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| WH1ドメイン | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | WH1 | ||||||||
| パム | PF00568 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | WH1 | ||||||||
| SCOP2 | 1evh / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd01205 | ||||||||
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WH1ドメインはEVH1ドメインとしても知られ、WASP（VASP）タンパク質に見られる進化的に保存されたタンパク質ドメインであり、アクチンの重合に関与することが多い。[1] [2]
関数
WH1ドメインはアクチンが関与するすべての細胞プロセスにとって重要であり、これには細胞運動、細胞輸送、細胞分裂と細胞質分裂、細胞シグナル伝達、細胞接合部と細胞形状の確立と維持が含まれます。[2]
構造
Menaタンパク質のWH1ドメインの三次構造は、プレクストリン（PH）ドメインと構造的に類似していることが明らかになった。全体的な折り畳みはコンパクトな平行βサンドイッチで構成され、1つの端に沿って長いαヘリックスによって閉じられている。表面に露出した3つの芳香族側鎖の高度に保存されたクラスターが、分子の標的リガンドの認識部位を形成する。[3]
インタラクション
WASPタンパク質ファミリーは、Arp2/3複合体を活性化することでアクチンの重合を制御します。WASPはウィスコット・アルドリッチ症候群（WAS）で欠陥があり、ほとんどの患者の症例で、点変異の大部分はN末端WH1ドメイン内で発生します。代謝型グルタミン酸受容体mGluR1alphaとmGluR5は、WH1ドメインホモログであるhomerと呼ばれるタンパク質に結合します。[4] [5]
WASPファミリータンパク質はN末端にEVH1（WH1）を含み、WASP相互作用タンパク質のプロリンリッチ配列に結合する。RanBP1ファミリーのタンパク質はN末端領域にWH1ドメインを含み、これはRanGTPタンパク質のC末端部分に存在する異なる配列モチーフに結合すると思われる。[6] [7]
Menaタンパク質のWH1ドメインの三次構造は、プレクストリン相同性（PH）ドメインと構造類似性があることが明らかになった。全体的な折り畳みはコンパクトな平行βサンドイッチで構成され、1つの端に沿って長いαヘリックスによって閉じられている。表面に露出した3つの芳香族側鎖の高度に保存されたクラスターは、分子標的リガンドの認識部位を形成する。[3]
EVH1
| EVH1 | |||||||||
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 n-wasp evh1 ドメイン-wip 複合体の構造 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | EVH1 | ||||||||
| パム | PF00568 | ||||||||
| ファム一族 | CL0266 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | WH1 | ||||||||
| SCOP2 | 1evh / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd00837 | ||||||||
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WH1ドメインのサブセットは、ポリプロリンモチーフに結合するEVH1ドメインと呼ばれています。EVH1ドメイン（ WH1、RanBP1-WASP、またはenabled/VASP homology 1ドメインとも呼ばれる）も進化的に保存されたタンパク質ドメインです。EVH1ドメインはプロリンに富むモチーフFPPPPを認識して低親和性で結合し、その後、隣接する残基間でさらなる相互作用が形成されます。[5] [8]
EVH1ドメインは、シグナル伝達、核輸送、細胞骨格イベントの多様な範囲に関与するマルチドメインEna/Vasp相同タンパク質に見られます。約115アミノ酸のこのドメインは、酵母から哺乳類までさまざまな種に存在します。多くのEVH1含有タンパク質はアクチンベースの構造と関連し、細胞骨格の組織化に役割を果たしています。EVH1ドメインはプロリンに富むモチーフFPPPPを認識して低親和性で結合し、その後、隣接する残基間でさらに相互作用が形成されます。[8] [9] [10]
例
WH1 (EVH1) ドメインを含むタンパク質をコードするヒト遺伝子には以下のものがあります。
参考文献
- ^ Symons M、Derry JM、Karlak B、Jiang S、Lemahieu V、Mccormick F、Francke U、Abo A (1996 年 3 月)。「GTPase CDC42H の新しいエフェクターである Wiskott-Aldrich 症候群タンパク質はアクチンの重合に関与している」。Cell . 84 (5): 723–34. doi : 10.1016/S0092-8674 ( 00)81050-8 . PMID 8625410. S2CID 17838931。
- ^ ab Veltman DM、Insall RH (2010)。「WASPファミリータンパク質：その進化と生理学的影響」。Mol Biol Cell . 21 (16): 2880–93. doi :10.1091/mbc.E10-04-0372. PMC 2921111 . PMID 20573979。
- ^ ab Prehoda KE、 Lee DJ、Lim WA (1999年5月)。「enabled/VASPホモロジー1ドメインペプチド複合体の構造：アクチンアセンブリの空間制御における重要な構成要素」。Cell。97 ( 4 ) :471–80。doi : 10.1016 /S0092-8674(00) 80757-6。PMID 10338211。S2CID 17078939 。
- ^ Ponting CP、Phillips C (1997)。「Homer が Wiskott-Aldrich 症候群タンパク質の相同体として同定されたことは、WH1 ドメインの受容体結合機能を示唆している」。J . Mol. Med . 75 (11–12): 769–71。doi : 10.1007/s001090050166。PMID 9428607。S2CID 39958754 。
- ^ ab Niebuhr K、Ebel F、Frank R、Reinhard M、Domann E、Carl UD、Walter U、Gertler FB、Wehland J、Chakraborty T (1997 年 9 月)。「リステリア菌の ActA および細胞骨格タンパク質に存在する新規プロリンリッチモチーフは、Ena/VASP ファミリーに存在するタンパク質モジュールである EVH1 ドメインのリガンドである」。EMBO J. 16 ( 17): 5433–44. doi :10.1093/emboj/16.17.5433. PMC 1170174. PMID 9312002 。
- ^ Callebaut I、Cossart P、Dehoux P (1998 年 12 月)。「VASP および WASP タンパク質の EVH1/WH1 ドメインは、RanBP1 ファミリーの Ran 結合ドメインを含む大きなファミリーに属します」。FEBS Lett . 441 (2): 181–5. doi :10.1016/S0014-5793(98)01541-5. PMID 9883880. S2CID 8527080.
- ^ Beddow AL、Richards SA、Orem NR、Macara IG (1995 年 4 月)。「Ran/TC4 GTPase 結合ドメイン: 発現クローニングによる同定と保存された配列モチーフの特徴付け」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 92 (8): 3328–32. doi : 10.1073/pnas.92.8.3328 . PMC 42159 . PMID 7724562。
- ^ ab Ball LJ、Jarchau T、Oschkinat H、Walter U (2002年2月)。「EVH1ドメイン：構造、機能、相互作用」。FEBS Lett . 513 (1): 45–52. doi : 10.1016/S0014-5793(01)03291-4 . PMID 11911879. S2CID 10368115.
- ^ Pawson T.「EVH1ドメイン」。The Pawson Lab 。2011年6月9日閲覧。
- ^ PDB : 1QC6 ; Fedorov AA、Fedorov E、Gertler F、Almo SC (1999年7月)。「細胞骨格のダイナミクスと神経機能に関与する新規プロリンリッチリガンド結合モジュールEVH1の構造」Nat. Struct. Biol . 6 (7): 661–5. doi :10.1038/10717. PMID 10404224. S2CID 22881412.
外部リンク
- 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_EVH1_1
- 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_EVH1_2
- 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_WH1