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| イネ | |
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| 成熟した種子頭 | |
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| 花序 | |
科学的分類 
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| 王国： | 植物界 |
| クレード: | 維管束植物 |
| クレード: | 被子植物 |
| クレード: | 単子葉植物 |
| クレード: | ツユクサ科 |
| 注文： | ポアレス |
| 家族： | イネ科 |
| 属: | オリザ |
| 種： | オオバコ
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| 二名法名 | |
| イネ | |
| 同義語[1] | |
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リスト
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Oryza sativaは、アジア栽培米[2]という一般名を持ち、穀物として栽培される2種のイネ種のうち、アフリカイネであるO. glaberrimaと比べるとはるかに一般的である13,500年から8,200年前に中国の揚子江流域で初めて栽培された。 [3] [4] [5] [6]
イネ科イネ属BOP系統に属する。12本の染色体からなる430Mbpのゲノムを持ち、遺伝子組み換えが容易なことで知られ、穀類や単子葉植物の生物学研究のモデル生物となっている。[7]
説明
O. sativa は直立した茎を持ち、高さは 80～120 cm (30～45 インチ) で、表面は滑らかです。葉は披針形で、長さ 15～30 cm ( 5+7 ⁄ 8 – 11+茎は長さ約3 ⁄ 4 インチで、10～20 mm（ 3 ⁄ 8～ 3 ⁄ 4 インチ）の舌状部から成長します。 [8]
分類
属名のOryza [9]は古典的なラテン語で米を意味し、種小名のsativaは「栽培された」を意味する。[10] [11]
Oryza sativaには、粘り気のある短粒種のジャポニカ種またはシニカ種と、粘り気のない長粒種の2つの主要な亜種があります。インディカ [zh] [ja]米の品種。ジャポニカは9～6,000年前に揚子江流域で栽培化され[12]その品種は乾燥地（日本では主に水上栽培）、東アジアの温帯、東南アジアの高地、南アジアの高地で栽培されている。一方、インディカは8,500～4,500年前にガンジス川流域で栽培化され[12]白、茶、黒（炊くと紫色）、赤など多様である。[13][14]
3番目の亜種は広粒度で熱帯の条件で繁茂し、形態に基づいて特定され、当初はジャバニカと呼ばれていましたが、現在は熱帯ジャポニカとして知られています。この品種の例には、フィリピンのルソン島北部のコルディリェラ山脈の標高の高い棚田で栽培されている中粒の「ティナウォン」と「ウノイ」の栽培品種があります。 [ 15]
グラスマン（1987）はアイソザイムを用いてO. sativaをジャポニカ、アロマティック、インディカ、オース、ラヤダ、アシナの6つのグループに分類した。[16]
ギャリスら（2004）は、単純な配列反復法を用いてO. sativaを5つのグループに分類した。温帯ジャポニカ、熱帯ジャポニカ、芳香性はジャポニカ種を構成し、インディカとオーストラリアはインディカ種を構成する。[17]ギャリスの分類法は2019年現在でも新しい分析に通用しているが、[18] 2014年の論文では、ラヤダはジャポニカ種の下で独自のグループになるほど独特であると主張している。[19]
遺伝学
SPL14 /LOC4345998は、植物の全体的な構造/成長習性を制御する遺伝子である。そのエピアレルのいくつかは、イネの収量を増加させる。 [20]正確で使用可能な単純配列反復マーカーセットが開発され、高密度マップを生成するために使用された。 [21]多重ハイスループットマーカー支援選択システムが開発されているが、他の作物と同様に、HTMASシステムはカスタマイズが難しく、コストが高く（直接的にも機器的にも）、柔軟性に欠けることが判明している。 [21]他の分子育種ツールは、イネいもち病抵抗性栽培品種を生み出した。 [22] [23] [21] DNAマイクロアレイはイネの雑種強勢の理解を深めるために使用され、 QTL配列決定は苗の強勢を解明するために使用され、全ゲノム配列決定（WGS）によるゲノムワイド関連研究（GWAS）はさまざまな農業形質の調査に使用されてきている。 [21]
合計で641のコピー数変異が知られています。[21] イネはゲノムが大きく、DNAの繰り返しが多いため、エクソームキャプチャーによって新しい一塩基多型が明らかになることがよくあります。 [21]
イネいもち病菌に対する抵抗性は、以下の様々な抵抗性遺伝子によってもたらされる。パイ1、Pi54、およびピタ。[24] O. sativaは植物ホルモンのアブシシン酸とサリチル酸をM. griseaに対する免疫を広く刺激し、アブシシン酸は抑制する。成功は両者のレベルのバランスに依存する。[25][26]
O. sativaには、特にトビイロウンカに対する多数の昆虫抵抗性遺伝子がある。[27] 2022年現在、15個のR遺伝子がクローン化され、特徴付けられている。[27][アップデート]
参照
参考文献
- ^ 「Oryza sativa L.」Plants of the World Online。キュー王立植物園評議員会。2017年。 2020年12月21日閲覧。
- ^ 「Oryza sativa (アジア栽培米)」。国立医学図書館。 2024年7月24日閲覧。
- ^ Normile, Dennis (1997). 「揚子江は最古の稲作地とみられる」. Science . 275 (5298): 309–310. doi :10.1126/science.275.5298.309. S2CID 140691699.
- ^ Vaughan, DA; Lu, B.; Tomooka, N. (2008). 「イネの進化の進化物語」.植物科学. 174 (4): 394–408. Bibcode :2008PlnSc.174..394V. doi :10.1016/j.plantsci.2008.01.016.
- ^ ハリス、デイビッド・R. (1996)。ユーラシアにおける農業と牧畜の起源と広がり。心理学出版。p. 565。ISBN 978-1-85728-538-3。
- ^ Zhang, Jianping; Lu, Houyuan; Gu, Wanfa; Wu, Naiqin; Zhou, Kunshu; Hu, Yayi; Xin, Yingjun; Wang, Can; Kashkush, Khalil (2012年12月17日). 「中国黄河中流地域における7800年前の雑穀と稲の初期の混合農業」. PLOS ONE . 7 (12): e52146. Bibcode :2012PLoSO...752146Z. doi : 10.1371/journal.pone.0052146 . PMC 3524165. PMID 23284907 .
- ^ Haberer, Georg; Mayer, Klaus FX; Spannagl, Manuel (2016年4月1日). 「単子葉植物ゲノムのビッグファイブ」. Current Opinion in Plant Biology . SI: 30: ゲノム研究と分子遺伝学. 30 : 33–40. Bibcode :2016COPB...30...33H. doi :10.1016/j.pbi.2016.01.004. ISSN 1369-5266. PMID 26866569.
- ^ カティンディグ、JLA;ルビガン、RT;ジョンソン、D. (nd)。 「オリザ・サティバ」。ライスナレッジバンク。国際稲研究所。2023 年6 月 29 日に取得。
- ^ "oryza". Merriam-Webster.com 辞書. Merriam-Webster.
- ^ 「サティバ」。Lexico UK English Dictionary 。オックスフォード大学出版局。nd
- ^ 「サティバ」。Merriam -Webster.com 辞書。Merriam-Webster。
- ^ ab Purugganan, Michael D.; Fuller, Dorian Q. (2009). 「植物の栽培化における選択の性質」. Nature . 457 (7231). Nature Research : 843–848. Bibcode :2009Natur.457..843P. doi :10.1038/nature07895. ISSN 0028-0836. PMID 19212403. S2CID 205216444.
- ^ 岡（1988）
- ^ Mohammadi Shad, Z.; Atungulu, G. (2019年3月). 「貯蔵環境と抗真菌処理の影響を受けた長粒種ハイブリッド、純系、中粒種のイネ品種における収穫後の穀粒の変色と真菌活動」。Journal of Stored Products Research。81 : 91–99。doi : 10.1016 / j.jspr.2019.02.002。S2CID 92050510 。
- ^ CECAP、PhilRice、IIRR。2000年。「フィリピン・コルディリェラ高原の米生産」
- ^ Glaszmann, JC (1987年5月). 「アジアのイネ品種のアイソザイムと分類」.理論および応用遺伝学. 74 (1): 21–30. doi :10.1007/BF00290078. PMID 24241451. S2CID 22829122.
- ^ Garris, Amanda J.; Tai, TH; Coburn, J.; Kresovich, S.; McCouch, S. (2004). 「Oryza sativa L. の遺伝的構造と多様性」遺伝学. 169 (3): 1631–1638. doi :10.1534/genetics.104.035642. PMC 1449546. PMID 15654106 .
- ^ Civáň, Peter; Ali, Sajid; Batista-Navarro, Riza; Drosou, Konstantina; Ihejieto, Chioma; Chakraborty, Debarati; Ray, Avik; Gladieux, Pierre; Brown, Terence A (2019年3月1日). 「インド亜大陸に遡る栽培イネの芳香族グループ ( Oryza sativa L.) の起源」.ゲノム生物学と進化. 11 (3): 832–843. doi :10.1093/gbe/evz039. PMC 6427689. PMID 30793171 .
- ^ Wang, CH; Zheng, XM; Xu, Q; Yuan, XP; Huang, L; Zhou, HF; Wei, XH; Ge, S (2014 年 5 月)。「中国のイネ遺伝資源に重点を置いた Oryza sativa の遺伝的多様性と分類」。遺伝。112 ( 5 ) : 489–496。doi :10.1038 / hdy.2013.130。PMC 3998783。PMID 24326293。
- ^ Stange, Madlen; Barrett, Rowan DH; Hendry, Andrew P. (2021年2月). 「生物多様性、生態系、そして人々にとってのゲノム変異の重要性」. Nature Reviews Genetics . 22 (2). Nature Portfolio : 89–105. doi :10.1038/s41576-020-00288-7. ISSN 1471-0056. PMID 33067582. S2CID 223559538. MS ORCID 0000-0002-4559-2535. (RDHB ORCID 0000-0003-3044-2531).
- ^ abcdef Rasheed, Awais; Hao, Yuanfeng; Xia, Xianchun; Khan, Awais; Xu, Yunbi; Varshney, Rajeev K.; He, Zhonghu (2017). 「作物育種チップとジェノタイピングプラットフォーム：進歩、課題、展望」. Molecular Plant . 10 (8). Elsevier : 1047–1064. doi : 10.1016/j.molp.2017.06.008 . ISSN 1674-2052. PMID 28669791. S2CID 33780984.中国科学院+中国植物生物学会+上海生物科学研究所.
- ^ Miah, G.; Rafii, MY; Ismail, MR; Puteh, AB; Rahim, HA; Asfaliza, R.; Latif, MA (2012 年 11 月 27 日). 「イネのいもち病抵抗性: 従来の育種から分子アプローチまでのレビュー」(PDF) . Molecular Biology Reports . 40 (3). Springer Science+Business Media : 2369–2388. doi :10.1007/s11033-012-2318-0. ISSN 0301-4851. PMID 23184051. S2CID 8922855.
- ^ Rao, Yuchun; Li, Yuanyuan; Qian, Qian (2014年1月19日). 「中国におけるイネの分子育種に関する最近の進歩」. Plant Cell Reports . 33 (4). Springer Science+Business Media : 551–564. doi :10.1007/s00299-013-1551-x. ISSN 0721-7714. PMC 3976512. PMID 24442397 .
- ^ Mehta, Sahil; Singh, Baljinder; Dhakate, Priyanka; Rahman, Mehzabin; Islam, Muhammad Aminul (2019). 「5 イネ、マーカー支援育種、および耐病性」。Wani, Shabir Hussain (ed.) 著。作物の耐病性：分子、遺伝、ゲノムの観点。Springer。pp . 83–112/xii+307。ISBN 978-3-030-20727-4. OCLC 1110184027.
- ^ Pieterse, Corné MJ; Van der Does, Dieuwertje; Zamioudis, Christos; Leon-Reyes, Antonio; Van Wees, Saskia CM (2012 年 11 月 10 日)。「植物免疫のホルモン調節」。Annual Review of Cell and Developmental Biology。28 (1)。Annual Reviews : 489–521。doi : 10.1146 /annurev-cellbio-092910-154055。hdl : 1874 / 274421。ISSN 1081-0706。PMID 22559264。S2CID 18180536 。 | Atkinson, Nicky J.; Urwin, Peter E. (2012 年 3 月 30 日)。「植物の生物的および非生物的ストレスの相互作用: 遺伝子からフィールドまで」。実験植物学ジャーナル。63 (10)。オックスフォード大学出版局: 3523–3543。doi : 10.1093 /jxb / ers100。ISSN 0022-0957。PMID 22467407。S2CID 205195661 。
- ^ Liu, Wende; Liu, Jinling; Triplett, Lindsay; Leach, Jan E.; Wang, Guo-Liang (2014 年 8 月 4 日)。「細菌および真菌病原体に対するイネの自然免疫に関する新たな知見」。Annual Review of Phytopathology。52 ( 1)。Annual Reviews : 213–241。doi : 10.1146 / annurev -phyto-102313-045926。ISSN 0066-4286。PMID 21380629。S2CID 9244874 。
- ^ ab Wang, Changsheng; Han, Bin (2022). 「イネゲノム研究20年：シーケンシングと機能ゲノムから定量ゲノムへ」. Molecular Plant . 15 (4). Cell Press : 593–619. doi : 10.1016/j.molp.2022.03.009 . ISSN 1674-2052. PMID 35331914. S2CID 247603925.
外部リンク
ウィキスペシーズのOryza sativaに関連するデータ
ウィキメディア・コモンズの Oryza sativa に関連するメディア