ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
インド 識別子 エイリアス NDUFA13 、B16.6、CDA016、GRIM-19、GRIM19、CGI-39、NADH:ユビキノン酸化還元酵素サブユニットA13、MC1DN28 外部ID オミム :609435; MGI : 1914434; ホモロジーン :41083; ジーンカード :NDUFA13; OMA :NDUFA13 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 染色体8(マウス) [2] バンド 8|8 B3.3 始める 70,346,830 bp [2] 終わり 70,355,208 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 心の頂点 左心室 右耳介 右精巣 被殻 左精巣 前頭前皮質 尾状核 側坐核 ブロードマン領域9
トップの表現 心室中隔 第四脳室脈絡叢 右腎臓 近位尿細管 腓腹筋 左心室 ヒラメ筋 大腿四頭筋 胸郭横隔膜 前脛骨筋
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
NADH脱水素酵素(ユビキノン)活性
タンパク質結合
ATP結合
NADH脱水素酵素活性
細胞成分
細胞質
膜の不可欠な構成要素
ミトコンドリア膜
膜
核質
ミトコンドリア
ミトコンドリアレスピラソーム
ミトコンドリア内膜
レスピラソーム
核
ミトコンドリア呼吸鎖複合体I
生物学的プロセス
レチノイン酸に対する細胞反応
ミトコンドリア内膜へのタンパク質挿入
タンパク質分解過程の正の調節
インターフェロンベータに対する細胞反応
内因性アポトーシスシグナル伝達経路の負の調節
活性酸素種の代謝プロセス
ペプチダーゼ活性の正の調節
アポトーシス過程に関与するシステイン型エンドペプチダーゼ活性の正の調節
細胞増殖の抑制
アポトーシスシグナル伝達経路
転写の負の調節、DNAテンプレート
アポトーシスの過程
外因性アポトーシスシグナル伝達経路
ミトコンドリア呼吸鎖複合体Iの組み立て
ミトコンドリア電子伝達、NADHからユビキノン
出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
NADH 脱水素酵素 [ユビキノン] 1 アルファサブ複合体サブユニット 13は、ヒトでは NDUFA13 遺伝子 によってコードされる 酵素 です 。 [5] [6] [7] [8] NDUFA13 タンパク質は、 ミトコンドリア内膜 に位置し、 電子伝達系 の 5 つの複合体の中で最大の NADH 脱水素酵素 (ユビキノン) のサブユニットです 。 [9] [10]
構造
NDUFA13遺伝子は、 19番染色体 のp腕の 13.2番の位置にあり、11,995塩基対に及んでいます。 [8]この遺伝子は、144個の アミノ酸 からなる17 kDaのタンパク質を生成します 。 [11] [12] NDUFA13は、呼吸複合体の中で最大の酵素であるNADH脱水素酵素 (ユビキノン) のサブユニットです。構造はL字型で、長い 疎水性膜 貫通 ドメインと、 すべての既知の酸化還元中心とNADH結合部位を含む末梢腕の 親水性ドメインを持っています。 [9] N末端疎水性ドメインは、 ミトコンドリア 内膜にまたがる αヘリックス に折り畳まれる可能性があり 、 C末端 親水性ドメインは複合体Iの球状サブユニットと相互作用すること が指摘されている。高度に 保存された 2つのドメイン構造は、この特徴がタンパク質機能にとって重要であり、疎水性ドメインはミトコンドリア内膜で NADH脱水素酵素(ユビキノン) 複合体のアンカーとして機能することを示唆している。NDUFA13は、複合体Iの膜貫通領域を形成する約31の疎水性サブユニットの1つですが、触媒に関与していないと考えられている補助サブユニットです。 [13] 予測される 二次構造は 主にαヘリックスですが、タンパク質のカルボキシ末端半分はコイルドコイル形態を採用する可能性が高いです。アミノ末端部分には、ミトコンドリアの輸入シグナルとして機能する可能性のある疎水性アミノ酸を豊富に含む推定βシートが含まれています。 [8] [10] [14]
関数
ヒトのNDUFA13遺伝子は、 呼吸鎖 の 複合体Iのサブユニットをコードしており、電子を NADH から ユビキノン に伝達します 。 [8] NADHは 複合体Iに結合し、2つの電子を フラビンモノヌクレオチド (FMN)義手 の イソアロキサジン環に伝達してFMNH 2 を形成します。電子は義手の一連の 鉄硫黄(Fe-S)クラスターを介して伝達され、最終的にコエンザイムQ10(CoQ)に伝達され、 ユビキノール (CoQH 2 )に還元されます。電子の流れによりタンパク質の酸化還元状態が変化し、イオン化側鎖の構造変化とp K シフトが起こり 、ミトコンドリアマトリックスから4つの水素イオンが排出されます。 [9]
NDUFA13は細胞死制御タンパク質である GRIM-19 として知られる相同タンパク質を持っています。これは インターフェロン /オールトランスレチノイン酸(IFN/RA)誘導細胞死に関与しています。この形態の アポトーシス活性は ウイルス IRF1 との相互作用によって阻害されます。GRIM-19は シグナル伝達および転写活性化因子3 (STAT3)標的遺伝子の転写活性 化を 阻害しますが、他のSTATファミリーメンバーの転写活性化は阻害しません。 [13]
臨床的意義
NDUFA13 の相同タンパク質である GRIM-19 は、 腸上皮の慢性炎症を特徴とする 炎症性腸疾患(IBD) である クローン病 (CD)に関与している可能性があります。これらの疾患の患者の炎症を起こした粘膜では、GRIM-19 の発現が低下しています。 ヌクレオチド結合オリゴマー化ドメイン含有タンパク質 2 (NOD2) は、カスパーゼ リクルートメント ドメイン含有タンパク質 15 (CARD15) または炎症性腸疾患タンパク質 1 (IBD1) としても知られ、哺乳類の細胞質病原体認識分子として機能し、細胞内侵入細菌の生存を制限することで抗菌の役割を果たします。GRIM-19 は、微生物に対する腸上皮細胞の応答を調節することで、CARD15 を介した自然粘膜応答における下流の抗菌エフェクターとして機能します。 NOD2を介した細菌ムラミルジペプチドの認識に続いて、GRIM-19は 感染に対する免疫応答を制御する上で重要な要素である NF-κBの 活性化に必要である。 [13] [15]
インタラクション
NDUFA13はSTAT3 と 相互作用する ことが示されている 。 [16]
参考文献
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さらに読む
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