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外科病理学は、ほとんどの解剖病理医にとって最も重要かつ時間のかかる業務分野です。外科病理学では、外科検体の肉眼的および顕微鏡的検査に加え、外科医や一般内科医、専門医、皮膚科医、インターベンショナル放射線科医などの非外科医から提出された生検検体の検査も行います。
外科病理学は、患者から外科的に組織が採取された場合、疾患の有無を確定的に診断することを可能にする。これは通常、組織の肉眼的（すなわちマクロ的）検査と組織学的（すなわちミクロ的）検査を組み合わせて行われ、免疫組織化学やその他の臨床検査による組織の分子特性の評価が含まれる場合もある。
外科病理分析のために提出される検体には、生検と外科切除の2つの主要なタイプがあります。 [ 1 ]
生検とは、主に外科病理学的分析を目的として採取される小さな組織片であり、多くの場合、確定診断を下すために行われます。生検の種類には、コア生検があります。コア生検は、超音波、CTスキャン、磁気共鳴画像法などの放射線学的技術の誘導下で、太い針を使用して採取されます。組織構造を保持するコア生検は、細胞病理学的技術を使用して分析される細針吸引生検と混同してはなりません。切開生検は、疑わしい病変の一部を切除する診断外科手術によって採取されますが、切除生検は病変全体を切除し、治療外科切除に似ています。皮膚病変や消化管ポリープの切除生検は非常に一般的です。病理医による生検の解釈は、良性腫瘍か悪性腫瘍かの診断を確定する上で重要であり、癌の種類やグレードを区別したり、腫瘍内の特定の分子経路の活性を判定したりすることができます。この情報は、患者の予後を予測し、最適な治療法を選択する上で重要です。生検は、がん以外の疾患の診断にも用いられ、皮膚や消化管の炎症性疾患、感染症、特発性疾患など、ほんの一例を挙げただけでも多岐にわたります。
外科切除検体は、病変部位または臓器全体（場合によっては複数の臓器）を治療目的で外科的に切除することによって得られます。これらの処置は、診断がすでに判明している、または強く疑われている疾患に対する確定的な外科的治療を目的として行われることが多いです。しかし、これらの検体の病理学的分析は、以前の診断の確認、悪性疾患の進行度の判定、病変部位全体が切除されたかどうかの確認（「手術マージン決定」と呼ばれるプロセスで、多くの場合、凍結切片法が用いられます）、疑われていなかった併発疾患の存在の特定、および術後治療（癌の場合の補助化学療法など）のための情報提供において、極めて重要です。
外科的切除における切除縁の決定には、パン切り法、またはCCPDMA法を用いることができる。CCPDMA法の特殊な形態は、ある外科医にちなんでモース手術法と呼ばれている。
多くの病理医は、フェローシップレベルの研修を受けたり、外科病理学の特定の分野で専門知識を追求したりします。サブスペシャリゼーションは、特に学術機関で一般的であり、病理医は自身の研究に関連する診断外科病理学の分野を専門とすることがありますが、開業医の間でもますます一般的になっています。サブスペシャリゼーションには、困難な症例の解釈に関する経験とスキルの向上、サブスペシャリゼーション分野内の病理医と臨床医とのより緊密な協力関係の構築など、多くの利点があります。外科病理学の一般的に認められているサブスペシャリゼーションには、次のものがあります。
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