ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
インド 識別子 エイリアス NDUFA10 、CI-42KD、CI-42k、NADH:ユビキノン酸化還元酵素サブユニットA10、MC1DN22 外部ID オミム ：603835; MGI : 1914523; ホモロジーン : 15342; ジーンカード ：NDUFA10; OMA :NDUFA10 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体1（マウス） [2] バンド 1|1 D 始める 92,366,732 bp [2] 終わり 92,401,582 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 心の頂点 左心室 右耳介 横行結腸粘膜 右心室 右副腎 左副腎 左副腎皮質 右副腎皮質 直腸
トップの表現 右心室 二腹筋 胸鎖乳突筋 上腕三頭筋 側頭筋 右腎臓 太ももの筋肉 外側広筋 顔面運動核 脊髄前角
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分
ミトコンドリア内膜 髄鞘 ミトコンドリアマトリックス レスピラソーム ミトコンドリア ミトコンドリア呼吸鎖複合体I 細胞質 生物学的プロセス
ミトコンドリア電子伝達、NADHからユビキノン ミトコンドリア呼吸鎖複合体Iの組み立て 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_004544 NM_001322019 NM_001322020
RefSeq (タンパク質) NP_001308948 NP_001308949 NP_004535
場所 (UCSC) 2 章: 239.89 – 240.03 Mb 1 章: 92.37 – 92.4 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
NADH 脱水素酵素 [ユビキノン] 1 アルファサブ複合体サブユニット 10は、ヒトでは NDUFA10 遺伝子 によってコードされる 酵素 です 。 [5] [6] NDUFA10 タンパク質は、 ミトコンドリア内膜 に位置し、 電子伝達系 の 5 つの複合体の中で最大の NADH 脱水素酵素 (ユビキノン) のサブユニットです。 [7] [8] 複合体 I としても知られる NADH 脱水素酵素 (ユビキノン) のサブユニットの変異は、 リー症候群 などの複雑な神経変性疾患を引き起こすことがよくあります 。 [5]さらに、 FOXM1 を介した過剰メチル化による NDUFA10 発現レベルの低下は、ヒトの 扁平上皮癌 と関連しており 、他の種類の癌とも関連している可能性があります。 [9]
構造 NDUFA10遺伝子は、染色体2 のq腕の 37.3番に位置し、68,031塩基対に及びます。 [5]この遺伝子は、355個の アミノ酸 からなる41 kDaのタンパク質を生成します 。 [10] [11] NDUFA10は、呼吸複合体の中で最大の酵素である NADH脱水素 酵素（ユビキノン）のサブユニットです 。構造はL字型で、長い 疎水性 膜貫通 ドメインと、 すべての既知の酸化還元中心とNADH結合部位を含む末梢腕の 親水性ドメインを持っています。 [7] N末端疎水性ドメインは、 ミトコンドリア 内膜にまたがる αヘリックス に折り畳まれる可能性があり 、 C末端 親水性ドメインは複合体Iの球状サブユニットと相互作用すること が指摘されている。高度に 保存された 2つのドメイン構造は、この特徴がタンパク質機能にとって重要であり、疎水性ドメインはミトコンドリア内膜で NADH脱水素酵素（ユビキノン） 複合体のアンカーとして機能することを示唆している。NDUFA10は、複合体Iの膜貫通領域を形成する約31の疎水性サブユニットの1つですが、触媒に関与していないと考えられている補助サブユニットです。 [12] 予測される 二次構造は 主にαヘリックスですが、タンパク質のカルボキシ末端半分はコイルドコイル形態を採用する可能性が高いです。アミノ末端部分には、ミトコンドリアの輸入シグナルとして機能する可能性のある疎水性アミノ酸を豊富に含む推定βシートが含まれています。 [5] [8] [13]
関数 ヒトのNDUFA10遺伝子は、 呼吸鎖 の 複合体Iのサブユニットをコードしており、電子を NADH から ユビキノン に伝達します 。 [5] NADHは 複合体Iに結合し、2つの電子を フラビンモノヌクレオチド （FMN）義手 の イソアロキサジン環に伝達してFMNH 2 を形成します。電子は義手の 一連の 鉄硫黄（Fe-S）クラスターを介して伝達され、最終的に コエンザイムQ10 （CoQ）に伝達され、 ユビキノール （CoQH 2 ）に還元されます。電子の流れによりタンパク質の酸化還元状態が変化し、イオン化側鎖の構造変化とp K シフトが起こり、 ミトコンドリアマトリックス から4つの水素イオンが排出されます 。 [7]
臨床的意義 NDUFA10は、 FOXM1 誘導性高メチル化 により、ヒト 扁平上皮癌 においてmRNA発現レベルが著しく低下していることが実証されている 。FOXM1は、ヒトのあらゆる癌種に関与していることが知られている癌遺伝子である。 プロモーター高メチル化などを通じて 腫瘍抑制遺伝子を阻害することで作用する。 [9] NDUFA10 の変異は、複合体I欠損に起因する リー病 とも関連している 。 [14]
インタラクション NDUFA10には56の二元タンパク質間相互作用 があり、そのうち55は共複合体相互作用で あることが示されています。NDUFA10は RAB8A と相互作用するようです。 [15]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000130414 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026260 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ abcde 「Entrez Gene: NDUFA10 NADH 脱水素酵素 (ユビキノン) 1 アルファ サブ複合体、10」。 ^ Loeffen JL、Triepels RH、van den Heuvel LP、Schuelke M、Buskens CA、Smeets RJ、Trijbels JM、Smeitink JA (1998 年 12 月)。 「NADH の 8 つの核コード サブユニットの cDNA: ユビキノン酸化還元酵素: ヒト複合体 I cDNA の特徴付けが完了しました。」 生化学および生物物理学研究コミュニケーション 。 253 (2): 415-22。 土井 ：10.1006/bbrc.1998.9786。 PMID 9878551。 ^ abc Voet D 、 Voet JG 、 Pratt CW (2013)。「第18章」。 生化学の基礎：分子レベルでの生命 （第4版）。ホーボーケン、ニュージャージー：ワイリー。pp. 581–620。ISBN 978-0-470-54784-7 。 ^ ab Emahazion T、Beskow A、Gyllensten U、Brookes AJ (1998 年 11 月)。「ヒト電子伝達鎖の 15 個の複合体 I 遺伝子のイントロンベースの放射線ハイブリッドマッピング」。 細胞 遺伝 学 と細胞遺伝学 。82 (1–2): 115–9。doi : 10.1159/000015082。PMID 9763677。S2CID 46818955。 ^ ab Teh MT、Gemenetzidis E、Patel D、Tariq R、Nadir A、Bahta AW、Waseem A、Hutchison IL (2012)。「FOXM1 は頭頸部扁平上皮癌において癌エピゲノムを模倣するグローバルメチル化シグネチャを誘導する」。PLOS ONE。7 ( 3 ) : e34329。Bibcode : 2012PLoSO ...734329T。doi : 10.1371 /journal.pone.0034329。PMC 3312909。PMID 22461910 。 ^ Zong NC、Li H、Li H、Lam MP、Jimenez RC、Kim CS、Deng N、Kim AK、Choi JH、Zelaya I、Liem D、Meyer D、Odeberg J、Fang C、Lu HJ、Xu T、Weiss J、Duan H、Uhlen M、Yates JR、Apweiler R、Ge J、Hermjakob H、Ping P (2013 年 10 月)。「専門的な知識ベースによる心臓プロテオーム生物学と医学の統合」。Circulation Research。113 ( 9 ) : 1043–53。doi : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151。PMC 4076475。PMID 23965338 。 ^ 「NDUFA10 - NADH 脱水素酵素 [ユビキノン] 1 アルファ サブ複合体 サブユニット 10」。 心臓オルガネラ タンパク質 アトラス ナレッジベース (COPaKB) 。 ^ 「NDUFA10 - NADH 脱水素酵素 [ユビキノン] 1 アルファサブ複合体サブユニット 10」。UniProt.org。UniProt コンソーシアム 。 ^ Ton C、Hwang DM、Dempsey AA、Liew CC (1997 年 12 月)。「5 つのヒト NADH-ユビキノン酸化還元酵素サブユニットの同定と一次構造」。 生化学 および生物物理学的研究通信 。241 (2): 589–94。doi : 10.1006/bbrc.1997.7707。PMID 9425316 。 ^ Hoefs SJ、van Spronsen FJ、Lenssen EW、Nijtmans LG、Rodenburg RJ、Smeitink JA、van den Heuvel LP (2011 年 3 月)。 「NDUFA10 変異はリー病患者に複合体 I 欠損症を引き起こす」。 欧州人類遺伝学ジャーナル 。 19 (3): 270-4。 土井 ：10.1038/ejhg.2010.204。 PMC 3061993 。 PMID 21150889。 ^ 「検索語 NDUFA10 で 56 個のバイナリ相互作用が見つかりました」。IntAct 分子相互作用データベース 。EMBL-EBI。2018 年 8 月 25 日 閲覧 。
さらに読む
Smeitink J、van den Heuvel L (1999 年 6 月)。「健康と疾患における ヒト ミトコンドリア複合体 I」。American Journal of Human Genetics。64 ( 6): 1505–10。doi :10.1086/302432。PMC 1377894。PMID 10330338 。 Ma J、Dempsey AA、Stamatiou D、Marshall KW、Liew CC (2007 年 3 月)。「ヒト被験者の血漿脂質レベルに関連する白血球遺伝子発現パターンの特定」。 アテローム 性動脈硬化症 。191 (1): 63–72。doi :10.1016/ j.atherosclerosis.2006.05.032。PMID 16806233 。 Gevaert K、Goethals M、Martens L、Van Damme J、Staes A、Thomas GR、Vandekerckhove J (2003 年 5 月)。「分類された N 末端ペプチドの質量分析によるプロテオームの探索とタンパク質処理の分析」。Nature Biotechnology。21 ( 5 ) : 566–9。doi : 10.1038/nbt810。PMID 12665801。S2CID 23783563。
この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
