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| ポルグ2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| エイリアス | POLG2、HP55、MTPOLB、PEOA4、POLB、POLG-BETA、POLGB、ポリメラーゼ（DNA）ガンマ2、補助サブユニット、DNAポリメラーゼガンマ2、補助サブユニット、MTDPS16、MTDPS16A、MTDPS16B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：604983; MGI : 1354947;ホモロジーン: 5221;ジーンカード：POLG2; OMA :POLG2 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ミトコンドリアDNAポリメラーゼサブユニットガンマ2は、ヒトではPOLG2遺伝子によってコードされるタンパク質である。POLG2遺伝子は、POLG遺伝子によってコードされるDNAポリメラーゼガンマの触媒サブユニットに高い処理能力と耐塩性を付与する55kDaの補助サブユニットタンパク質をコードしている。[5] [6]この遺伝子の変異は、ミトコンドリアDNA欠失を伴う常染色体優性進行性外眼筋麻痺を引き起こす。[7]
構造
POLG2は染色体17のq腕の23.3番に位置し、8つのエクソンを持っています。[7]この遺伝子によってコードされるタンパク質POLG2は、 p.38にホスホセリン修飾残基とトランジットペプチドを含んでいます。その構造は25本のβ鎖、21本のαヘリックス、および8つのターンで構成されています。[8] [9]
関数
POLG2はミトコンドリアDNAポリメラーゼγのプロセッシビティサブユニットをコードしている。コードされたタンパク質は1つの触媒サブユニットと2つのプロセッシビティサブユニットを含むヘテロ三量体を形成する。このタンパク質はDNA結合を強化し、ポリメラーゼとエキソヌクレアーゼの活性を刺激し、プロセッシブDNA合成を促進する。[7] [8] [9]
触媒活性
デオキシヌクレオシド三リン酸+ DNA(n) =二リン酸 + DNA(n+1) [8] [9]
臨床的意義
POLG2の変異は、ミトコンドリアDNAの欠失を伴う進行性外眼筋麻痺と関連している。この疾患は、眼筋と上眼瞼挙筋の進行性衰弱を引き起こし、患者は骨格筋症、筋生検でみられる赤色ぼろぼろ線維と萎縮、白内障、難聴、感覚軸索ニューロパチー、運動失調、うつ病、性腺機能低下症、パーキンソン病を呈することもある。この多系統疾患は、DNAポリメラーゼγサブユニットを破壊するG451E変異に関連している。[8] [9] [10]
慢性C型肝炎患者のうち、DDX5マイナーアレルまたはDDX5-POLG2ハプロタイプを持つ人は進行性線維症のリスクが高いと考えられています。ただし、 CPT1Aマイナーアレルを持つ人はリスクが低いと考えられていることに注意することが重要です。 [11]
インタラクション
POLG2には、19の共複合体相互作用を含む39の二元タンパク質間相互作用があることが示されています。POLG2はPOLGと相互作用するようです。[12]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000256525 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020718 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Wang Y、Farr CL 、 Kaguni LS (1997 年 5 月)。「ショウジョウバエ胚のミトコンドリア DNA ポリメラーゼの補助サブユニット。クローニング、分子分析、および天然酵素との関連」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 21): 13640–6。doi : 10.1074/ jbc.272.21.13640。PMID 9153213 。
- ^ Lim SE、Longley MJ、Copeland WC (1999 年 12 月)。「ヒト DNA ポリメラーゼ ガンマのミトコンドリア p55 補助サブユニットは DNA 結合を強化し、DNA 合成を促進し、N-エチルマレイミド耐性を付与する」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 53): 38197–203。doi : 10.1074/ jbc.274.53.38197。PMID 10608893。
- ^ abc 「Entrez Gene: POLG2 ポリメラーゼ (DNA 指向)、ガンマ 2、アクセサリ サブユニット」。
この記事には、パブリック ドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています。
- ^ abcd 「POLG2 - DNAポリメラーゼサブユニットガンマ-2、ミトコンドリア前駆体 - Homo sapiens（ヒト） - POLG2遺伝子とタンパク質」。www.uniprot.org 。 2018年8月31日閲覧。 この記事には、CC BY 4.0 ライセンスに基づいて利用可能なテキストが組み込まれています。
- ^ abcd 「UniProt: ユニバーサルタンパク質知識ベース」。核酸研究。45 (D1): D158–D169。2017年1月。doi : 10.1093 / nar/gkw1099。PMC 5210571。PMID 27899622 。
- ^ Longley MJ、Clark S、Yu Wai Man C、Hudson G、Durham SE、Taylor RW、Nightingale S、Turnbull DM、Copeland WC、Chinnery PF (2006 年 6 月)。「変異 POLG2 は DNA ポリメラーゼのガンマサブユニットを破壊し、進行性外眼筋麻痺を引き起こす」。American Journal of Human Genetics。78 ( 6 ): 1026–34。doi :10.1086/504303。PMC 1474082。PMID 16685652。
- ^ Huang H、Shiffman ML、Cheung RC、Layden TJ、Friedman S、Abar OT、Yee L、Chokkalingam AP、Schrodi SJ、Chan J、Catanese JJ、Leong DU、Ross D、Hu X、Monto A、McAllister LB、Broder S、White T、Sninsky JJ、Wright TL (2006 年 5 月)。「慢性 C 型肝炎患者の進行性線維症のリスクに関連する 2 つの遺伝子変異の特定」。消化 器病学。130 (6): 1679–87。doi : 10.1053/ j.gastro.2006.02.032。PMID 16697732。
- ^ 「検索語 POLG2 で 39 個のバイナリ相互作用が見つかりました」。IntAct . EMBL-EBI . 2019 年 9 月 4 日閲覧。
さらに読む
- Michiels S、Danoy P、Dessen P、Bera A、Boulet T、Bouchardy C、Lathrop M、Sarasin A、Benhamou S (2007 年 8 月)。「62 個の DNA 修復遺伝子における多型の発見と、肺がんおよび頭頸部がんのリスクとのハプロタイプの関連性」。発がん性。28 ( 8 ): 1731–9。doi : 10.1093/carcin/bgm111。PMID 17494052 。
- Huang H、Shiffman ML、Cheung RC、Layden TJ、Friedman S、Abar OT、Yee L、Chokkalingam AP、Schrodi SJ、Chan J、Catanese JJ、Leong DU、Ross D、Hu X、Monto A、McAllister LB、Broder S、White T、Sninsky JJ、Wright TL (2006 年 5 月)。「慢性 C 型肝炎患者の進行性線維症のリスクに関連する 2 つの遺伝子変異の特定」。消化器病学。130 ( 6 ) : 1679–87。doi : 10.1053/j.gastro.2006.02.032。PMID 16697732。
- Longley MJ、Clark S、Yu Wai Man C、Hudson G、Durham SE、Taylor RW、Nightingale S、Turnbull DM、Copeland WC、Chinnery PF (2006 年 6 月)。「変異 POLG2 は DNA ポリメラーゼのガンマサブユニットを破壊し、進行性外眼筋麻痺を引き起こす」。American Journal of Human Genetics。78 ( 6 ): 1026–34。doi :10.1086/504303。PMC 1474082。PMID 16685652。
- Yakubovskaya E、Chen Z、Carrodeguas JA、Kisker C 、 Bogenhagen DF (2006 年 1 月)。「機能的なヒトミトコンドリア DNA ポリメラーゼ ガンマはヘテロ三量体を形成する」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 1): 374–82。doi : 10.1074/ jbc.M509730200。PMID 16263719。
- Carrodeguas JA、Pinz KG 、Bogenhagen DF (2002 年 12 月)。「ヒト pol gammaB の DNA 結合特性」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 51): 50008–14。doi : 10.1074/jbc.M207030200。PMID 12379656。
- Johnson AA、Tsai Y、 Graves SW、Johnson KA (2000 年 2 月)。「ヒトミトコンドリア DNA ポリメラーゼホロ酵素: 再構成と特性評価」。生化学。39 ( 7): 1702–8。doi :10.1021/bi992104w。PMID 10677218 。
- Carrodeguas JA、Bogenhagen DF (2000 年 3 月)。「原核生物のアミノアシル tRNA 合成酵素で保存されているタンパク質配列は、ヒトミトコンドリア DNA ポリメラーゼのプロセシビティ因子の活性にとって重要である」。核酸 研究。28 ( 5): 1237–44。doi :10.1093 / nar /28.5.1237。PMC 102604。PMID 10666468。
- Lim SE、Longley MJ、Copeland WC (1999 年 12 月)。「ヒト DNA ポリメラーゼ ガンマのミトコンドリア p55 補助サブユニットは DNA 結合を強化し、プロセッシブ DNA 合成を促進し、N-エチルマレイミド耐性を付与する」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 53): 38197–203。doi : 10.1074/ jbc.274.53.38197。PMID 10608893。