(AZアミノ酸コードについては、「タンパク質構成アミノ酸#化学的性質」を参照してください)
タンパク質に付加される短いタグは、一般的に「エピトープタグ」と呼ばれます。このリストにあるタグも、このカテゴリーに分類されます。「エピトープタグ付け」とは、タンパク質に短いペプチドを付加し、そのペプチド(エピトープ)に特異的な抗体を用いて検出できるようにするプロセスです。
ALFAタグは、生化学および顕微鏡アプリケーション向けに新たに設計されたらせん状ペプチドタグ(SRLEEELRRRLTE)です。このタグは、単一ドメイン抗体のレパートリーによって認識されます[ 16 ]。 AviTagは、酵素BirAによるビオチン化を 可能にするペプチドであり、これによりタンパク質をストレプトアビジン (GLNDIFEAQKIEWHE)で分離することができる。 EPEAタグは、市販ではCaptureSelect Cタグと呼ばれ、ファージディスプレイ (EPEA)によって発見されたVHHまたは単一ドメインのラクダ科抗体によって認識される4アミノ酸ペプチドである[ 17 ] [ 18 ]。 カルモジュリンタグ 、タンパク質カルモジュリン(KRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGAL)に結合するペプチドi CapTag™(インテイン キャプチャ タグ )は、自己除去型のペプチドベースのタグ(MIKIATRKYLGKQNVYGIGVERDHNFALKNGFIAHN)です。i CapTag ™ はpHの変化によって制御されます。通常、pHの変化はpH 8.5からpH 6.2に起こり、タグのない標的タンパク質が溶出液に放出されます。必要に応じて、pHシフトとバッファーは、タンパク質特異的な精製方法に合わせて最適化できます(たとえば、膜タンパク質の場合は、タンパク質の溶解度を高めるためにバッファーに界面活性剤を追加できます)。[ 19 ] 他のタンパク質精製方法とは対照的に、この方法は、タグ-タンパク質複合体からタグを切断するためにプロテアーゼに依存していません。代わりに、溶出段階でバッファーのpHが8.5からpH 6.2に変化すると、切断反応が引き起こされ、タグのない標的タンパク質が放出されますが、高度に設計されたタグはカラムに結合したままになります。タグなしの標的タンパク質またはペプチドの予想される純度は 95~99% です。i CapTag ™ には 、Nostoc punctiforme (Npu)インテイン 由来の特許成分が含まれています。このタグは、ペプチド、 mAb の断片、組換えタンパク質 およびその断片のタンパク質精製に使用されます。研究室で使用でき、下流の製造プロセスでの大規模精製も目的としています。i CapTag ™-標的タンパク質複合体は、幅広い発現ホスト (たとえば 、CHO 細胞およびE.coli 細胞)で発現できます[ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] ポリグルタミン酸タグは、モノQ(EEEEEE)などの陰イオン交換樹脂に効率的に結合するペプチドである[ 3 ]。 ポリアルギニンタグ、陽イオン交換樹脂に効率的に結合するペプチド(5~9個の連続したR) Eタグとは、抗体によって認識されるペプチド(GAPVPYPDPLEPR)のことである。 FLAGタグ 、抗体によって認識されるペプチド(DYKDDDDK)[ 23 ] HAタグは 、抗体によって認識されるヘマグルチニン 由来のペプチド(YPYDVPDYA) [ 24 ] Hisタグ 、ニッケルまたはコバルトキレートによって結合された5~10個のヒスチジン(HHHHH) Gly-HisタグはN末端Hisタグ変異体(例:GHHHH、GHHHHHH、GSSHHHHHH)であり、固定化された金属カチオンに結合するが、アジドグルコノイル化によって活性化され、クリックケミストリーアプリケーションを可能にすることもできる[ 25 ]。 Mycタグは 、抗体(EQKLISEEDL)によって認識されるc- myc 由来のペプチドである。NEタグは 、モノクローナルIgG1抗体によって認識される18アミノ酸の合成ペプチド(TKENPRSNQEESYDDNES)であり、ウェスタンブロッティング、ELISA、フローサイトメトリー、免疫細胞化学、免疫沈降、組換えタンパク質の親和性精製など幅広い用途に有用である[ 26 ]。 Rho1D4タグとは、ウシロドプシンの細胞内C末端の最後の9アミノ酸(TETSQVAPA)を指します。これは膜タンパク質 の精製に使用できる非常に特異的なタグです。 Sタグ 、リボヌクレアーゼA由来のペプチド(KETAAAKFERQHMDS)SBPタグは、 ストレプトアビジン に結合するペプチド(MDEKTTGWRGGHVVEGLAGELEQLRARLEHHPQGQREP)[ 27 ]です。 Softag 1 、哺乳類発現用(SLAELLNAGLGGS)Softag 3 、原核生物発現用(TQDPSRVG)Spot-tagは 、免疫沈降、アフィニティー精製、免疫蛍光、超解像顕微鏡観察のためにナノボディ (PDRVRAVSHWSS)によって認識されるペプチドです。ストレプトタグは 、ストレプトアビジンまたはストレプタクチンと呼ばれる修飾ストレプトアビジンに結合するペプチドです(ストレプトタグII:WSHPQFEK)[ 2 ] T7タグは 、T7遺伝子(MASMTGGQQMG)のT7主要カプシドタンパク質由来のエピトープタグです。さまざまな免疫測定法やアフィニティー精製 に主に使用されます[ 28 ] TCタグは 、FlAsHおよびReAsH二ヒ素化合物(CCPGCC)によって認識されるテトラシステインタグです。Tyタグ (EVHTNQDPLD)V5タグ 、抗体によって認識されるペプチド(GKPIPNPLLGLDST)[ 29 ] VSVタグ、抗体によって認識されるペプチド(YTDIEMNRLGK) Xpressタグ(DLYDDDDK)は、抗体によって認識されるペプチドである。
イソペプタグは 、ピリンCタンパク質(TDKDMTITFTNKKDAE)に共有結合するペプチドである[ 30 ]。 SpyTagは、 SpyCatcher タンパク質(AHIVMVDAYKPTK)に共有結合するペプチドである[ 31 ]。 SnoopTagは 、SnoopCatcherタンパク質(KLGDIEFIKVNK)に共有結合するペプチドです。[ 32 ] また、第2世代のSnoopTagJrも開発され、SnoopCatcherまたはDogTag(SnoopLigaseを介して)(KLGSIEFIKVNK)に結合するようにしました。[ 33 ] DogTagは、DogCatcher(DIPATYEFTDGKHYITNEPIPPK)に共有結合するペプチドであり、タンパク質のループ内の内部タグとして反応することができる。[ 34 ] DogTagは、SnoopLigaseを介してSnoopTagJrにも共有結合することができる。[ 33 ] SdyTagは、SdyCatcherタンパク質(DPIVMIDNDKPIT)に共有結合するペプチドである。[ 35 ] SdyTag/SdyCatcherは、SpyTag/SpyCatcherと速度論的に依存する交差反応性を示す。
その他 HiBiTタグは プロメガ社 の科学者によって開発されました。これは11アミノ酸からなるペプチドタグで、タンパク質のN末端、C末端、または内部に融合させることができます。[ 41 ] サイズが小さいため、CRISPR/Cas9技術を用いて他のタンパク質にこのタグを迅速にノックインすることができます。[ 41 ]
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