ピーター・ヤン・ベックス

オーストリア管区長として、ベックスは1853年6月に開催された総会に出席した。この総会は、3月に亡くなったヤン・ルーターンの後継者を選出するために招集されたものであった。7月2日、第1回投票で、ペーター・ヤン・ベックスが（51票中27票を獲得して）イエズス会総長に選出された。また、4人の補佐総長も選出された。総会では、イエズス会に対する新たな攻撃に懸念が表明され、イエズス会を批判者から守るには慎重かつ機転を利かせるよう助言された。

イエズス会の弾圧は、イエズス会士にとって困難な時代をもたらした。彼らは1820年にロシアから、1854年と1858年にスペインから、1859年にナポリ・シチリアから、1872年にドイツから、1880年にフランスとフランス植民地から、そして1873年にはローマ自体からも追放された。その間、ベックスは本部をフィレンツェ近郊のフィエーゾレに移し、そこに「総本部」が1895年まで置かれた。

ベックスはイエズス会の仲間たちに15通もの手紙を書き、しばしば激しい攻撃に直面しながらも彼らの精神を支えた。彼らが直面していた災難にもかかわらず、その手紙は穏やかで率直な内容が印象的である。特に1870年のパリ・コミューンで数人のフランス人イエズス会士（その中にはピエール・オリヴァンもいた）が処刑された後に、1871年に全イエズス会に宛てて書かれた手紙はそうだ。「時代の変化」を考慮して、彼は新しい使徒的活動に非常に寛容だった。彼は『ラティオ・ストゥディオルム』を近代化し、イエズス会の教育において科学科目により多くのスペースを与え、イマヌエル・カントのような近代哲学者の議論を奨励した。「信教の自由」は（慎重に…）促進できたが、教会の世俗権力に疑問を呈することはタブーだった。

1871年9月、ベックスはイエズス会をイエスの御心に捧げました。^{[ 1 ]}イエスの人格への愛と霊的な一致は、イエズス会の生活と活動の中心です。

世界各地で新たな宣教活動が開始され、ヨーロッパからの海外移住の増加も間接的にこれを後押しした。キューバ（1853年）、コロンビア（1858年）、フィリピン（1859年）、マダガスカル（1861年）、インドのマンガロール（1878年）、アルメニア（1881年）、オーストラリア（1882年）などである。知的活動も奨励された。いくつかの雑誌が創刊された。イタリアの『ラ・チヴィルタ・カトリカ』（1850年）、 『ザ・マンス』（ロンドン、1864年）、『エチュード』（パリ、1865年）、 『シュティンメン・アウス・マリア・ラーハ』（ドイツ、1865年）など、アイルランド、ポーランド、ベルギーでも創刊された。

彼が将軍を務めていた間、ウルトラモンタニズムはカトリックの自由主義派に大きく浸透した。聖座に非常に近い雑誌『ラ・チヴィルタ・カトリカ』 （一部の記事はピウス9世教皇の直接的な影響を受けたと言われている）は、特にこの闘争に深く関わっていた。すなわち、教皇領の擁護（1859年から）、誤謬表の擁護（1864年）、教皇至上権の擁護（1870年）である。

ベックスがイエズス会を率いた30年間で、会員数は倍増し、アイルランド、フランス、スペイン、ポルトガル、ミズーリ州（米国）などに多数の新しい管区が設立された。彼の在任期間は、プロテスタント諸国への宣教活動への注力が強化された時期として特徴づけられる。

1883年までに、彼は88歳となり、30年間様々な役職を務めていた。病弱であった彼は、自らの意思で総会を招集し、自身の下で奉仕する「継承権を有する総代理」を選出するよう求めた。第23回総会は1883年にローマで開催され、9月24日、スイス人イエズス会司祭のアントン・アンデルレディが選出された。ベックスは「総長」の肩書きは残したものの、事実上その職務を完全に放棄した。彼は4年後、92歳でローマで死去した。