ヒトに見られる核受容体タンパク質
| NR1H3 |
|---|
 |
| 利用可能な構造 |
|---|
| ＰＤＢ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
| PDB IDコードのリスト |
|---|
1UHL、3IPQ、3IPS、3IPU、5AVI、5AVL、5HJS |
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | NR1H3、LXR-a、LXRA、RLD-1、肝臓X受容体α、核受容体サブファミリー1グループHメンバー3 |
|---|
| 外部ID | オミム：602423; MGI : 1352462;ホモロジーン: 21165;ジーンカード：NR1H3; OMA :NR1H3 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置（マウス） |
|---|
 | | クロ。 | 染色体2（マウス）[2] |
|---|
| | バンド | 2 E1|2 50.52 cM | 始める | 91,014,406 bp [2] |
|---|
| 終わり | 91,033,179 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
|---|
| トップの表現 | - 肝臓の右葉
- 横行結腸粘膜
- 脾臓
- 脛骨神経
- 皮下脂肪組織
- 子宮頸管
- 胆嚢
- リンパ節
- 甲状腺の右葉
- 右副腎皮質
|
| | トップの表現 | - 右腎臓
- 肝臓の左葉
- 回腸上皮
- 太ももの筋肉
- 乳腺
- 近位尿細管
- 褐色脂肪組織
- 白色脂肪組織
- 皮下脂肪組織
- 十二指腸
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- コレステロール結合
- タンパク質結合
- 亜鉛イオン結合
- 核受容体活性
- ステロール応答要素結合
- ステロイドホルモン受容体活性
- DNA結合
- 配列特異的DNA結合
- 金属イオン結合
- DNA結合転写因子活性
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- 転写活性化因子活性
- 転写シス調節領域結合
- RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合
- 転写因子結合
- 核受容体コアクチベーター活性
- シグナル伝達受容体の活性
| | 細胞成分 |
- 受容体複合体
- 核質
- RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体
- 核
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- Toll様受容体4シグナル伝達経路の正の調節
- ステロール恒常性
- 膵液分泌の抑制
- 炎症反応の抑制
- リポ多糖に対する細胞反応
- 脂質輸送の負の調節
- リポタンパク質リパーゼ活性の正の調節
- 脂質恒常性
- トリグリセリド恒常性
- マクロファージ活性化の負の調節
- マクロファージ由来泡状細胞分化の負の制御
- コレステロール輸送の正の調節
- コレステロール貯蔵の負の調節
- 転写の調節、DNAテンプレート
- トリグリセリド生合成過程の正の調節
- コレステロール排出の積極的な調節
- タンパク質代謝プロセスの正の調節
- インターフェロン-γを介したシグナル伝達経路の負の調節
- 概日リズムの調節
- 転写、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- プロゲステロンに対する反応
- ステロイドホルモンを介したシグナル伝達経路
- アポトーシス細胞の除去
- 脂肪酸生合成過程の正の調節
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- リソソーム酵素の分泌の抑制
- 飲作用の負の調節
- 転写の正の制御、DNAテンプレート
- 細胞内受容体シグナル伝達経路
- コレステロール恒常性
- 脂質代謝
- 多細胞生物の発達
- 細胞分化
- 寒冷誘発性熱産生の負の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | |
|---|
NM_001130101
NM_001130102
NM_001251934
NM_001251935
NM_005693 |
| |
|---|
NM_001177730
NM_013839
NM_001355279 |
|
|---|
| RefSeq (タンパク質) | NP_001123573
NP_001123574
NP_001238863
NP_001238864
NP_005684
|
|---|
NP_001350524
NP_005684.2 |
| |
|---|
NP_001171201
NP_038867
NP_001342208 |
|
|---|
| 場所 (UCSC) | 11 章: 47.25 – 47.27 Mb | 2 章: 91.01 – 91.03 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
肝臓X受容体α（LXR-α）は、ヒトではNR1H3遺伝子（核受容体サブファミリー1、グループH、メンバー3）によってコードされる核受容体タンパク質である。[5] [6]
表現
miRNA hsa-miR-613は、LXRα 3'非翻訳領域内の特定のmiRNA応答要素（613MRE）を介して内因性LXRαを標的とし、ヒトLXRα遺伝子を自己制御する。LXRαは、miRNA has-miR-613をアップレギュレーションするSREBP1cの誘導を介して自身の抑制を自己制御する。[7]
関数
肝臓のX受容体であるLXRα（このタンパク質）とLXRβは、核受容体スーパーファミリーのサブファミリーを形成し、マクロファージ機能の重要な調節因子であり、脂質恒常性と炎症に関与する転写プログラムを制御します。さらに、これらは脱ヨウ素酵素を介して甲状腺ホルモンの局所活性化に重要な役割を果たします。[8]誘導性LXRαは、肝臓、副腎、腸、脂肪組織、マクロファージ、肺、腎臓で高度に発現していますが、LXRβは普遍的に発現しています。リガンド活性化LXRは、レチノイドX受容体（RXR）と必須ヘテロ二量体を形成し、LXR応答要素を含む標的遺伝子の発現を制御します。[9] [10]乾癬病変内でのLXR-α発現/機能の回復は、乾癬皮膚から無症状皮膚への移行を切り替えるのに役立つ可能性があります。[11]
インタラクション
肝臓X受容体αはEDF1 [12]および小さなヘテロ二量体パートナーと相互作用することが示されている。[13] LXRαは転写因子SREBP-1cを活性化し、脂肪生成を引き起こす。[14]
多発性硬化症との関連
2016年の研究では、まれな急速進行性多発性硬化症を患う2つの家族の70%にNR1H3の変異が認められました。[15]しかし、国際多発性硬化症遺伝学コンソーシアムが13倍のサンプルサイズで行った分析では、問題の変異（p.Arg415Gln）が多発性硬化症に関連しているという証拠は見つからず、これらの研究結果は否定されました。[16]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000025434 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000002108 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Miyata KS、McCaw SE、Patel HV、Rachubinski RA、Capone JP (1996 年 4 月)。「オーファン核ホルモン受容体 LXR アルファはペルオキシソーム増殖因子活性化受容体と相互作用し、ペルオキシソーム増殖因子シグナル伝達を阻害する」。The Journal of Biological Chemistry . 271 (16): 9189–92. doi : 10.1074/jbc.271.16.9189 . PMID 8621574。
- ^ Willy PJ、Umesono K、Ong ES 、 Evans RM、Heyman RA、Mangelsdorf DJ (1995 年 5 月)。「LXR は、明確なレチノイド応答経路を定義する核受容体です」。遺伝子と発達。9 (9): 1033–45。doi : 10.1101/gad.9.9.1033。PMID 7744246 。
- ^ http://mend.endojournals.org/content/25/4/584.abstract [リンク切れ ]
- ^ Christoffolete MA, Doleschall M, Egri P, Liposits Z, Zavacki AM, Bianco AC, et al. (2010). 「肝臓X受容体/レチノイドX受容体経路による甲状腺ホルモン活性化の調節」The Journal of Endocrinology . 205 (2): 179–86. doi :10.1677/JOE-09-0448. PMC 3133926 . PMID 20176747.
- ^ Korf H, Vander Beken S, Romano M, Steffensen KR, Stijlemans B, Gustafsson JA, et al. (2009年6月). 「肝臓X受容体はマウスの結核菌に対する防御免疫反応に寄与する」. The Journal of Clinical Investigation . 119 (6): 1626–37. doi :10.1172/JCI35288. PMC 2689129. PMID 19436111 .
- ^ 「Entrez遺伝子：核受容体サブファミリー1」。
- ^ Gupta DS、Kaul D、 Kanwar AJ、Parsad D (2010年1月)。「乾癬：LXR-alpha RNomicsの重要な役割」。 遺伝子と免疫。11 (1): 37–44。doi ：10.1038/gene.2009.63。PMID 19798078。
- ^ Brendel C, Gelman L, Auwerx J (2002年6月). 「多タンパク質架橋因子-1 (MBF-1) は脂質代謝を制御する核受容体の補因子である」.分子内分泌学. 16 (6): 1367–77. doi : 10.1210/mend.16.6.0843 . PMID 12040021.
- ^ Brendel C, Schoonjans K, Botrugno OA, Treuter E, Auwerx J (2002年9月). 「小さなヘテロ二量体パートナーは肝臓X受容体αと相互作用し、その転写活性を抑制する」.分子内分泌学. 16 (9): 2065–76. doi : 10.1210/me.2001-0194 . PMID 12198243.
- ^ Wang MY, Chen L, Clark GO, Lee Y, Stevens RD, Ilkayeva OR, et al. (2010). 「インスリン欠乏型I型糖尿病におけるレプチン療法」。米国科学 アカデミー紀要。107 (11): 4813–9。Bibcode : 2010PNAS..107.4813W。doi : 10.1073 / pnas.0909422107。PMC 2841945。PMID 20194735。
- ^ Wang Z, Sadovnick AD, Traboulsee AL, Ross JP, Bernales CQ, Encarnacion M, et al. (2016). 「家族性多発性硬化症における核内受容体NR1H3」。Neuron . 90 (5): 948–54. doi :10.1016/j.neuron.2016.04.039. PMC 5092154 . PMID 27253448.
- ^ Antel J, Ban M, Baranzini S, Barcellos L, Barizzone N, Beecham A, et al. (国際多発性硬化症遺伝学コンソーシアム) (2016 年 10 月). 「NR1H3 p.Arg415Gln は多発性硬化症のリスクとは関連がない」. Neuron . 92 (2): 333–335. doi :10.1016/j.neuron.2016.09.052. PMC 5641967. PMID 27764667 .
さらに読む
- Lehmann JM、Kliewer SA、Moore LB、Smith-Oliver TA、Oliver BB、Su JL、他 (1997 年 2 月)。「オキシステロールによる核受容体 LXR の活性化が新しいホルモン応答経路を定義する」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 6): 3137–40。doi : 10.1074/jbc.272.6.3137。PMID 9013544。
- Auboeuf D、Rieusset J、Fajas L、Vallier P、Frering V、Riou JP、他 (1997 年 8 月)。「ヒトにおけるペルオキシソーム増殖因子活性化受容体および肝臓 X 受容体アルファの mRNA 発現の組織分布と定量: 肥満および NIDDM 患者の脂肪組織では変化なし」。糖尿病。46 ( 8 ) : 1319–27。doi :10.2337/diabetes.46.8.1319。PMID 9231657 。
- Peet DJ、Turley SD、Ma W、Janowski BA、Lobaccaro JM、Hammer RE、他 (1998 年 5 月)。「核オキシステロール受容体 LXR アルファを欠くマウスではコレステロールと胆汁酸の代謝が損なわれる」。Cell . 93 ( 5): 693–704. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81432-4 . PMID 9630215. S2CID 5856580。
- Miyata KS、McCaw SE、Meertens LM、Patel HV、Rachubinski RA、Capone JP (1998 年 11 月)。「受容体相互作用タンパク質 140 は、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体アルファおよび肝臓 X 受容体アルファと相互作用し、それらの転写活性化を阻害する」。分子細胞内分泌学。146 (1–2): 69–76。doi :10.1016/S0303-7207(98) 00196-8。PMID 10022764。S2CID 53253694 。
- Venkateswaran A、Laffitte BA、Joseph SB、Mak PA、Wilpitz DC、Edwards PA、他 (2000 年 10 月)。「核オキシステロール受容体 LXR アルファによる細胞コレステロール流出の制御」。米国科学アカデミー紀要。97 ( 22 ) : 12097–102。Bibcode : 2000PNAS ... 9712097V。doi : 10.1073/ pnas.200367697。PMC 17300。PMID 11035776 。
- Chinetti G、Lestavel S、Bocher V、Remaley AT、Neve B、Torra IP、他 (2001 年 1 月)。「PPAR-α および PPAR-γ 活性化因子は、ABCA1 経路の刺激を通じてヒトマクロファージ泡状細胞からのコレステロール除去を誘導する」。Nature Medicine。7 ( 1 ) : 53–8。doi : 10.1038/83348。PMID 11135616。S2CID 20558311。
- Laffitte BA、Repa JJ、Joseph SB、Wilpitz DC、Kast HR、Mangelsdorf DJ、他 (2001 年 1 月)。「LXR はマクロファージと脂肪細胞におけるアポリポタンパク質 E 遺伝子の脂質誘導性発現を制御します」。米国科学アカデミー紀要。98 ( 2 ) : 507–12。doi : 10.1073 / pnas.021488798。PMC 14617。PMID 11149950。
- Li Y、Bolten C、Bhat BG、 Woodring -Dietz J、Li S、Prayaga SK、他 (2002 年 3 月)。「自己調節ループ機構によるヒト肝臓 X 受容体アルファ遺伝子発現の誘導」。分子 内分泌学。16 (3): 506–14。doi : 10.1210/mend.16.3.0789。PMID 11875109。
- Mak PA、Laffitte BA、Desrumaux C、Joseph SB、Curtiss LK、Mangelsdorf DJ、他 (2002 年 8 月)。「マウスおよびヒトのマクロファージにおけるアポリポタンパク質 E/CI/C-IV/C-II 遺伝子クラスターの調節発現。核肝臓 X 受容体アルファおよびベータの重要な役割」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 35): 31900–8。doi : 10.1074/ jbc.M202993200。PMID 12032151。
- Brendel C、Gelman L、Auwerx J (2002 年 6 月)。「多タンパク質架橋因子 1 (MBF-1) は、脂質代謝を制御する核受容体の補因子である」。 分子内分泌学。16 (6): 1367–77。doi : 10.1210/ mend.16.6.0843。PMID 12040021。
- Steffensen KR、Schuster GU、Parini P、Holter E、Sadek CM、Cassel T、他 (2002 年 5 月)。「CCAAT/エンハンサー結合タンパク質のアイソフォームによる LXRalpha プロモーター活性の異なる制御」。生化学および生物物理学的研究通信。293 (5): 1333–40。doi :10.1016/S0006-291X(02)00390-X。PMID 12054659 。
- Gbaguidi GF、Agellon LB (2002 年 7 月)。「ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体アルファと肝臓 X 受容体アルファの非定型相互作用は、マウスコレステロール 7α-ヒドロキシラーゼ遺伝子プロモーターに対するそれぞれのリガンドの刺激効果に拮抗する」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 脂質の分子および細胞生物学。1583 (2): 229–36。doi : 10.1016 /s1388-1981(02)00217-2。PMID 12117567 。
- Pawar A、Xu J、Jerks E、Mangelsdorf DJ、Jump DB (2002 年 10 月)。「HEK293 細胞における肝臓 X 受容体 (LXR) とペルオキシソーム増殖因子活性化受容体アルファ (PPARalpha) の脂肪酸調節」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 42): 39243–50。doi : 10.1074/ jbc.M206170200。PMID 12161442。
- Brendel C、Schoonjans K、Botrugno OA 、 Treuter E、Auwerx J (2002 年 9 月)。「小さなヘテロ二量体パートナーは肝臓 X 受容体アルファと相互作用し、その転写活性を抑制する」。分子 内分泌学。16 (9): 2065–76。doi : 10.1210/me.2001-0194。PMID 12198243。
- Oberkofler H、Schraml E、Krempler F、Patsch W (2003 年 4 月)。「ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマ共活性化因子 1 アルファによる肝臓 X 受容体転写活性の増強」。The Biochemical Journal。371 ( Pt 1 ): 89–96。doi :10.1042/ BJ20021665。PMC 1223253。PMID 12470296。
- Wang M、Thomas J、Burris TP、Schkeryantz J 、 Michael LF (2003 年 11 月)。「LXRalpha アゴニズムの分子決定因子」。Journal of Molecular Graphics & Modelling。22 ( 2): 173–81。doi : 10.1016 /S1093-3263(03)00159-1。PMID 12932788 。
- Fukuchi J, Song C, Ko AL, Liao S (2003 年 9 月)。「肝臓 X 受容体によるファルネシルピロリン酸合成酵素の転写制御」。ステロイド。68 ( 7–8 ) : 685–91。doi : 10.1016 /S0039-128X(03)00100-4。PMID 12957674。S2CID 6023862 。
外部リンク
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。
