シャンク1

シャンク1
識別子
エイリアス	SHANK1、SPANK-1、SSTRIP、シナモン、SH3および複数のアンキリン繰り返しドメイン1
外部ID	OMIM : 604999; MGI : 3613677; HomoloGene : 22949; GeneCards : SHANK1; OMA :SHANK1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） クロ。 19番染色体（ヒト）[1] バンド 19q13.33 始める 50,659,255 bp [1] 終わり 50,719,802 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） クロ。 染色体7（マウス）[2] バンド 7|7 B3 始める 43,959,677 bp [2] 終わり 44,009,996 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） トップの表現 前帯状皮質 右前頭葉 前頭前皮質 扁桃体 小脳の右半球 一次視覚野 背外側前頭前皮質 ブロードマン領域9 海馬本体 中側頭回 トップの表現 前頭前皮質 一次運動野 側頭葉 鉤状部 帯状回 扁桃体 外側膝状体 梨状皮質 一次視覚野 内側背核 参照表現データの詳細 バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 ソマトスタチン受容体結合 SH3ドメイン結合 アンキリン繰り返し結合 足場タンパク質結合 タンパク質C末端結合 タンパク質結合 シナプス受容体アダプター活性 同一のタンパク質結合 イオンチャネル型グルタミン酸受容体結合 シグナル伝達受容体複合体アダプター活性 タンパク質含有複合体結合 細胞成分 細胞質 シナプス後膜 膜 樹状突起棘 シナプス 興奮性シナプス 細胞内解剖構造 NMDA選択的グルタミン酸受容体複合体 細胞接合 樹状突起 ニューロン投影 イオンチャネル型グルタミン酸受容体複合体 シナプス後密度 細胞質 細胞膜 シャッファー側枝 - CA1シナプス グルタミン酸シナプス ニューロン脊柱 生物学的プロセス 細胞分化 嗅覚行動 連想学習 バランスを制御する神経筋プロセス アクチンフィラメント束の集合の負の調節 樹状突起棘の発達の正の調節 神経系の発達 AMPA受容体の活性の調節 樹状突起棘の形態形成 発声行動 大人の行動 長期記憶 シナプスの成熟 興奮性シナプス後電位の正の調節 社会的行動 慣れ 感情の決定 立ち直り反射 シナプスへのタンパク質の局在 タンパク質を含む複合体アセンブリ シナプス後組織 シナプスの組み立て 脳の形態形成 神経筋接合部におけるシナプス形成 シナプス伝達の正の調節、グルタミン酸作動性 長期増強 シナプス後密度アセンブリ 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 50944 243961 アンサンブル ENSG00000161681 ENSMUSG00000038738 ユニプロット Q9Y566 Ｄ３ＹＺＵ１ RefSeq (mRNA) NM_016148 NM_001034115 RefSeq (タンパク質) NP_057232 NP_001029287 場所 (UCSC) 19章: 50.66 – 50.72 Mb 7 章: 43.96 – 44.01 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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SH3および多重アンキリン反復ドメインタンパク質1は、ヒトではSHANK1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

SHANK1 は以下と相互作用することが示されています:

• ARHGEF7 , ^[7]
• BAIAP2 , ^[8]
• DNM2 , ^[9]
• SPTAN1、^[10] および
• ソマトスタチン受容体2 ^[5 ]

SHANK1 は、脳内の興奮性シナプスの形成と維持に重要な役割を果たす足場タンパク質です。SHANK1 遺伝子の変異は、自閉症スペクトラム障害 (ASD)、統合失調症、知的障害など、多くの神経発達障害に関係していると言われています。特に、SHANK1 発現の喪失は ASD と関連しており、ASD またはその他の神経発達障害を持つ個人で SHANK1 変異が確認されています。ASD は「自閉症スペクトラム障害」とも呼ばれ、人間の脳に障害を引き起こす特性を引き起こす一連の疾患として特定されています。これらの障害には、コミュニケーション、興味、社会化の問題、または行動の相違のパターンなどがあります。

Sato et al 2012は、ASDの男性におけるSHANK1の変異と欠失の重要な影響を明らかにしました。^[11]この研究は、ASDを患う1,158人のカナダ人と456人のヨーロッパ人で構成されていました。SHANK1はヒトでは19番染色体に位置し、SHANK2は11番染色体、SHANK3は22番染色体に位置しています。特にSHANK1の遺伝子座は、SHANK2やSHANK3ほどASDとの関連で研究されていません。この研究の目的は、より多くの文脈を提供し、欠失、微小欠失、および/または変異によって引き起こされる男性のASD発症の焦点として特定のタンパク質SHANK1を分析することです。研究者らは、遺伝子の新規欠失が高機能ASDの男性に見られ、対照群として使用された15,000人の男性には欠失が見られなかったことを発見しました。

この研究の焦点の 1 つは、SHANK1 に関連する 19 番染色体の欠失があると思われる 7 名の個人でした。この 7 名のうち 4 名は高機能 ASD の男性で、これは SHANK1 遺伝子の遺伝的変異および/または欠失が複数世代にわたって検出されたことに起因しています。同じグループには SHANK1 欠失を持つ女性 2 名がいましたが、ASD の症状は見られませんでした。グループの最後の 1 名は男性で、ASD の症状が見られながら、無関係な (遺伝ではない) SHANK1 遺伝子の欠失を持っていました。この研究で ASD の症状が見られたすべての個人は、自閉症診断観察スケジュール (ADOS) および/または改訂版自閉症診断面接 (ADI-R) を使用して専門の臨床医によって評価および診断されました。個人はカナダおよびヨーロッパ中のさまざまな病院および専門臨床センターから選ばれました。

SYBR-Green ベースのリアルタイム定量 PCR (qPCR) を使用して、個人の遺伝子を特定するために実験室テストが実行されました。このテストは、SHANK ファミリーが見つかる遺伝子座であるファミリー 1 に焦点を当てました。これにより、プライマーを使用して SHANK1 の突然変異、欠失、または微小欠失の存在を確立できました。結果は、欠失が 63.8 kb であり、SHANK1 遺伝子のエクソン 1-20 の除去と CLEC11A 遺伝子の欠失を引き起こしていることを示しました。CLEC11A 遺伝子 (MIM 604713) は染色体 2q14.1 にあり、オステオアクチビンと呼ばれるタンパク質をコードします。オステオアクチビンは、骨、軟骨、肺など、さまざまな組織に存在します。この遺伝子は、骨のリモデリング、血管新生、免疫応答など、いくつかの生物学的プロセスの一部であることがわかっています。 CLEC11A 遺伝子の変異は、骨粗鬆症やその他の骨関連疾患を発症するリスクの増加と関連しています。

SHANK1 遺伝子の欠失を持つ男性に ASD が発症していることがわかったことに加え、母親から受け継いだ研究対象者の染色体からも遺伝子が受け継がれていることがわかった。これらのケースでは、母親が SHANK1 遺伝子のコピーを 2 つ持っているようだった。しかし、遺伝子の変異を持つ男性に ASD が存在する場合、欠失のみの場合、このことは当てはまらない。

研究者らは、血縁関係のない ASD 罹患男性が SHANK1 の独立した de novo 欠失を保有していることを発見し、家族 1 で分離した SHANK1 CNV が実際に個人に ASD を発症させる主な病因であるという解釈を裏付けています。この主張をさらに裏付けるために、研究者らは複数世代の家族の症例報告の継続的な検査が必要であるとも述べています。証拠は、SHANK1 遺伝子の変異、欠失、または微小欠失が、男性個人に ASD を発症させる上で SHANK2 および SHANK3 と同等の影響力を持つことを裏付けています。

遺伝子変異の発見の重要性は、医学的な範囲を超えています。また、ASD 患者が男性よりも女性に偏った診断を受ける理由も理解できます。また、遺伝性の ASD と無関係な遺伝子変異の違いを遺伝的に解釈することもできます。これは、ASD 患者の社会的側面に影響を及ぼす可能性があります。診断を受ける人が増え、これらの患者のためのリソース分野が拡大し続ける中、ASD の原因に関するテスト済みで信頼できる証拠があることは非常に重要です。