ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
NR1H2 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1P8D、1PQ6、1PQ9、1PQC、1UPV、1UPW、3KFC、3L0E、4DK7、4DK8、4RAK、5HJP、4NQA、5I4V、%%s4NQA
識別子 エイリアス NR1H2 、LXR-b、LXRB、NER、NER-I、RIP15、UNR、肝臓X受容体ベータ、核受容体サブファミリー1グループHメンバー2 外部ID オミム ：600380; MGI : 1352463; ホモロジーン : 21397; ジーンカード ：NR1H2; OMA :NR1H2 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体7（マウス） [2] バンド 7|7 B3 始める 44,199,040 bp [2] 終わり 44,203,375 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 膝窩動脈 脛骨動脈 右冠動脈 胸部大動脈 左冠動脈 上行大動脈 胸部大動脈下行 胃粘膜 腓腹筋 太ももの筋肉
トップの表現 顆粒球 網膜の神経層 リップ 太ももの筋肉 右腎臓 上前頭回 十二指腸 胸腺 食道 心室帯
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 配列特異的DNA結合 DNA結合転写因子活性 ATPase結合 亜鉛イオン結合 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 金属イオン結合 レチノイドX受容体結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 ステロイドホルモン受容体活性 アポリポタンパク質AI受容体結合 核受容体活性 タンパク質結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 転写シス調節領域結合 RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合 転写因子結合 核受容体コアクチベーター活性 シグナル伝達受容体の活性 細胞成分
細胞質 核質 核 RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体 生物学的プロセス
高密度リポタンパク質粒子の集合の正の調節 タンパク質分解の負の調節 トリグリセリド生合成過程の正の調節 タンパク質代謝プロセスの正の調節 インターフェロンγを介したシグナル伝達経路の負の調節 コレステロール輸送の正の調節 転写の調節、DNAテンプレート 細胞脂質代謝プロセス RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 リソソーム酵素の分泌の正の調節 脂質貯蔵の正の調節 リポタンパク質リパーゼ活性の正の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 脂肪酸生合成過程の正の調節 遺伝子発現の負の調節 転写、DNAテンプレート 転写の正の制御、DNAテンプレート コレステロール貯蔵の負の調節 飲作用の負の調節 遺伝子発現の正の調節 レチノイン酸受容体シグナル伝達経路 コレステロール排出の積極的な調節 膵液分泌の正の調節 脂質恒常性 脂質輸送の負の調節 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始 転写の負の調節、DNAテンプレート マクロファージ由来泡状細胞分化の負の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 ステロイドホルモンを介したシグナル伝達経路 コレステロール恒常性 脂質代謝 多細胞生物の発達 細胞分化 リポ多糖に対する細胞反応 寒冷誘発性熱産生の負の調節 細胞内受容体シグナル伝達経路 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001285517 NM_001285518 NM_001285519 NM_009473
RefSeq (タンパク質) NP_001243576 NP_009052 NP_009052.3
NP_001272446 NP_001272447 NP_001272448 NP_033499
場所 (UCSC) 19章: 50.33 – 50.38 Mb 7 章: 44.2 – 44.2 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
肝臓X受容体β （ LXR-β ）は、 転写因子 の 核受容体 ファミリーのメンバーです。LXR-βは NR1H2 遺伝子（核受容体サブファミリー1、グループH、メンバー2） によってコードされています。 [5]
関数 肝臓 X受容体 （LXR）は 、もともとリガンドが不明であったため、核受容体スーパーファミリーの 孤立メンバーとして同定されました。ファミリーの他の受容体と同様に、LXRは レチノイドX受容体とヘテロ二量体を形成し、4ヌクレオチドで区切られた 直接反復 を特徴とする特異的 応答要素 （LXRE）に結合します 。2つの遺伝子、α（ LXRA ）とβがLXRタンパク質をコードすることが知られています。 [5] [6]
構造 ヒト肝臓X受容体β（LXRβ）の結晶構造は、その同族要素上のパートナーであるレチノイドX受容体α（RXRα）とヘテロ二量体を形成し、4nt間隔のAGGTCA直接反復配列は、DNA結合ドメインとリガンド結合ドメインが交差した拡張X字型配置を示しています。LXRβコアは、標準的な接触と、応答要素に対する親和性を高める補助的なDNA接触を介してDNAに結合します。 [7]
インタラクション 肝臓X受容体βはNCOA6 [8] および レチノイドX受容体α [9] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000131408 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000060601 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ ab 「Entrez遺伝子：NR1H2核受容体サブファミリー1、グループH、メンバー2」。 ^ Song C、Hiipakka RA、Kokontis JM、Liao S (1995 年 6 月)。「ユビキタス受容体: レチノイン酸および甲状腺ホルモン受容体の構造、免疫細胞化学的局在、および遺伝子活性化の調節」。Annals of the New York Academy of Sciences。761 (2): 38–49。Bibcode :1995NYASA.761...38S。doi :10.1111 / j.1749-6632.1995.tb31367.x。PMID 7625741。S2CID 27208069 。 ^ Lou X、Toresson G、Benod C、Suh JH、Philips KJ、Webb P、Gustafsson JA (2014 年 3 月)。「DNA 上のレチノイド X 受容体 α-肝臓 X 受容体 β (RXRα-LXRβ) ヘテロ二量体の構造」。Nature Structural & Molecular Biology 21 ( 3): 277–81。doi : 10.1038/nsmb.2778。PMID 24561505。S2CID 23226682。 ^ Lee SK、Jung SY、Kim YS、Na SY、Lee YC、Lee JW (2001 年 2 月)。「活性化シグナルコインテグレーター 2 の 2 つの異なる核受容体相互作用ドメインと CREB 結合タンパク質依存性トランス活性化機能」。 分子 内分泌 学 。15 (2): 241–54。doi : 10.1210/ mend.15.2.0595。PMID 11158331 。 ^ Seol W, Choi HS, Moore DD (1995年1月). 「レチノイドX受容体と特異的に相互作用するタンパク質の単離：2つの新規オーファン受容体」. 分子内分泌学 . 9 (1): 72–85. doi : 10.1210/mend.9.1.7760852 . PMID 7760852.
さらに読む
Seol W、Choi HS、 Moore DD (1995 年 1 月)。「レチノイド X 受容体と特異的に相互作用するタンパク質の分離: 2 つの新規オーファン受容体」。 分子 内分泌 学 。9 (1): 72–85。doi : 10.1210/mend.9.1.7760852。PMID 7760852 。 Le Beau MM、Song C、Davis EM、Hiipakka RA、Kokontis JM、Liao S (1995 年 3 月)。 「蛍光 in situ ハイブリダイゼーションを使用したヒトユビキタス受容体遺伝子 (UNR) の 19q13.3 への割り当て」。 ゲノミクス 。 26 (1): 166-8。 土井 ：10.1016/0888-7543(95)80100-Z。 PMID 7782080。 Shinar DM、Endo N、Rutledge SJ、Vogel R、Rodan GA、Schmidt A (1994 年 9 月)。「NER、ヒトステロイドホルモン核受容体をコードする遺伝子ファミリーの新しいメンバー」。Gene . 147 (2): 273–6. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94)90080-9. PMID 7926814。 Song C、Kokontis JM、 Hiipakka RA、Liao S (1994 年 11 月)。「ユビキタス受容体: レチノイン酸および甲状腺ホルモン受容体による遺伝子活性化を調節する受容体」。 米国 科学 アカデミー紀要 。91 (23): 10809–13。Bibcode : 1994PNAS ... 9110809S。doi : 10.1073/ pnas.91.23.10809。PMC 45115。PMID 7971966 。 Janowski BA、Grogan MJ、Jones SA、Wisely GB、Kliewer SA、Corey EJ、Mangelsdorf DJ (1999 年 1 月)。「オキシステロール肝臓 X 受容体 LXRalpha および LXRbeta のリガンドの構造要件」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。96 (1): 266–71。Bibcode : 1999PNAS ...96..266J。doi : 10.1073 / pnas.96.1.266。PMC 15128。PMID 9874807 。 Feltkamp D、Wiebel FF、Alberti S、Gustafsson JA (1999 年 4 月)。「核オーファン受容体OR1 の新しい DNA 結合部位の同定」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 15): 10421–9。doi : 10.1074 / jbc.274.15.10421。PMID 10187832 。 Lee SK、Jung SY、Kim YS、Na SY、Lee YC、Lee JW (2001 年 2 月)。「活性化シグナルコインテグレーター 2 の 2 つの異なる核受容体相互作用ドメインと CREB 結合タンパク質依存性トランス活性化機能」。 分子 内分泌学 。15 ( 2): 241–54。doi : 10.1210/ mend.15.2.0595。PMID 11158331 。 Whitney KD、Watson MA、Goodwin B、Galardi CM、Maglich JM、Wilson JG、Willson TM、Collins JL、Kliewer SA (2001 年 11 月)。「ヒトマクロファージにおける肝臓 X 受容体 (LXR) による LXRalpha 遺伝子の調節」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 47): 43509–15。doi : 10.1074/ jbc.M106155200。PMID 11546778 。 Whitney KD、Watson MA、Collins JL、Benson WG、Stone TM、Numerick MJ、Tippin TK、Wilson JG、Winegar DA、Kliewer SA (2002 年 6 月)。「中枢神経系における肝臓 X 受容体によるコレステロール恒常性の調節」。 分子 内分泌 学 。16 ( 6): 1378–85。doi : 10.1210/mend.16.6.0835。PMID 12040022 。 Brendel C、Schoonjans K、Botrugno OA 、 Treuter E、Auwerx J (2002 年 9 月)。「小さなヘテロ二量体パートナーは肝臓 X 受容体アルファと相互作用し、その転写活性を抑制する」。 分子 内分泌 学 。16 (9): 2065–76。doi : 10.1210/me.2001-0194。PMID 12198243 。 Mo J、 Fang SJ、Chen W、 Blobe GC (2002 年 12 月)。「核受容体 LXRbeta による ALK-1 シグナル伝達の調節」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 52): 50788–94。doi : 10.1074/jbc.M210376200。PMID 12393874 。 Williams S、Bledsoe RK、Collins JL、Boggs S、Lambert MH、Miller AB、Moore J、McKee DD、Moore L、Nichols J、Parks D、Watson M、Wisely B、Willson TM (2003 年 7 月)。「肝臓 X 受容体ベータリガンド結合ドメインの X 線結晶構造: ヒスチジン-トリプトファンスイッチによる制御」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 29): 27138–43。doi : 10.1074/ jbc.M302260200。PMID 12736258 。 Färnegårdh M、Bonn T、Sun S、Ljunggren J、Ahola H、Wilhelmsson A、Gustafsson JA、Carlquist M (2003 年 10 月)。「肝臓 X 受容体ベータの 3 次元構造は、根本的に異なるリガンドを収容できる柔軟なリガンド結合ポケットを明らかにしました」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 40): 38821–8。doi : 10.1074 / jbc.M304842200。PMID 12819202 。 Fukuchi J, Song C, Ko AL, Liao S (2003 年 9 月)。「肝臓 X 受容体によるファルネシルピロリン酸合成酵素の転写制御」。ステロイド。68 ( 7–8 ) : 685–91。doi : 10.1016 /S0039-128X(03)00100-4。PMID 12957674。S2CID 6023862 。 Hoerer S、Schmid A、Heckel A、 Budzinski RM、Nar H (2003 年 12 月)。「合成アゴニストと複合体を形成したヒト肝臓 X 受容体ベータリガンド結合ドメインの結晶構造」。Journal of Molecular Biology。334 ( 5): 853–61。doi :10.1016/ j.jmb.2003.10.033。PMID 14643652 。 Walczak R、Joseph SB、Laffitte BA、Castrillo A、Pei L、Tontonoz P (2004 年 3 月)。「マクロファージにおける血管内皮増殖因子遺伝子の転写は肝臓 X 受容体によって制御される」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 11): 9905–11。doi : 10.1074/ jbc.M310587200。PMID 14699103 。
この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
