Loading article…
| SH3ドメイン | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | SH3_1 | ||||||||
| パム | PF00018 | ||||||||
| ファム一族 | CL0010 | ||||||||
| エコド | 4.1.1 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | SM00326 | ||||||||
| プロサイト | PS50002 | ||||||||
| SCOP2 | 1shf / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd00174 | ||||||||
| |||||||||
SRCホモロジー3ドメイン （またはSH3ドメイン）は、約60アミノ酸残基の小さなタンパク質ドメインです。当初、SH3はウイルスアダプタータンパク質v-Crkの保存された配列として説明されました。このドメインは、ホスホリパーゼの分子や、AblやSrcなどのいくつかの細胞質チロシンキナーゼにも存在します。[1] [2]また、 PI3キナーゼ、Ras GTPase活性化タンパク質、CDC24、cdc25など、いくつかの他のタンパク質ファミリーでも特定されています。[3] [4] [5] SH3ドメインは、細胞骨格、Rasタンパク質、Srcキナーゼなどを制御するシグナル伝達経路のタンパク質に見られます。SH3タンパク質は、アダプタータンパク質やチロシンキナーゼと相互作用します。チロシンキナーゼと相互作用する際、SH3タンパク質は通常、活性部位から遠く離れた場所に結合します。ヒトゲノムにコードされているタンパク質には約300個のSH3ドメインが存在します。さらに、SH3ドメインはシグナル伝達経路におけるタンパク質間相互作用の制御[6]や細胞質シグナル伝達に関与するタンパク質の相互作用の調節を担っています。[7]
構造
SH3ドメインは、 2つの密に詰まった反平行βシートとして配置された5つまたは6つのβストランドからなる特徴的なβバレルフォールドを持っています。リンカー領域には短いヘリックスが含まれている場合があります。SH3型フォールドは、真核生物だけでなく原核生物にも見られる古代のフォールドです。[8]
ペプチド結合
古典的な SH3 ドメインは、通常、他のタンパク質と相互作用し、それぞれの結合パートナーのプロリンに富むペプチドに結合することによって、特定のタンパク質複合体の組み立てを仲介するタンパク質に見られます。古典的な SH3 ドメインは、ヒトでは細胞内タンパク質に限定されていますが、小さなヒト MIA ファミリーの細胞外タンパク質にも、SH3 のようなフォールドを持つドメインが含まれています。
タンパク質の多くの SH3 結合エピトープは、正規表現または短い線状モチーフとして表すことができるコンセンサス配列を持っています。
-XPpXP- 1 2 3 4 5
1 と 4 は脂肪族アミノ酸、2 と 5 は常にプロリン、3 は時々プロリンです。この配列は、 SH3 ドメインの疎水性ポケットに結合します。最近では、コアコンセンサスモチーフ RxxK に結合する SH3 ドメインが説明されています。例としては、Grb2 や Mona (別名 Gads、Grap2、Grf40、GrpL など) などのアダプタータンパク質の C 末端 SH3 ドメインがあります。その他の SH3 結合モチーフは、さまざまな分子研究の過程で出現しており、現在も出現し続けており、このドメインの汎用性が強調されています。
SH3インタラクトーム
SH3ドメインを介したタンパク質間相互作用ネットワーク、すなわちSH3インタラクトームは、線虫のSH3インタラクトームがエンドサイトーシスに関与するタンパク質に著しく富んでいるため、類似の酵母ネットワークに類似していることを明らかにした。[9] [10]それにもかかわらず、相同SH3ドメインを介した相互作用は、線虫と酵母の間で高度に再配線されている。[9]
SH3ドメインを持つタンパク質
- シグナル伝達アダプタータンパク質
- CDC24
- Ｃｄｃ２５
- PI3キナーゼ
- ホスホリパーゼ
- Ras GTPase活性化タンパク質
- Vav 癌原遺伝子
- GRB2
- p54 S6キナーゼ2（S6K2）
- SH3D21
- ARMH3（潜在的）
- STAC3
- いくつかのミオシン
- SH3および複数のアンキリン繰り返しドメイン: SHANK1、SHANK2、SHANK3
- ヤップ1
- ARHGAP12
- ベクシン ( VXN )
- タンゴ1
- インテグラーゼ
- 接着局所キナーゼ (FAK、PTK2)
- プロリンリッチチロシンキナーゼ（Pyk2、CADTK、PTK2beta）
- TRIP10 (cip4)
参照
参考文献
- ^ Pawson T、 Schlessingert J (1993年7月)。「SH2およびSH3ドメイン」。Current Biology。3 ( 7 ):434–42。doi :10.1016/0960-9822(93)90350-W。PMID 15335710。S2CID 53273571 。
- ^ Mayer BJ (2001 年 4 月). 「SH3 ドメイン: 適度な複雑さ」. Journal of Cell Science . 114 (Pt 7): 1253–63. doi :10.1242/jcs.114.7.1253. PMID 11256992.
- ^ Musacchio A、Gibson T、Lehto VP、 Saraste M (1992年7 月)。「SH3 - 機能を求める豊富なタンパク質ドメイン」。FEBS Letters。307 ( 1): 55–61。doi :10.1016/0014-5793(92)80901- R。PMID 1639195。S2CID 8564342 。
- ^ Mayer BJ、Baltimore D (1993年1月)。「SH2 およびSH3ドメインを介したシグナル伝達」。Trends in Cell Biology。3 ( 1 ): 8–13。doi :10.1016/0962-8924(93)90194-6。PMID 14731533 。
- ^ Pawson T (1995年2月). 「タンパク質モジュールとシグナル伝達ネットワーク」. Nature . 373 (6515): 573–80. doi :10.1038/373573a0. PMID 7531822. S2CID 4324726.
- ^ Schlessinger J (1994年2月). 「SH2/SH3シグナル伝達タンパク質」. Current Opinion in Genetics & Development . 4 (1): 25–30. doi :10.1016/0959-437X(94)90087-6. PMID 8193536.
- ^ Koch CA、Anderson D、Moran MF、Ellis C、Pawson T (1991 年 5 月)。「SH2 および SH3 ドメイン: 細胞質シグナル伝達タンパク質の相互作用を制御する要素」。Science . 252 ( 5006): 668–74. doi :10.1126/science.1708916. PMID 1708916。
- ^ Whisstock JC、 Lesk AM (1999年4月)。「原核生物のSH3ドメイン」。生化学科学の動向。24 (4):132–3。doi :10.1016/s0968-0004(99)01366-3。PMID 10322416 。
- ^ ab Xin, Xiaofeng; Gfeller, David; Cheng, Jackie; Tonikian, Raffi; Sun, Lin; Guo, Ailan; Lopez, Lianet; Pavlenco, Alevtina; Akintobi, Adenrele (2013-01-01). 「SH3 インタラクトームは特定の形態よりも一般的な機能を維持する」。分子システム生物 学。9 : 652。doi : 10.1038 /msb.2013.9。ISSN 1744-4292。PMC 3658277。PMID 23549480。
- ^ Tonikian, Raffi; Xin, Xiaofeng; Toret, Christopher P.; Gfeller, David; Landgraf, Christiane; Panni, Simona; Paoluzi, Serena; Castagnoli, Luisa; Currell, Bridget (2009-10-01). 「酵母 SH3 ドメインインタラクトームのベイジアンモデリングはエンドサイトーシスタンパク質の時空間ダイナミクスを予測する」. PLOS Biology . 7 (10): e1000218. doi : 10.1371/journal.pbio.1000218 . ISSN 1545-7885. PMC 2756588. PMID 19841731 .
外部リンク
- 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_SH3_1
- 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_SH3_2
- 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_SH3_3
- 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_SH3_4
- 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_SH3_5
- 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス TRG_PEX_1
- シグナル伝達におけるナッシュ ラボ タンパク質相互作用ドメイン - SH3 ドメイン[永久リンク切れ ]
- GENEART - 単一のファージディスプレイサイクルですべてのヒト SH3 ドメインに対してタンパク質をスクリーニングします。2009-07-07 にWayback Machineでアーカイブされました。