につながるタンパク質の部分です。エクトドメインの注目すべき例は、 COVID-19パンデミックの原因であるウイルス粒子のSタンパク質（一般にスパイクタンパク質として知られています）です。スパイクタンパク質（S）のエクトドメイン領域は、ウイルスタンパク質が宿主細胞に付着し、最終的に侵入するために不可欠です。^[1]

エクトドメインは、ウイルスのシグナル伝達経路において重要な役割を果たします。最近の研究結果では、抗受容体結合ドメイン（抗RBD）または抗スパイクエクトドメイン（抗ECD）IgG抗体価を含む特定の抗体が、疾患、呼吸困難、入院患者で特定できるウイルス中和抗体価（VN抗体価）として機能することが示されています。重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-Cov-2）の観点から、これらの特定のエクトドメインはSARS-Cov-2に対する抗体の有効性を検出し、VN抗体価で適格な血漿ドナーを分類できる可能性があります。エクトドメインに関する継続的な研究を通じて、疾患や呼吸器疾患に対する予防策をさらに進めることができます。エクトドメインは、ウイルスのシグナル伝達経路において重要な役割を果たします。重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-Cov-2）の観点から、これらの特定のエクトドメインはSARS-Cov-2に対する抗体の有効性を検出し、VN力価によって適格な血漿ドナーを分類できる可能性があります。エクトドメインに関する継続的な研究を通じて、疾患や呼吸器疾患に対する予防対策をさらに進めることができます。^[2]

また、エクトドメインは膜システムと相互作用して小胞凝集、脂質混合、リポソーム漏出を引き起こし、特定のウイルスが細胞ドメイン全体に感染を広げる方法についての情報を提供します。具体的には、C型肝炎ウイルス（HCV）は融合プロセスを利用しており、HCV E2エンベロープタンパク質のエクトドメインが膜システムに融合特性を付与し、受容体を介したエンドサイトーシスを通じてHCV感染が細胞全体に進行することを示唆しています。標的膜と相互作用するエクトドメインの役割に関するこれらの発見は、ウイルスの不安定化と、まだ詳細が明らかにされていないウイルスと細胞膜の融合のメカニズムについての洞察を与えます。^[3]

参照

外部ドメインの切断

参考文献

^ Wrapp D, Wang N, Corbett KS, Goldsmith JA, Hsieh CL, Abiona O, et al. (2020年3月). 「融合前構造における2019-nCoVスパイクのCryo-EM構造」. Science . 367 (6483): 1260–1263. Bibcode :2020Sci...367.1260W. doi : 10.1126/science.abb2507 . PMC 7164637. PMID 32075877 .
^ サラザール、エリック; クチプディ、スレシュ V.; クリステンセン、ポール A.; イーガー、トッド; イー、シン; チャオ、ピチェン; ジン、ジーチェン; ロング、S. ウェズリー; オルセン、ランドール J.; チェン、ジアン; カスティーヨ、ブライアン; レベック、クリストファー; タワーズ、ダルトン; ラビンダー、ジェイソン; ゴリハー、ジミー; カルドナ、ホセ; イッポリト、グレゴリー; ニスリー、ルース; バード、イアン; グリーンウォルト、デンバー; ロッシ、ランドール M.; ゴントゥ、アビナイ; スリニヴァサン、スリーニディ; プージャリー、インディラ; カタドリ、イザベラ M.; ハドソン、ピーター J.; ジョスリン、ニコール M.; プルガー、ローラ; ヒュー、キャスリーン; ハーバート、アンドリュー; バーナード、デビッド W.; Dye, John M.; Kapur, Vivek; Musser, James M. (2020年12月1日). 「回復期血漿抗SARS-CoV-2スパイクタンパク質エクトドメインおよび受容体結合ドメインIgGはウイルス中和と相関する」。The Journal of Clinical Investigation。130 ( 12): 6728–6738。doi : 10.1172/JCI141206。PMC 7685744。PMID 32910806。2022年5月10日閲覧。
^ ロドリゲス・ロドリゲス、3月;テロ、ダニエル。ゴメス＝グティエレス、フリアン。 L. ピーターソン、ダレル L;ガビラネス、フランシスコ。ベレン、イェラモス（2018年3月）。「HCV E2エンベロープタンパク質の外部ドメインの融合特性」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 生体膜。1860年(3): 728–736。土井：10.1016/j.bbamem.2017.12.017。PMID 29273334 。2022 年5 月 10 日に取得。

[1] Wrapp D, Wang N, Corbett KS, Goldsmith JA, Hsieh CL, Abiona O, et al. (2020年3月). 「融合前構造における2019-nCoVスパイクのCryo-EM構造」. Science . 367 (6483): 1260–1263. Bibcode :2020Sci...367.1260W. doi : 10.1126/science.abb2507 . PMC 7164637. PMID 32075877 .

[2] サラザール、エリック; クチプディ、スレシュ V.; クリステンセン、ポール A.; イーガー、トッド; イー、シン; チャオ、ピチェン; ジン、ジーチェン; ロング、S. ウェズリー; オルセン、ランドール J.; チェン、ジアン; カスティーヨ、ブライアン; レベック、クリストファー; タワーズ、ダルトン; ラビンダー、ジェイソン; ゴリハー、ジミー; カルドナ、ホセ; イッポリト、グレゴリー; ニスリー、ルース; バード、イアン; グリーンウォルト、デンバー; ロッシ、ランドール M.; ゴントゥ、アビナイ; スリニヴァサン、スリーニディ; プージャリー、インディラ; カタドリ、イザベラ M.; ハドソン、ピーター J.; ジョスリン、ニコール M.; プルガー、ローラ; ヒュー、キャスリーン; ハーバート、アンドリュー; バーナード、デビッド W.; Dye, John M.; Kapur, Vivek; Musser, James M. (2020年12月1日). 「回復期血漿抗SARS-CoV-2スパイクタンパク質エクトドメインおよび受容体結合ドメインIgGはウイルス中和と相関する」。The Journal of Clinical Investigation。130 ( 12): 6728–6738。doi : 10.1172/JCI141206。PMC 7685744。PMID 32910806。2022年5月10日閲覧。

[3] ロドリゲス・ロドリゲス、3月;テロ、ダニエル。ゴメス＝グティエレス、フリアン。 L. ピーターソン、ダレル L;ガビラネス、フランシスコ。ベレン、イェラモス（2018年3月）。「HCV E2エンベロープタンパク質の外部ドメインの融合特性」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 生体膜。1860年(3): 728–736。土井：10.1016/j.bbamem.2017.12.017。PMID 29273334 。2022 年5 月 10 日に取得。