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| bZIP転写因子 | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | ZIP_1 は | ||||||||
| パム | PF00170 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00036 | ||||||||
| SCOP2 | 1ysa / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd14686 | ||||||||
| メンブラノーム | 235 | ||||||||
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ベーシックロイシンジッパードメイン（bZIPドメイン）は、多くのDNA結合真核生物タンパク質に見られます。ドメインの一部には、配列特異的なDNA結合特性を媒介する領域と、 2つのDNA結合領域を結合（二量体化）するために必要なロイシンジッパーが含まれています。DNA結合領域は、アルギニンやリジンなどのいくつかの基本アミノ酸で構成されています。このドメインを含むタンパク質は転写因子です。[1] [2]
bZIP転写因子
bZIP転写因子はすべての真核生物に存在し、二量体化転写因子の最大のファミリーの1つを形成しています。[3] 2008年の進化研究では、4つのbZIP遺伝子がすべての植物の最も最近の共通祖先のゲノムによってコード化されていることが明らかになりました。 [4] bZIP転写因子間の相互作用は多数あり複雑であり[5] [6] [3]、上皮組織における癌の発生[7] 、内分泌組織の細胞によるステロイドホルモンの合成、 [8]生殖機能に影響を与える因子、[9]および人間の健康に影響を与えるその他のいくつかの現象において重要な役割を果たしています。
bZIPドメインを含むタンパク質
- 転写因子を形成するAP-1 fos / junヘテロダイマー
- Jun-B転写因子
- CREB cAMP応答エレメント転写因子
- OPAQUE2 (O2) は、トウモロコシ ( Zea mays ) の胚乳中の貯蔵タンパク質のクラスをコードする 22 kD ゼイン遺伝子の転写因子です。
- NFE2L2または Nrf2
- Bzip Maf転写因子
このドメインを含むヒトタンパク質
ATF1 ; ATF2 ; ATF4 ; ATF5 ; ATF6 ; ATF7 ; バッハ1 ; バッハ2 ; BATF ; BATF2 ; CEBPA ; CEBPB ; CEBPD ; セブペ; CEBPG ; CEBPZ ; CREB1 ; CREB3 ; CREB3L1 ; CREB3L2; CREB3L3; CREB3L4; CREB5 ; CREBL1 ; クリーム; E4BP4 ; FOSL1 ; FOSL2 ; ジュン； ジュンブ; ジャンド; マファ; MAFB ; 農林水産省; 農林水産省; NRL; C-MAF ; 農水省; NFE2 ; NFE2L2 ; NFE2L3 ; SNFT; XBP1
参考文献
- ^ Ellenberger T (1994). 「DNA認識の把握：基本領域ロイシンジッパーの構造と基本領域ヘリックス-ループ-ヘリックスDNA結合ドメイン」Curr. Opin. Struct. Biol . 4 (1): 12–21. doi :10.1016/S0959-440X(94)90054-X.
- ^ Hurst HC (1995). 「転写因子1: bZIPタンパク質」.タンパク質プロファイル. 2 (2): 101–68. PMID 7780801.
- ^ ab Amoutzias, Grigoris D.; Robertson, David L.; Van de Peer, Yves; Oliver, Stephen G. (2008-05-01). 「パートナーの選択: 真核生物転写因子の二量体化」. Trends in Biochemical Sciences . 33 (5): 220–229. doi :10.1016/j.tibs.2008.02.002. ISSN 0968-0004. PMID 18406148.
- ^ Corrêa LG、Riaño-Pachón DM、Schrago CG、dos Santos RV、Mueller-Roeber B、Vincentz M (2008)。Shiu SH (編)。「緑色植物の進化におけるbZIP転写因子の役割：4つの創始遺伝子から出現する適応機能」。PLOS ONE。3 ( 8 ): e2944。Bibcode : 2008PLoSO ... 3.2944C。doi : 10.1371 /journal.pone.0002944。PMC 2492810。PMID 18698409。
- ^ Vinson, Charles; Acharya, Asha; Taparowsky, Elizabeth J. (2006-01-01). 「in vitro および in vivo での B-ZIP 転写因子相互作用の解読」. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子構造と発現. 1759 (1–2): 4–12. doi :10.1016/j.bbaexp.2005.12.005. ISSN 0006-3002. PMID 16580748.
- ^ Newman, John RS; Keating, Amy E. (2003-06-27). 「コイルドコイルアレイによるヒトbZIP相互作用の包括的同定」. Science . 300 (5628): 2097–2101. Bibcode :2003Sci...300.2097N. doi : 10.1126/science.1084648 . ISSN 1095-9203. PMID 12805554. S2CID 36715183.
- ^ ヴラホプロス SA、ロゴテティ S、ミカス D、ギアリカ A、ゴルゴウリス V、ズンプルリス V (2008 年 4 月)。 「発癌におけるATF-2の役割」。バイオエッセイ。30 (4): 314–27。土井：10.1002/bies.20734。PMID 18348191。S2CID 678541 。
- ^ Manna PR、Dyson MT、Eubank DW、Clark BJ、Lalli E、Sassone-Corsi P、Zeleznik AJ、Stocco DM (2002 年 1 月)。「cAMP 応答要素結合タンパク質ファミリーのメンバーによるステロイド生成およびステロイド生成急性調節タンパク質の調節」。Mol . Endocrinol . 16 (1): 184–99. doi : 10.1210/mend.16.1.0759 . PMID 11773448。
- ^ Hoare S、Copland JA、Wood TG、Jeng YJ、Izban MG、Soloff MS (1999 年 5 月)。「ヒト乳腺細胞におけるオキシトシン受容体遺伝子発現の誘導に関与する GABP アルファ/ベータ結合部位の同定、c-Fos/c-Jun による増強」。内分泌学。140 ( 5): 2268–79。doi : 10.1210/ endo.140.5.6710。PMID 10218980。
外部リンク
- SMART データベースの bZIP ドメイン エントリ
- PlantTFDB の bZIP ファミリー: 植物転写因子データベース
- 植物の bZIP 転写因子 2012-03-20 にWayback Machineでアーカイブ