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| ボルデテラ・トレマタム | |
|---|---|
科学的分類 
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| ドメイン： | 細菌 |
| 門: | シュードモナドタ |
| クラス： | ベータプロテオバクテリア |
| 注文： | バークホルデリア目 |
| 家族： | アルカリゲ科 |
| 属: | ボルデテラ |
| 種： | B.トレマタム
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| 二名法名 | |
| ボルデテラ・トレマタム ヴァンダムら 1996 [1]
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| 菌株 | |
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ボルデテラ トレマタムは、 1996 年に 10種類のB. トレマタム株と他のよく特徴付けられたボルデテラおよびアルカリゲネス種との比較によって特定されたグラム陰性細菌の一種です。 [2]トレマ という用語は、突き刺されたり貫通されたりしたもの、または隙間を指します。「トレマタム」は開いたものに関連しており、傷や体の他の露出部分に細菌が存在することを指します。 [2]この種の参照 株は LMG 13506 T株です。 [2]
分離
ボルデテラ属菌は一般的にヒトの呼吸器に感染しますが、B. trematum はヒトや動物の呼吸器から分離されたことはありません。ヒトの耳の感染症や手足の傷から分離されています。 [2]以下は、既知のB. trematum株、代替株の名称、および最初に分離された日付とソース のリストです。 [2]
特徴
ボルデテラ・トレマタムはグラム陰性で莢膜を持ち、胞子を形成せず、幅約0.5μm、長さ1.0～1.8μmの桿菌であるが、2.4μmの桿菌も観察されている。 [2]好気性で25～42℃の温度で 増殖し、増殖に最適な温度は35～37℃である。最適温度では微好気性増殖が観察されることがある。[2]周毛鞭毛 を介して運動する。[2] B. トレマタムはカタラーゼ陽性である。[2]ボルデテラ属の他のすべての種がオキシダーゼ陽性であるのに対し、オキシダーゼ陰性 であることが独特である。[3] [4]
ボルデテラ・トレマタムは、馬血液寒天培地、マッコンキー寒天培地、ボルデ・ゲンゴウ寒天培地で培養できる。ボルデテラ分離の標準寒天培地であるボルデ・ゲンゴウ寒天培地で培養した場合、コロニーは凸型で真珠のような滑らかな表面を呈し、ほぼ透明で光沢があり、周囲を溶血帯が取り囲んでいる。血液寒天培地で培養した場合、コロニーは灰白色から白色の円形で凸型となる。[2]
代謝
B. trematumは比較的最近発見されたため、その代謝についてはほとんどわかっていません。すべてのBordetella種と同様に、B. trematum は化学有機栄養生物であり、呼吸代謝による成長にはニコチンアミド、システインなどの有機硫黄、アミノ酸などの有機窒素が必要です。[2] その代謝は糖分解性ではなく、つまりエネルギー源としていかなる形態の糖も使用しません。[2]既知の 10 株のうち 6 株は、硝酸塩を亜硝酸塩に 還元できます。[2]インドール陰性でウレアーゼ陰性 です。 [2]
分類
DNA-rRNAハイブリダイゼーションにより、 B. trematum LMG 13506 Tはアルカリゲネス科に分類されました。 [2]増幅リボソームDNA制限解析により、 B. trematum参照株とボルデテラ参照種であるB. pertussisの 間に94%の類似性が明らかになりました。[2]その後、 B. trematum株LMG 13506およびLMG 14446と他のボルデテラおよびアルカリゲネス種の参照株とのDNA-DNAハイブリダイゼーション により、属レベルでの分類を決定するための追加の証拠が得られました。結果は、種B. trematumがボルデテラ属のメンバーに最も似ていることを示しました。[2]全細胞タンパク質のSDS-PAGE解析により、ボルデテラが単系統ではないことを示す樹状図を作成することができました。[2] DNA-rRNAハイブリダイゼーションと16S rRNA配列解析により、ボルデテラ属とアルカリゲネス属の間に密接な関係があることが示されています。[2] 2つの属を区別することは難しいことが多く、実際、属をまたいでいくつかの種は表現型が同一です。[2]
ボルデテラ・トレマタムとB. ホルメシは、呼吸器に定着しない唯一の種です。 百日咳菌とパラ百日咳菌は、百日咳を引き起こす呼吸器病原体です。B . ブロンキセプティカとB. アビウムは、他の動物の呼吸器病原体です。B . ヒンジは病原性がなく、鳥の呼吸器に定着します。B . ホルメシは、ヒトの血液から分離されています。[2]アルカリゲネス 属のメンバーは、ヒトに定着しますが、呼吸器、土壌、水には定着しません。[2]
ゲノミクス
B. trematumの ゲノムは2013年に配列決定され、現在アノテーションが行われている。[5] ゲノムには4,145のコード配列があると推定されており 、その大部分はアミノ酸、アミノ酸誘導体、炭水化物経路をコードしている。約184の遺伝子が膜輸送に関与すると予測されている。[5] GC含量は 64～65%である。[2] ゲノム全体のサイズは現在のところ不明である。
病原性
ボルデテラ・トレマタムは非病原性[4] 、日和見[3]の微生物であり、その唯一の分離源は人間の開いた傷口である[2] 。 医療介入なしに体内から排除することができる。[3]
ボルデテラ菌の エンドトキシンは、属、種、株に特有のものである。B . trematumは、単一のOユニットを含む半粗面リポ多糖類を持つ唯一のボルデテラ菌種である。B . trematumの脂質Aユニットは日和見細菌B. hinziiの脂質Aユニットと同一であるが、他のボルデテラ菌種とは異なる。[6]
参考文献
- ^ 「分類ブラウザ：Bordatella trematum」。NCBI 。 2014年4月7日閲覧。
- ^ abcdefghijklmnopqrstu vwx Vandamme, P; M Heyndrickx; M Vancanneyt; B Hoste; P De Vos; E Falsen; K Kersters; KH Hinz (1996 年 10 月). 「Bordetella trematum sp. nov.、ヒトの創傷および耳感染症から分離、および Alcaligenes denitrificans Ruger および Tan 1983 の再評価」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 46 (4): 849–858. doi : 10.1099/00207713-46-4-849 . PMID 8863408.
- ^ abc Daxboeck, F; E Goerzer; P Apfalter; M Nehr; R Krause (2004 年 11 月). 「糖尿病性下肢潰瘍からの Bordetella trematum の分離」.糖尿病医学. 21 (11): 1247–1248. doi :10.1111/j.1464-5491.2004.01310.x. PMID 15498093.
- ^ ab Bergey's Manual of Systematic Bacteriology、第2版、第2巻、パートC。 2005年。doi :10.1007/ 0-387-29298-5。ISBN 978-0-387-24145-6。
- ^ ab Shah, NR; M Moska; A Novikv; MB Perry; M Hirst; M Caroff; RC Fernandez (2013年9月～10月). 「Bordatella hinziiおよびBordetella trematumのドラフトゲノム配列」. Genome Announcements . 1 (5): e00838–e00913. doi :10.1128/genomeA.00838-13. PMC 3813182. PMID 24158552 .
- ^ Caroff, Martine; Laurent Aussel; Hassan Zarrouk; Adele Martin; James Richards; Helene Therisod; Malcolm Perry; Doris Karibian (2001 年 2 月)。「Bordetella エンドトキシンの構造の多様性と独自性」。先天性免疫。7 (1): 63–68。doi :10.1177/ 09680519010070011101。PMID 11521085 。
外部リンク
- BacDive の Bordetella trematum の標準株 - 細菌多様性メタデータ