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| RBP3 について | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | RBP3、D10S64、D10S65、D10S66、IRBP、RBPI、RP66、レチノール結合タンパク質3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：180290; MGI : 97878;ホモロジーン: 9261;ジーンカード：RBP3; OMA :RBP3 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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レチノール結合タンパク質3間質（RBP3 ）は、光受容体間レチノイド結合タンパク質（IRBP）としても知られ、ヒトではRBP3遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] RBP3相同遺伝子[6]は、テンレックとアルマジロを除くほとんどの真獣類で特定されています。脊索動物の目の進化を説明するために、細菌からの水平遺伝子伝播が提案されています。[7]
関数
光受容体 間レチノイド結合タンパク質は、レチノイドと結合することが知られている大きな糖タンパク質であり、主に網膜の網膜色素上皮（RPE）と光受容体細胞の間の光受容体間マトリックスに存在します。RPEと光受容体の間でレチノイドを輸送すると考えられており、視覚プロセスにおいて重要な役割を果たしています。[8] [9]
遺伝子
ヒト IRBP 遺伝子は長さが約 9.5 kbp で、 3 つのイントロンで区切られた4 つのエクソンで構成されています。イントロンの長さは 1.6～1.9 kbp です。この遺伝子は、光受容体細胞と網膜芽細胞腫細胞によって約 4.3 キロベースの mRNA に転写され、これが翻訳されて 135,000 Da の糖化タンパク質に処理されます。
構造
ヒト IRBP のアミノ酸配列は、33～38% の同一性を持つ 4 つの連続した相同ドメインに分けられ、一連の遺伝子重複イベントを示唆しています。遺伝子では、これらのドメインの境界は、予想されていたようにエクソン-イントロン接合部によって定義されていません。最初の 3 つの相同ドメインと 4 番目の相同ドメインの一部はすべて、3,180 塩基対の長さの最初の大きなエクソンによってエンコードされています。4 番目のドメインの残りは、それぞれ 191、143、約 740 塩基対の長さの最後の 3 つのエクソンでエンコードされています。[5]
応用
rbp3遺伝子は、動物において核DNA系統マーカーとして一般的に使用されています。[6]エクソン1は、翼手目の単系統性の証拠を提供するための先駆的な研究で初めて使用されました。[10]その後、有胎盤哺乳類目[11] [12]や、齧歯目[13]、大型齧歯目[14]、霊長類[15]の主要な系統群の 系統を推測するために使用されました。RBP3は、ネズミ目齧歯類[16]やマダガスカル霊長類[17] 、 GeomysおよびApodemus齧歯類の系統地理学レベル[18] [19]、さらには食肉類の種の同定目的にも有用です。[20]
RBP3イントロン1は、広鼻類霊長類の系統発生の研究にも使用されていることに留意してください。[21]
参考文献
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さらに読む
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外部リンク
- GeneReviews/NCBI/NIH/UW の網膜色素変性症に関するエントリーの概要
- 「RBP3マーカーのコーディングDNAとタンパク質配列アラインメントの概要」。OrthoMaM –相同哺乳類マーカーの生物学的データベース。rbp3進化マーカーは、対応する遺伝子
系統
とともに見つけることができます。
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