人間の体内に存在するタンパク質
RP5 について 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 4UG0、4V6X、5AJ0、4UJD、4D67、4D5Y、4UJE、4UJC
識別子 エイリアス RPL5 、DBA6、L5、PPP1R135、MSTP030、リボソームタンパク質L5、uL18 外部ID オミム ：603634; MGI : 102854; ホモロジーン : 110649; ジーンカード ：RPL5; OMA :RPL5 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5 F|5 52.23 cM 始める 108,048,368 bp [2] 終わり 108,056,871 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 胚上皮 生殖腺 壁側胸膜 鼻咽頭上皮 左卵巣 脛骨 右卵巣 眼瞼結膜 心室帯 子宮体部
トップの表現 胚葉上層 子宮 卵巣 心室帯 胚 神経節隆起 胚 レンズ 精母細胞 回腸
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
rRNA結合 タンパク質結合 RNA結合 リボソームの構造構成要素 mRNA 3'-UTR結合 5S rRNA結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 mRNA 5'-UTR結合 ユビキチンリガーゼ阻害活性 細胞成分
細胞質 細胞質 リボソーム 膜 焦点接着 細胞内解剖構造 核小体 細胞質大リボソームサブユニット 細胞外エクソソーム 核 核質 小胞体 タンパク質含有複合体 シナプス リボ核タンパク質複合体 生物学的プロセス
ウイルス転写 SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化 リボソーム大サブユニットの生合成 翻訳開始 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解 rRNA処理 リボソーム大サブユニットアセンブリ タンパク質生合成 遺伝子発現の正の調節 翻訳の積極的な規制 タンパク質の安定化 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性の負の制御 ユビキチン依存性タンパク質分解過程の負の制御 タンパク質のネディレーションの負の制御 p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の調節 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
60Sリボソームタンパク質L5は、ヒトでは RPL5 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数 リボソームは 、 タンパク質合成を 触媒する 細胞小器官 で、小さな 40S サブユニットと大きな 60S サブユニットから構成されています。これらのサブユニットは、4種類の RNA と約 80 種類の構造的に異なるタンパク質で構成されています。この遺伝子は、 60S サブユニットの構成要素である リボソームタンパク質 をコードしています。このタンパク質は、リボソームタンパク質の L18P ファミリーに属しています。 細胞質 にあります。このタンパク質は 5S rRNAと結合して、5S リボ核タンパク質粒子 (RNP)と呼ばれる安定した複合体を形成します。これは、リボソームに関連しない細胞質 5S rRNA を 核小体 に輸送してリボソームに組み立てるのに必要です。このタンパク質は、 カゼインキナーゼ 2 のベータサブユニットと特異的に相互作用します 。
臨床的意義 大腸がん におけるこの遺伝子の発現は、 隣接する正常組織と比較して変動することが観察されているが、発現レベルと疾患の重症度との相関関係は確認されていない。この遺伝子は、その5番目の イントロン に位置する 小さな核小体RNA 遺伝子 U21 と共転写される。リボソームタンパク質をコードする遺伝子に典型的であるように、この遺伝子の複数の 処理された擬似遺伝子 がゲノム全体に分散している。 [7]
インタラクション リボソームタンパク質 L5 は以下と 相互作用する ことが示されています。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000122406 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000058558 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Qu LH、Nicoloso M、Michot B、Azum MC、Caizergues-Ferrer M、Renalier MH、Bachellerie JP (1994 年 11 月)。「U21 は、28S rRNA と 13 nt の相補性を持つ新規の小さな核小体 RNA で、ニワトリと哺乳類のリボソームタンパク質 L5 遺伝子のイントロンにコードされています」。Nucleic Acids Res . 22 (20): 4073–81. doi :10.1093/nar/22.20.4073. PMC 331892 . PMID 7937132。 ^ Frigerio JM、Dagorn JC、Iovanna JL (1995 年 7 月)。「L5、L21、L27a、L28、S5、S9、S10、S29 ヒトリボソームタンパク質 mRNA のクローニング、配列決定、発現」。Biochim Biophys Acta。1262 ( 1 ): 64–8。doi :10.1016/0167-4781(95)00045-i。PMID 7772601 。 ^ 「Entrez Gene: RPL5 リボソームタンパク質 L5」。 ^ Lehner B、Semple JI、Brown SE、Counsell D、Campbell RD、Sanderson CM (2004 年 1 月)。「ハイスループット酵母 2 ハイブリッド システムの分析と、ヒト MHC クラス III 領域内にコードされている細胞内タンパク質の機能予測へのその使用」。Genomics。83 ( 1 ) : 153–67。doi : 10.1016 /s0888-7543(03)00235-0。PMID 14667819 。 ^ Boldyreff B、Issinger OG (1997 年 2 月)。「A-Raf キナーゼはタンパク質キナーゼ CK2 ベータサブユニットの新しい相互作用パートナーです」。FEBS Lett . 403 (2): 197–9. doi :10.1016/s0014-5793(97)00010-0. PMID 9042965. S2CID 84557809. ^ キム・JM、チャ・JY、マーシャクDR、ペ・YS (1996年9月)。 「カゼインキナーゼ II のベータ サブユニットとリボソーム タンパク質 L5 の相互作用」。 生化学。生物物理学。解像度共通 。 226 (1): 180-6。 土井 ： 10.1006/bbrc.1996.1330 。 PMID 8806611。 ^ Ahn BH、Kim TH、Bae YS (2001年10月)。「タンパク質キナーゼCKIIベータサブユニットの相互作用ドメインと標的タンパク質のマッピング」。Mol . Cells . 12 (2): 158–63. doi : 10.1016/S1016-8478(23)17077-4 . PMID 11710515。 ^ Schatz O, Oft M, Dascher C, Schebesta M, Rosorius O, Jaksche H, Dobrovnik M, Bevec D, Hauber J (1998年2月). 「HIV-1 rev補因子真核生物開始因子5Aとリボソームタンパク質L5との相互作用」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (4): 1607–12. Bibcode :1998PNAS...95.1607S. doi : 10.1073/pnas.95.4.1607 . PMC 19115 . PMID 9465063. ^ Zhang Y、Wolf GW、Bhat K、Jin A、Allio T、Burkhart WA、Xiong Y (2003 年 12 月)。「リボソームタンパク質 L11 は腫瘍タンパク質 MDM2 を負に制御し、p53 依存性リボソームストレスチェックポイント経路を媒介する」。Mol . Cell. Biol . 23 (23): 8902–12. doi :10.1128/mcb.23.23.8902-8912.2003. PMC 262682. PMID 14612427 。 ^ Marechal V、Elenbaas B、Piette J、Nicolas JC、Levine AJ (1994 年 11 月)。「リボソーム L5 タンパク質は mdm-2 および mdm-2-p53 複合体と関連している」。Mol . Cell. Biol . 14 (11): 7414–20. doi :10.1128/mcb.14.11.7414. PMC 359276. PMID 7935455 。 ^ Dai MS、Sun XX、Lu H（2008年7月）。「ヌクレオステミンの異常発現はp53を活性化し、MDM2の阻害を介して細胞周期停止を誘導する」。Mol . Cell . Biol . 28 （13）：4365–76。doi ： 10.1128 /MCB.01662-07。PMC 2447154。PMID 18426907 。 ^ Kang MJ、Ahn HS、Lee JY、Matsuhashi S、Park WY (2002年4月)。「老化したヒト二倍体線維芽細胞におけるPDCD4の上方制御」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 293 (1): 617–21. doi :10.1016/S0006-291X(02)00264-4. PMID 12054647。
さらに読む
Wool IG、Chan YL、Glück A (1996)。「哺乳類リボソームタンパク質の構造と進化」。Biochem . Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. doi :10.1139/o95-101. PMID 8722009。 Pogue-Geile K、Geiser JR、Shu M、Miller C、Wool IG、Meisler AI、 Pipas JM (1991)。「リボソームタンパク質遺伝子は大腸癌で過剰発現している：ヒトS3リボソームタンパク質をコードするcDNAクローンの単離」。Mol . Cell. Biol . 11 (8): 3842–9. doi :10.1128/MCB.11.8.3842. PMC 361167. PMID 1712897 。 Steitz JA、Berg C、Hendrick JP、La Branche-Chabot H、Metspalu A、Rinke J、Yario T (1988)。「5S rRNA/L5 複合体は哺乳類細胞におけるリボソーム組み立ての前駆体である」。J . Cell Biol . 106 (3): 545–56. doi :10.1083/jcb.106.3.545. PMC 2115095. PMID 3279045 。 Hirano K, Ito M, Hartshorne DJ (1995). 「リボソームタンパク質 L5 とタンパク質ホスファターゼ 1 型の相互作用」 J. Biol. Chem . 270 (34): 19786–90. doi : 10.1074/jbc.270.34.19786 . PMID 7649987. Marechal V、Elenbaas B、Piette J、Nicolas JC、Levine AJ (1994)。「リボソームL5タンパク質はmdm-2およびmdm-2-p53複合体と関連している」。Mol . Cell. Biol . 14 (11): 7414–20. doi :10.1128/mcb.14.11.7414. PMC 359276. PMID 7935455 。 Ogata K, Kurahashi A, Nishiyama C, Terao K (1994). 「ラット肝臓細胞質中のトレオニル-およびヒスチジル-tRNA合成酵素複合体における5SrRNA-L5タンパク質複合体（5SRNP）の役割の存在」。 Biochim. Biophys. Acta . 1218 (3): 388–400. doi :10.1016/0167-4781(94)90192-9. PMID 8049265。 Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」 Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Michael WM、Dreyfuss G (1996)。「リボソームタンパク質 L5 の異なるドメインが 5 S rRNA の結合と核小体への局在を仲介する」。J . Biol. Chem . 271 (19): 11571–4. doi : 10.1074/jbc.271.19.11571 . PMID 8626719。 Kim JM、Cha JY、Marshak DR、Bae YS (1996)。「カゼインキナーゼIIのβサブユニットとリボソームタンパク質L5との相互作用」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 226 (1): 180–6. doi : 10.1006/bbrc.1996.1330 . PMID 8806611。 Boldyreff B、Issinger OG (1997)。「A- Rafキナーゼ は タンパク質キナーゼCK2ベータサブユニットの新しい相互作用パートナーです」。FEBS Lett。403 （ 2 ）：197–9。doi ： 10.1016 / S0014-5793（97）00010-0。PMID 9042965。S2CID 84557809 。 Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Schatz O, Oft M, Dascher C, Schebesta M, Rosorius O, Jaksche H, Dobrovnik M, Bevec D, Hauber J (1998). 「HIV-1 rev 補因子真核生物開始因子 5A とリボソームタンパク質 L5 との相互作用」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (4): 1607–12. Bibcode :1998PNAS...95.1607S. doi : 10.1073/pnas.95.4.1607 . PMC 19115 . PMID 9465063. Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (1998). 「75 個のヒトリボソームタンパク質遺伝子のマップ」 Genome Res . 8 (5): 509–23. doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194. Jäkel S, Görlich D (1998). 「インポーチンベータ、トランスポーター、RanBP5、RanBP7 は哺乳類細胞におけるリボソームタンパク質の核内輸送を仲介する」 EMBO J. 17 ( 15): 4491–502. doi :10.1093/emboj / 17.15.4491. PMC 1170780. PMID 9687515. Guerra B、Issinger OG (1998)。「p53 とリボソームタンパク質 L5 は、血清刺激およびシスプラチン処理後のマウス奇形癌細胞株 F9 におけるタンパク質キナーゼ CK2 との高分子量複合体形成に関与している」。FEBS Lett . 434 (1–2) : 115–20。doi :10.1016 / S0014-5793(98)00962-4。PMID 9738462。S2CID 7694535 。 Park JW、Bae YS (1999)。「タンパク質キナーゼ CKII によるリボソームタンパク質 L5 のリン酸化は 5S rRNA 結合活性を低下させる」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 263 (2): 475–81. doi :10.1006/bbrc.1999.1345. PMID 10491318。 Rosorius O, Fries B, Stauber RH, Hirschmann N, Bevec D, Hauber J (2000). 「ヒトリボソームタンパク質 L5 には明確な核局在および核外輸送シグナルが含まれている」 J. Biol. Chem . 275 (16): 12061–8. doi : 10.1074/jbc.275.16.12061 . PMID 10766838.
外部リンク GeneReviews/NCBI/NIH/UW のダイアモンド・ブラックファン貧血に関するエントリ ダイヤモンド・ブラックファン貧血に関する OMIM のエントリ
