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| KDM6B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | KDM6B、JMJD3、リジンデメチラーゼ6B、NEDCFSA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：611577; MGI : 2448492;ホモロジーン: 18945;ジーンカード：KDM6B; OMA :KDM6B - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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リジン脱メチル化酵素6Bは、ヒトではKDM6B（JMJD3）遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
分化中の制御
KDM6Bはマウス胚性幹細胞の心臓および内皮分化中に発現が増加することが判明した。[6]
小分子阻害
マクロファージにおける炎症誘発反応を調節するために、 KDM6ヒストン脱メチル化酵素ファミリーの十文字ドメインを阻害する小分子阻害剤（GSK-J1）が開発されている。[7]
病理学における役割
KDM6B遺伝子の変異は、粗い顔貌と軽度の遠位骨格異常を伴う神経発達障害を引き起こす可能性があり、これは2019年にストーラーマンらによって初めて報告された[8] 。
KDM6B 遺伝子変異の特定には、 標準的な実験室エクソーム配列解析を使用できます。
臨床像
2019年に行われたKDM6B変異による症状に関する 研究[8]では、以下の結果が報告されています。
- 言語および運動発達の遅れ
- 顔の輪郭が粗い、額が突出している、口が広い、耳が大きく突出している、顔が丸い、顎が突き出ている、内眼角質が目立つなどの異常な顔の特徴
- 筋骨格の特徴としては、手や指がやや広く厚くなり、関節可動性亢進、第5指の斜指症、および足指の合指症などがあります。
- 神経筋低緊張症
- 知的障害
- 自閉症スペクトラム障害
さらに2023年に行われた国際研究[9] では、（おそらく）病原性KDM6B変異を持つ個人における以下の臨床的特徴が報告された。
疫学
知的障害および/または発達遅延を報告する患者のうち、約 0.12% に KDM6B 遺伝子の de novo 変異が見られます。
関連する症状
歌舞伎症候群に関連するKDM6Aと KDM6B 変異体の患者に共通する表現型の特徴には、突出耳、異常な歯列、先天性心疾患、摂食障害、停留精巣、関節過可動性、発達遅延、筋緊張低下、行動障害などがあります。
進行中の研究
2022年に発表された研究によると、脳葉酸欠乏症の患者5名でKDM6Bの病的変異が発見された。[10]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000132510 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000018476 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: Lysine demethylase 6B」。2016年4月9日閲覧。
- ^ Boeckel JN、Derlet A、Glaser SF、Luczak A、Lucas T、Heumüller AW、他 (2016 年 7 月)。「JMJD8 は内皮細胞でピルビン酸キナーゼ M2 と相互作用して血管新生の発芽と細胞代謝を制御する」。 動脈硬化、血栓症、血管生物学。36 (7): 1425–1433。doi : 10.1161/ ATVBAHA.116.307695。PMID 27199445。
- ^ Kruidenier L, Chung CW, Cheng Z, Liddle J, Che K, Joberty G, et al. (2012年8月). 「選択的jumonji H3K27脱メチル化酵素阻害剤は炎症誘発性マクロファージ反応を調節する」. Nature . 488 (7411): 404–408. Bibcode :2012Natur.488..404K. doi :10.1038/nature11262. PMC 4691848. PMID 22842901 .
- ^ ab Stolerman ES、Francisco E、Stallworth JL、Jones JR、Monaghan KG、Keller-Ramey J、et al. (2019年7月)。「KDM6B遺伝子の遺伝子変異は神経発達遅延および異形性特徴と関連している」。American Journal of Medical Genetics。パートA。179（7）：1276–1286。doi ： 10.1002/ajmg.a.61173。PMID 31124279。S2CID 163167304 。
- ^ Rots D, Jakub TE, Keung C, Jackson A, Banka S, Pfundt R, et al. (2023年6月). 「KDM6B関連神経発達障害の臨床的および分子的スペクトル」. American Journal of Human Genetics . 110 (6): 963–978. doi :10.1016/j.ajhg.2023.04.008. PMC 10257005. PMID 37196654 .
- ^ ハン・X、カオ・X、カブレラRM、ピミエンタ・ラミレスPA、チャン・C、ラマカースVT、他。 （2022年12月）。 「KDM6B 変異体はヒト脳葉酸欠乏症の病態生理学に寄与する可能性がある」。生物学。12 (1): 74.土井: 10.3390/biology12010074。PMC 9855468。PMID 36671766。
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