ヒトのタンパク質コード遺伝子
| CSNK2B |
|---|
 |
| 利用可能な構造 |
|---|
| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
| PDB IDコードのリスト |
|---|
1DS5、1JWH、1QF8、3EED、4DGL、4MD7、4MD8、4MD9、4NH1、2R6M |
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | CSNK2B、CK2B、CK2N、CSK2B、G5A、カゼインキナーゼ2ベータ、Ckb2、Ckb1、POBINDS |
|---|
| 外部ID | オミム:115441; MGI : 88548;ホモロジーン: 55572;ジーンカード:CSNK2B; OMA :CSNK2B - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 17番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 17 B1|17 18.59 cM | 始める | 35,335,172 bp [2] |
|---|
| 終わり | 35,341,029 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 左精巣
- 右精巣
- 脚の皮膚
- 腹部の皮膚
- 神経節隆起
- 左卵巣
- 子宮内膜間質細胞
- 横行結腸粘膜
- 右卵巣
- 子宮頸管
|
| | トップの表現 | - 精子細胞
- 精細管
- 精母細胞
- リップ
- 心室帯
- 胚
- 食道
- 桑実胚
- 太ももの筋肉
- 体節
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- タンパク質ドメイン特異的結合
- 転写因子結合
- クロマチン結合
- 金属イオン結合
- タンパク質結合
- タンパク質キナーゼ調節活性
- 同一のタンパク質結合
- シグナル伝達受容体結合
- リボ核タンパク質複合体結合
- タンパク質セリン/スレオニンキナーゼ活性
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- PcGタンパク質複合体
- 細胞外エクソソーム
- 核質
- クロマチン
- 細胞外領域
- 核
- 細胞質
- 細胞膜
- 繊毛
- 核マトリックス
- 分泌顆粒腔
- 細胞投影
- フィコリン-1を多く含む顆粒腔
- タンパク質キナーゼCK2複合体
| | 生物学的プロセス |
- DNA結合の調節
- 血管内皮細胞遊走の抑制
- 内皮管の形態形成
- 経路制限SMADタンパク質リン酸化の正の制御
- Wntシグナル伝達経路
- アディポネクチン活性化シグナル伝達経路
- アクチビン受容体シグナル伝達経路の正の調節
- シグナル伝達
- 細胞集団増殖の負の調節
- タンパク質の折り畳み
- p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の調節
- タンパク質キナーゼ活性の調節
- ホスファチジルコリンの生合成過程
- テストステロンへの反応
- 好中球脱顆粒
- 肝臓再生
- マクロオートファジー
- ペプチジルスレオニンリン酸化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | ENSG00000228875 ENSG00000204435 ENSG00000232960 ENSG00000206406 ENSG00000224774
|
|---|
ENSG00000230700 ENSG00000224398 |
| |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | | |
|---|
NM_009975 NM_001303445 NM_001303446 NM_001303476 |
|
|---|
| RefSeq (タンパク質) | | |
|---|
NP_001290374 NP_001290375 NP_001290405 NP_034105 |
|
|---|
| 場所 (UCSC) | 6 章: 31.67 – 31.67 Mb | 17章: 35.34 – 35.34 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
| カゼインキナーゼII調節サブユニット |
|---|
 p21waf1ペプチドの存在下で結晶化されたck2ベータサブユニットの構造 |
|
| シンボル | CK_II_ベータ |
|---|
| パム | PF01214 |
|---|
| インタープロ | 著作権 |
|---|
| プロサイト | PDOC00845 |
|---|
| SCOP2 | 1qf8 / スコープ / SUPFAM |
|---|
|
カゼインキナーゼIIサブユニットベータは、ヒトではCSNK2B遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]これは、代謝経路、シグナル伝達、転写、翻訳、複製を制御する普遍的なタンパク質キナーゼである。この酵素は小胞体とゴルジ体に局在する。[7]
カゼインキナーゼは、細胞の代謝と分化に関与する普遍的でよく保存されたタンパク質キナーゼであり、アミノ酸の酸性領域におけるセリンまたはトレオニンを好むという特徴があります。この酵素は、2 つのアルファサブユニットと 2 つのベータサブユニットの四量体です。 [8] [9]ただし、一部の種(例:哺乳類)は 2 つの関連する形態のアルファサブユニット(アルファとアルファ')を持ち、他の種(例:真菌)は 2 つの関連するベータサブユニット(ベータとベータ')を持ちます。[10]アルファサブユニットは触媒単位で、セリン/トレオニンタンパク質キナーゼの特徴的な領域が含まれています。ベータサブユニットは調節的であると考えられており、N 末端の自己リン酸化部位、内部の酸性ドメイン、および潜在的な金属結合モチーフを持っています。[10] βサブユニットは、約25kDaの高度に保存されたタンパク質で、その中央部分には、亜鉛などの金属との結合に関与している可能性のあるシステインに富んだモチーフCX(n)Cが含まれています。[11]哺乳類のβサブユニット遺伝子プロモーターは、他の哺乳類タンパク質キナーゼと共通の特徴を共有しており、cAMP依存性タンパク質キナーゼの調節サブユニットのプロモーターと密接に関連しています。[10]
インタラクション
CSNK2BはCD163 [12] 、CSNK2A2 [13] [ 14] [15] [16]カゼインキナーゼ2アルファ1、[14] [15] [16] [17] [18] FGF1、[19] TRIB3 、[20] CDC34、[21]リボソームタンパク質L5、[13] [17] [ 22] [23] BTF3、[24 ] BRCA1、[25] RNF7、[17] P70-S6キナーゼ1 [26]およびAPCと相互作用することが示されている。[27]
参考文献
- ^ abc ENSG00000204435、ENSG00000232960、ENSG00000206406、ENSG00000224774、ENSG00000230700、ENSG00000224398 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000228875、ENSG00000204435、ENSG00000232960、ENSG00000206406、ENSG00000224774、ENSG00000230700、ENSG00000224398 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024387 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Yang-Feng TL、Teitz T、Cheung MC、Kan YW、Canaani D (1991 年 3 月)。「ヒトカゼインキナーゼ II ベータサブユニット遺伝子の 6p12----p21 への割り当て」。Genomics . 8 ( 4): 741–2. doi : 10.1016/0888-7543(90)90266-W . PMID 2276748。
- ^ Mucher G、Becker J、Knapp M、Buttner R、Moser M、Rudnik-Schoneborn S、Somlo S、Germino G、Onuchic L、Avner E、Guay-Woodford L、Zerres K (1998 年 4 月)。「常染色体劣性多発性嚢胞腎遺伝子座 (PKHD1) と遺伝子 MUT、RDS、CSNK2 beta、および GSTA1 の 6p21.1-p12 における詳細なマッピング」。Genomics . 48 ( 1): 40–5. doi : 10.1006/geno.1997.5145 . PMID 9503014。
- ^ 「Entrez Gene: CSNK2B カゼインキナーゼ 2、ベータポリペプチド」。
- ^ Jakobi R、Voss H、Pyerin W (1989 年 7 月)。「ヒトホスビチン/カゼインキナーゼ II 型。サブユニット β をコードする全長 cDNA の分子クローニングと配列決定」。Eur . J. Biochem . 183 (1): 227–33. doi : 10.1111/j.1432-1033.1989.tb14917.x . PMID 2666134。
- ^ ヴォス H、ウィルクナー U、ヤコビ R、ヒューイット NA、シュヴァーガー C、ツィマーマン J、アンゾルゲ W、ピエリン W (1991 年 7 月)。 「ヒトカゼインキナーゼIIサブユニットβをコードする遺伝子の構造」。J.Biol.化学。266 (21): 13706–11。土井: 10.1016/S0021-9258(18)92756-0。PMID 1856204。
- ^ abc Bidwai AP、Reed JC、Glover CV (1995 年 5 月)。「Saccharomyces cerevisiae カゼインキナーゼ II (CKII) の 38 kDa ベータサブユニットをコードする遺伝子 CKB1 のクローニングと破壊。CKII 調節サブユニットの欠失により塩感受性表現型が誘発される」。J . Biol. Chem . 270 (18): 10395–404。doi : 10.1074 /jbc.270.18.10395。PMID 7737972 。
- ^ Reed JC、Bidwai AP、Glover CV(1994年7月)。「Saccharomyces cerevisiaeカゼインキナーゼIIの32kDa調節β'サブユニットをコードする遺伝子CKB2のクローニングと破壊」。J . Biol. Chem . 269(27):18192–200。doi :10.1016 / S0021-9258 (17)32434-1。PMID 8027080。
- ^ Ritter M、Buechler C、Kapinsky M、Schmitz G (2001 年 4 月)。「CD163 とカゼインキナーゼ II (CKII) の調節サブユニットとの相互作用、および CD163 シグナル伝達の CKII およびプロテインキナーゼ C への依存性」。Eur . J. Immunol . 31 (4)。ドイツ: 999–1009。doi : 10.1002 /1521-4141(200104)31:4<999::AID-IMMU999>3.0.CO;2- R。ISSN 0014-2980。PMID 11298324 。
- ^ ab Lehner B、Semple Jennifer I、Brown Stephanie E、Counsell Damian、Campbell R Duncan、Sanderson Christopher M (2004 年 1 月)。「高スループット酵母 2 ハイブリッド システムの分析と、ヒト MHC クラス III 領域内でコードされる細胞内タンパク質の機能予測へのその使用」。Genomics。83 ( 1 )。米国: 153–67。doi : 10.1016 /S0888-7543( 03 )00235-0。ISSN 0888-7543。PMID 14667819 。
- ^ ab Kim MS, Lee YT, Kim JM, Cha JY, Bae YS (1998年2月). 「in vivoおよびin vitroにおけるタンパク質キナーゼCKIIサブユニット間のタンパク質相互作用の特性評価」. Mol. Cells . 8 (1). 韓国: 43–8. doi : 10.1016/S1016-8478(23)13390-5 . ISSN 1016-8478. PMID 9571630.
- ^ ab Marin O, Meggio F, Sarno S, Pinna LA (1997 年 6 月). 「タンパク質キナーゼ CK2 ベータサブユニットの調節特性とサブユニット間相互作用を担う構造要素の物理的分析」.生化学. 36 (23). 米国: 7192–8. doi :10.1021/bi962885q. ISSN 0006-2960. PMID 9188720.
- ^ ab Bosc DG、Graham KC、Saulnier RB、Zhang C、Prober D、Gietz RD、Litchfield DW (2000 年 5 月)。「タンパク質キナーゼ CK2 と相互作用する新規プレクストリン相同ドメイン含有タンパク質 CKIP-1 の同定と特性評価」。J . Biol . Chem . 275 (19)。米国: 14295–306。doi : 10.1074/ jbc.275.19.14295。ISSN 0021-9258。PMID 10799509 。
- ^ abc Ahn BH、Kim TH、Bae YS(2001年10月)。「タンパク質キナーゼCKIIベータサブユニットの相互作用ドメインと標的タンパク質のマッピング」。Mol . Cells . 12(2)。韓国(南):158–63。doi :10.1016 / S1016-8478(23) 17077-4。ISSN 1016-8478。PMID 11710515 。
- ^ Kusk M、Ahmed R、Thomsen B、Bendixen C、Issinger OG、Boldyreff B (1999 年 1 月)。「タンパク質キナーゼ CK2beta サブユニットとホロ酵素内および他のタンパク質との相互作用」。Mol . Cell. Biochem . 191 (1–2)。オランダ: 51–8。doi : 10.1023 / A :1006840613986。ISSN 0300-8177。PMID 10094392。S2CID 257329 。
- ^ Skjerpen CS、Nilsen Trine、Wesche Jørgen、Olsnes Sjur (2002 年 8 月)。 「FGF-1 変異体のプロテインキナーゼ CK2 への結合は分裂促進性と相関します。」エンボ J . 21 (15)。イングランド: 4058–69。土井:10.1093/emboj/cdf402。ISSN 0261-4189。PMC 126148。PMID 12145206。
- ^ Zhou Y、Li Lu、Liu Qionming、Xing Guichun、Kuai Xuezhang、Sun Jing、Yin Xiushan、Wang Jian、Zhang Lingqiang、何府中 (2008 年 5 月)。 「E3 ユビキチンリガーゼ SIAH1 は、TRB3 のユビキチン化と分解を媒介します。」細胞。信号。20 (5)。イングランド: 942–8。土井:10.1016/j.cellsig.2008.01.010。ISSN 0898-6568。PMID 18276110。
- ^ Block K、Boyer TG、Yew PR (2001 年 11 月)。「カゼインキナーゼ 2 によるヒトユビキチン結合酵素 CDC34 のリン酸化」。J . Biol. Chem . 276 (44) 。米国: 41049–58。doi : 10.1074 / jbc.M106453200。ISSN 0021-9258。PMID 11546811 。
- ^ Boldyreff B、Issinger OG (1997 年 2 月)。「A-Raf キナーゼはタンパク質キナーゼ CK2 ベータサブユニットの新しい相互作用パートナーです」。FEBS Lett . 403 ( 2)。オランダ: 197–9。doi :10.1016/S0014-5793(97 ) 00010-0。ISSN 0014-5793。PMID 9042965。S2CID 84557809 。
- ^ Kim JM、Cha JY、Marshak DR、Bae YS (1996 年 9 月)。「カゼインキナーゼ II のベータサブユニットとリボソームタンパク質 L5 との相互作用」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 226 (1) 。米国: 180–6。doi : 10.1006/ bbrc.1996.1330。ISSN 0006-291X。PMID 8806611 。
- ^ Grein S, Pyerin W (1999年1月). 「BTF3はタンパク質キナーゼCK2の潜在的新規基質である」. Mol. Cell. Biochem . 191 (1–2). オランダ: 121–8. doi :10.1023/A:1006806226764. ISSN 0300-8177. PMID 10094400. S2CID 1057554.
- ^ O'Brien KA、Lemke SJ、Cocke KS、Rao RN、Beckmann RP (1999 年 7 月)。「カゼインキナーゼ 2 は BRCA1 に結合し、これをリン酸化します」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 260 (3)。米国: 658–64。doi : 10.1006/bbrc.1999.0892。ISSN 0006-291X。PMID 10403822 。
- ^ Panasyuk G、Nemazanyy Ivan、Zhyvoloup Alexander、Bretner Maria、Litchfield David W、Filonenko Valeriy、Gout Ivan T (2006 年 10 月)。「S6K1 II の核外輸送は、タンパク質キナーゼ CK2 の Ser-17 でのリン酸化によって制御される」。J . Biol. Chem . 281 (42)。米国: 31188–201。doi : 10.1074 / jbc.M602618200。ISSN 0021-9258。PMID 16895915 。
- ^ Homma MK、Li Dongxia、Krebs Edwin G、Yuasa Yasuhito、Homma Yoshimi (2002年4月)。「大腸腺腫性ポリポーシスタンパク質によるカゼインキナーゼ2活性の関連と制御」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA 99 ( 9 ) 。米国: 5959–64。Bibcode : 2002PNAS ...99.5959K。doi : 10.1073 / pnas.092143199。ISSN 0027-8424。PMC 122884。PMID 11972058。
外部リンク
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト CSNK2B ゲノムの位置と CSNK2B 遺伝子の詳細ページ。
- PDBe-KBは、ヒトカゼインキナーゼIIサブユニットベータ(CSNK2B)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要を提供します。
さらに読む
- Schubert U、Schneider T、Henklein P、et al. (1992)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型にコードされる Vpu タンパク質はカゼインキナーゼ II によってリン酸化される」。Eur . J. Biochem . 204 (2): 875–83. doi :10.1111/j.1432-1033.1992.tb16707.x. PMID 1541298。
- Teitz T、Eli D、Penner M、他 (1990)。「ヒトカゼインキナーゼIIのβサブユニットのcDNAの発現は、色素性乾皮症細胞に部分的なUV耐性を付与する」。Mutat . Res . 236 (1): 85–97. doi :10.1016/0921-8777(90)90036-5. PMID 1694965。
- Voss H, Wirkner U, Jakobi R, et al. (1991). 「ヒトカゼインキナーゼIIサブユニットベータをコードする遺伝子の構造」J. Biol. Chem . 266 (21): 13706–11. doi : 10.1016/S0021-9258(18)92756-0 . PMID 1856204.
- Litchfield DW、Lozeman FJ、Cicirelli MF、他 (1991)。「ヒト A431 細胞におけるカゼインキナーゼ II のベータサブユニットのリン酸化。自己リン酸化部位と p34cdc2 によりリン酸化される部位の同定」。J . Biol. Chem . 266 (30): 20380–9. doi : 10.1016/S0021-9258(18)54934-6 . PMID 1939094。
- Ackerman P、Glover CV、Osheroff N (1990)。「上皮成長因子によるカゼインキナーゼ II の刺激: キナーゼの生理活性とそのベータサブユニットのリン酸化状態の関係」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA。87 ( 2): 821–5。Bibcode : 1990PNAS ... 87..821A。doi : 10.1073 / pnas.87.2.821。PMC 53358。PMID 2300566。
- Heller-Harrison RA、 Meisner H、Czech MP (1990)。「ヒトカゼインキナーゼIIのβサブユニットをコードするcDNAのクローニングと特性評価」。生化学。28 ( 23): 9053–8。doi :10.1021/bi00449a014。PMID 2513884 。
- Jakobi R、Voss H、Pyerin W (1989)。「ヒトホスビチン/カゼインキナーゼII型。サブユニットβをコードする全長cDNAの分子クローニングと配列決定」。Eur . J. Biochem . 183 (1): 227–33. doi : 10.1111/j.1432-1033.1989.tb14917.x . PMID 2666134。
- Vincent MJ、Abdul Jabbar M (1996)。「ヒト免疫不全ウイルス1型 Vpu タンパク質: 哺乳類の分泌経路におけるタンパク質分解とタンパク質輸送の潜在的調節因子」。ウイルス学。213 (2): 639–49。doi : 10.1006/ viro.1995.0035。PMID 7491787 。
- Litchfield DW、Bosc DG、Slominski E (1995)。「カゼインキナーゼIIベータサブユニットのSer-209をリン酸化する有糸分裂ヒト細胞由来のタンパク質キナーゼはp34cdc2である」。Biochim . Biophys. Acta . 1269 (1): 69–78. doi : 10.1016/0167-4889(95)00100-7 . PMID 7578274。
- Jin YJ、Burakoff SJ (1993)。「25kDa FK506結合タンパク質は核内に局在し、カゼインキナーゼIIおよびヌクレオリンと会合する」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 90 ( 16 ): 7769–73。Bibcode : 1993PNAS ...90.7769J。doi : 10.1073/ pnas.90.16.7769。PMC 47224。PMID 7689229。
- Gietz RD、Graham KC、Litchfield DW (1995)。「カゼインキナーゼIIのサブユニット間の相互作用」。J . Biol. Chem . 270 (22): 13017–21. doi : 10.1074/jbc.270.22.13017 . PMID 7768894。
- Szebeni A、Herrera JE、 Olson MO (1995)。「核小体タンパク質 B23 と核局在シグナルに関連するペプチドとの相互作用」。生化学。34 ( 25): 8037–42。doi :10.1021/bi00025a009。PMID 7794916 。
- Arnold SF、Obourn JD、Jaffe H、Notides AC (1995)。「セリン167は、ヒトエストロゲン受容体におけるエストラジオール誘導性リン酸化の主要な部位である」。Mol . Endocrinol . 8 (9): 1208–14. doi : 10.1210/mend.8.9.7838153 . PMID 7838153. S2CID 29238638.
- Pyerin W (1994). 「ヒトカゼインキナーゼII:構造、遺伝子、発現、細胞増殖刺激における必要性」。Adv . Enzyme Regul . 34 : 225–46. doi :10.1016/0065-2571(94)90018-3. PMID 7942276。
- el Benna J、Faust LP、Babior BM (1994)。「好中球活性化中の呼吸バースト酸化酵素成分p47phoxのリン酸化。タンパク質キナーゼCおよびプロリン指向性キナーゼによって認識される部位のリン酸化」。J . Biol. Chem . 269 (38): 23431–6. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31534-X . PMID 8089108。
- Schubert U、Henklein P、Boldyreff B、et al. (1994)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型がコードする Vpu タンパク質は、予測されるアルファヘリックスターンアルファヘリックスモチーフ内の Ser52 と Ser56 の位置でカゼインキナーゼ 2 (CK-2) によってリン酸化される」。J . Mol. Biol . 236 (1): 16–25. doi :10.1006/jmbi.1994.1114. PMID 8107101。
- Schubert U、Strebel K (1994)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型にコードされる Vpu タンパク質の異なる活動はリン酸化によって制御され、異なる細胞区画で発生する」。J . Virol . 68 (4): 2260–71. doi :10.1128/JVI.68.4.2260-2271.1994. PMC 236702. PMID 8139011 。
- Tanasijevic MJ、Myers MG、Thoma RS、et al. (1993)。「カゼインキナーゼIIによるインスリン受容体基質IRS-1のリン酸化」。J . Biol. Chem . 268 (24): 18157–66. doi : 10.1016/S0021-9258(17)46824-4 . PMID 8349691。
- Friborg J、Ladha A、Göttlinger H、et al. (1996)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型 Vpu タンパク質のリン酸化部位の機能分析」。J . Acquir. Immune Defic. Syndr. Hum. Retrovirol . 8 (1): 10–22. doi : 10.1097/00042560-199501000-00004 . PMID 8548340。
この記事にはパブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR000704からのテキストが組み込まれています。