ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ATF6B |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ATF6B、CREB-RP、CREBL1、G13、活性化転写因子6ベータ |
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| 外部ID | オミム:600984; MGI : 105121;ホモロジーン: 31238;ジーンカード:ATF6B; OMA :ATF6B - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 17番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 17 B1|17 18.22 cM | 始める | 34,866,120 bp [2] |
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| 終わり | 34,874,048 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 単球
- 顆粒球
- 右子宮管
- 左卵巣
- 右卵巣
- 甲状腺の右葉
- 脾臓
- 小脳の右半球
- 甲状腺の左葉
- 胆嚢
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| | トップの表現 | - 卵黄嚢
- 顆粒球
- リップ
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 網膜の神経層
- 神経管
- 心室帯
- 胸腺
- 第四脳室脈絡叢
- 嗅内皮質
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- DNA結合転写因子活性
- タンパク質結合
- cAMP応答要素結合
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- ゴルジ体
- 小胞体膜
- 膜
- 細胞内解剖構造
- 小胞体膜の不可欠な構成要素
- タンパク質-DNA複合体
- 小胞体
- 核
- 内膜系
- 核小体
- RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体
| | 生物学的プロセス |
- 転写の調節、DNAテンプレート
- 小胞体ストレスに応答したRNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写の正の制御
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- 転写、DNAテンプレート
- 小胞体未折り畳みタンパク質応答
- ATF6を介した未折り畳みタンパク質応答
- 折り畳まれていないタンパク質に対する反応
- シグナル伝達
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- ATF6を介した未折り畳みタンパク質応答の負の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | |
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ENSG00000213676 ENSG00000228628 ENSG00000234539 ENSG00000168468 |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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| 場所 (UCSC) | 6 章: 32.12 – 32.13 Mb | 17章: 34.87 – 34.87 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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CAMP応答配列結合タンパク質様1はCREBL1としても知られ、ヒトではCREBL1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、転写因子bZipスーパーファミリーのCreb /ATFサブファミリーと配列類似性を持っています。この遺伝子は細胞質と核の両方に局在します。この遺伝子は染色体6の主要組織適合遺伝子複合体(MHC)クラスIII領域に局在します。[5]
参考文献
- ^ abc ENSG00000228628、ENSG00000234539、ENSG00000168468 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000213676、ENSG00000228628、ENSG00000234539、ENSG00000168468 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000015461 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab "Entrez Gene: CREBL1 cAMP 応答要素結合タンパク質様 1"。
- ^ Haze K, Okada T, Yoshida H, Yanagi H, Yura T, Negishi M, Mori K (2001 年 4 月). 「哺乳類の折り畳みされていないタンパク質の応答の転写活性化因子としての転写因子 6 の活性化に関連する G13 (cAMP 応答エレメント結合タンパク質関連タンパク質) 遺伝子産物の同定」. Biochem. J. 355 ( Pt 1): 19–28. doi :10.1042/0264-6021:3550019. PMC 1221707. PMID 11256944 .
さらに読む
- Bristow J、Tee MK、Gitelman SE、et al. (1993)。「テナシン-X: ヒトXB遺伝子重複P450c21Bによってコードされる新規細胞外マトリックスタンパク質」。J . Cell Biol . 122 (1): 265–78. doi :10.1083/jcb.122.1.265. PMC 2119596. PMID 7686164 。
- Min J、Shukla H、Kozono H 、 et al. (1996)。「HLA複合体におけるHLA-DRAの末端に位置する新しいCrebファミリー遺伝子」。Genomics。30 ( 2): 149–56。doi : 10.1006 / geno.1995.9891。PMID 8586413 。
- Khanna A、Campbell RD (1996)。「ヒトMHCのクラスIII領域にある遺伝子G13は、潜在的なDNA結合タンパク質をコードする」。Biochem . J. 319. (Pt 1) (Pt 1): 81–9. doi :10.1042/bj3190081. PMC 1217738. PMID 8870652 。
- Speek M、Barry F、Miller WL (1997)。「5' 末端と 3' 末端が他の遺伝子に埋め込まれた遺伝子、ヒトテネイシン X の代替プロモーターと代替スプライシング」。Hum . Mol. Genet . 5 (11): 1749–58. doi : 10.1093/hmg/5.11.1749 . PMID 8923003。
- Swanson DJ、 Aomori M、 Lewis EJ (2000)。「ホメオドメインタンパク質 Arix は、複数の要素とコアクチベーター cAMP 応答要素結合タンパク質との相互作用を介して、ドーパミン β-ヒドロキシラーゼ プロモーターのタンパク質キナーゼ A 依存性活性化を促進する」。J . Biol. Chem . 275 (4): 2911–23. doi : 10.1074/jbc.275.4.2911 . PMID 10644760。
- Yoshida H, Okada T, Haze K, et al. (2001). 「小胞体ストレス誘導性転写因子複合体 ERSF の形成、これには NF-Y (CBF) と活性化転写因子 6alpha および 6beta が含まれており、これが哺乳類の折り畳まれていないタンパク質の応答を活性化します」。Mol . Cell. Biol . 21 (4): 1239–48. doi :10.1128/MCB.21.4.1239-1248.2001. PMC 99577. PMID 11158310 。
- Ye J、Rawson RB、Komuro R、他 (2001)。「ER ストレスは、SREBP を処理する同じプロテアーゼによる膜結合型 ATF6 の切断を誘導する」。Mol . Cell . 6 (6): 1355–64. doi : 10.1016/S1097-2765(00)00133-7 . PMID 11163209。
- Haze K、Okada T、Yoshida H、et al. (2001)。「哺乳類の折り畳まれていないタンパク質の応答の転写活性化因子として転写因子 6 の活性化に関連する G13 (cAMP 応答エレメント結合タンパク質関連タンパク質) 遺伝子産物の同定」。Biochem . J. 355 ( Pt 1): 19–28。doi : 10.1042/ 0264-6021 :3550019。PMC 1221707。PMID 11256944。
- Tong WY, Nagano-Fujii M, Hidajat R, et al. (2003). 「C型肝炎ウイルスNS4Bタンパク質とCREB-RP/ATF6betaの物理的相互作用」(PDF) . Biochem. Biophys. Res. Commun . 299 (3): 366–72. doi :10.1016/S0006-291X(02)02638-4. PMID 12445808. 2020-07-12に オリジナル(PDF)からアーカイブ。2020-09-05に取得。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Okada T, Haze K, Nadanaka S, et al. (2003). 「セリンプロテアーゼ阻害剤は小胞体ストレス誘導性切断を阻止するが、膜結合型転写因子 ATF6 の輸送は阻止しない」J. Biol. Chem . 278 (33): 31024–32. doi : 10.1074/jbc.M300923200 . PMID 12782636.
- Mungall AJ 、Palmer SA、Sims SK、他 (2003)。「ヒト染色体6のDNA配列と分析」。Nature 425 ( 6960 ) : 805–11。Bibcode :2003Natur.425..805M。doi : 10.1038/ nature02055。PMID 14574404 。
- Xie T, Rowen L, Aguado B, et al. (2004). 「遺伝子密度の高い主要組織適合遺伝子複合体クラス III 領域の解析とマウスとの比較」Genome Res . 13 (12): 2621–36. doi :10.1101/gr.1736803. PMC 403804. PMID 14656967 .
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
外部リンク
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。